RNF5

RNF5
Идентификаторы
Псевдонимы	RNF5 , RING5, RMA1, Берегнек -белок 5
Внешние идентификаторы	Омим : 602677 ; MGI : 1860076 ; Гомологен : 56004 ; GeneCards : RNF5 ; OMA : rnf5 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	32,180,793 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	34,822,664 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	ganglionic eminence; ; human kidney; ; ventricular zone; ; right adrenal gland; ; mucosa of transverse colon; ; right adrenal cortex; ; monocyte; ; apex of heart; ; left ventricle; ; duodenum;
	Top expressed in
	proximal tubule; ; right kidney; ; neural tube; ; neural layer of retina; ; yolk sac; ; ganglionic eminence; ; human kidney; ; pons; ; brown adipose tissue; ; olfactory bulb;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	metal ion binding; ubiquitin-protein transferase activity; protein binding; ubiquitin-like protein conjugating enzyme binding; transferase activity; identical protein binding; zinc ion binding; ubiquitin protein ligase activity; protein-containing complex binding;
Cellular component	integral component of membrane; mitochondrial membranes; membrane; mitochondrion; Derlin-1 retrotranslocation complex; endoplasmic reticulum; endoplasmic reticulum membrane; endoplasmic reticulum quality control compartment;
Biological process	response to bacterium; protein K63-linked ubiquitination; ER-associated misfolded protein catabolic process; regulation of autophagosome assembly; protein K48-linked ubiquitination; protein destabilization; protein ubiquitination; negative regulation of autophagy; transmembrane transport; endoplasmic reticulum mannose trimming; ubiquitin-dependent ERAD pathway; ERAD pathway; ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6048
	54197
showENSG00000227277 ; ENSG00000223767 ; ENSG00000228907 ; ENSG00000183574 ; ENSG00000204308 ;
	ENSG00000225452; ENSG00000228405
	Ensmusg00000015478
	Q99942
	O35445
	NM_006913
	NM_019403
	NP_008844
	NP_062276
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

E3 убиквитин-белковой лигаза RNF5 -это фермент , который у людей кодируется RNF5 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, содержит безымянный палец , который является мотивом, который, как известно, участвует в взаимодействиях белка-белок. Этот белок представляет собой мембрану, связанную с убиквитин-лигазой . Он может регулировать подвижность клеток путем нацеливания на убиквитинирование Паксиллина и изменяя распределение и локализацию паксиллина в цитоплазме и клетке . ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ENSG00000223767, ENSG00000228907, ENSG00000183574, ENSG00000204308, ENSG00000225452, ENSG00000228405 GRCH38: ENSEMBL Release 89: ENSG0000022777, ENSG002223767, ENSG00289077777, ENSG00000223767, ENSG00289077777, ENSG002223767, ENSG002890777777, ENSG.GATERSG777777, ENSG.GAT 4308, ENSG00000225452, ENSG00000228405 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000015478 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Кюшики Х., Куга Ю., Сузуки М., Такахаши Е., Хори М. (апрель 1998). «Клонирование, экспрессия и картирование нового гена кольца (RNF5), человеческого гомолога предполагаемого гена цинка из Caenorhabditis elegans». Цитогенетика и клеточная генетика . 79 (1–2): 114–7. doi : 10.1159/000134695 . PMID 9533025 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: RNF5 БИНКЕЙ ПЕШЕВ 5» .

