CNOT9

CNOT9
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2FV2, 4CRU, 4CRV, 4CT6, 4CT7
Идентификаторы
Псевдонимы	CNOT9 , CT129, RCD-1, RCD1, CAF40, RQCD1, субъединица 9 транскрипционного комплекса CCR4-NOT.
Внешние идентификаторы	Опустить : 612054 ; МГИ : 1928902 ; Гомологен : 3973 ; Генные карты : CNOT9 ; OMA : CNOT9 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	218,597,080 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	74,570,001 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gingival epithelium; ; epithelium of nasopharynx; ; ganglionic eminence; ; right uterine tube; ; lymph node; ; stromal cell of endometrium; ; gastric mucosa; ; Achilles tendon; ; anterior pituitary; ; rectum;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; genital tubercle; ; yolk sac; ; epiblast; ; somite; ; ventricular zone; ; maxillary prominence; ; zygote; ; mandibular prominence; ; fetal liver hematopoietic progenitor cell;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	protein homodimerization activity; protein domain specific binding; protein binding; epidermal growth factor receptor binding; kinase binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; membrane; CCR4-NOT complex; P-body; CCR4-NOT core complex; nucleus; protein-containing complex;
Biological process	nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening; negative regulation of translation; regulation of transcription, DNA-templated; mRNA catabolic process; cytokine-mediated signaling pathway; sex differentiation; transcription, DNA-templated; gene silencing; negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway; regulation of translation; DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay; positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation; positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9125
	58184
	ENSG00000144580
	ENSMUSG00000026174
	Q92600
	Q9JKY0
	НМ_001271634 ; НМ_001271635 ; НМ_005444
	НМ_021383
	НП_001258563 ; НП_001258564 ; НП_005435
	НП_067358
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица 9 транскрипционного комплекса CCR4-NOT представляет собой белок , который у человека кодируется геном CNOT9 . ^{[ 5 ]}

Функция

Этот ген кодирует члена высококонсервативного семейства белков RCD1. Кодируемый белок является транскрипционным кофактором и основным белком CCR4-Not комплекса деаденилирования . Он может участвовать в передаче сигнала, а также в дифференцировке и развитии клеток, регулируемых ретиноевой кислотой. Для этого гена были описаны альтернативно сплайсированные варианты транскрипта. [предоставлено RefSeq, октябрь 2012 г.].

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000144580 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026174 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: субъединица 9 транскрипционного комплекса CCR4-NOT» . Проверено 15 апреля 2020 г.

Дальнейшее чтение

Хирои Н., Ито Т., Ямамото Х., Очия Т., Джинно С., Окаяма Х. (октябрь 2002 г.). «Rcd1 млекопитающих — это новый транскрипционный кофактор, который опосредует дифференцировку клеток, индуцированную ретиноевой кислотой» . ЭМБО Дж. 21 (19): 5235–44. дои : 10.1093/emboj/cdf521 . ПМК 129043 . ПМИД 12356739 .
Гарапати С., Махаджан М.А., Сэмюэлс Х.Х. (март 2008 г.). «Компоненты комплекса CCR4-NOT действуют как коактиваторы ядерных рецепторов гормонов посредством ассоциации с NRC-взаимодействующим фактором NIF-1» . Ж. Биол. Хим . 283 (11): 6806–16. дои : 10.1074/jbc.M706986200 . ПМИД 18180299 .
Аджиро М., Катагири Т., Уэда К., Накагава Х., Фукукава С., Лин М.Л., Пак Дж.Х., Нишидате Т., Дайго Ю., Накамура Ю. (октябрь 2009 г.). «Участие сверхэкспрессии RQCD1, нового антигена рака яичка, в пути Akt в клетках рака молочной железы». Межд. Дж. Онкол . 35 (4): 673–81. ПМИД 19724902 .
Аджиро М., Нишидате Т., Катагири Т., Накамура Ю. (ноябрь 2010 г.). «Критическое участие RQCD1 в пути EGFR-Akt в канцерогенезе молочной железы» . Межд. Дж. Онкол . 37 (5): 1085–93. дои : 10.3892/ijo_00000760 . ПМИД 20878056 .
Матис Х., Баскен Дж., Озгур С., Чарноцки-Чецюра М., Бонно Ф., Аартсе А., Дзембовский А., Новотны М., Конти Е., Филипович В. (июнь 2014 г.). «Структурные и биохимические данные о роли комплекса CCR4-NOT и АТФазы DDX6 в репрессии микроРНК» . Мол. Ячейка 54 (5): 751–65. doi : 10.1016/j.molcel.2014.03.036 . ПМИД 24768538 .
Чен Ю, Боланд А, Кузуоглу-Озтюрк Д, Баванкар П, Лох Б, Чанг ЧТ, Вайхенридер О, Изаурральде Э (июнь 2014 г.). «Комплекс DDX6-CNOT1 и W-связывающие карманы в CNOT9 обнаруживают прямые связи между распознаванием мишени и молчанием миРНК» . Мол. Клетка . 54 (5): 737–50. doi : 10.1016/j.molcel.2014.03.034 . ПМИД 24768540 .
Вонг С.К., Берен А., Мар В.Дж., Вудс К., Ли Дж., Мартин С., Шеппард К.Е., Вулф Р., Келли Дж., Себон Дж., Добрович А., Макартур Г.А. (январь 2015 г.). «Секвенирование всего экзома выявляет рецидивирующую мутацию RQCD1 P131L при меланоме кожи» . Онкотаргет . 6 (2): 1115–27. дои : 10.18632/oncotarget.2747 . ПМЦ 4359221 . ПМИД 25544760 .
Булбрук Д., Брейзер Х., Махаджан П., Клищак М., Федоров О., Марчезе Ф.П., Обареда А., Чок Р., Пико С., Стрейн-Дамерелл С., Филиппакопулос П., Гилеади О., Кларк А.Р., Юэ В.В., Берджесс-Браун Н.А., Дин JLE (март 2018 г.). «Триптофан-опосредованные взаимодействия между тристетрапролином и субъединицей CNOT9 необходимы для рекрутирования комплекса CCR4-NOT деаденилазы» (PDF) . Дж. Мол. Биол . 430 (5): 722–736. дои : 10.1016/j.jmb.2017.12.018 . ПМИД 29291391 .
Хан Дж, Ю Дж, Дай Ю, Ли Дж, Го М, Сун Дж, Чжоу Икс (февраль 2019 г.). «Сверхэкспрессия миР-361-5p при тройном негативном раке молочной железы (TNBC) ингибирует миграцию и инвазию путем нацеливания на RQCD1 и ингибирования пути EGFR/PI3K/Akt» . Босн Дж. Базовые медицинские науки . 19 (1): 52–59. дои : 10.17305/bjbms.2018.3399 . ПМК 6387672 . ПМИД 29924958 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

статья о гене на хромосоме 2 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000144580 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026174 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Энтрез: субъединица 9 транскрипционного комплекса CCR4-NOT» . Проверено 15 апреля 2020 г.

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]