Sema6a

Sema6a
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	3AFC, 3AL8, 3OKW, 3OKY
Идентификаторы
Псевдонимы	Sema6a , ht018, sema, sema6a1, semaq, via, semaphorin 6a
Внешние идентификаторы	Омим : 605885 ; MGI : 1203727 ; Гомологен : 32426 ; Genecards : sema6a ; OMA : sema6a - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	116,574,823 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	47,501,937 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	inferior ganglion of vagus nerve; ; external globus pallidus; ; subthalamic nucleus; ; corpus callosum; ; jejunal mucosa; ; lateral nuclear group of thalamus; ; pars reticulata; ; ventral tegmental area; ; superior vestibular nucleus; ; pons;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; genital tubercle; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; yolk sac; ; Dermatocranium; ; membranous bone; ; epiblast; ; mandible; ; cartilage of the septum; ; medial geniculate nucleus;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	protein binding; semaphorin receptor binding; chemorepellent activity;
Cellular component	integral component of membrane; axon; plasma membrane; membrane; integral component of plasma membrane; extracellular space;
Biological process	animal organ morphogenesis; multicellular organism development; cell surface receptor signaling pathway; cell differentiation; cytoskeleton organization; nervous system development; apoptotic process; axon guidance; positive regulation of neuron migration; negative regulation of sprouting angiogenesis; negative regulation of angiogenesis; negative regulation of cell adhesion involved in sprouting angiogenesis; cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus; negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade; negative regulation of vascular endothelial growth factor signaling pathway; neural crest cell migration; positive regulation of cell migration; negative regulation of axon extension involved in axon guidance; negative chemotaxis; semaphorin-plexin signaling pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	57556
	20358
	ENSG00000092421
	Ensmusg00000019647
	Q9H2E6
	O35464
	NM_001300780 ; NM_020681 ; NM_020796
	NM_018744 ; NM_001311097
	NP_001287709 ; NP_065847
	NP_001298026 ; NP_061214
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Семфорин-6A -это белок , который у людей кодируется SEMA6A геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

В меланоцитарных клетках экспрессия гена SEMA6A может регулироваться MITF . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000092421 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000019647 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Чжоу Л., Уайт Ф.А., Ленц С.И., Райт Д.Е., Фишер Д.А., Снайдер В.Д. (сентябрь 1997). «Клонирование и экспрессия нового мышиного семафорина со структурным сходством с семафорином насекомых I». Мол -клеточные нейроски . 9 (1): 26–41. doi : 10.1006/mcne.1997.0607 . PMID 9204478 . S2CID 38730386 .
^ Klostermann A, Lutz B, Gertler F, Behl C (январь 2001). «Ортологичные белки семафорина 6A-1 человека и мыши (SEMA6A-1/SEMA6A-1) связываются с включенным/сосудимулированным фосфопротеин белком (EVL) с помощью нового карбоксильно-концевого зисиноподобного домена» . J Biol Chem . 275 (50): 39647–53. doi : 10.1074/jbc.m006316200 . PMID 10993894 .
^ «Ген Entrez: Sema6a sema -домен, трансмембранный домен (TM) и цитоплазматический домен, (Semaphorin) 6a» .
^ Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, et al. (2008). «Новые мишени MITF, идентифицированные с использованием двухэтапной стратегии микрочипов ДНК» . Пигментная клеточная меланома Res . 21 (6): 665–76. doi : 10.1111/j.1755-148x.2008.00505.x . PMID 19067971 . S2CID 24698373 .

Дальнейшее чтение

Прислей С., Мозетти С., Филипп Ф. и др. (2008). «От плазматической мембраны до цитоскелета: новая функция для Semaphori 6a » Мол Рак другой 7 (1): 233–4 Doi : 10.1158/1535-7163.mct- 07-0 18187809PMID
Като М., Като М (2007). «Сравнительная интеграмика по неканоническим молекулам сигнальной полярности Wnt или плоской клеток: механизм транскрипции PTK7 при колоректальном раке и механизм SEMA6A в недифференцированных ES-клетках» . Инт. J. Mol. Медик 20 (3): 405–9. doi : 10.3892/ijmm.20.3.405 . PMID 17671748 .
Gautier G, De Saint-Vis B, Sénéchal B, et al. (2006). «Семфорин Sema6a класса 6 индуцируется интерфероном-гаммой и определяет статус активации клеток Лангерганса, наблюдаемые в патологических ситуациях» . Являюсь. J. Pathol . 168 (2): 453–65. doi : 10.2353/ajpath.2006.050288 . PMC 1606484 . PMID 16436660 .
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, et al. (2007). «Последовательность сигнала и ловушка ключевых слов в Silico для отбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек кДНК с олиго» . ДНК Res . 12 (2): 117–26. doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК» . НАТ Генет . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Накаяма М., Кикуно Р., Охара О (2003). «Белковые взаимодействия между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК» . Геном Res . 12 (11): 1773–84. doi : 10.1101/gr.406902 . PMC 187542 . PMID 12421765 .
Nagase T, Kikuno R, Ishikawa Ki, et al. (2000). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XVI. Полные последовательности из 150 новых клонов кДНК из мозга, которые код для крупных белков in vitro» . ДНК Res . 7 (1): 65–73. doi : 10.1093/dnares/7.1.65 . PMID 10718198 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 5 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000092421 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000019647 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9204478-5] Чжоу Л., Уайт Ф.А., Ленц С.И., Райт Д.Е., Фишер Д.А., Снайдер В.Д. (сентябрь 1997). «Клонирование и экспрессия нового мышиного семафорина со структурным сходством с семафорином насекомых I». Мол -клеточные нейроски . 9 (1): 26–41. doi : 10.1006/mcne.1997.0607 . PMID 9204478 . S2CID 38730386 .

[pmid10993894-6] Klostermann A, Lutz B, Gertler F, Behl C (январь 2001). «Ортологичные белки семафорина 6A-1 человека и мыши (SEMA6A-1/SEMA6A-1) связываются с включенным/сосудимулированным фосфопротеин белком (EVL) с помощью нового карбоксильно-концевого зисиноподобного домена» . J Biol Chem . 275 (50): 39647–53. doi : 10.1074/jbc.m006316200 . PMID 10993894 .

[entrez-7] «Ген Entrez: Sema6a sema -домен, трансмембранный домен (TM) и цитоплазматический домен, (Semaphorin) 6a» .

[pmid19067971-8] Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, et al. (2008). «Новые мишени MITF, идентифицированные с использованием двухэтапной стратегии микрочипов ДНК» . Пигментная клеточная меланома Res . 21 (6): 665–76. doi : 10.1111/j.1755-148x.2008.00505.x . PMID 19067971 . S2CID 24698373 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]