ДДХ6

ДДХ6
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1VEC, 2WAX, 2WAY, 4CRW, 4CT4, 4CT5, 5ANR
Идентификаторы
Псевдонимы	DDX6 , HLR2, P54, RCK, геликаза 6 DEAD-бокса, IDDILF, Rck/p54
Внешние идентификаторы	Опустить : 600326 ; МГИ : 104976 ; Гомологен : 3238 ; Генные карты : DDX6 ; OMA : DDX6 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 11 (human) Band 11q23.3 Start 118,747,763 bp End 118,791,164 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 9 (mouse) Band 9 A5.2|9 24.84 cM Start 44,516,189 bp End 44,552,028 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in ganglionic eminence Achilles tendon ventricular zone middle temporal gyrus superior vestibular nucleus amniotic fluid internal globus pallidus vena cava lateral nuclear group of thalamus trigeminal ganglion Top expressed in aortic valve ascending aorta gastrula saccule otic placode supraoptic nucleus mesenteric lymph nodes otic vesicle lacrimal gland superior cervical ganglion More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function RNA helicase activity nucleotide binding helicase activity protein domain specific binding protein binding nucleic acid binding hydrolase activity ATP binding RNA binding cadherin binding Cellular component cytoplasm RISC complex membrane P-body cytoplasmic stress granule mitochondrion sperm annulus P granule outer dense fiber heterochromatin nucleus cytosol nucleolus cytoplasmic ribonucleoprotein granule chromatoid body perinuclear region of cytoplasm concave side of sperm head Biological process negative regulation of neuron differentiation stem cell population maintenance RNA secondary structure unwinding P-body assembly exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA viral RNA genome packaging regulation of translation spermatogenesis spermatid differentiation Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 1656 13209 Вместе ENSG00000110367 ENSMUSG00000032097 ЮниПрот P26196 P54823 RefSeq (мРНК) НМ_001257191 НМ_004397 НМ_001110826 НМ_007841 НМ_181324 НМ_001357702 НМ_001357703 RefSeq (белок) НП_001244120 НП_004388 НП_001104296 НП_031867 НП_851841 НП_001344631 НП_001344632 Местоположение (UCSC) Чр 11: 118,75 – 118,79 Мб Chr 9: 44,52 – 44,55 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Вероятная АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX6 представляет собой фермент , который у человека кодируется DDX6 геном .

Белки DEAD-бокса , характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), представляют собой предполагаемые РНК-хеликазы. Они участвуют в ряде клеточных процессов, включающих изменение вторичной структуры РНК, таких как инициация трансляции, ядерный и митохондриальный сплайсинг, а также сборка рибосом и сплайсосом . Судя по характеру распределения, некоторые члены этого семейства, как полагают, участвуют в эмбриогенезе , сперматогенезе , а также росте и делении клеток . Этот ген кодирует белок DEAD box. Это может способствовать пролиферации клеток и канцерогенезу .

