ПЭГ10

ПЭГ10
Идентификаторы
Псевдонимы	PEG10 , EDR, HB-1, MEF3L, Mar2, Mart2, RGAG3, экспрессируемый по отцовской линии 10, SIRH1, RTL2
Внешние идентификаторы	Опустить : 609810 ; МГИ : 2157785 ; Гомологен : 116067 ; Генные карты : PEG10 ; ОМА : PEG10 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	94,669,695 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	4,760,517 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; right adrenal cortex; ; left adrenal cortex; ; nucleus accumbens; ; pituitary gland; ; placenta; ; Pars compacta; ; cerebellar vermis; ; hypothalamus;
	Top expressed in
	yolk sac; ; tail of embryo; ; genital tubercle; ; ventricular zone; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; superior frontal gyrus; ; dorsomedial hypothalamic nucleus; ; spermatocyte; ; supraoptic nucleus; ; primary visual cortex;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; zinc ion binding; protein binding; metal ion binding; nucleic acid binding; RNA binding;
Cellular component	cytoplasm; nucleus; cytosol;
Biological process	cell differentiation; negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway; apoptotic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	23089
	170676
	ENSG00000242265
	ENSMUSG00000092035
	Q86TG7
	Q7TN75
showНМ_015068 ; НМ_001040152 ; НМ_001172437 ; НМ_001172438 ; НМ_001184961 ;
	NM_001184962
	НМ_001040611 ; НМ_130877
showНП_001035242 ; НП_001165908 ; НП_001165909 ; НП_001171890 ; НП_001171891 ;
	NP_055883
	НП_001035701 ; НП_570947
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок PEG10, производный ретротранспозонов, представляет собой белок , который у человека кодируется PEG10 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Функция

Этот ген включает две перекрывающиеся рамки считывания одного и того же транскрипта, кодирующего разные изоформы. Более короткая изоформа имеет мотив цинкового пальца типа CCHC, содержащий последовательность, характерную для gag-белков большинства ретровирусов и некоторых ретротранспозонов, и частично функционирует за счет взаимодействия с членами семейства рецепторов TGF-бета. Более длинная изоформа имеет консенсусную последовательность DSG активного сайта протеазного домена белков pol. Более длинная изоформа является результатом трансляционного сдвига рамки -1, который также наблюдается у некоторых ретровирусов. Экспрессия этих двух изоформ происходит только за счет отцовского аллеля вследствие импринтинга. Повышенная экспрессия генов (что наблюдается по увеличению уровней мРНК) связана с гепатоцеллюлярной карциномой. ^{[ 8 ]}

PEG10 представляет собой импринтированный ген, экспрессируемый по отцовской линии, который экспрессируется во взрослых и эмбриональных тканях. ^{[ 9 ]} Наиболее заметное проявление происходит в плаценте. Этот ген высококонсервативен у разных видов млекопитающих и сохраняет гептануклеотид (GGGAAAC). Сообщалось, что этот ген играет роль в пролиферации, дифференцировке и апоптозе клеток. Сверхэкспрессия этого гена связана с несколькими злокачественными новообразованиями, такими как гепатоцеллюлярная карцинома и В-клеточный лимфоцитарный лейкоз. У нокаутных мышей, у которых отсутствовал этот ген, наблюдалась ранняя эмбриональная летальность с дефектами плаценты, что указывает на важность этого гена в эмбриональном развитии. Было показано, что в плацентарной ткани преэклампсии уровень PEG10 снижается. ^{[ 10 ]} и повышенная регуляция ^{[ 11 ]} подразумевая это как возможную причинную роль в возникновении преэклампсии.

Взаимодействия

Было показано, что PEG10 взаимодействует с SIAH2. ^{[ 12 ]} и СИАХ1 . ^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000242265 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000092035 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Оно Р., Кобаяши С., Вагацума Х., Айсака К., Кода Т., Канеко-Исино Т., Исино Ф. (апрель 2001 г.). «Ген, происходящий из ретротранспозона, PEG10, представляет собой новый импринтированный ген, расположенный на хромосоме 7q21 человека». Геномика . 73 (2): 232–7. дои : 10.1006/geno.2001.6494 . ПМИД 11318613 .
^ Брандт Дж., Шраут С., Фейт А.М., Фрошауэр А., Ханеке Т., Шультайс С., Гесслер М., Леймейстер С., Вольф Дж.Н. (январь 2005 г.). «Мобильные элементы как источник генетических инноваций: экспрессия и эволюция семейства неогенов, происходящих из ретротранспозонов, у млекопитающих». Джин . 345 (1): 101–11. дои : 10.1016/j.gene.2004.11.022 . ПМИД 15716091 .
^ Брандт Дж., Вейт А.М., Вольф Дж.Н. (август 2005 г.). «Семейство неофункционализированных генов ретротранспозонов Ty3/gypsy в геномах млекопитающих». Цитогенетические и геномные исследования . 110 (1–4): 307–17. дои : 10.1159/000084963 . ПМИД 16093683 . S2CID 38398479 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: PEG10, экспрессируемый по отцовской линии 10» .
^ «PEG10 по отцовской линии экспрессировал 10 [Homo sapiens (человек)]» . Опубликовано . Проверено 14 апреля 2015 г.
^ Лян XY, Чен X, Цзинь YZ, Чэнь XO, Чен QZ (18 декабря 2014 г.). «Экспрессия и значение импринтированного гена PEG10 в плаценте больных преэклампсией» . Генетика и молекулярные исследования . 13 (4): 10607–14. doi : 10.4238/2014.18.12.2014 . ПМИД 25526181 .
^ Чен Х, Сунь М, Чжао Г, Лю Дж, Гао В, Си С, Мэн Т (октябрь 2012 г.). «Повышенная экспрессия PEG10 в плацентах человека при преэкламптической беременности». Акта гистохимика . 114 (6): 589–93. дои : 10.1016/j.acthis.2011.11.003 . ПМИД 22137777 .
^ Jump up to: ^а ^б Окабе Х., Сато С., Фурукава Ю., Като Т., Хасегава С., Накадзима Ю., Ямаока Ю., Накамура Ю. (июнь 2003 г.). «Участие PEG10 в гепатоцеллюлярном канцерогенезе человека посредством взаимодействия с SIAH1». Исследования рака . 63 (12): 3043–8. ПМИД 12810624 .

