ARMCX6

ARMCX6
Идентификаторы
Псевдонимы	ARMCX6 , GASP10, повтор броненосца, содержащий, Х-связанный 6, повтор броненосца, содержащий Х-связанный 6
Внешние идентификаторы	МГИ : 2147993 ; Гомологен : 10373 ; Генные карты : ARMCX6 ; OMA : ARMCX6 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	101,618,001 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	X chromosome (mouse)
End	133,652,166 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right adrenal cortex; ; body of pancreas; ; left adrenal cortex; ; smooth muscle tissue; ; islet of Langerhans; ; stromal cell of endometrium; ; spleen; ; monocyte; ; right coronary artery; ; lymph node;
	Top expressed in
	ovary; ; lens; ; neural tube; ; mesencephalon; ; epiblast; ; genital tubercle; ; hypothalamus; ; rhombencephalon; ; neural layer of retina; ; embryo;
	More reference expression data
	n/a
hideОртологи
	54470
	278097
	ENSG00000198960
	ENSMUSG00000050394
	Q7L4S7
	Q8K3A6
	НМ_001009584 ; НМ_001184768 ; НМ_019007
	НМ_001007578
	НП_001009584 ; НП_001171697 ; НП_061880
	НП_001007579
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Повтор броненосца, содержащий Х-связанный 6, представляет собой белок , который у человека кодируется ARMCX6, геном расположенным на Х-хромосоме. ^{[ 5 ]}

Это один из шести повторов броненосца, содержащих Х-связанные белки ( ARMCX1 , ARMCX2 , ARMCX3 , ARMCX4 , ARMCX5 и ARMCX6 (этот белок)).

Функция этого белка в настоящее время неизвестна.

Белковая последовательность

     1 MGRAREVGWM AAGLMIGAGA CYCVYKLTIG RDDSEKLEEE 
    41 GEEEWDDDQE LDEEEPDIWF DFETMARPWT EDGDWTEPGA 
    81 PGGTEDRPSG GGKANRAHPI KQRPFPYEHK NTWSAQNCKN 
   121 GSCVLDLSKC LFIQGKLLFA EPKDAGFPFS QDINSHLASL 
   161 SMARNTSPTP DPTVREALCA PDNLNASIES QGQIKMYINE 
   201 VCRETVSRCC NSFLQQAGLN LLISMTVINN MLAKSASDLK 
   241 FPLISEGSGC AKVQVLKPLM GLSEKPVLAG ELVGAQMLFS 
   301 FMSLFIRNGN REILLETPAP

Гомология

ARMCX6 консервативен во многих эукариотических организмах.

Ортологи

таксономическое название	общее имя	запись NCBI	Процент сходства последовательностей	Длина (АА)	комментарии
Мудрый человек	Человек	[1]	100%	300	повтор броненосца, содержащий X-связанный 6
Макака мулатта	Обезьяна-резус	[2]	97.0%	300	ПРЕДСКАЗЫВАЕМО: аналогично повтору амрмадилло, содержащему Х-связанную 6 (H. sapiens)-подобную изоформу 1.
Лошадь лошадь	Лошадь	[3]	90.0%	300	ПРЕДСКАЗЫВАЕМО: аналогично повтору броненосца, содержащему Х-связанный 6
Дания рерио	рыбка данио	[4]	84.0%	301	Аналогично RIKEN кДНК 0610039K22
Мышиная мышца	Домовая мышь	[5]	97.7%	393	повтор броненосца, содержащий X-связанный 6 (H. sapiens)-подобный
Бос Телец	корова	[6]	83.0%	301	повтор броненосца, содержащий Х-связанный 6
Мышиная мышца	Мышь	[7]	82.0%	301	повтор броненосца, содержащий Х-связанный 6
Такифугу рубрипы	Тетрадонтоидея	[8]	66.0%	818	арилуглеводородный рецептор 2C
Ценорабдитис элегантный	К. Элеганс	[9]	50.0%	332	Серпентиновый рецептор, член семейства класса H (srh-216)
Сахаромицеты cerevisiae	Дрожжи	[10]	70.0%	910	Hul5p
Петух есть петух	Курица	[11]	52.0%	317	ПРЕДСКАЗАН: гипотетический белок

Вторичная структура

Предполагается, что вторичная структура ARMCX6 аналогична цианазе. Ниже показано сравнение двух последовательностей. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

                          10        20        30        40
                ....*....|....*....|....*....|....*....|....*..
ARMCX6      231 MLAKSASDLKFPLISEGSGCAKVQVLKPLMGLSEKPVLAGELVGAQM 277
1DW9_A       19 LLSKAKKDLSFAEIADGTGLAEAFVTAALLGQQALPADAARLVGAKL 65
                 + +   ++ +  +  + + +   +   + +    +  +  ++++

Выражение

Данные микрочипов показывают, что ARMCX6 высоко экспрессируется на самых ранних стадиях сперматогенеза у мышей. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000198960 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000050394 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Энтрез Ген: содержащий повтор броненосца» .
^ SDSC Biology Workbench 2.0
^ «Сервис CBlast прекращает работу» .
^ Просмотр профиля EST - человек
^ Просмотр профиля EST — мышь
^ Су А.И., Уилтшир Т., Баталов С., Лапп Х. и др. (апрель 2004 г.). «Атлас генов транскриптомов, кодирующих белки мыши и человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (16): 6062–7. Бибкод : 2004PNAS..101.6062S . дои : 10.1073/pnas.0400782101 . ПМЦ 395923 . ПМИД 15075390 .

Внешние ссылки

человека Расположение генома ARMCX6 и страница сведений о гене ARMCX6 в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Росс М.Т., Графэм Д.В., Коффи А.Дж. и др. (2005). «Последовательность ДНК Х-хромосомы человека» . Природа . 434 (7031): 325–37. Бибкод : 2005Natur.434..325R . дои : 10.1038/nature03440 . ПМЦ 2665286 . ПМИД 15772651 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2002). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .

Эта статья о гене человека Х-хромосомы и/или связанном с белке незавершена . ним Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000198960 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000050394 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Энтрез Ген: содержащий повтор броненосца» .

[biobench-6] SDSC Biology Workbench 2.0

[C_BLAST-7] «Сервис CBlast прекращает работу» .

[esthum-8] Просмотр профиля EST - человек

[estmus-9] Просмотр профиля EST — мышь

[gds596-10] Су А.И., Уилтшир Т., Баталов С., Лапп Х. и др. (апрель 2004 г.). «Атлас генов транскриптомов, кодирующих белки мыши и человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (16): 6062–7. Бибкод : 2004PNAS..101.6062S . дои : 10.1073/pnas.0400782101 . ПМЦ 395923 . ПМИД 15075390 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]