Дальнейшее чтение

• Акао Ю., Сето М., Ямамото К. и др. (1992). «Ген RCK, связанный с транслокацией t(11;14), отличается от гена MLL/ALL-1 с транслокациями t(4;11) и t(11;19)». Рак Рез . 52 (21): 6083–7. ПМИД   1394235 .
• Акао Ю., Марукава О., Морикава Х. и др. (1995). «Кандидатный протоонкогенный продукт rck/p54 представляет собой белок DEAD-бокс массой 54 килодальтон, дифференциально экспрессирующийся в тканях человека и мыши». Рак Рез . 55 (15): 3444–9. ПМИД   7614484 .
• Чжан WJ, Ву JY (1996). «Функциональные свойства p54, нового белка SR, активного в конститутивном и альтернативном сплайсинге» . Мол. Клетка. Биол . 16 (10): 5400–8. дои : 10.1128/MCB.16.10.5400 . ПМК   231539 . ПМИД   8816452 .
• Акияма К., Акао Ю., Ёкояма М. и др. (1999). «Экспрессия двух генов мертвого бокса (DDX1 и DDX6) не зависит от экспрессии MYCN в клеточных линиях нейробластомы человека» . Биохим. Мол. Биол. Межд . 47 (4): 563–8. дои : 10.1080/15216549900201603 . ПМИД   10319407 . S2CID   45609314 .
• Накагава Ю., Морикава Х., Хирата И. и др. (1999). «Сверхэкспрессия rck/p54, белка DEAD box, в колоректальных опухолях человека» . Бр. Дж. Рак . 80 (5–6): 914–7. дои : 10.1038/sj.bjc.6690441 . ПМЦ   2362290 . ПМИД   10360675 .
• Смилли Д.А., Соммервилл Дж. (2002). «РНК-хеликаза p54 (DDX6) представляет собой челночный белок, участвующий в ядерной сборке хранящихся частиц мРНП». Дж. Клеточная наука . 115 (Часть 2): 395–407. дои : 10.1242/jcs.115.2.395 . ПМИД   11839790 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Миядзи К., Накагава Ю., Мацумото К. и др. (2003). «Сверхэкспрессия белка DEAD-бокс/РНК-хеликазы, rck/p54, в гепатоцитах человека пациентов с хроническим гепатитом, связанным с вирусом гепатита С, и его влияние на гепатоцеллюлярный канцерогенез». J. Вирусный гепатит . 10 (4): 241–8. дои : 10.1046/j.1365-2893.2003.00447.x . ПМИД   12823589 . S2CID   36830183 .
• Мацуи Т., Хогецу К., Акао Ю. и др. (2004). «Кристаллизация и рентгеновский анализ N-концевого корового домена РНК-хеликазы DEAD-box человека, связанной с опухолью, rck/p54». Акта Кристаллогр. Д. ​ 60 (Часть 1): 156–9. Бибкод : 2004AcCrD..60..156M . дои : 10.1107/S0907444903024223 . ПМИД   14684915 .
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД   14702039 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Фенгер-Грён М., Филлман С., Норрильд Б., Люкке-Андерсен Дж. (2006). «Множественные факторы обработки тела и ARE-связывающий белок TTP активируют декапирование мРНК» . Мол. Клетка . 20 (6): 905–15. doi : 10.1016/j.molcel.2005.10.031 . ПМИД   16364915 .
• Мацуи Т., Хогецу К., Усукура Дж. и др. (2006). «Структурное понимание человеческого белка DEAD-box rck/p54 в распознавании его субстрата с конформационными изменениями» . Генные клетки . 11 (4): 439–52. дои : 10.1111/j.1365-2443.2006.00951.x . ПМИД   16611246 . S2CID   29643976 .
• Вичроски М.Дж., Робб ГБ, Рана Т.М. (2006). «Факторы рестрикции ретровирусов человека APOBEC3G и APOBEC3F локализуются в органах, обрабатывающих мРНК» . ПЛОС Патог . 2 (5): е41. doi : 10.1371/journal.ppat.0020041 . ПМЦ   1458959 . ПМИД   16699599 .
• Чу С.И., Рана ТМ (2006). «Репрессия трансляции в клетках человека путем подавления генов, индуцированного микроРНК, требует RCK/p54» . ПЛОС Биол . 4 (7): е210. дои : 10.1371/journal.pbio.0040210 . ПМЦ   1475773 . ПМИД   16756390 .
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ   1847948 . ПМИД   17353931 .
• Нонхофф У., Ральсер М., Вельцель Ф. и др. (2007). «Атаксин-2 взаимодействует с РНК-хеликазой DEAD/H-Box DDX6 и взаимодействует с P-тельцами и стрессовыми гранулами» . Мол. Биол. Клетка . 18 (4): 1385–96. дои : 10.1091/mbc.E06-12-1120 . ПМК   1838996 . ПМИД   17392519 .