Контрайфан

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary
PDB	1dfy , 1dfz , 1dg0 , 1nxn , 1qfb

Контрайфан
Контрайфан
	ЯМР- структура контраджифан-вн. Пептидная макавая изображена изогнутой трубкой, в то время как аминокислотные боковые цепи представлены с помощью палочек. Атомы углерода цветные серые, атомы азота голубые, атомы кислорода красными и атомами серы желтый. ; .
Идентификаторы
Символ	Contryphan_cs
Pfam	PF02950
InterPro	IPR011062
PROSITE	PS60027
Краткое содержание	2CCO / SCOPE / SUPFAM
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary
PDB	1dfy , 1dfz , 1dg0 , 1nxn , 1qfb

Контрайфан , ( Con Us + Try PTO Phan ) представляют собой семейство пептидов , которые являются активными компонентами мощного яда продуцируемого Cone Snail (род Conus ). Два аминокислотных остатков цистеина в контрактах связаны дисульфидной связью . Кроме того, контрарифаны подвергаются необычной степени посттрансляционной модификации, включая Эпимеризация лейцина , и триптофана , триптофана броминации гидроксилирования амидации конца С- и пролина . ^{[ 2 ]} В более широкой схеме генетической классификации конотоксинов контрагины являются членами «конотоксинового суперсемейства O2». ^{[ 3 ]}

Члены семьи

Члены семьи контрарфан включают в себя:

Пептид	Последовательность	Разновидность	Ссылка
DES (Gly1) Contryphan-r	Cowepwc-NH2	C. Radiant	^{[ 4 ]}
Контрифан-R	GCOWEPWC-NH2	Conus Radiant	^{[ 4 ]}
BromoContyphan-R	GCOWEPXC-NH2	C. Radiant	^{[ 5 ]}
Контрайфан-См	GCOWQPWC-NH2	Конус Stercusmuscarum	^{[ 6 ]}
Контрайфан-П	GCOWDPWC-NH ₂	C. purpuraseens	^{[ 6 ]}
Contryphan-R/TX	GCOWEPWC-NH2	Конус	^{[ 6 ]}
Contryphan-TX	GCOWQPYC-NH2	Конус	^{[ 6 ]}
Контрайфан-Вн	GDCPWKPWC-NH ₂	Конус желудочника	^{[ 7 ]}
Leu-Contryphan-P	Gcvllpwc-oh	Conus purpurascens	^{[ 8 ]}
Leu-Contryphan-TX	Cvlypwc-nh ₂	Конус	^{[ 6 ]}
Glaconryphan-m	NγSγCPWHPWC-NH ₂	Конус мрамор	^{[ 2 ]}

где соревнования последовательности обозначают:

O = 4-транс- гидроксипролин ,
l = d-leacine, l = l-le-leucine ,
w = d-tryptophan, w = l-tryptophan ,
γ = гамма-карбоксиглютамическая кислота ,
NH ₂ = С-терминальное амидирование

и оставшаяся часть букв относится к стандартным сокращениям одной буквы для аминокислот.

Механизм токсичности

Яд конусных улиток вызывает паралич их рыбной добычи. Молекулярная мишень не была определена для всех контракно-пептидов, однако известно, что контрарифан-VN является CA ²⁺-зависимый k ⁺ канал модулятор, ^{[ 7 ]} в то время как Glacontryphan-M является блокатором кальциевого канала L-типа . ^{[ 2 ]}

