Thoc5

Thoc5
Идентификаторы
Псевдонимы	Thoc5 , C22orf19, FMIP, PK1.3, FSAP79, THO Complex 5
Внешние идентификаторы	Омим : 612733 ; MGI : 1351333 ; Гомологен : 37836 ; GeneCards : Thoc5 ; OMA : THOC5 - Ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 22 (human)
End	29,555,216 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	4,878,867 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	gastric mucosa; ; stromal cell of endometrium; ; Achilles tendon; ; muscle layer of sigmoid colon; ; popliteal artery; ; tibial arteries; ; body of uterus; ; ascending aorta; ; right coronary artery; ; apex of heart;
	Top expressed in
	superior cervical ganglion; ; otic vesicle; ; neural layer of retina; ; interventricular septum; ; seminiferous tubule; ; spermatid; ; tail of embryo; ; spermatocyte; ; ventricular zone; ; epiblast;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	protein binding; RNA binding; mRNA binding;
Cellular component	cytoplasm; THO complex; THO complex part of transcription export complex; transcription export complex; nucleus; nucleoplasm; nuclear chromosome;
Biological process	positive regulation of DNA-templated transcription, elongation; primitive hemopoiesis; mRNA processing; cell differentiation; mRNA transport; viral mRNA export from host cell nucleus; negative regulation of DNA damage checkpoint; monocyte differentiation; RNA splicing; RNA export from nucleus; mRNA export from nucleus; mRNA 3'-end processing;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8563
	107829
	ENSG00000100296
	Ensmusg00000034274
	Q13769
	Q8BKT7
	NM_001002877 ; NM_001002878 ; NM_001002879 ; NM_003678
	NM_172438
	NP_001002877 ; NP_001002878 ; NP_001002879 ; NP_003669
	NP_766026
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Комплексная субъединица 5 гомолог - это белок , который у людей кодируется ThoC5 геном . Thocs является членом комплекса, который является подкоимплексом комплекса транскрипции/экспорта (TREX).

THOC5 эволюционно сохраняется у более высоких эукариот , однако точная роль THOC5 в транскрипции и экспорте мРНК по -прежнему неясна. ThoC5 фосфорилируется несколькими протеинкиназами в нескольких остатках на внеклеточных стимулах. К ним относятся стимуляция с факторами роста/ цитокинами/ хемокинами или реагентами повреждения ДНК. Кроме того, THOC5 является субстратом для нескольких онкогенных тирозинкиназ, предполагая, что THOC5 может участвовать в развитии рака.

Недавние данные о нокаутировании мыши THOC5 показывают, что THOC5 является важным элементом поддержания стволовых клеток и фактора роста /опосредованной цитокином дифференцировкой /пролиферации. Кроме того, истощение THOC5 влияет на менее 1% от общего экспорта мРНК в устойчивом состоянии, однако это влияет на более чем 90% генов, индуцированных фактором роста/цитокинов. Thoc5, тем самым способствует 3'-обработке и/или экспорту генов с непосредственным рано, индуцированным внеклеточными стимулами. Эти исследования дают новое понимание связи между комплексом экспорта мРНК и немедленным ответом генов. Данные из этих исследований также показывают, что THOC5 может быть полезным инструментом для изучения биологии стволовых клеток, для изменения процессов дифференцировки и терапии раком . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}

