FLRT3

FLRT3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	5CMN, 5CMP
Идентификаторы
Псевдонимы	FLRT3 , HH21, трансмембранный белок 3, богатый фибронектином и лейцином.
Внешние идентификаторы	Опустить : 604808 ; МГИ : 1918686 ; Гомологен : 8322 ; Генные карты : FLRT3 ; ОМА : FLRT3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	14,337,614 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	140,513,389 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	endothelial cell; ; lower lobe of lung; ; pericardium; ; Brodmann area 23; ; middle temporal gyrus; ; renal medulla; ; visceral pleura; ; germinal epithelium; ; jejunal mucosa; ; hair follicle;
	Top expressed in
	genital tubercle; ; hand; ; abdominal wall; ; tail of embryo; ; hair follicle; ; mandibular prominence; ; otolith organ; ; ganglionic eminence; ; maxillary prominence; ; olfactory tubercle;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein-macromolecule adaptor activity; protein homodimerization activity; fibroblast growth factor receptor binding; protein kinase inhibitor activity; protein binding; chemorepellent activity;
Cellular component	cytoplasm; axon terminus; integral component of membrane; synaptic membrane; cell projection; endoplasmic reticulum membrane; membrane; cell-cell junction; focal adhesion; axonal growth cone; integral component of plasma membrane; extracellular region; axon; endoplasmic reticulum; extracellular space; cytosol; plasma membrane; cell junction; extracellular matrix; glutamatergic synapse; integral component of postsynaptic membrane;
Biological process	negative chemotaxis; negative regulation of protein kinase activity; cytokine-mediated signaling pathway; head development; neuron projection extension; axon guidance; multicellular organism development; heart development; cell adhesion; response to axon injury; embryonic morphogenesis; proepicardium cell migration involved in pericardium morphogenesis; synapse assembly; neuron projection development; negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT; positive regulation of synapse assembly; fibroblast growth factor receptor signaling pathway; cell-cell adhesion via plasma-membrane adhesion molecules; synaptic membrane adhesion;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	23767
	71436
	ENSG00000125848
	ENSMUSG00000051379
	Q9NZU0
	Q8BGT1
	НМ_013281 ; НМ_198391
	НМ_001172160 ; НМ_178382
	НП_037413 ; НП_938205
	НП_001165631 ; НП_848469
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Трансмембранный белок FLRT3 с богатыми лейцином повторами представляет собой белок , который у человека кодируется FLRT3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

FLRT1 , FLRT2 и FLRT3 являются членами семейства трансмембранных белков, богатых фибронектином и лейцином (FLRT). Они могут участвовать в клеточной адгезии и/или передаче сигналов рецепторам. Их белковые структуры напоминают небольшие лейцином богатые протеогликаны, обнаруженные во внеклеточном матриксе. FLRT3 имеет 55% идентичности аминокислотной последовательности с FLRT1 и 44% идентичности с FLRT2. FLRT3 экспрессируется в почках , головном мозге , поджелудочной железе , скелетных мышцах, легких , печени , плаценте и сердце . Для этого гена описаны два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000125848 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000051379 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Лейси С.Е., Боннеманн К.Г., Бузни Э.А., Кункель Л.М. (март 2000 г.). «Идентификация FLRT1, FLRT2 и FLRT3: новое семейство трансмембранных богатых лейцином повторяющихся белков». Геномика . 62 (3): 417–26. дои : 10.1006/geno.1999.6033 . ПМИД 10644439 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: трансмембранный белок 3, богатый фибронектином и лейцином FLRT3» .

Дальнейшее чтение

Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевых слов in silico для селекции полноразмерных кДНК человека, кодирующих секреторные или мембранные белки из библиотек кДНК с олигокепками» . ДНК Рез . 12 (2): 117–26. дои : 10.1093/dnares/12.2.117 . ПМИД 16303743 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нишикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретируемых белков (SPDI), крупномасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые человеком и трансмембранные белки: оценка биоинформатики» . Геном Рез . 13 (10): 2265–70. дои : 10.1101/гр.1293003 . ПМЦ 403697 . ПМИД 12975309 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Делоукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. и др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ 20 хромосомы человека» . Природа . 414 (6866): 865–71. Бибкод : 2001Natur.414..865D . дои : 10.1038/414865a . ПМИД 11780052 .
Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К. и др. (2000). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XVII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 7 (2): 143–50. дои : 10.1093/dnares/7.2.143 . ПМИД 10819331 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 20 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000125848 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000051379 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10644439-5] Лейси С.Е., Боннеманн К.Г., Бузни Э.А., Кункель Л.М. (март 2000 г.). «Идентификация FLRT1, FLRT2 и FLRT3: новое семейство трансмембранных богатых лейцином повторяющихся белков». Геномика . 62 (3): 417–26. дои : 10.1006/geno.1999.6033 . ПМИД 10644439 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: трансмембранный белок 3, богатый фибронектином и лейцином FLRT3» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]