Дальнейшее чтение

Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Дж.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод «двойного адаптера» для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107–13. дои : 10.1006/abio.1996.0138 . ПМИД 8619474 .
Ю В., Андерссон Б., Уорли К.С., Музный Д.М., Дин Ю., Лю В., Рикафренте Дж.Ю., Вентланд М.А., Леннон Дж., Гиббс Р.А. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геномные исследования . 7 (4): 353–8. дои : 10.1101/гр.7.4.353 . ПМК 139146 . ПМИД 9110174 .
Кикуно Р., Нагасе Т., Исикава К., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (июнь 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследования ДНК . 6 (3): 197–205. дои : 10.1093/dnares/6.3.197 . ПМИД 10470851 .
Вольф Дж., Кёртинг С., Шартл М. (февраль 2001 г.). «Окаменелости ретротранспозонов Ty3/Gypsy в геномах млекопитающих: эволюционировали ли они в новые клеточные функции?» . Молекулярная биология и эволюция . 18 (2): 266–70. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003801 . ПМИД 11158386 .
Сигэмото К., Бреннан Дж., Уоллс Э., Уотсон С.Дж., Стотт Д., Ригби П.В., Рейт А.Д. (октябрь 2001 г.). «Идентификация и характеристика гена млекопитающих, регулируемого в процессе развития, который использует запрограммированный сдвиг рамки рибосомы -1» . Исследования нуклеиновых кислот . 29 (19): 4079–88. дои : 10.1093/нар/29.19.4079 . ПМК 60235 . ПМИД 11574691 .
Смоллвуд А., Папагеоргиу А., Николаидес К., Элли М.К., Джим А., Наргунд Г., Оджа К., Кэмпбелл С., Банерджи С. (июль 2003 г.). «Временная регуляция экспрессии синцитина (HERV-W), материнского импринтированного PEG10 и SGCE в плаценте человека» . Биология размножения . 69 (1): 286–93. дои : 10.1095/biolreprod.102.013078 . ПМИД 12620933 .
Окабе Х., Сато С., Фурукава Ю., Като Т., Хасегава С., Накадзима Ю., Ямаока Ю., Накамура Ю. (июнь 2003 г.). «Участие PEG10 в гепатоцеллюлярном канцерогенезе человека посредством взаимодействия с SIAH1». Исследования рака . 63 (12): 3043–8. ПМИД 12810624 .
Цоу А.П., Чуан Ю.К., Су Цзюй, Ян К.В., Ляо Ю.Л., Лю В.К., Чиу Дж.Х., Чжоу К.К. (2004). «Сверхэкспрессия нового импринтированного гена PEG10 при гепатоцеллюлярной карциноме человека и при регенерации печени мышей». Журнал биомедицинской науки . 10 (6, часть 1): 625–35. дои : 10.1159/000073528 . ПМИД 14576465 . S2CID 202655065 .
Сузуки Ю., Ямасита Р., Широта М., Сакакибара Ю., Тиба Дж., Мидзусима-Сугано Дж., Накаи К., Сугано С. (сентябрь 2004 г.). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши обнаруживает гомологичную блочную структуру в областях промотора» . Геномные исследования . 14 (9): 1711–8. дои : 10.1101/гр.2435604 . ПМК 515316 . ПМИД 15342556 .
Люкс А., Бейл С., Маджети М., Бэррон С., Галлионе С.Дж., Кун Х.М., Берг Дж.Н., Киошис П., Марчук Д.А., Хафнер М. (март 2005 г.). «Человеческие ретровирусные белки, подобные gag- и gag-pol, взаимодействуют с киназой 1, подобной рецептору активина бета-рецептора трансформирующего фактора роста» . Журнал биологической химии . 280 (9): 8482–93. дои : 10.1074/jbc.M409197200 . ПМИД 15611116 .
Манктелоу Э., Шигемото К., Бриерли И. (2005). «Характеристика сигнала сдвига рамки Edr, примера запрограммированного сдвига рамки рибосомы -1 у млекопитающих» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (5): 1553–63. дои : 10.1093/nar/gki299 . ПМЦ 1065257 . ПМИД 15767280 .
Хе Х., Олеснаник К., Надь Р., Лиянараччи С., Прасад М.Л., Стратакис К.А., Клоос Р.Т., де ла Шапель А. (июль 2005 г.). «Аллельные вариации экспрессии генов в ткани щитовидной железы». Щитовидная железа . 15 (7): 660–7. дои : 10.1089/thy.2005.15.660 . ПМИД 16053381 .
Ху С, Сюн Дж, Чжан Л, Хуан Б, Чжан Ц, Ли Ц, Ян М, Ву Ю, У Ц, Шэнь Ц, Гао Ц, Чжан К, Сунь З, Лю Дж, Цзинь Ю, Тан Дж (август 2004 г.) ). «Активация PEG10 путем совместной стимуляции CXCR5 и CCR7 существенно способствует устойчивости к апоптозу в CD19+CD34+ B-клетках пациентов с острым и хроническим лимфоцитарным лейкозом B-клеточной линии». Клеточная и молекулярная иммунология . 1 (4): 280–94. ПМИД 16225771 .
Кимура К, Вакамацу А, Судзуки Ю, Ота Т, Нисикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секине М, Цуритани К, Вакагури Х, Исии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ириэ Р, Кушида Н, Ёнеяма Т , Оцука Р., Канда К., Ёкой Т., Кондо Х., Вагацума М., Муракава К., Исида С., Исибаши Т., Такахаши-Фуджи А., Танасе Т., Нагай К., Кикучи Х., Накаи К., Исогай Т., Сугано С. (январь 2006 г.) «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов» . Геномные исследования . 16 (1): 55–65 . 10.1101/ . ПМЦ 1356129 . ПМИД 16344560 гр.4039406
Ли СМ, Марголин А.А., Салас М., Мемео Л., Мансухани М., Хибшуш Х., Саболч М., Клинакис А., Тыко Б (январь 2006 г.). «PEG10 представляет собой ген-мишень c-MYC в раковых клетках» . Исследования рака . 66 (2): 665–72. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-05-1553 . ПМИД 16423995 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 7 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000242265 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000092035 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11318613-5] Оно Р., Кобаяши С., Вагацума Х., Айсака К., Кода Т., Канеко-Исино Т., Исино Ф. (апрель 2001 г.). «Ген, происходящий из ретротранспозона, PEG10, представляет собой новый импринтированный ген, расположенный на хромосоме 7q21 человека». Геномика . 73 (2): 232–7. дои : 10.1006/geno.2001.6494 . ПМИД 11318613 .

