АРФ4

АРФ4
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1Z6X
Идентификаторы
Псевдонимы	ARF4 , ARF2, фактор рибозилирования ADP 4
Внешние идентификаторы	Опустить : 601177 ; МГИ : 99433 ; Гомологен : 55593 ; GeneCards : ARF4 ; OMA : ARF4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	57,598,220 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 14 (mouse)
End	26,386,239 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	tibia; ; parietal pleura; ; visceral pleura; ; germinal epithelium; ; corpus epididymis; ; mucosa of sigmoid colon; ; pancreatic epithelial cell; ; parotid gland; ; epithelium of nasopharynx; ; stromal cell of endometrium;
	Top expressed in
	genital tubercle; ; tail of embryo; ; ventricular zone; ; right kidney; ; esophagus; ; embryo; ; embryo; ; lip; ; yolk sac; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	nucleotide binding; epidermal growth factor receptor binding; GTP binding; protein binding; GTPase activity;
Cellular component	cytosol; Golgi apparatus; membrane; dendritic spine; intracellular anatomical structure; ruffle membrane; extracellular exosome; extracellular matrix; cytoplasm; plasma membrane; glutamatergic synapse;
Biological process	protein ADP-ribosylation; small GTPase mediated signal transduction; negative regulation of apoptotic process; regulation of reactive oxygen species metabolic process; endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; activation of phospholipase D activity; protein transport; cell migration; vesicle-mediated transport; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum; transport; dendritic spine development; intracellular protein transport; Golgi to plasma membrane transport; epidermal growth factor receptor signaling pathway; brain development; learning; apical protein localization; establishment or maintenance of epithelial cell apical/basal polarity; response to axon injury; regulation of synapse organization; protein localization to cilium; regulation of postsynapse organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	378
	11843
	ENSG00000168374
	ENSMUSG00000021877
	P18085
	P61750
	НМ_001660
	НМ_007479
	НП_001651
	НП_031505
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор АДФ-рибозилирования 4 представляет собой белок , который у человека кодируется ARF4 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Фактор АДФ-рибозилирования 4 (ARF4) является членом семейства генов ARF человека. Эти гены кодируют небольшие белки, связывающие гуаниновые нуклеотиды, которые стимулируют АДФ-рибозилтрансферазную активность холерного токсина и играют роль в везикулярном транспорте, а также являются активаторами фосфолипазы D. Генные продукты включают 5 белков ARF и 11 ARF-подобных белков и составляют одно семейство. суперсемейства RAS. Белки ARF подразделяются на класс I (ARF1 и ARF3), класс II (ARF4 и ARF5) и класс III (ARF6). Члены каждого класса имеют общую организацию генов. Ген ARF4 занимает около 12 тыс. пар оснований и содержит шесть экзонов и пять интронов. ARF4 — самый разнородный член человеческих ARF. Сообщалось о противоречивых положениях карты в 3p14 или 3p21 для этого гена. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что ARF4 взаимодействует с рецептором эпидермального фактора роста. ^{[ 7 ]} и с мотивами RVxP . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000168374 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021877 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Монако Л., Мурта Дж.Дж., Ньюман К.Б., Цай СК, Мосс Дж., Воган М. (апрель 1990 г.). «Селективная амплификация мРНК и родственного псевдогена человеческого фактора АДФ-рибозилирования, гуанин-нуклеотид-зависимого белкового активатора холерного токсина» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 87 (6): 2206–10. Бибкод : 1990PNAS...87.2206M . дои : 10.1073/pnas.87.6.2206 . ПМК 53655 . ПМИД 2107548 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: фактор АДФ-рибозилирования ARF4 4» .
^ Ким С.В., Хаяши М., Ло Дж.Ф., Ян Ю, Ю Дж.С., Ли Дж.Д. (январь 2003 г.). «ADP-рибозилирование фактора 4, малая ГТФаза опосредует активацию фосфолипазы D2, зависимой от рецептора эпидермального фактора роста» . Ж. Биол. Хим . 278 (4): 2661–8. дои : 10.1074/jbc.M205819200 . ПМИД 12446727 .
^ Уорд, Хизер Х.; Браун-Глаберман, Урса; Ван, Цзин; Морита, Ёсико; Альпер, Сет Л.; Бедрик, Эдвард Дж.; Гаттоне, Винсент Х.; Деретич, Душанка; Вандингер-Несс, Анджела (20 июля 2011 г.). «Для цилиарного транспорта полицистина-1 необходимы консервативный сигнал и комплекс ГТФазы» . Молекулярная биология клетки . 22 (18): 3289–3305. дои : 10.1091/mbc.e11-01-0082 . ISSN 1059-1524 . ПМК 3172256 . ПМИД 21775626 .

