Фир

Фир
Идентификаторы
Псевдонимы	Firre , LINC01200, Функциональный межгенный повторяющийся РНК -элемент, Firre Intergency Repecting RNA -элемент
Внешние идентификаторы	Омим : 300999 ; MGI : 2147989 ; GeneCards : огонь ; OMA : Огонь - Ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	131,830,862 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	X chromosome (mouse)
End	49,724,198 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	epithelium of colon; ; sural nerve; ; testicle; ; body of pancreas; ; gonad; ; bone marrow cells; ; C1 segment; ; ventricular zone; ; monocyte; ; granulocyte;
	Top expressed in
	neural layer of retina; ; choroidal fissure; ; fourth ventricle; ; choroid plexus of fourth ventricle; ; esophagus; ; superior frontal gyrus; ; cerebellar cortex; ; otolith organ; ; utricle; ; epiblast;
	More reference expression data
	n/a
hideОртологи
	286467
	103012
	ENSG00000213468
	Ensmusg00000085396
	не ; а
	n/a
	n/a
	n/a
	n/a
	n/a
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Firre (функциональный межгенный повторяющийся РНК-элемент) представляет собой длинную некодирующую РНК, расположенную на хромосоме X. Он сохраняется в ядре посредством взаимодействия с ядерной матрицы фактором hnrnpu . ^{[ 5 ]} Он опосредует трансхромосомные взаимодействия ^{[ 5 ]} и закрепляет неактивную x хромосому к ядрышке. ^{[ 6 ]} Это играет роль в плюрипотентности ^{[ 7 ]} и адипогенез . ^{[ 8 ]}

Смотрите также

Длинная некодирующая РНК

Ссылки

^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000213468 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000085396 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Hacisuleyman E, Goff LA, Trapnell C, Williams A, Henao-Mejia J, Sun L, McClanahan P, Hendrickson DG, Sauvageau M, Kelley DR, Morse M, Engreitz J, Lander ES, Guttman M, Lodish HF, Flavell R, Радж А., Ринн Дж.Л. (февраль 2014 г.). «Топологическая организация мультихромосомных областей с помощью длинной межгенной некодирующей РНК -фирра» . Природа структурная и молекулярная биология . 21 (2): 198–206. doi : 10.1038/nsmb.2764 . PMC 3950333 . PMID 24463464 .
^ Ян Ф., Денг Х, М.А., Берлетч Дж. Б., Рабайя Н., Вей Г., Мур Дж. М., Филиппова Г.Н., Сюй Дж., Лю Й., Нобл В.С., Шендур Дж., Дисеч С.М. (2015). «Firre Lncrna прикрепляет неактивную X -хромосому с ядрелкой путем связывания CTCF и поддерживает метилирование H3K27me3» . Биология генома . 16 (52): 52. doi : 10.1186/s13059-015-0618-0 . PMC 4391730 . PMID 25887447 .
^ Bergmann JH, Li J, Eckersley-Maslin MA, Rigo F, Freier SM, Spector DL (сентябрь 2015). «Регулирование транскриптома ESC с помощью ядерных некодирующих РНК» . Исследование генома . 25 (9): 1336–1346. doi : 10.1101/gr.189027.114 . PMC 4561492 . PMID 26048247 .
^ Sun L, Goff LA, Trapnell C, Alexander R, Lo Ka, Hacisuleyman E, Sauvageau M, Tazon-Vega B, Kelley DR, Hendrickson DG, Yuan B, Kellis M, Lodish HF, Rinn JL (февраль 2013 г.). «Длинные некодирующие РНК регулируют адипогенез» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (9): 3387–3392. Bibcode : 2013pnas..110.3387s . doi : 10.1073/pnas.1222643110 . PMC 3587215 . PMID 23401553 .

Дальнейшее чтение

Ринн Дж., Гутман М (сентябрь 2014). «Функция РНК. РНК и динамическая ядерная организация» . Наука . 345 (6202): 1240–1241. doi : 10.1126/science.1252966 . PMC 4186717 . PMID 25214588 .

Эта статья о гене на хромосоме человека и/или связанного с ним белка является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000213468 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000085396 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid24463464-5] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Hacisuleyman E, Goff LA, Trapnell C, Williams A, Henao-Mejia J, Sun L, McClanahan P, Hendrickson DG, Sauvageau M, Kelley DR, Morse M, Engreitz J, Lander ES, Guttman M, Lodish HF, Flavell R, Радж А., Ринн Дж.Л. (февраль 2014 г.). «Топологическая организация мультихромосомных областей с помощью длинной межгенной некодирующей РНК -фирра» . Природа структурная и молекулярная биология . 21 (2): 198–206. doi : 10.1038/nsmb.2764 . PMC 3950333 . PMID 24463464 .

[pmid25887447-6] Ян Ф., Денг Х, М.А., Берлетч Дж. Б., Рабайя Н., Вей Г., Мур Дж. М., Филиппова Г.Н., Сюй Дж., Лю Й., Нобл В.С., Шендур Дж., Дисеч С.М. (2015). «Firre Lncrna прикрепляет неактивную X -хромосому с ядрелкой путем связывания CTCF и поддерживает метилирование H3K27me3» . Биология генома . 16 (52): 52. doi : 10.1186/s13059-015-0618-0 . PMC 4391730 . PMID 25887447 .

[pmid26048247-7] Bergmann JH, Li J, Eckersley-Maslin MA, Rigo F, Freier SM, Spector DL (сентябрь 2015). «Регулирование транскриптома ESC с помощью ядерных некодирующих РНК» . Исследование генома . 25 (9): 1336–1346. doi : 10.1101/gr.189027.114 . PMC 4561492 . PMID 26048247 .

[pmid23401553-8] Sun L, Goff LA, Trapnell C, Alexander R, Lo Ka, Hacisuleyman E, Sauvageau M, Tazon-Vega B, Kelley DR, Hendrickson DG, Yuan B, Kellis M, Lodish HF, Rinn JL (февраль 2013 г.). «Длинные некодирующие РНК регулируют адипогенез» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (9): 3387–3392. Bibcode : 2013pnas..110.3387s . doi : 10.1073/pnas.1222643110 . PMC 3587215 . PMID 23401553 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]