[pmid15716091-6] Брандт Дж., Шраут С., Фейт А.М., Фрошауэр А., Ханеке Т., Шультайс С., Гесслер М., Леймейстер С., Вольф Дж.Н. (январь 2005 г.). «Мобильные элементы как источник генетических инноваций: экспрессия и эволюция семейства неогенов, происходящих из ретротранспозонов, у млекопитающих». Джин . 345 (1): 101–11. дои : 10.1016/j.gene.2004.11.022 . ПМИД 15716091 .

[pmid16093683-7] Брандт Дж., Вейт А.М., Вольф Дж.Н. (август 2005 г.). «Семейство неофункционализированных генов ретротранспозонов Ty3/gypsy в геномах млекопитающих». Цитогенетические и геномные исследования . 110 (1–4): 307–17. дои : 10.1159/000084963 . ПМИД 16093683 . S2CID 38398479 .

[entrez-8] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: PEG10, экспрессируемый по отцовской линии 10» .

[9] «PEG10 по отцовской линии экспрессировал 10 [Homo sapiens (человек)]» . Опубликовано . Проверено 14 апреля 2015 г.

[10] Лян XY, Чен X, Цзинь YZ, Чэнь XO, Чен QZ (18 декабря 2014 г.). «Экспрессия и значение импринтированного гена PEG10 в плаценте больных преэклампсией» . Генетика и молекулярные исследования . 13 (4): 10607–14. doi : 10.4238/2014.18.12.2014 . ПМИД 25526181 .

[11] Чен Х, Сунь М, Чжао Г, Лю Дж, Гао В, Си С, Мэн Т (октябрь 2012 г.). «Повышенная экспрессия PEG10 в плацентах человека при преэкламптической беременности». Акта гистохимика . 114 (6): 589–93. дои : 10.1016/j.acthis.2011.11.003 . ПМИД 22137777 .

[pmid12810624-12] Jump up to: ^а ^б Окабе Х., Сато С., Фурукава Ю., Като Т., Хасегава С., Накадзима Ю., Ямаока Ю., Накамура Ю. (июнь 2003 г.). «Участие PEG10 в гепатоцеллюлярном канцерогенезе человека посредством взаимодействия с SIAH1». Исследования рака . 63 (12): 3043–8. ПМИД 12810624 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]