Ссылки

^ Pdb : 1nxn ; Elyso T, Out, Romeus C, Schinann ME, Massili GR, Poltcellels F, Ascenzi P, Paci M (июнь 2004 г.). "Струкция структуры цикцита пептида-VN, CA ²⁺-зависимый k ⁺ канал модулятор ». Биополимеры . 74 (3): 189–98. : 10.1002 /BIP.20025 . PMID 15150794. . S2CID 24487744 DOI
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Hansson K, Ma X, Eliasson L, Czerwiec E, Furie B, Furie BC, Rorsman P, Stenflo J (июль 2004 г.). «Первый гамма-карбобоксиглютамино-кислотный, содержащий контрариф. Селективный ионный ионный канал L-типа, изолированный из яда Conus Marmoreus» . Журнал биологической химии . 279 (31): 32453–63. doi : 10.1074/jbc.m313825200 . PMID 15155730 .
^ Робинсон С.Д., Нортон Р.С. (декабрь 2014 г.). "Конотоксин генов суперсемейства" . Морские лекарства . 12 (12): 6058–101. doi : 10.3390/md12126058 . PMC 4278219 . PMID 25522317 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Jimenéz EC, Olivera BM, Grey WR, Cruz LJ (ноябрь 1996 г.). «Контрайфан-это D-трипптофан, содержащий пептид Conus» . Журнал биологической химии . 271 (45): 28002–5. doi : 10.1074/jbc.271.45.28002 . PMID 8910408 .
^ Хименес Э.К., Крейг А.Г., Уоткинс М., Хиллиард Д.Р., Грей В.Р., Гуляс Дж., Ривье Дж., Круз Л.Дж., Оливера Б.М. (февраль 1997 г.). «Bromocontryphan: посттрансляционная бромирование триптофана». Биохимия . 36 (5): 989–94. doi : 10.1021/bi962840p . PMID 9033387 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Джейкобсен Р., Хименес Е.К., Грилли М., Уоткинс М., Хиллиард Д., Круз Л.Дж., Оливера Б.М. (март 1998 г.). «Контрайфаны, D-триптофан, содержащая семейство пептидов Conus: взаимосвязь между конформерами». Журнал исследований пептидов . 51 (3): 173–9. doi : 10.1111/j.1399-3011.1998.tb01213.x . PMID 9531419 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Massilia GR, Schininà ME, Ascenzi P, Polticelli F (ноябрь 2001 г.). «Contryphan-VN: новый пептид из яда средиземноморской улитки Conus Ventricosus». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 288 (4): 908–13. doi : 10.1006/bbrc.2001.5833 . PMID 11688995 .
^ Jacobsen RB, Jimenez EC, De La Cruz RG, Grey WR, Cruz LJ, Olivera BM (август 1999 г.). «Новый D-Le-Leucine-содержащий пептид CONUS: разнообразная конформационная динамика в семействе контратифан». Журнал исследований пептидов . 54 (2): 93–9. doi : 10.1034/j.1399-3011.1999.00093.x . PMID 10461743 .

Внешние ссылки

Контрайфан библиотеки США в Национальной библиотеке медицинской (Mesh)

[pmid15150794-1] Pdb : 1nxn ; Elyso T, Out, Romeus C, Schinann ME, Massili GR, Poltcellels F, Ascenzi P, Paci M (июнь 2004 г.). "Струкция структуры цикцита пептида-VN, CA ²⁺-зависимый k ⁺ канал модулятор ». Биополимеры . 74 (3): 189–98. : 10.1002 /BIP.20025 . PMID 15150794. . S2CID 24487744 DOI

[pmid15155730-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Hansson K, Ma X, Eliasson L, Czerwiec E, Furie B, Furie BC, Rorsman P, Stenflo J (июль 2004 г.). «Первый гамма-карбобоксиглютамино-кислотный, содержащий контрариф. Селективный ионный ионный канал L-типа, изолированный из яда Conus Marmoreus» . Журнал биологической химии . 279 (31): 32453–63. doi : 10.1074/jbc.m313825200 . PMID 15155730 .

[3] Робинсон С.Д., Нортон Р.С. (декабрь 2014 г.). "Конотоксин генов суперсемейства" . Морские лекарства . 12 (12): 6058–101. doi : 10.3390/md12126058 . PMC 4278219 . PMID 25522317 .

[pmid8910408-4] Jump up to: ^а ^{беременный} Jimenéz EC, Olivera BM, Grey WR, Cruz LJ (ноябрь 1996 г.). «Контрайфан-это D-трипптофан, содержащий пептид Conus» . Журнал биологической химии . 271 (45): 28002–5. doi : 10.1074/jbc.271.45.28002 . PMID 8910408 .

[pmid9033387-5] Хименес Э.К., Крейг А.Г., Уоткинс М., Хиллиард Д.Р., Грей В.Р., Гуляс Дж., Ривье Дж., Круз Л.Дж., Оливера Б.М. (февраль 1997 г.). «Bromocontryphan: посттрансляционная бромирование триптофана». Биохимия . 36 (5): 989–94. doi : 10.1021/bi962840p . PMID 9033387 .

[pmid9531419-6] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Джейкобсен Р., Хименес Е.К., Грилли М., Уоткинс М., Хиллиард Д., Круз Л.Дж., Оливера Б.М. (март 1998 г.). «Контрайфаны, D-триптофан, содержащая семейство пептидов Conus: взаимосвязь между конформерами». Журнал исследований пептидов . 51 (3): 173–9. doi : 10.1111/j.1399-3011.1998.tb01213.x . PMID 9531419 .

[pmid11688995-7] Jump up to: ^а ^{беременный} Massilia GR, Schininà ME, Ascenzi P, Polticelli F (ноябрь 2001 г.). «Contryphan-VN: новый пептид из яда средиземноморской улитки Conus Ventricosus». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 288 (4): 908–13. doi : 10.1006/bbrc.2001.5833 . PMID 11688995 .

[pmid10461743-8] Jacobsen RB, Jimenez EC, De La Cruz RG, Grey WR, Cruz LJ, Olivera BM (август 1999 г.). «Новый D-Le-Leucine-содержащий пептид CONUS: разнообразная конформационная динамика в семействе контратифан». Журнал исследований пептидов . 54 (2): 93–9. doi : 10.1034/j.1399-3011.1999.00093.x . PMID 10461743 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]