Броненосец повторить
Повторяющийся домен броненосца | |||
---|---|---|---|
Идентификаторы | |||
Символ | Рука | ||
Пфам | PF00514 | ||
Пфам Клан | CL0020 | ||
ИнтерПро | IPR000225 | ||
УМНЫЙ | SM00185 | ||
PROSITE | PS50176 | ||
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 3bct / SCOPe / СУПФАМ | ||
CDD | cd00020 | ||
Мембраном | 350 | ||
|
Повтор броненосца представляет собой характерную повторяющуюся аминокислотную последовательность длиной около 42 остатков , которая встречается во многих белках. Белки, содержащие повторы броненосца, обычно содержат несколько тандемно повторяющихся копий. [ 2 ] [ 3 ] Каждый повтор броненосца состоит из пары альфа-спиралей, образующих шпильку. Множественные копии повтора образуют так называемую структуру альфа-соленоида .
Примеры белков, содержащих повторы броненосца, включают β-катенин , Sarm1 ( SARM1 ), [ 4 ] α-импортин , [ 5 ] плакоглобин , [ 6 ] аденоматозный полипоз кишечной палочки (АПК), [ 7 ] и многие другие.
Термин «броненосец» происходит от исторического названия гена β-катенина у плодовой мушки Drosophila, где впервые был обнаружен повтор броненосца. Хотя ранее считалось, что β-катенин является белком, участвующим в связывании кадгерина белков адгезии клеток с цитоскелетом , недавняя работа показывает, что β-катенин регулирует гомодимеризацию альфа-катенина, который, в свою очередь, контролирует актина . ветвление и связывание [ 8 ] Но повтор броненосца встречается в широком спектре белков с другими функциями. Этот тип белкового домена важен для передачи сигналов WNT во время эмбрионального развития .
Структура
[ редактировать ]Трехмерная складка повтора броненосца была впервые обнаружена в кристаллической структуре β-катенина , где 12 тандемных повторов образуют суперспираль из альфа-спиралей с тремя спиралями на единицу. [ 1 ] Цилиндрическая структура имеет положительно заряженную бороздку, которая предположительно взаимодействует с кислотными поверхностями известных партнеров по взаимодействию β-катенина . [ 9 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Хубер А.Х., Нельсон В.Дж., Вейс В.И. (сентябрь 1997 г.). «Трехмерная структура повторяющейся области β-катенина броненосца» . Клетка . 90 (5): 871–82. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80352-9 . ПМИД 9298899 . S2CID 18612343 .
- ^ Пайфер М. , Берг С., Рейнольдс А.Б. (1994). «Повторяющийся аминокислотный мотив, общий для белков с разнообразными клеточными ролями». Клетка . 76 (5): 789–91. дои : 10.1016/0092-8674(94)90353-0 . ПМИД 7907279 . S2CID 26528190 .
- ^ Гроувс М.Р., Барфорд Д. (1999). «Топологические характеристики белков со спиральными повторами». Современное мнение в области структурной биологии . 9 (3): 383–9. дои : 10.1016/S0959-440X(99)80052-9 . ПМИД 10361086 .
- ^ «Предварительный просмотр Scopus – Scopus – Добро пожаловать в Scopus» . www.scopus.com . Проверено 21 марта 2023 г.
- ^ Герольд А., Труант Р., Виганд Х., Каллен Б.Р. (октябрь 1998 г.). «Определение функциональной доменной организации фактора ядерного импорта импортина альфа» . Дж. Клеточная Биол . 143 (2): 309–18. дои : 10.1083/jcb.143.2.309 . ПМК 2132842 . ПМИД 9786944 .
- ^ МакКри PD, Терк CW, Гамбинер Б (ноябрь 1991 г.). «Гомолог белка броненосца у дрозофилы (плакоглобин), связанный с E-кадгерином». Наука . 254 (5036): 1359–61. Бибкод : 1991Sci...254.1359M . дои : 10.1126/science.1962194 . ПМИД 1962194 .
- ^ Хиршль Д., Байер П., Мюллер О. (март 1996 г.). «Вторичная структура одиночного повтора броненосца белка APC». ФЭБС Летт . 383 (1–2): 31–6. дои : 10.1016/0014-5793(96)00215-3 . ПМИД 8612785 . S2CID 36190869 .
- ^ Нуссе, Роэл и Ганс Клеверс. «Передача сигналов Wnt/β-катенина, заболевания и новые терапевтические методы». Клетка, том. 169, нет. 6, 1 июня 2017 г., стр. 985–999., doi:10.1016/j.cell.2017.05.016.
- ^ «Броненосец (IPR000225)» . ИнтерПро . ЭМБЛ-ЭБИ.
Внешние ссылки
[ редактировать ]- ресурса Eukaryotic Linear Motif Класс мотива TRG_NLS_Bipartite_1
- ресурса Eukaryotic Linear Motif Класс мотива TRG_NLS_MonoCore_2
- ресурса Eukaryotic Linear Motif Класс мотива TRG_NLS_MonoExtC_3
- ресурса Eukaryotic Linear Motif Класс мотива TRG_NLS_MonoExtN_4
- Броненосец + домен + белки Национальной медицинской библиотеки США в медицинских предметных рубриках (MeSH)
- Армадилло/плакоглобин ARM повтор [ постоянная мертвая ссылка ] и СПРОСИТЕ