Дальнейшее чтение

Кендалл Э., Сарджент К.А., Кэмпбелл Р.Д. (декабрь 1990 г.). «Основной комплекс гистосовместимости человека содержит новый кластер генов между HLA-D и комплементом локусов C4» . Исследование нуклеиновых кислот . 18 (24): 7251–7. doi : 10.1093/nar/18.24.7251 . PMC 332860 . PMID 2259622 .
Бональдо М.Ф., Леннон Г., Соарс М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов» . Исследование генома . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Барритт Д.С., Пирн М.Т., Зиш А.Х., Ли С.С., Хавьер Р.Т., Паскуале Э.Б., Сталлкуп В.Б. (август 2000 г.). «Белок домена мульти-PDZ Mupp1 является цитоплазматическим лигандом для мембранного протеогликана NG2» . Журнал сотовой биохимии . 79 (2): 213–24. doi : 10.1002/1097-4644 (20001101) 79: 2 <213 :: AID-JCB50> 3.0.CO; 2-G . PMC 3501957 . PMID 10967549 .
Мацуда Н., Сузуки Т., Танака К., Накано А (май 2001 г.). «RMA1, новый тип белка безымянного пальца, консервативный от арабидопсиса к человеку, представляет собой мембраносвязанную убиквитин-лигазу». Журнал сотовой науки . 114 (Pt 10): 1949–57. doi : 10.1242/jcs.114.10.1949 . PMID 11329381 .
Pouly S, Prat A, Blain M, Olivier A, Antel J (октябрь 2001 г.). «Иммунореактивность NG2 на эндотелиальных клетках мозга человека». Acta Neuropathologica . 102 (4): 313–20. doi : 10.1007/s004010000350 . PMID 11603805 . S2CID 1353236 .
Didier C, Broday L, Bhoumik A, Израиль С., Такахаши С., Накаяма К., Томас С.М., Тернер К.Е., Хендерсон С., Сабе Х., Ронаи З. (август 2003 г.). «RNF5, белок безымянного пальца, который регулирует подвижность клеток путем нацеливания на убиквитинирование Paxillin и измененную локализацию» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (15): 5331–45. doi : 10.1128/mcb.23.15.5331-5345.2003 . PMC 165736 . PMID 12861019 .
Xie T, Rowen L, Aguado B, Ahearn Me, Madan A, Qin S, Campbell Rd, Hood L (декабрь 2003 г.). «Анализ генной области основной гистосовместимости комплексной области класса III и ее сравнения с мышей» . Исследование генома . 13 (12): 2621–36. doi : 10.1101/gr.1736803 . PMC 403804 . PMID 14656967 .
Lehner B, Semple Ji, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной двухгибридной системы дрожжей и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области MHC класса III человека». Геномика . 83 (1): 153–67. doi : 10.1016/s0888-7543 (03) 00235-0 . PMID 14667819 .
Лю А.М., Вонг Й.Х. (декабрь 2004 г.). «G16-опосредованная активация ядерного фактора Kappab рецептором аденозина A1 включает C-SRC, протеинкиназу C и передачу сигналов ERK» (PDF) . Журнал биологической химии . 279 (51): 53196–204. doi : 10.1074/jbc.m410196200 . PMID 15485865 .
Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B, Bose R, Liu Z, Donovan RS, Shinjo F, Liu Y, Dembowy J, Taylor IW, Luga V, Przulj N, Robinson M, Suzuki H, Hayashizaki Y, Jurisica I, Wrana JL (март 2005 г.). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в ячеек млекопитающих». Наука . 307 (5715): 1621–5. Bibcode : 2005sci ... 307.1621b . doi : 10.1126/science.1105776 . PMID 15761153 . S2CID 39457788 .
Zhang Y, Higashide W, Dai S, Sherman DM, Zhou D (ноябрь 2005 г.). «Распознавание и убиквитинирование эффекторного SOPA Salmonella типа III с помощью убиквитина E3 -лигазы, HSRMA1» . Журнал биологической химии . 280 (46): 38682–8. doi : 10.1074/jbc.m506309200 . PMID 16176924 .
Младший Дж. М., Чен Л., Рен Хи, Россер М.Ф., Тернбулл Э.Л., Фан Сай, Паттерсон С., Сир Д.М. (август 2006 г.). «Последовательный контроль качества контрольные точки сортировки неправильно свернутой регулятор трансмембранного проводимости муковисцидоза» . Клетка . 126 (3): 571–82. doi : 10.1016/j.cell.2006.06.041 . PMID 16901789 . S2CID 51698 .
Бромберг К.Д., Клугер Х.М., Делаун А., Аббас С., Дивито К.А., Крайьюски С., Ронаи З. (сентябрь 2007 г.). «Повышенная экспрессия убиквитин -лигазы E3 RNF5 связана со снижением выживаемости при раке молочной железы» . РАНКА . 67 (17): 8172–9. doi : 10.1158/0008-5472.can-07-0045 . PMC 2962863 . PMID 17804730 .
Fujita Y, Khateb A, Li Y, Tnoco R, Zhang T, Bar-Yoseph H, Tam Ma, Chowers Y, Sabo E, Gerassy-Vinberg S, Starosvetsky E, James B, Brown-Ror Ss, Bddley LM, Tessier Pa , Ronai ZA (сентябрь 2018 г.). «Повторное количество стабильности S100A8 с помощью кишечных эпителиальных клеток RNF5 определяет воспаление кишечника и тяжесть колита » Сотовые отчеты 24 (12): 3296–3311.e6 Doi : 10.1016/ j.cellep.2018.08.0 PMC 6185744 . PMID 30232010

Внешние ссылки

RNF5+белок,+человек в Национальной медицинской библиотеке Медицинской библиотеки США (Mesh)

Эта связанная с белком статья является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ENSG00000223767, ENSG00000228907, ENSG00000183574, ENSG00000204308, ENSG00000225452, ENSG00000228405 GRCH38: ENSEMBL Release 89: ENSG0000022777, ENSG002223767, ENSG00289077777, ENSG00000223767, ENSG00289077777, ENSG002223767, ENSG002890777777, ENSG.GATERSG777777, ENSG.GAT 4308, ENSG00000225452, ENSG00000228405 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000015478 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9533025-5] Кюшики Х., Куга Ю., Сузуки М., Такахаши Е., Хори М. (апрель 1998). «Клонирование, экспрессия и картирование нового гена кольца (RNF5), человеческого гомолога предполагаемого гена цинка из Caenorhabditis elegans». Цитогенетика и клеточная генетика . 79 (1–2): 114–7. doi : 10.1159/000134695 . PMID 9533025 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: RNF5 БИНКЕЙ ПЕШЕВ 5» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]