неохромосома
Неохромосома хромосома — это , которая обычно не встречается в природе. Неохромосомы, ассоциированные с раком, обнаруживаются в некоторых раковых клетках. [ 1 ] [ 2 ]
Неохромосомы также были созданы с использованием генной инженерии . методов [ 3 ] [ 4 ]
Неохромосомы, связанные с раком
[ редактировать ]Неохромосомы, ассоциированные с раком, представляют собой гигантские сверхкомплектные хромосомы. Они содержат мутации, вызывающие определенные виды рака (высоко амплифицированные копии ключевых онкогенов , таких как MDM2 , CDK4 , HMGA2 ). Это могут быть кольцевые или линейные хромосомы. У них есть функциональные центромеры и теломеры , если они линейные. В целом они редки и встречаются примерно в 3% случаев рака, но часто встречаются при некоторых редких видах рака. Например, они обнаруживаются в 90% паростальных остеосарком . [ 2 ]
Неохромосомы из хорошо- и дедифференцированной липосаркомы были изучены с высоким разрешением путем выделения (с использованием сортировки потока) и секвенирования, а также микроскопии. Они состоят из сотен фрагментов ДНК, часто происходящих из нескольких нормальных хромосом, сшитых случайным образом, и содержат высокие уровни амплификации ДНК (~30-60 копий некоторых генов). [ 2 ]
Используя статистические выводы и математическое моделирование , процесс первоначального формирования и развития неохромосом стал более ясным. Фрагменты ДНК, образующиеся в результате хромотриптического разрушения хромосомы 12, подвергаются репарации ДНК с образованием кольцевой хромосомы . Он подвергается сотням циклических циклов разрыв-слияние-мостик , вызывающих случайную амплификацию и удаление ДНК с отбором на амплификацию ключевых онкогенов. Во время этого процесса каким-то образом добавляется ДНК из дополнительных хромосом. Эрозия центромер может привести к образованию неоцентромеров или захвату новых нативных центромер из других хромосом. Процесс заканчивается, когда неохромосома образует линейную хромосому после захвата теломерных колпачков, которые могут быть получены хромотриптически.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Гарсед, Д.В.; Маршалл, О.Дж.; Корбин, VDA; Сюй, А.; Ди Стефано, Л.; Шредер, Дж.; Ли, Дж.; Фэн, ЗП; Ким, BW; Коварски, М.; Лансделл, Б.; Бруквелл, Р.; Миклебост, О.; Меза-Сепеда, Л.; Холлоуэй, Эй Джей; Педетур, Ф.; Чу, ХА; Дамор, Массачусетс; Динс, Эй Джей; Папенфусс, АТ; Томас, DM (2014). «Архитектура и эволюция раковых неохромосом» . Раковая клетка . 26 (5): 653–67. дои : 10.1016/j.ccell.2014.09.010 . ПМИД 25517748 .
- ^ Jump up to: а б с Гарсед, Д.В.; Холлоуэй, Эй Джей; Томас, DM (2009). «Рак-ассоциированные неохромосомы: новый механизм онкогенеза». Биоэссе . 31 (11): 1191–200. doi : 10.1002/bies.200800208 . ПМИД 19795405 . S2CID 42141654 .
- ^ Каллауэй, Э. (2014). «Обнаружена первая синтетическая дрожжевая хромосома» . Природа . дои : 10.1038/nature.2014.14941 . S2CID 88104990 .
- ^ Алан Бойл (27 марта 2014 г.). «Генные гуру создают синтетическую дрожжевую хромосому с нуля» . Новости Эн-Би-Си.