Defb105a

Defb105a
Идентификаторы
Псевдонимы	Defb105a , bd-5, defb-5, defb105, defensin beta 105a
Внешние идентификаторы	MGI : 1924924 ; Гомологен : 17531 ; Genecards : defb105a ; OMA : defb105a - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 8 (human)
End	7,823,880 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	19,164,866 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	muscle tissue; ; cell; ; blood; ; somatic cell; ; white blood cell; ; monocyte; ; renal cortex; ; endometrium; ; exocrine gland; ; cervix;
	Top expressed in
	zone of skin; ; testicle;
	More reference expression data
	n/a
hideОртологи
	245908
	77674
	ENSG00000186562
	Ensmusg00000043787
	Q8NG35
	Q8K4N3
	NM_152250
	NM_152802
	NP_689463
	NP_690015
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Бета-дефенсин 105 -это белок , который кодируется DEFB105A геном у людей. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Дефенсины образуют семейство микробицидных и цитотоксических пептидов, изготовленных нейтрофилами . Дефенсины представляют собой короткие обработанные пептидные молекулы, которые классифицируются по структуре на три группы: альфа -защитники , бета -защитники и тета -дефенсины . Все бета-дефенсиновые гены плотно кластеризованы в четырех-пяти синенических хромосомных областях. Хромосома 8p23 содержит как минимум две копии дублированного бета-дефенсинового кластера. Это дублирование приводит к двум идентичным копиям защиты, бета 105, DEFB105A и DEFB105B, в ориентации на хвост. Этот ген DEFB105A представляет более центромерную копию. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000186562 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000043787 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Schutte BC, Mitros JP, Bartlett JA, Walters JD, JIA HP, Welsh MJ, Casavant TL, McCray PB JR (февраль 2002 г.). «Открытие пяти консервативных бета -дефенсиновых генов с использованием стратегии вычислительного поиска» . Proc Natl Acad Sci USA . 99 (4): 2129–33. Bibcode : 2002pnas ... 99.2129S . doi : 10.1073/pnas.042692699 . PMC 122330 . PMID 11854508 .
^ Semple CA, Rolfe M, Dorin Jr (май 2003 г.). «Дублирование и отбор в эволюции приматов бета-дефенсиновых генов» . Геном биол . 4 (5): R31. doi : 10.1186/gb-2003-4-5-r31 . PMC 156587 . PMID 12734011 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: Defb105a Defensin, бета 105A" .

Дальнейшее чтение

Patil AA, Cai Y, Sang Y, et al. (2006). «Межвидовая анализ семейства генов бета-дефенсина млекопитающих: наличие синтенных генов и преимущественная экспрессия в мужском репродуктивном тракте». Физиол. Геномика . 23 (1): 5–17. doi : 10.1152/physiolgenomics.00104.2005 . PMID 16033865 . S2CID 22355626 .
Boniotto M, Ventura M, Eskdale J, et al. (2005). «Доказательства дублирования гена дефенсина человека DEFB4 в хромосомной области 8P22-23 и последствия для анализа распределения аллелей SNP». Генет. Тест . 8 (3): 325–7. doi : 10.1089/gte.2004.8.325 . PMID 15727258 .
Taudien S, Galgoczy P, Huse K, et al. (2006). «Полиморфные сегментарные дупликации при 8P23.1 оспаривают определение отдельного репертуара генов дефенсина и сборки смежной эталонной последовательности человека» . BMC Genomics . 5 (1): 92. doi : 10.1186/1471-2164-5-92 . PMC 544879 . PMID 15588320 .
Hollox EJ, Armor JA, Barber JC (2003). «Обширное изменение нормального числа копий бета-дефенсина кластера антимикробного гена» . Являюсь. J. Hum. Генет . 73 (3): 591–600. doi : 10.1086/378157 . PMC 1180683 . PMID 12916016 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Yamaguchi Y, Nagase T, Makita R, et al. (2002). «Идентификация множества новых изоформ бета-дефенсина, специфичных для эпидидимиса у людей и мышей» . J. Immunol . 169 (5): 2516–23. doi : 10.4049/jimmunol.169.5.2516 . PMID 12193721 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000186562 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000043787 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid11854508-5] Schutte BC, Mitros JP, Bartlett JA, Walters JD, JIA HP, Welsh MJ, Casavant TL, McCray PB JR (февраль 2002 г.). «Открытие пяти консервативных бета -дефенсиновых генов с использованием стратегии вычислительного поиска» . Proc Natl Acad Sci USA . 99 (4): 2129–33. Bibcode : 2002pnas ... 99.2129S . doi : 10.1073/pnas.042692699 . PMC 122330 . PMID 11854508 .

[pmid12734011-6] Semple CA, Rolfe M, Dorin Jr (май 2003 г.). «Дублирование и отбор в эволюции приматов бета-дефенсиновых генов» . Геном биол . 4 (5): R31. doi : 10.1186/gb-2003-4-5-r31 . PMC 156587 . PMID 12734011 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: Defb105a Defensin, бета 105A" .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]