Дальнейшее чтение

Ли Ф.Дж., Мосс Дж., Воган М. (1992). «Факторы АДФ-рибозилирования человека и лямблий (ARF) дополняют функцию ARF у Saccharomyces cerevisiae» . Ж. Биол. Хим . 267 (34): 24441–5. дои : 10.1016/S0021-9258(18)35786-7 . ПМИД 1447192 .
Кан Р.А., Керн Ф.Г., Кларк Дж., Гельманн Э.П., Рулка С. (1991). «Факторы АДФ-рибозилирования человека. Функционально консервативное семейство GTP-связывающих белков» . Ж. Биол. Хим . 266 (4): 2606–14. дои : 10.1016/S0021-9258(18)52288-2 . ПМИД 1899243 .
Стернс Т., Уиллингем М.К., Ботштейн Д., Кан Р.А. (1990). «Фактор АДФ-рибозилирования функционально и физически связан с комплексом Гольджи» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 87 (3): 1238–42. Бибкод : 1990PNAS...87.1238S . дои : 10.1073/pnas.87.3.1238 . ПМК 53446 . ПМИД 2105501 .
Воробьева Н, Протопопов А, Протопопова М, Кашуба В, Алликметс РЛ, Моди В, Забаровский ЭР, Кляйн Г, Киселев Л, Графодатский А (1995). «Локализация человеческих генов ARF2 и NCK и 13 других NotI-связывающих клонов на хромосоме 3 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Цитогенет. Клеточная генетика . 68 (1–2): 91–4. дои : 10.1159/000133898 . ПМИД 7956370 .
Оркл Л., Палмер Д.Д., Амхердт М., Ротман Дж.Э. (1993). «Сборка покрытых оболочкой пузырьков в аппарате Гольджи требует только коатомера и белков ARF из цитозоля». Природа . 364 (6439): 732–4. Бибкод : 1993Natur.364..732O . дои : 10.1038/364732a0 . ПМИД 8355790 . S2CID 4348442 .
Хелмс Дж.Б., Палмер DJ, Ротман Дж.Э. (1993). «Две отдельные популяции ARF, связанные с мембранами Гольджи» . Дж. Клеточная Биол . 121 (4): 751–60. дои : 10.1083/jcb.121.4.751 . ПМК 2119793 . ПМИД 8491770 .
Пардинас Дж., Панг З., Хоутон Дж., Палейвала В., Доннелли Р.Дж., Хаббард К., Смолл М.Б., Озер Х.Л. (1997). «Дифференциальная экспрессия генов при SV40-опосредованной иммортализации фибробластов человека». Дж. Селл. Физиол . 171 (3): 325–35. doi : 10.1002/(SICI)1097-4652(199706)171:3<325::AID-JCP11>3.0.CO;2-9 . ПМИД 9180902 . S2CID 3026138 .
Ким ХС (1998). «Ген человеческого фактора АДФ-рибозилирования 4 (ARF4). Положение на карте 3p14.1». Хромосома Res . 6 (8): 663. doi : 10.1023/A:1009230216005 . ПМИД 10099884 . S2CID 31829743 .
Лебеда Р.А., Хаун Р.С. (1999). «Клонирование и характеристика гена человеческого фактора АДФ-рибозилирования 4». Джин . 237 (1): 209–14. дои : 10.1016/S0378-1119(99)00290-5 . ПМИД 10524252 .
Шин О.Х., Росс А.Х., Михай И., Экстон Дж.Х. (1999). «Идентификация арфофилина, белка-мишени для GTP-связанных факторов АДФ-рибозилирования класса II» . Ж. Биол. Хим . 274 (51): 36609–15. дои : 10.1074/jbc.274.51.36609 . ПМИД 10593962 .
Невриви DJ, Петерсон В.Дж., Аврам Д., Измаил Дж.Э., Хансен С.Г., Доуэлл П., Хруби Д.Е., Доусон М.И., Лейд М. (2000). «Взаимодействие GRASP, белка, кодируемого новым геном, индуцируемым ретиноевой кислотой, с членами семейства цитогезиновых факторов обмена гуаниновых нуклеотидов» . Ж. Биол. Хим . 275 (22): 16827–36. дои : 10.1074/jbc.275.22.16827 . ПМИД 10828067 .
Прекерис Р., Дэвис Дж. М., Шеллер Р. Х. (2001). «Идентификация нового связывающего домена Rab11/25, присутствующего в белках Eferin и Rip» . Ж. Биол. Хим . 276 (42): 38966–70. дои : 10.1074/jbc.M106133200 . ПМИД 11481332 .
Ким С.В., Хаяши М., Ло Дж.Ф., Ян Й., Ю Дж.С., Ли Дж.Д. (2003). «ADP-рибозилирование фактора 4, малая ГТФаза опосредует активацию фосфолипазы D2, зависимой от рецептора эпидермального фактора роста» . Ж. Биол. Хим . 278 (4): 2661–8. дои : 10.1074/jbc.M205819200 . ПМИД 12446727 .
Катаяма Т, Имаидзуми К, Йонеда Т, Танигучи М, Хонда А, Манабе Т, Хитоми Дж, Ооно К, Баба К, Мията С, Мацузаки С, Такацудзи К, Тохьяма М (2004). «Роль ARF4L в рециркуляции между эндосомами и плазматической мембраной». Клетка. Мол. Нейробиол . 24 (1): 137–47. doi : 10.1023/B:CEMN.0000012719.12015.ec . ПМИД 15049518 . S2CID 6273028 .

Внешние ссылки

Местоположение генома человека ARF4 и страница сведений о гене ARF4 в браузере генома UCSC .

статья о гене на хромосоме 3 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000168374 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021877 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2107548-5] Монако Л., Мурта Дж.Дж., Ньюман К.Б., Цай СК, Мосс Дж., Воган М. (апрель 1990 г.). «Селективная амплификация мРНК и родственного псевдогена человеческого фактора АДФ-рибозилирования, гуанин-нуклеотид-зависимого белкового активатора холерного токсина» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 87 (6): 2206–10. Бибкод : 1990PNAS...87.2206M . дои : 10.1073/pnas.87.6.2206 . ПМК 53655 . ПМИД 2107548 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: фактор АДФ-рибозилирования ARF4 4» .

[pmid12446727-7] Ким С.В., Хаяши М., Ло Дж.Ф., Ян Ю, Ю Дж.С., Ли Дж.Д. (январь 2003 г.). «ADP-рибозилирование фактора 4, малая ГТФаза опосредует активацию фосфолипазы D2, зависимой от рецептора эпидермального фактора роста» . Ж. Биол. Хим . 278 (4): 2661–8. дои : 10.1074/jbc.M205819200 . ПМИД 12446727 .

[8] Уорд, Хизер Х.; Браун-Глаберман, Урса; Ван, Цзин; Морита, Ёсико; Альпер, Сет Л.; Бедрик, Эдвард Дж.; Гаттоне, Винсент Х.; Деретич, Душанка; Вандингер-Несс, Анджела (20 июля 2011 г.). «Для цилиарного транспорта полицистина-1 необходимы консервативный сигнал и комплекс ГТФазы» . Молекулярная биология клетки . 22 (18): 3289–3305. дои : 10.1091/mbc.e11-01-0082 . ISSN 1059-1524 . ПМК 3172256 . ПМИД 21775626 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]