СИНДЖ2

СИНДЖ2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1UFW
Идентификаторы
Псевдонимы	SYNJ2 , INPP5H, синаптоянин 2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 609410 ; МГИ : 1201671 ; Гомологен : 117703 ; Генные карты : SYNJ2 ; OMA : SYNJ2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	158,099,176 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	6,094,565 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	inferior ganglion of vagus nerve; ; internal globus pallidus; ; C1 segment; ; subthalamic nucleus; ; medulla oblongata; ; pons; ; superior vestibular nucleus; ; corpus callosum; ; inferior olivary nucleus; ; ventral tegmental area;
	Top expressed in
	muscle of thigh; ; spermatid; ; primary visual cortex; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; ascending aorta; ; soleus muscle; ; right ventricle; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; superior frontal gyrus; ; temporal muscle;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	phosphoric ester hydrolase activity; protein binding; hydrolase activity; RNA binding; nucleic acid binding; phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate 5-phosphatase activity; phosphatidylinositol phosphate 4-phosphatase activity; phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 5-phosphatase activity; phosphatidylinositol-3-phosphatase activity; phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate 3-phosphatase activity; phosphatidylinositol phosphate 5-phosphatase activity; inositol-polyphosphate 5-phosphatase activity; SH3 domain binding; PDZ domain binding; phosphatidylinositol-4-phosphate phosphatase activity;
Cellular component	cytoplasm; membrane raft; axon; cytosol; plasma membrane; cell projection; cytoskeleton; membrane; cytoplasmic microtubule; extrinsic component of mitochondrial outer membrane; ruffle membrane; axon terminus; perinuclear region of cytoplasm; presynapse;
Biological process	phosphatidylinositol biosynthetic process; phosphatidylinositol dephosphorylation; phosphatidylinositol-3-phosphate biosynthetic process; membrane organization; brain development; inositol phosphate dephosphorylation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8871
	20975
	ENSG00000078269
	ENSMUSG00000023805
	О15056
	Q9D2G5
	НМ_001178088 ; НМ_003898
showНМ_001113351 ; НМ_001113352 ; НМ_001113353 ; НМ_001290698 ; НМ_011523 ;
	NM_001357665; NM_001357667
	НП_001171559 ; НП_003889
showНП_001106822 ; НП_001106823 ; НП_001106824 ; НП_001277627 ; НП_035653 ;
	NP_001344594; NP_001344596
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Синаптоянин 2 — это белок , который у человека кодируется геном SYNJ2 . ^{[ 5 ]}

Функция

Ген является членом семейства инозитол-полифосфат-5-фосфатазы . Кодируемый белок взаимодействует с родственным ras субстратом ботулинического токсина C3 1 , что вызывает транслокацию кодируемого белка на плазматическую мембрану , где он ингибирует клатрин -опосредованный эндоцитоз . Альтернативный сплайсинг приводит к образованию множества вариантов транскрипта . [предоставлено RefSeq, май 2010 г.].

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000078269 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023805 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Энтрез Ген: Синаптоянин 2» .