^{[ 17 ]}^{[ 18 ]}^{[ 19 ]}^{[ 20 ]}^{[ 21 ]}^{[ 22 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000100296 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000034274 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Tran Ddh, Koch A и Tamura T. thoc5, член комплекса экспорта мРНК: новая связь между механизмом экспорта мРНК и путями передачи сигнала в пролиферации и дифференцировке клеток. Коточная связь и сигнализация 2014, 12: 3
^ Тран Д.Д., Саран С., Диттрих-Брейхольц О., Уильямсон А.Дж., Клебба-Фарбер С., Кох А., Крачт М., Уэттон А.Д., Тамура Т. (2013). сложный, способствует дифференцировке макрофагов, вызванной M-CSF. Клеточная гибель и болезнь 4: E879
^ Саран С., Тран Д.Д., Клебба-Фарбер С., Моран-Лосада П., Вилманн Л., Кох А., Чопра Х, Пабст О., Хоффманн А., Клопфлеш Р., Тамура Т. (2013) Thoc5, член экспортного комплекса мРНК, участвует в обработке подмножества бесценных/интегрированных (WNT) целевых мРНК и целостности эпителиального барьера кишечника. BMC Cell Biol 14: 51
^ Griaud, F., Pierce, A., Гонсалес Санчес, М.Б., Скотт, М., Авраам, С.А., Холиоаке, Т.Л., Тран, Д.Д., Тамура, Т. и Уэттон, А.Д. (2013). Путь от лейкозных онкогенов и хемокинов стволовых клеток до РНК -обработки через THOC5. Лейкемия 27, 932-940.
^ Katahira J, Okuzaki D, Inoue H, Yoneda Y, Maehara K, Ohkawa Y (2013) Компонент человека Thoc5 влияет на альтернативный выбор места полиаденилирования путем набора коэффициента расщепления млекопитающих I. Изучение нуклеиновых кислот 41: 7060-7072
^ Katahira J, Inoue H, Hurt E, Yoneda Y (2009) Адаптер Aly и совместный адаптор ThoC5 в ядерном экспорте, опосредованном TAP-P15, экспорта мРНК HSP70. Embo Journal 28: 556-567
^ Ramachandran S., Tran Dd., Klebba-Faerber S., Kardinal C., Whetton Ad., Tamura T. Атаксия-телеаниэктазия-мутация (ATM) киназа опосредованной реакцией на повреждение ДНК подавляет мРНК-связывающий потенциал Thoc5. РНК 17 (11): 1957-66, 2011
^ Гурия А., Тран Д.Д., Рамачандран С., Кох А., Боункари О., Датта П., Хаузер Х., Тамура Т. Идентификация мРНК, которые сплайсируются, но не экспортируются в цитоплазму в отсутствие THOC5 в фибробластах мыши эмбрио. , РНК, 2011 17: 00-00.
^ Mancini, A., Niemann-Seyde, SC, Pankow, R., El Bounkari, O., Klebba-Färber, S., Koch, A., Ejaworska, E., Spooncer, E., Gruber, AD, Whetton , AD, Tamura, T. (2010) THOC5/FMIP, белок комплекса экспорта мРНК TREX, необходим для выживания примитивных примитивных клеток гемопоэтических примитивных клеток in vivo. BMC Biology 8, 1.
^ Mancini, A., El Bounkari, O., Norrenbrock, AF., Scherr, M., Schaefer, D., Eder M., Banham, AH, Pulford, K., Lyne, L., Whetton AD и Tamura , T. (2007) FMIP контролирует приверженность линии адипоцитов клеток C2C12 путем модуляции C/Ebpalpha. Онкоген 26, 1020-1027.
^ Манчини А., Кох А., Уэттон А.Д. и Тамура Т. (2004). Субстрат рецептора M-CSF и взаимодействующий белок FMIP определяется в его субклеточной локализации с помощью C-опосредованной фосфорилированием и опосредованной M-CSF-опосредованным дифференциация. Онкоген, 23, 6581-9.
^ Tamura, T., Mancini, A., Joos, H., Koch, A., Hakim, C., Dumanski, J., Weidner, KM и Niemann, H. (1999), FMIP, новый FMS-Interacting Белок, поражает гранулоциты/макрофаги. Онкоген, 18, 6488-6495.
^ Strasser K, Masuda S, Mason P, Pfannstiel J, Oppizzi M, Rodriguez-Navarro S, Rondon AG, Aguilera A, Struhl K, Reed R, Hurt E (май 2002 г.). «Trex - это консервативная сложная транскрипция связи с экспортом РНК Messenger». Природа . 417 (6886): 304–8. Bibcode : 2002natur.417..304S . doi : 10.1038/nature746 . PMID 11979277 . S2CID 1112194 .
^ Xie YG, Han FY, Peyrard M, Ruttlege Mh, Fransson I, Dejong P, Collins J, Dunham I, Nordenskjold M, Dumanski JP (декабрь 1993 г.). «Клонирование нового анонимного гена из мегабаз-диапазона YAC и Cosmid Contig в области нейрофиброматоза типа 2/менингиомы на хромосоме человека 22Q12». Hum Mol Genet . 2 (9): 1361–8. doi : 10.1093/hmg/2.9.1361 . PMID 8242058 .
^ Нагасе Т., Ишикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Мияджима Н., Танака А., Котани Х, Номура Н., Охара О (июль 1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIII. Полные последовательности из 100 новых клонов кДНК из мозга, которые код для крупных белков in vitro» . ДНК Res . 6 (1): 63–70. doi : 10.1093/dnares/6.1.63 . PMID 10231032 .
^ Карни Л., Пирс А., Риджнен М., Гонсалес Санчес М.Б., Хамза Х.Г., Чжан Л., Тамура Т., Уэттон А.Д. (декабрь 2008). «THOC5 пары передачи сигналов рецептора M-CSF с экспрессией фактора транскрипции». Клеточный сигнал . 21 (2): 309–16. doi : 10.1016/j.cellsig.2008.10.018 . PMID 19015024 .
^ Пирс А., Карни Л., Хамза Х.Г., Гриффитс Дж.Р., Чжан Л., Уэттон Б.А., Гонсалес Санчес М.Б., Тамура Т., Стернберг Д., Уэттон А.Д. (май 2008 г.). «Белок сплайсосомы ThoC5: мишень для лейкамогенных тирозинкиназ, которые влияют на оборот иннозитол липидов». Br J Gaematol . 141 (5): 641–50. doi : 10.1111/j.1365-2141.2008.07090.x . PMID 18373705 . S2CID 21122818 .
^ "Entrez Gene: Thoc5 Tho Complex 5" .

Дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-капитализация: простой метод замены структуры крышки эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Бональдо М.Ф., Леннон Г., Соарс М.Б. (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов» . Геном Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). «Строительство и характеристика обогащенной полной длиной и библиотекой кДНК с 5'-эндом». Ген . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/s0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Tamura T, Mancini A, Joos H, et al. (2000). «FMIP, новый FMS-взаимодействующий белок, влияет на дифференцировку гранулоцитов/макрофагов». Онкоген . 18 (47): 6488–95. doi : 10.1038/sj.onc.1203062 . PMID 10597251 . S2CID 32568059 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК» . НАТ Генет . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Манчини А., Кох А., Уэттон А.Д., Тамура Т. (2004). «Субстрат рецептора M-CSF и взаимодействующий белок FMIP определяются в его субклеточной локализации с помощью C-опосредованной фосфорилированием протеинкиназы и тем самым потенцирует дифференцировку опосредованной M-CSF». Онкоген . 23 (39): 6581–9. doi : 10.1038/sj.onc.1207841 . PMID 15221008 . S2CID 21923924 .
Коллинз JE, Wright CL, Edwards CA, et al. (2005). «Подход, основанный на аннотациях генома к клонированию человека Orfeome» . Геном биол . 5 (10): R84. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC 545604 . PMID 15461802 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Carroll JS, Liu XS, Brodsky AS, et al. (2005). «Картографирование связывания рецептора эстрогена в масштабах хромосомы выявляет регуляцию дальнего действия, требующая белка вилки Foxa1» . Клетка . 122 (1): 33–43. doi : 10.1016/j.cell.2005.05.008 . PMID 16009131 .
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). «Глобальная динамика фосфорилирования в Global, in vivo и сайт в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 .

Внешние ссылки

Thoc5 на биосигнализации

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000100296 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000034274 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[5] Tran Ddh, Koch A и Tamura T. thoc5, член комплекса экспорта мРНК: новая связь между механизмом экспорта мРНК и путями передачи сигнала в пролиферации и дифференцировке клеток. Коточная связь и сигнализация 2014, 12: 3

[6] Тран Д.Д., Саран С., Диттрих-Брейхольц О., Уильямсон А.Дж., Клебба-Фарбер С., Кох А., Крачт М., Уэттон А.Д., Тамура Т. (2013). сложный, способствует дифференцировке макрофагов, вызванной M-CSF. Клеточная гибель и болезнь 4: E879

[7] Саран С., Тран Д.Д., Клебба-Фарбер С., Моран-Лосада П., Вилманн Л., Кох А., Чопра Х, Пабст О., Хоффманн А., Клопфлеш Р., Тамура Т. (2013) Thoc5, член экспортного комплекса мРНК, участвует в обработке подмножества бесценных/интегрированных (WNT) целевых мРНК и целостности эпителиального барьера кишечника. BMC Cell Biol 14: 51

[8] Griaud, F., Pierce, A., Гонсалес Санчес, М.Б., Скотт, М., Авраам, С.А., Холиоаке, Т.Л., Тран, Д.Д., Тамура, Т. и Уэттон, А.Д. (2013). Путь от лейкозных онкогенов и хемокинов стволовых клеток до РНК -обработки через THOC5. Лейкемия 27, 932-940.

