ТАДА2Л

ТАДА2А
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1X41
Идентификаторы
Псевдонимы	TADA2A , ADA2, ADA2A, TADA2L, hADA2, KL04P, транскрипционный адаптер 2A
Внешние идентификаторы	Опустить : 602276 ; МГИ : 2144471 ; Гомологен : 38834 ; Генные карты : TADA2A ; ОМА : TADA2A — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	37,479,725 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	84,020,426 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	testicle; ; Achilles tendon; ; corpus callosum; ; ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; right testis; ; left testis; ; bone marrow cells; ; skeletal muscle tissue; ; endometrium;
	Top expressed in
	otic vesicle; ; saccule; ; neural layer of retina; ; epiblast; ; renal corpuscle; ; ventricular zone; ; otic placode; ; secondary oocyte; ; primary oocyte; ; medullary collecting duct;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; histone acetyltransferase activity; DNA-binding transcription factor activity; DNA binding; chromatin binding; transcription coregulator activity; transcription coactivator activity; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus; chromosome; SAGA-type complex;
Biological process	positive regulation of histone acetylation; histone H3 acetylation; regulation of transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; chromatin remodeling; regulation of histone acetylation; positive regulation of nucleic acid-templated transcription;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6871
	217031
	ENSG00000276234 ; ENSG00000277104
	ENSMUSG00000018651
	О75478
	Q8CHV6
	НМ_001166105 ; НМ_001291918 ; НМ_001488 ; НМ_133439
	НМ_172562
	НП_001159577 ; НП_001278847 ; НП_001479 ; НП_597683
	НП_766150
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Транскрипционный адаптер 2-альфа — это белок , который у человека кодируется TADA2A геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Многие ДНК-связывающие белки-активаторы транскрипции повышают скорость инициации транскрипции генов, опосредованной РНК-полимеразой II, функционально взаимодействуя с общим механизмом транскрипции, связанным с базальным промотором. Для этой активации обычно необходимы адаптерные белки, возможно, для ацетилирования и дестабилизации нуклеосом, тем самым снимая ограничения хроматина на промоторе. Белок, кодируемый этим геном, является адаптером активатора транскрипции и, как было обнаружено, является частью комплекса гистон-ацетилазы PCAF. Для этого гена идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что TADA2L взаимодействует с GCN5L2 . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} ТАДА3Л ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} и Мик . ^{[ 11 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000277104 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000276234, ENSG00000277104 — Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018651 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Кандау Р., Мур П.А., Ван Л., Барлев Н., Ин С.И., Розен К.А., Бергер С.Л. (февраль 1996 г.). «Идентификация белков человека, функционально консервативных с предполагаемыми дрожжевыми адаптерами ADA2 и GCN5» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (2): 593–602. дои : 10.1128/mcb.16.2.593 . ПМК 231038 . ПМИД 8552087 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: транскрипционный адаптер 2 TADA2L (гомолог ADA2, дрожжи)» .
^ Барлев Н.А., Полторацкий В., Оуэн-Хьюз Т., Ин С., Лю Л., Уоркман Дж.Л., Бергер С.Л. (март 1998 г.). «Репрессия активности гистон-ацетилтрансферазы GCN5 посредством опосредованного бромодоменом связывания и фосфорилирования Ku-ДНК-зависимым протеинкиназным комплексом» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (3): 1349–58. дои : 10.1128/mcb.18.3.1349 . ПМЦ 108848 . ПМИД 9488450 .
^ Ван Л., Миззен С., Ин С., Кандау Р., Барлев Н., Браунелл Дж., Эллис С.Д., Бергер С.Л. (январь 1997 г.). «Активность гистон-ацетилтрансферазы консервативна между дрожжами и человеческим GCN5 и необходима для комплементации роста и активации транскрипции» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (1): 519–27. дои : 10.1128/mcb.17.1.519 . ПМК 231776 . ПМИД 8972232 .
^ Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.Ю. , Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
^ Ван Т., Кобаяши Т., Такимото Р., Денес А.Е., Снайдер Э.Л., Эль-Дейри В.С., Брахманн Р.К. (ноябрь 2001 г.). «hADA3 необходим для активности p53» . Журнал ЭМБО . 20 (22): 6404–13. дои : 10.1093/emboj/20.22.6404 . ПМЦ 125723 . ПМИД 11707411 .
^ Лю X, Тесфай Дж., Эврард Ю.А., Дент С.Ю., Мартинес Э. (май 2003 г.). «Домен трансформации c-Myc рекрутирует человеческий комплекс STAGA и требует активности ацетилазы TRRAP и GCN5 для активации транскрипции» . Журнал биологической химии . 278 (22): 20405–12. дои : 10.1074/jbc.M211795200 . ПМК 4031917 . ПМИД 12660246 .

Дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Ван Л., Миззен С., Ин С., Кандау Р., Барлев Н., Браунелл Дж., Эллис С.Д., Бергер С.Л. (январь 1997 г.). «Активность гистон-ацетилтрансферазы консервативна между дрожжами и человеческим GCN5 и необходима для комплементации роста и активации транскрипции» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (1): 519–27. дои : 10.1128/mcb.17.1.519 . ПМК 231776 . ПМИД 8972232 .
Картер К.К., Ван Л., Шелл Б.К., Замир И., Бергер С.Л., Мур П.А. (март 1997 г.). «Гены транскрипционных адаптеров человека TADA2L и GCN5L2 колокализуются на хромосоме 17q12-q21 и демонстрируют аналогичную картину экспрессии в тканях». Геномика . 40 (3): 497–500. дои : 10.1006/geno.1996.4605 . ПМИД 9073520 .
Хенрикссон А., Альмлёф Т., Форд Дж., Макьюэн И.Дж., Густафссон Дж.А., Райт А.П. (июнь 1997 г.). «Роль адапторного комплекса Ада в активации генов глюкокортикоидным рецептором» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (6): 3065–73. дои : 10.1128/mcb.17.6.3065 . ПМК 232159 . ПМИД 9154805 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Огрызко В.В., Котани Т., Чжан X, Шильц Р.Л., Ховард Т., Ян XJ, Ховард Б.Х., Цинь Дж., Накатани Ю. (июль 1998 г.). «Гистоноподобные TAF в комплексе гистон-ацетилазы PCAF» . Клетка . 94 (1): 35–44. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81219-2 . ПМИД 9674425 . S2CID 18942972 .
Василев А., Ямаути Дж., Котани Т., Привес С., Авантаджиати М.Л., Цинь Дж., Накатани Ю. (декабрь 1998 г.). «Субъединица гистон-ацетилазного комплекса PCAF массой 400 кДа принадлежит к суперсемейству ATM» . Молекулярная клетка . 2 (6): 869–75. дои : 10.1016/S1097-2765(00) 80301-9 ПМИД 9885574 .
Ван Т., Кобаяши Т., Такимото Р., Денес А.Е., Снайдер Э.Л., Эль-Дейри В.С., Брахманн Р.К. (ноябрь 2001 г.). «hADA3 необходим для активности p53» . Журнал ЭМБО . 20 (22): 6404–13. дои : 10.1093/emboj/20.22.6404 . ПМЦ 125723 . ПМИД 11707411 .
Барлев Н.А., Емельянов А.В., Кастаньино П., Зегерман П., Баннистер А.Дж., Сепульведа М.А., Роберт Ф., Тора Л., Кузаридес Т., Бирштейн Б.К., Бергер С.Л. (октябрь 2003 г.). «Новый гомолог Ada2 человека функционирует совместно с Gcn5 или Brg1, коактивируя транскрипцию» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (19): 6944–57. дои : 10.1128/MCB.23.19.6944-6957.2003 . ЧВК 193946 . ПМИД 12972612 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Цянь С., Чжан Ц., Ли С., Цзэн Л., Уолш М.Дж., Чжоу М.М. (декабрь 2005 г.). «Структура и связывание хромосомной ДНК домена SWIRM». Структурная и молекулярная биология природы . 12 (12): 1078–85. дои : 10.1038/nsmb1022 . ПМИД 16299514 . S2CID 23215862 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000277104 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000276234, ENSG00000277104 — Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018651 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8552087-5] Кандау Р., Мур П.А., Ван Л., Барлев Н., Ин С.И., Розен К.А., Бергер С.Л. (февраль 1996 г.). «Идентификация белков человека, функционально консервативных с предполагаемыми дрожжевыми адаптерами ADA2 и GCN5» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (2): 593–602. дои : 10.1128/mcb.16.2.593 . ПМК 231038 . ПМИД 8552087 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: транскрипционный адаптер 2 TADA2L (гомолог ADA2, дрожжи)» .

[pmid9488450-7] Барлев Н.А., Полторацкий В., Оуэн-Хьюз Т., Ин С., Лю Л., Уоркман Дж.Л., Бергер С.Л. (март 1998 г.). «Репрессия активности гистон-ацетилтрансферазы GCN5 посредством опосредованного бромодоменом связывания и фосфорилирования Ku-ДНК-зависимым протеинкиназным комплексом» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (3): 1349–58. дои : 10.1128/mcb.18.3.1349 . ПМЦ 108848 . ПМИД 9488450 .

[pmid8972232-8] Ван Л., Миззен С., Ин С., Кандау Р., Барлев Н., Браунелл Дж., Эллис С.Д., Бергер С.Л. (январь 1997 г.). «Активность гистон-ацетилтрансферазы консервативна между дрожжами и человеческим GCN5 и необходима для комплементации роста и активации транскрипции» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (1): 519–27. дои : 10.1128/mcb.17.1.519 . ПМК 231776 . ПМИД 8972232 .

[pmid16189514-9] Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.Ю. , Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

[pmid11707411-10] Ван Т., Кобаяши Т., Такимото Р., Денес А.Е., Снайдер Э.Л., Эль-Дейри В.С., Брахманн Р.К. (ноябрь 2001 г.). «hADA3 необходим для активности p53» . Журнал ЭМБО . 20 (22): 6404–13. дои : 10.1093/emboj/20.22.6404 . ПМЦ 125723 . ПМИД 11707411 .

[pmid12660246-11] Лю X, Тесфай Дж., Эврард Ю.А., Дент С.Ю., Мартинес Э. (май 2003 г.). «Домен трансформации c-Myc рекрутирует человеческий комплекс STAGA и требует активности ацетилазы TRRAP и GCN5 для активации транскрипции» . Журнал биологической химии . 278 (22): 20405–12. дои : 10.1074/jbc.M211795200 . ПМК 4031917 . ПМИД 12660246 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]