Дальнейшее чтение

Лучано М, Лопес ЛМ, де Моор МХ, Харрис С.Э., Дэвис Дж., Нутиле Т, Крюгер Р.Ф., Эско Т., Шлессингер Д., Тошико Т., Дерринджер Х.Л., Реало А., Ханселл Н.К., Пергадия М.Л., Песонен А.К., Санна С., Терраччано А, Мэдден П.А., Пеннинкс Б., Спинховен П., Хартман К.А., Остра Б.А., Янссенс АС, Эрикссон Й.Г., Старр Й.М., Каннас А., Ферруччи Л., Метспалу А., Райт М.Дж., Хит АС, ван Дуйн СМ, Берут Л.Дж., Райкконен К., Мартин Н.Г., Чулло М., Руеску Д., Бумсма ДИ, Дири И.Дж. (март) 2012). «Гены-кандидаты на долголетие и их связь с личностными качествами пожилых людей» . Американский журнал медицинской генетики. Часть B. Нейропсихиатрическая генетика . 159Б (2): 192–200. дои : 10.1002/ajmg.b.32013 . ПМК 3583011 . ПМИД 22213687 .
Вервей К.Дж., Винхейзен А.А., Беньямин Б., Лински М.Т., Куэй Л., Агравал А., Гордон С.Д., Монтгомери Г.В., Мэдден П.А., Хит А.К., Спектор Т.Д., Мартин Н.Г., Медланд С.Э. (сентябрь 2013 г.). «Генетическая этиология начала употребления каннабиса: метаанализ полногеномных исследований ассоциаций и оценка наследственности на основе SNP» . Биология наркомании . 18 (5): 846–50. дои : 10.1111/j.1369-1600.2012.00478.x . ПМЦ 3548058 . ПМИД 22823124 .
Модрегер Дж., Шмидт А.А., Риттер Б., Хаттнер В.Б., Пломанн М. (февраль 2003 г.). «Характеристика эндофилина B1b, специфической для мозга мембранассоциированной ацилтрансферазы лизофосфатидной кислоты со свойствами, отличными от эндофилина А1» . Журнал биологической химии . 278 (6): 4160–7. дои : 10.1074/jbc.M208568200 . ПМИД 12456676 .
Спэний-Деккинг Э.Х., Ван Делфт Дж., Ван Дер Мейден Э., Химстра Х.С., Фалькенбург Дж.Х., Конинг Ф., Дрейфхаут Дж.В., Клюин-Нелеманс Дж.К. (декабрь 2003 г.). «Синаптоянин 2 распознается Т-клетками, специфичными для волосатоклеточного лейкоза, ограниченными HLA класса II» . Лейкемия . 17 (12): 2467–73. дои : 10.1038/sj.leu.2403174 . ПМИД 14562116 .
Чуанг Ю, Сюй Х, Квятковска А, Цапраиллис Г, Хван Х, Петритис К, Флинн Д, Саймонс М (2012). «Регуляция активности синаптоянин-2-5'-фосфатазы с помощью Src» . Адгезия и миграция клеток . 6 (6): 518–25. дои : 10.4161/cam.22139 . ПМЦ 3547897 . ПМИД 23076136 .
Вонг К.А., Уилсон Дж., Руссо А., Ван Л., Окур М.Н., Ван X, Мартин Н.П., Скаппини Е., Карнеги Г.К., О'Брайан Дж.П. (2012). «Семейство каркасов интерсектина (ITSN) функционирует как молекулярные концентраторы в сетях взаимодействия белков» . ПЛОС ОДИН . 7 (4): e36023. Бибкод : 2012PLoSO...736023W . дои : 10.1371/journal.pone.0036023 . ПМЦ 3338775 . ПМИД 22558309 .
Цзяо С., Сюй Л., Берндт С., Безье С., Бреннер Х., Бьюкенен Д., Каан Б.Дж., Кэмпбелл П.Т., Карлсон К.С., Кейси Дж., Чан А.Т., Чанг-Клод Дж., Чанок С., Конти Д.В., Кертис КР, Дагган Д., Галлингер С., Грубер С.Б., Харрисон Т.А., Хейс Р.Б., Хендерсон Б.Е., Хоффмайстер М., Хоппер Дж.Л., Хадсон Т.Дж., Хаттер С.М., Джексон Р.Д., Дженкинс М.А., Кантор Э.Д., Колонель Л.Н., Кюри С., Ле Маршан Л., Лемир М., Ньюкомб П.А., Поттер Дж.Д., Ку С.А., Росс С.А., Шон Р.Э., Шумахер Ф.Р., Семинара Д., Слэттери МЛ, Ульрих СМ, Занке БВ, Петерс У (2012). «Полногеномный поиск межгенных взаимодействий при колоректальном раке» . ПЛОС ОДИН . 7 (12): е52535. Бибкод : 2012PLoSO...752535J . дои : 10.1371/journal.pone.0052535 . ПМК 3530500 . ПМИД 23300701 .
Варнац Х.Дж., Шмидт Д., Манке Т., Пиччини И., Султан М., Бородина Т., Бальцерейт Д., Врук В., Солдатов А., Вингрон М., Лерах Х., Яспо М.Л. (июль 2011 г.). «Гены-мишени BTB и CNC гомологий 1 (BACH1) участвуют в реакции на окислительный стресс и в контроле клеточного цикла» . Журнал биологической химии . 286 (26): 23521–32. дои : 10.1074/jbc.M111.220178 . ПМК 3123115 . ПМИД 21555518 .
Чуанг Ю., Тран Н.Л., Раск Н., Накада М., Беренс М.Е., Саймонс М. (ноябрь 2004 г.). «Роль синаптоянина 2 в миграции и инвазии клеток глиомы» . Исследования рака . 64 (22): 8271–5. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-04-2097 . ПМИД 15548694 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 6 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000078269 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023805 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Энтрез Ген: Синаптоянин 2» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]