[9] Katahira J, Okuzaki D, Inoue H, Yoneda Y, Maehara K, Ohkawa Y (2013) Компонент человека Thoc5 влияет на альтернативный выбор места полиаденилирования путем набора коэффициента расщепления млекопитающих I. Изучение нуклеиновых кислот 41: 7060-7072

[10] Katahira J, Inoue H, Hurt E, Yoneda Y (2009) Адаптер Aly и совместный адаптор ThoC5 в ядерном экспорте, опосредованном TAP-P15, экспорта мРНК HSP70. Embo Journal 28: 556-567

[11] Ramachandran S., Tran Dd., Klebba-Faerber S., Kardinal C., Whetton Ad., Tamura T. Атаксия-телеаниэктазия-мутация (ATM) киназа опосредованной реакцией на повреждение ДНК подавляет мРНК-связывающий потенциал Thoc5. РНК 17 (11): 1957-66, 2011

[12] Гурия А., Тран Д.Д., Рамачандран С., Кох А., Боункари О., Датта П., Хаузер Х., Тамура Т. Идентификация мРНК, которые сплайсируются, но не экспортируются в цитоплазму в отсутствие THOC5 в фибробластах мыши эмбрио. , РНК, 2011 17: 00-00.

[13] Mancini, A., Niemann-Seyde, SC, Pankow, R., El Bounkari, O., Klebba-Färber, S., Koch, A., Ejaworska, E., Spooncer, E., Gruber, AD, Whetton , AD, Tamura, T. (2010) THOC5/FMIP, белок комплекса экспорта мРНК TREX, необходим для выживания примитивных примитивных клеток гемопоэтических примитивных клеток in vivo. BMC Biology 8, 1.

[14] Mancini, A., El Bounkari, O., Norrenbrock, AF., Scherr, M., Schaefer, D., Eder M., Banham, AH, Pulford, K., Lyne, L., Whetton AD и Tamura , T. (2007) FMIP контролирует приверженность линии адипоцитов клеток C2C12 путем модуляции C/Ebpalpha. Онкоген 26, 1020-1027.

[15] Манчини А., Кох А., Уэттон А.Д. и Тамура Т. (2004). Субстрат рецептора M-CSF и взаимодействующий белок FMIP определяется в его субклеточной локализации с помощью C-опосредованной фосфорилированием и опосредованной M-CSF-опосредованным дифференциация. Онкоген, 23, 6581-9.

[16] Tamura, T., Mancini, A., Joos, H., Koch, A., Hakim, C., Dumanski, J., Weidner, KM и Niemann, H. (1999), FMIP, новый FMS-Interacting Белок, поражает гранулоциты/макрофаги. Онкоген, 18, 6488-6495.

[pmid11979277-17] Strasser K, Masuda S, Mason P, Pfannstiel J, Oppizzi M, Rodriguez-Navarro S, Rondon AG, Aguilera A, Struhl K, Reed R, Hurt E (май 2002 г.). «Trex - это консервативная сложная транскрипция связи с экспортом РНК Messenger». Природа . 417 (6886): 304–8. Bibcode : 2002natur.417..304S . doi : 10.1038/nature746 . PMID 11979277 . S2CID 1112194 .

[pmid8242058-18] Xie YG, Han FY, Peyrard M, Ruttlege Mh, Fransson I, Dejong P, Collins J, Dunham I, Nordenskjold M, Dumanski JP (декабрь 1993 г.). «Клонирование нового анонимного гена из мегабаз-диапазона YAC и Cosmid Contig в области нейрофиброматоза типа 2/менингиомы на хромосоме человека 22Q12». Hum Mol Genet . 2 (9): 1361–8. doi : 10.1093/hmg/2.9.1361 . PMID 8242058 .

[pmid10231032-19] Нагасе Т., Ишикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Мияджима Н., Танака А., Котани Х, Номура Н., Охара О (июль 1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIII. Полные последовательности из 100 новых клонов кДНК из мозга, которые код для крупных белков in vitro» . ДНК Res . 6 (1): 63–70. doi : 10.1093/dnares/6.1.63 . PMID 10231032 .

[pmid19015024-20] Карни Л., Пирс А., Риджнен М., Гонсалес Санчес М.Б., Хамза Х.Г., Чжан Л., Тамура Т., Уэттон А.Д. (декабрь 2008). «THOC5 пары передачи сигналов рецептора M-CSF с экспрессией фактора транскрипции». Клеточный сигнал . 21 (2): 309–16. doi : 10.1016/j.cellsig.2008.10.018 . PMID 19015024 .

[pmid18373705-21] Пирс А., Карни Л., Хамза Х.Г., Гриффитс Дж.Р., Чжан Л., Уэттон Б.А., Гонсалес Санчес М.Б., Тамура Т., Стернберг Д., Уэттон А.Д. (май 2008 г.). «Белок сплайсосомы ThoC5: мишень для лейкамогенных тирозинкиназ, которые влияют на оборот иннозитол липидов». Br J Gaematol . 141 (5): 641–50. doi : 10.1111/j.1365-2141.2008.07090.x . PMID 18373705 . S2CID 21122818 .

[entrez-22] "Entrez Gene: Thoc5 Tho Complex 5" .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]