Кафетерий вирус Roenbergensis
| Кафетерий вирус Roenbergensis | |
|---|---|
| |
| Гигантский вирус кров [ 1 ] | |
Классификация вирусов 
| |
| (не вмешательство): | Вирус |
| Область : | Varidnaviria |
| Королевство: | Bamfordvirae |
| Филум: | Нуклеоцитовирикота |
| Сорт: | Мегавирицеты |
| Заказ: | Имитервиралс |
| Семья: | Mimiviridae |
| Род: | Кафетериявирус |
| Разновидность: | Кафетерий вирус Roenbergensis
|
Кафетерий вирус Roenbergensis ( CROV ) - это гигантский вирус , который заражает морской бикосочецированный жгутиковый кафетерий Roenbergensis , член сообщества Microzooplankton.
История
[ редактировать ]Вирус был выделен из образцов морской воды, собранных из Мексиканского залива в течение 1989 по 1991 год, на жгутиковом хозяине, который был неправильно идентифицирован как принадлежащий роду Бодо ; Отсюда и первоначальное обозначение вируса как BV-PW1. Было показано, что вирус имеет диаметр около 300 нм и имеет сложную внутреннюю структуру, а также доказательство предполагаемой хвостовой структуры [ 2 ] Дальнейшая работа над вирусом показала, что хозяин был изолятом рода кафетерия и что геном имел содержание G+C ~ 34%. Дальнейший анализ показал, что геликаза вируса была филогенетически связана с таковыми, обнаруженными в семействе Asfarviridae , и что вирус общие свойства с членами нуклеоцитоплазматической группы крупных вирусов ДНК . [ 3 ] Crov имеет один из крупнейших геномов всех известных морских вирусов , состоящих из ~ 730 000 пар оснований двухцепочечной ДНК. [ 4 ] Среди его 544 предсказанных генов, кодирующих белок, несколько, которые обычно ограничены клеточными организмами, такими как трансляции факторы и ферменты для репарации ДНК и синтеза углеводов . Кров отдаленно связан с мимивирусом и принадлежит группе вирусов, известных как нуклеоцитоплазматические вирусы больших ДНК . [ 5 ] Кров сам паразитирован вируафагом под названием « Мавирус ». [ 6 ] [ 7 ]
Состав и структура вирусного белка
[ редактировать ]
Состав вирусного белка включает в себя 141 кодируемые белки, которые были идентифицированы в CROV, число, которое, как считается, находится в непосредственной близости от всего протеома вириона . Вирус упаковывает несколько отдельных групп белков, в том числе предположительно полный путь восстановления базового удаления (BER). Это самый обширный механизм восстановления ДНК, который еще наблюдался в вирусе. Это также первый вирус, который будет обнаружен с механочувствительным белком ионного канала , который может защитить геном от осмотического повреждения. [ 8 ] Зрелый CROV состоит из внешней оболочки белка диаметром 300 нм с икосаэдрической симметрией, основной липидной мембраной и внутреннего ядра, содержащего геном. [ 9 ] Разрешение вирусной структуры с помощью криоэлектронной микроскопии икосаэдрического вируса дало капсид с номером 499 и новой моделью для сборки капсида для гигантских вирусов. [ Цитация необходима ]
Вирусный геном
[ редактировать ]
Кров является единственным членом рода кафетериавируса в семье Mimiviridae в рамках предлагаемого порядка мегавирал. [ 10 ] Филогенетический анализ показывает, что вирус представляет собой нуклеоцитоплазматический большой ДНК -вирус (вирус NCLD). Мимивирус Acanthamoeba Polyphaga является его самым близким известным родственником, хотя два вируса имеют менее трети гомологичных генов. [ 4 ]
