CNOT4

CNOT4
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1E4U, 1UR6
Идентификаторы
Псевдонимы	CNOT4 , CLONE243, NOT4, NOT4H, субъединица 4 транскрипционного комплекса CCR4-NOT
Внешние идентификаторы	Опустить : 604911 ; МГИ : 1859026 ; Гомологен : 40870 ; Генные карты : CNOT4 ; OMA : CNOT4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 7 (human) Band 7q33 Start 135,361,795 bp End 135,510,127 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 6 (mouse) Band 6|6 B1 Start 34,999,000 bp End 35,110,659 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in buccal mucosa cell Achilles tendon testicle gastrocnemius muscle parietal pleura corpus callosum internal globus pallidus sural nerve endothelial cell muscle of thigh Top expressed in genital tubercle Rostral migratory stream tail of embryo zygote saccule primary oocyte secondary oocyte otic placode fossa otic vesicle More reference expression data BioGPS n/a
showГенная онтология Molecular function ubiquitin-protein transferase activity protein binding nucleic acid binding metal ion binding transferase activity RNA binding Cellular component cytosol cytoplasm CCR4-NOT complex nucleus Biological process protein ubiquitination nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening protein autoubiquitination DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay ubiquitin-dependent protein catabolic process regulation of megakaryocyte differentiation Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 4850 53621 Вместе ENSG00000080802 ENSMUSG00000038784 ЮниПрот О95628 Q8BT14 RefSeq (мРНК) showНМ_001008225 НМ_001190847 НМ_001190848 НМ_001190849 НМ_001190850 NM_013316 NM_001393370 NM_001393371 NM_001393372 NM_001393373 NM_001393374 NM_001393375 НМ_001164411 НМ_001164412 НМ_001164413 НМ_001164414 НМ_016877 RefSeq (белок) showНП_001008226 НП_001177776 НП_001177777 НП_001177778 НП_001177779 NP_037448 НП_001157883 НП_001157884 НП_001157885 НП_001157886 НП_058573 Местоположение (UCSC) Chr 7: 135,36 – 135,51 Мб Чр 6: 35 – 35,11 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Транскрипционный комплекс CCR4-NOT, субъединица 4, представляет собой белок , который у человека кодируется геном CNOT4 .

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является субъединицей комплекса CCR4-Not , глобального транскрипции регулятора и деаденилазы . Кодируемый белок взаимодействует с CNOT1 и обладает активностью убиквитинлигазы . несколько вариантов транскрипта, кодирующих различные изоформы Для этого гена было обнаружено . [предоставлено RefSeq, июль 2010 г.]. Заболевания, связанные с CNOT4, включают аденоидит.

Дальнейшее чтение

• Грёнхольм Дж., Каустио М., Мюллюмяки Х., Каллио Дж., Саарикетту Дж., Кронхамн Дж., Валанне С., Сильвеннойнен О., Рамет М. (март 2012 г.). «Not4 усиливает экспрессию генов, зависимую от пути JAK/STAT, у дрозофилы и в клетках человека» . Журнал ФАСЭБ . 26 (3): 1239–50. дои : 10.1096/fj.11-195875 . ПМИД   22159038 . S2CID   25618632 .
• Винклер Г.С., Альберт Т.К., Домингес С., Легтенберг Ю.И., Боеленс Р., Тиммерс Х.Т. (март 2004 г.). «Пара убиквитин-конъюгирующий фермент/убиквитин-белковая лигаза с измененной специфичностью». Журнал молекулярной биологии . 337 (1): 157–65. дои : 10.1016/j.jmb.2004.01.031 . ПМИД   15001359 .
• Лау, Северная Каролина, Колкман А., ван Шайк Ф.М., Малдер К.В., Пейнаппель В.В., Хек А.Дж., Тиммерс Х.Т. (сентябрь 2009 г.). «Комплексы Ccr4-Not человека содержат вариабельные субъединицы деаденилазы» (PDF) . Биохимический журнал . 422 (3): 443–53. дои : 10.1042/BJ20090500 . ПМИД   19558367 .
• Альберт Т.К., Ханзава Х., Легтенберг Ю.И., де Руве М.Дж., ван ден Хевел Ф.А., Колларт М.А., Боеленс Р., Тиммерс Х.Т. (февраль 2002 г.). «Идентификация субъединицы убиквитин-протеинлигазы в комплексе репрессора транскрипции CCR4-NOT» . Журнал ЭМБО . 21 (3): 355–64. дои : 10.1093/emboj/21.3.355 . ПМК   125831 . ПМИД   11823428 .
• Домингес С., Бонвин А.М., Винклер Г.С., ван Шайк Ф.М., Тиммерс Х.Т., Боленс Р. (апрель 2004 г.). «Структурная модель комплекса UbcH5B/CNOT4, выявленная путем сочетания подходов ЯМР, мутагенеза и докинга» . Структура . 12 (4): 633–44. дои : 10.1016/j.str.2004.03.004 . ПМИД   15062086 .
• Вистов Г., Бернштейн С.Л., Вятт М.К., Фарисс Р.Н., Бехал А., Тачман Дж.В., Буффард Г., Смит Д., Петерсон К. (июнь 2002 г.). «Анализ выраженных меток последовательности РПЭ/сосудистой оболочки человека для проекта NEIBank: более 6000 неизбыточных транскриптов, новые гены и варианты сплайсинга». Молекулярное видение . 8 : 205–20. ПМИД   12107410 .
• Мерсман Д.П., Ду Х.Н., Фингерман И.М., Южный П.Ф., Бриггс С.Д. (апрель 2009 г.). «Полюбиквитинирование деметилазы Jhd2 контролирует метилирование гистонов и экспрессию генов» . Гены и развитие . 23 (8): 951–62. дои : 10.1101/gad.1769209 . ПМЦ   2675863 . ПМИД   19346402 .
• Ханзава Х., де Руве М.Дж., Альберт Т.К., ван дер Влит ПК, Тиммерс Х.Т., Боленс Р. (март 2001 г.). «Структура безымянного пальца C4C4 человеческого NOT4 демонстрирует особенности, отличные от структуры безымянного пальца C3HC4» . Журнал биологической химии . 276 (13): 10185–90. дои : 10.1074/jbc.M009298200 . ПМИД   11087754 .
• Альберт Т.К., Лемэр М., ван Беркум Н.Л., Генц Р., Колларт М.А., Тиммерс Х.Т. (февраль 2000 г.). «Выделение и характеристика человеческих ортологов субъединиц дрожжевого комплекса CCR4-NOT» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (3): 809–17. дои : 10.1093/нар/28.3.809 . ПМЦ   102560 . ПМИД   10637334 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .