Hnrph1

HDRNH1
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2LXU
Идентификаторы
Псевдонимы	Hnrnph1 , hnrph, hnrph1, hnrnph, гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H1 (H), гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H1
Внешние идентификаторы	Омим : 601035 ; MGI : 1891925 ; Гомологен : 31318 ; GeneCards : hnrnph1 ; OMA : hnrnph1 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	179,634,784 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	50,386,528 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	right lobe of thyroid gland; ; left lobe of thyroid gland; ; right uterine tube; ; left ovary; ; right ovary; ; Achilles tendon; ; body of pancreas; ; right lung; ; ganglionic eminence; ; ventricular zone;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; superior cervical ganglion; ; hand; ; abdominal wall; ; mandibular prominence; ; maxillary prominence; ; genital tubercle; ; primitive streak; ; Gonadal ridge; ; dermis;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	nucleic acid binding; protein binding; RNA binding; poly(U) RNA binding;
Cellular component	catalytic step 2 spliceosome; spliceosomal complex; membrane; nucleoplasm; cytosol; nucleus;
Biological process	mRNA splicing, via spliceosome; regulation of RNA splicing; mRNA processing; RNA processing; RNA splicing; fibroblast growth factor receptor signaling pathway; RNA metabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3187
	59013
	ENSG00000169045
	Ensmusg00000007850
	P31943
	O35737
	NM_001257293 ; NM_005520 ; NM_001363572
	NM_021510 ; NM_001347487
showNP_001244222 ; NP_005511 ; NP_001350501 ; NP_001351154 ; NP_001351155 ;
	NP_001351156; NP_001351157; NP_001351158; NP_001351159; NP_001351160; NP_001351161; NP_001351162; NP_001351163; NP_001351164; NP_001351165; NP_001351166; NP_001351167; NP_001351168; NP_001351169; NP_001351170; NP_001351171; NP_001351172; NP_001351173; NP_001351174; NP_001351175; NP_001351176; NP_001351177; NP_001351179; NP_001351180; NP_001351181; NP_001351182; NP_001351183; NP_001351184
showNP_001334416 ; NP_067485 ; NP_001349451 ; NP_001349452 ; NP_001349453 ;
	NP_001349454; NP_001349455; NP_001349456; NP_001349457; NP_001349458; NP_001349459; NP_001349461; NP_001349462; NP_001349463
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H является белком ^{[ 5 ]} что у людей кодируется hnrnph1 геном . ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Этот ген принадлежит к подсемейству повсеместно экспрессируемых гетерогенных ядерных рибонуклеопротеинов (HNRNP). HNRNP являются РНК -связывающими белками, и они комплексны с гетерогенной ядерной РНК (HNRNA). Эти белки связаны с пре-мРНК в ядре и, по-видимому, влияют на обработку пре-мРНК и другие аспекты метаболизма мРНК и транспорта. В то время как все HNRNP присутствуют в ядре, некоторые, по -видимому, переключаются между ядром и цитоплазмой. Белки HNRNP обладают различными свойствами связывания нуклеиновой кислоты. Белок, кодируемый этим геном, имеет три повторения квази-RRM-доменов, которые связываются с RNA. Это очень похоже на члена семьи HNRPF. Считается, что этот ген потенциально участвует в наследственном фенотипе лимфедемы типа I. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000169045 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000007850 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Penumatchu S, Chiu Ly, Meagher JL, Hansen AL, Stuckey JA, Tolbert BS (2018-08-18). «Дифференциальная конформационная динамика, кодируемая межкррм-линкером HNRNP H» . Журнал Американского химического общества . 140 (37): 11661–11673. doi : 10.1021/jacs.8b05366 . ISSN 0002-7863 . PMC 6648666 . PMID 30122033 .
^ Honore B, Rasmussen HH, Vocorum H, Dejgaard K, Liu X, Gromov P, Madsen P, Gesser B, Tommerup N, Celis JE (январь 1996). «Гетерогенные ядерные риклеарные рисовые риклеарные рикаминеины H, H 'и F являются членами Ubikity, экспрессируемого подсемейства, экспрессируемой подсемейство, подсемейная, но отдельные белки, пользованные генами, отображающими с различными хромосом » J Biol Chem 270 (48): 28780–9 Doi : 10.1074/ jbc.270.48.28780 PMID 7499401
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: Hnrph1 гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H1 (H)» .

Дальнейшее чтение

Rasmussen HH, Van Damme J, Puype M, et al. (1993). «Микроязывания из 145 белков, зарегистрированных в двумерной базе данных гелевых белков нормальных эпидермальных кератиноцитов человека». Электрофорез . 13 (12): 960–9. doi : 10.1002/elps.115013011199 . PMID 1286667 . S2CID 41855774 .
Доусон С.Дж., Уайт Л.А. (1992). «Лечение эндокардита Haemophilus aphrophilus с ципрофлоксацином». J. Infect . 24 (3): 317–20. doi : 10.1016/s0163-4453 (05) 80037-4 . PMID 1602151 .
Matunis MJ, Xing J, Dreyfuss G (1994). «Белок HNRNP F: уникальная первичная структура, связывающие нуклеиновую кислоту и субклеточную локализацию» . Нуклеиновые кислоты Res . 22 (6): 1059–67. doi : 10.1093/nar/22.6.1059 . PMC 307930 . PMID 7512260 .
Gamberi C, Izaurralde E, Beisel C, Mattaj IW (1997). «Взаимодействие между ядерным белковым комплексом человека-связывающим белком и HNRNP F.» Мол Клетка. Биол . 17 (5): 2587–97. doi : 10.1128/mcb.17.5.2587 . PMC 232108 . PMID 9111328 .
Chou My, Rooke N, Turck CW, Black DL (1999). «HNRNP H является компонентом комплекса энхансера сплайсинга, который активирует альтернативный экзон C-SRC в нейрональных клетках» . Мол Клетка. Биол . 19 (1): 69–77. doi : 10.1128/mcb.19.1.69 . PMC 83866 . PMID 9858532 .
Эванс А.Л., Брайс Г., Сотирова В. и др. (1999). «Картирование первичного врожденного лимфедемы в область 5q35.3» . Являюсь. J. Hum. Генет . 64 (2): 547–55. doi : 10.1086/302248 . PMC 1377764 . PMID 9973292 .
Honoré B, Vorum H, Baandrup U (1999). «Hnrnps H, H 'и F ведут себя по -разному в отношении посттрансляционного расщепления и субклеточной локализации» . Фебс Летт . 456 (2): 274–80. doi : 10.1016/s0014-5793 (99) 00911-4 . PMID 10456323 . S2CID 7617501 .
Марковтсков В., Николик Дж. М., Голдман Дж.А. и соавт. (2000). «Кооперативная сборка комплекса HNRNP, индуцированного тканеспецифическим гомологом белка, связывающего полипиримидинового тракта» . Мол Клетка. Биол . 20 (20): 7463–79. doi : 10.1128/mcb.20.20.7463-7479.2000 . PMC 86300 . PMID 11003644 .
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, et al. (2002). «Переданный протеомный анализ человеческого ядры» . Карт Биол . 12 (1): 1–11. Bibcode : 2002cbio ... 12 .... 1a . doi : 10.1016/s0960-9822 (01) 00650-9 . PMID 11790298 . S2CID 14132033 .
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi Sr, et al. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа» . РНК . 8 (4): 426–39. doi : 10.1017/s13558388202021088 . PMC 1370266 . PMID 11991638 .
Angenstein F, Evans AM, Settletlage RE, et al. (2002). «Рецептор для активированной С киназы является частью комплексов рибонуклеопротеинов мессенджера, связанных с полиа-мРНК в нейронах» . J. Neurosci . 22 (20): 8827–37. doi : 10.1523/jneurosci.22-20-08827.2002 . PMC 6757688 . PMID 12388589 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Li J, Hawkins IC, Harvey CD, et al. (2003). «Регуляция альтернативного сплайсинга с помощью SRRP86 и его взаимодействующих белков» . Мол Клетка. Биол . 23 (21): 7437–47. doi : 10.1128/mcb.23.21.7437-7447.2003 . PMC 207616 . PMID 14559993 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК» . НАТ Генет . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Honoré B, Baandrup U, Vorum H (2004). «Гетерогенные ядерные рибонуклеопротеины F и H/H» демонстрируют дифференциальную экспрессию в нормальных и выбранных раковых тканях ». Эксплуат Ячейка . 294 (1): 199–209. doi : 10.1016/j.yexcr.2003.11.011 . PMID 14980514 .
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, et al. (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т -клеток человека с использованием иммобилизованной аффинной хроматографии металлов и тандемной масс -спектрометрии». Анальный. Химический 76 (10): 2763–72. doi : 10.1021/ac035352d . PMID 15144186 .
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004pnas..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Jin J, Smith FD, Stark C, et al. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3-связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации» . Карт Биол . 14 (16): 1436–50. Bibcode : 2004cbio ... 14.1436j . doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660 . S2CID 2371325 .
Лин К.Т., Лу Р.М., Тарн Ви (2004). «Белки, содержащие домен WW, взаимодействуют с ранней сплайсосомой и участвуют в сплайсинге пре-мРНК in vivo» . Мол Клетка. Биол . 24 (20): 9176–85. doi : 10.1128/mcb.24.20.9176-9185.2004 . PMC 517884 . PMID 15456888 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 5 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000169045 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000007850 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[5] Penumatchu S, Chiu Ly, Meagher JL, Hansen AL, Stuckey JA, Tolbert BS (2018-08-18). «Дифференциальная конформационная динамика, кодируемая межкррм-линкером HNRNP H» . Журнал Американского химического общества . 140 (37): 11661–11673. doi : 10.1021/jacs.8b05366 . ISSN 0002-7863 . PMC 6648666 . PMID 30122033 .

[pmid7499401-6] Honore B, Rasmussen HH, Vocorum H, Dejgaard K, Liu X, Gromov P, Madsen P, Gesser B, Tommerup N, Celis JE (январь 1996). «Гетерогенные ядерные риклеарные рисовые риклеарные рикаминеины H, H 'и F являются членами Ubikity, экспрессируемого подсемейства, экспрессируемой подсемейство, подсемейная, но отдельные белки, пользованные генами, отображающими с различными хромосом » J Biol Chem 270 (48): 28780–9 Doi : 10.1074/ jbc.270.48.28780 PMID 7499401

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: Hnrph1 гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H1 (H)» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]