Вирусный геном представляет собой в первую очередь 618 000 пары основания, окруженная большими и очень повторяющимися повторами на обоих концах генома. Эти большие колпачки теоретизируются для защиты концов области кодирования белка, аналогично теломер у эукариот . Из-за производства транскрипционных генов, таких как тРНК-синтетаза, вирус способен модифицировать и регулировать трансляционное механизм хозяина, что приводит к тому, что CROV менее зависит от компонентов хозяина. 5% генома состоит из повторяющихся элементов, которые служат еще неизвестной цели. Наблюдалась область из 38 000 оснований, которая, как считается, связана с метаболизмом углеводов . Вирус содержит пути, которые помогают в биосинтезе KDO (3-дезокси-D-манно-октулозонат). Было выявлено наличие и экспрессия 10 генов, участвующих в синтезе гликопротеинов, что позволяет предположить, что CROV может потенциально участвовать в распознавании вирион-клеток. [ 4 ]
Кров также кодирует несколько других интересных белков. Он кодирует целый биосинтетический путь для создания 3-дезокси-D-манно-OCT-2-ULOSOIN , или KDO, которая является компонентом клеточных стенок грамотрицательных бактерий . Он также кодирует две разные фотолизазы , которые восстанавливают повреждение ДНК от ультрафиолетового излучения . Кров также кодирует белки, которые могут выполнять убиквитинирование , которая представляет собой посттрансляционную модификацию белков, которые функционируют в клеточной передаче сигналов. [ 11 ]
Вирусная репликация
[ редактировать ]
Вирусное размножение происходит в крупных конструкциях, известных как крупные цитоплазматические фабрики или вирусные фабрики. Это сайт, где репликация ДНК , транскрипция считается, что и сборка частиц. Эти фабрики также являются основными мишенями вирусного мавируса , в котором используется механизм Crov для воспроизведения. Mavirus - это круговой ДНК -вирус с двойным вирусом с двойным межкомпаниями 19 000 т.п.н. Мавиральная инфекция снижает гибель клеток хозяина, вмешиваясь в инфекцию и репликацию CROV. [ 12 ] Mavirus интегрируется в геном клеток кафетерия Roenbergensis и, таким образом, дает иммунитет населению. [ 13 ]
Кров входит в клетки посредством фагоцитоза . Оказавшись внутри клетки, выделяются капсид Crov и вирусные белки и геном. Crov не использует транскрипцию или трансляционную машину ячейки -хозяина. Он остается в цитоплазме, где образуется «вирусная фабрика» и повторяет независимо от ядра клеток -хозяина . Геном Crov не интегрирован в геном клеток -хозяина. CROV кодирует восемь субъединиц ДНК-зависимой РНК-полимеразы , а также кодирует по меньшей мере шесть факторов транскрипции, что позволяет ДНК транскрибировать геном в мРНК без использования белков клетки. Затем Кров может перевести мРНК в белки с помощью трансляционной машины клетки и с помощью собственной тРНК-синтетазы, тРНК и факторов инициации трансляции, чтобы точно настроить трансляцию с собственным преимуществом. [ 4 ]
Взаимодействие хоста
[ редактировать ]CROV заражает кафетерий Roenbergensis , который является морским зю -зоофлагеллятом. Кров является смертельным для клетки -хозяина. Это влияет на прибрежную экологию, потому что кафетерий Roenbergensis питается бактериями, обнаруженными в воде. Когда существует низкое количество кафетерия Roenbergensis из -за обширных инфекций CROW, бактериальные популяции растут в геометрической прогрессии. [ 4 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Duponchel, S. and Fischer, MG (2019) «Viva Lavidavirus! PLOS -патогены , 15 (3). Doi : 10.1371/journal.ppat.1007592 .
Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
- ^ Доктор Гарза; CA Suttle (1995). «Большие двухцепочечные ДНК-вирусы, которые вызывают лизис морского гетеротрофного нанофлагеллята ( Bodo sp .), Встречаются в природных морских вирусных сообществах» . Водная микробная экология . 9 (3): 203–210. doi : 10.3354/ame009203 .
- ^ Сент -Джон, Таня Мари (май 2003 г.). Характеристика большого вируса ДНК (BV-PW1), заражающий гетеротрофный морской нанофлагеллятный кафетерий SP (MSC). Ванкувер, Канада: Университет Британской Колумбии. doi : 10.14288/1.0090960 . HDL : 2429/14364 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и Матиас Г. Фишер; Майкл Дж. Аллен; Уильям Х. Уилсон; Кертис А. Саттл (2010). «Гигантский вирус с замечательным дополнением генов заражает морской зоопланктон» (PDF) . Труды Национальной академии наук . 107 (45): 19508–19513. BIBCODE : 2010PNAS..10719508F . doi : 10.1073/pnas.1007615107 . PMC 2984142 . PMID 20974979 .
- ^ Матиас Фишер. «Лабораторная лабораторная вирусология и микробиология: профиль: Матиас Фишер» . Сайтл лаборатория . Получено 2010-10-26 .
- ^ Джон Тиммер. «Вирус такой большой, что он получает вирусы» . Ars Technica . Получено 2010-03-05 .
- ^ Фишер, мг; Саттл, Калифорния (2011). «Вируфаг в начале больших транспозонов ДНК». Наука . 332 (6026): 231–234. Bibcode : 2011sci ... 332..231f . doi : 10.1126/science.1199412 . PMID 21385722 . S2CID 206530677 .
- ^ Фишер, Матиас; Келли, Изабель; Фостер, Леонард; Саттл, Кертис (октябрь 2014 г.). «Вирус вириона Catereria Roenbergensis (CROV) содержит сложный набор белков для транскрипции и репарации ДНК» . Вирусология . 466–467: 82–94. doi : 10.1016/j.virol.2014.05.029 . PMID 24973308 .
- ^ Xiao, C.; Фишер, мг; Bolotaulo, DM; Ulloa-Rondeau, N.; Авила, Джорджия; Саттл, Калифорния (июль 2017 г.). «Крио-Эм Реконструкция кафетерия капсида вируса Roenbergensis предполагает новый путь сборки гигантских вирусов» . Научные отчеты . 7 (1): 5484. Bibcode : 2017natsr ... 7.5484x . doi : 10.1038/s41598-017-05824-w . PMC 5511168 . PMID 28710447 . >
- ^ Колсон, P; Де Ламбаллери, х; Ютин, н; Asgari, S; Фанат, y; Бидеши, BK; Ченг, XW; Federici, Ba; Ван Эттен, JL; Кунин, ЭВ; La Scola, B; Раульт, D (декабрь 2013 г.). « Megavirales», предложенный новый порядок нуклеоцитоплазматических вирусов крупных ДНК » . Архив вирусологии . 158 (12): 2517–21. doi : 10.1007/s00705-013-1768-6 . PMC 4066373 . PMID 23812617 .
- ^ Ван Эттен, Джеймс (2011). «Еще один, действительно, действительно большой вирус» . Вирусы . 3 (12): 32–46. doi : 10.3390/v3010032 . PMC 3187590 . PMID 21994725 .
- ^ Фишер, Матиас; Саттл, Кертис (апрель 2011 г.). «Вируфаг в начале больших транспозонов ДНК». Наука . 332 (6026): 231–234. Bibcode : 2011sci ... 332..231f . doi : 10.1126/science.1199412 . PMID 21385722 . S2CID 206530677 .
- ^ Фишер М.Г., Хакл (декабрь 2016 г.). «Интеграция генома-хозяина и гигантская вирусная реактивация вируфейного мавируса». Природа . 540 (7632): 288–91. Bibcode : 2016natur.540..288f . doi : 10.1038/nature20593 . PMID 27929021 . S2CID 4458402 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Биоразнообразие: сложнее, чем вы думаете. Новый, гигантский вирус - это смешание старой определенности , экономист , 28 октября 2010 г.