ТФЭ3

ТФЭ3
Идентификаторы
Псевдонимы	TFE3 , RCCP2, RCCX1, TFEA, bHLHe33, связывание фактора транскрипции с энхансером 3 IGHM, MRXSPF
Внешние идентификаторы	Опустить : 314310 ; МГИ : 98511 ; Гомологен : 4755 ; Генные карты : TFE3 ; ОМА : TFE3 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	49,043,410 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	X chromosome (mouse)
End	7,641,441 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	inferior olivary nucleus; ; dorsal motor nucleus of vagus nerve; ; olfactory bulb; ; seminal vesicula; ; stromal cell of endometrium; ; secondary oocyte; ; left uterine tube; ; cartilage tissue; ; external globus pallidus; ; right adrenal cortex;
	Top expressed in
	zygote; ; granulocyte; ; secondary oocyte; ; primary oocyte; ; thin ascending limb of loop of Henle; ; molar; ; epiblast; ; cumulus cell; ; ankle; ; yolk sac;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; protein dimerization activity; DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; protein binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleoplasm; nucleus; cytosol;
Biological process	positive regulation of cell adhesion; transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; regulation of transcription, DNA-templated; adaptive immune response; regulation of osteoclast differentiation; immune system process; positive regulation of transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; humoral immune response; negative regulation of cold-induced thermogenesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7030
	209446
	ENSG00000068323
	ENSMUSG00000000134
	P19532
	Q64092
	НМ_001282142 ; НМ_006521
showНМ_001105196 ; НМ_001105197 ; НМ_001271489 ; НМ_001271490 ; НМ_001271491 ;
	NM_172472
	НП_001269071 ; НП_006512
showНП_001098666 ; НП_001098667 ; НП_001258418 ; НП_001258419 ; НП_001258420 ;
	NP_766060
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Транскрипционный фактор Е3 представляет собой белок , который у человека кодируется TFE3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

TFE3, член семейства транскрипционных факторов спираль-петля-спираль , связывается с мотивом mu-E3 энхансера тяжелой цепи иммуноглобулина и экспрессируется во многих типах клеток (Henthorn et al., 1991). ] ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что TFE3 взаимодействует с:

Транслокации

Часть случаев рака почки (ПКР), возникающих у молодых пациентов, связана с транслокациями, вовлекающими ген TFE3 на хромосоме Xp11.2 PRCC. ^{[ нужна ссылка ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000068323 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000134 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Пак Дж.М., Стюарт К.С., Хентхорн П.С. (май 1991 г.). «Высокочастотный RFLP в локусе TFE3 человека на Х-хромосоме» . Нуклеиновые кислоты Рез . 19 (3): 684. doi : 10.1093/nar/19.3.684-a . ПМЦ 333678 . ПМИД 1672758 .
^ Хентхорн П.С., Стюарт К.С., Кадеш Т., Пак Дж.М. (февраль 1992 г.). «Ген, кодирующий человеческий TFE3, фактор транскрипции, который связывает энхансер тяжелой цепи иммуноглобулина, сопоставляется с Xp11.22». Геномика . 11 (2): 374–8. дои : 10.1016/0888-7543(91)90145-5 . ПМИД 1685140 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: связывание транскрипционного фактора TFE3 с энхансером 3 IGHM» .
^ Джангранде П.Х., Холлстром Т.К., Туньяплин С., Каламе К., Невинс-младший (июнь 2003 г.). «Идентификация фактора E-box TFE3 как функционального партнера фактора транскрипции E2F3» . Мол. Клетка. Биол . 23 (11): 3707–20. дои : 10.1128/mcb.23.11.3707-3720.2003 . ПМК 155231 . ПМИД 12748276 .
^ Стейнгримссон Э., Тессаролло Л., Патак Б., Хоу Л., Арнхайтер Х., Коупленд Н.Г., Дженкинс Н.А. (апрель 2002 г.). «Mitf и Tfe3, два члена семейства Mitf-Tfe транскрипционных факторов bHLH-Zip, играют важную, но функционально дублирующую роль в развитии остеокластов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (7): 4477–82. Бибкод : 2002PNAS...99.4477S . дои : 10.1073/pnas.072071099 . ПМЦ 123673 . ПМИД 11930005 .
^ Мански К.К., Сульцбахер С., Пурдом Г., Нельсен Л., Хьюм Д.А., Рели М., Островски М.С. (февраль 2002 г.). «Фактор транскрипции микрофтальмии и родственные ему факторы «спираль-петля-спираль-молния» TFE-3 и TFE-C взаимодействуют, чтобы активировать промотор тартрат-резистентной кислой фосфатазы» . Дж. Леукок. Биол . 71 (2): 304–10. дои : 10.1189/jlb.71.2.304 . ПМИД 11818452 . S2CID 22801820 .
^ Гринберг А.В., Керппола Т. (март 2003 г.). «И Max, и TFE3 взаимодействуют с белками Smad, связывая промотор ингибитора активатора плазминогена-1, но они оказывают противоположные эффекты на транскрипционную активность» . Ж. Биол. Хим . 278 (13): 11227–36. дои : 10.1074/jbc.M211734200 . ПМИД 12551947 .
^ Хуа X, Миллер З.А., Ву Г, Ши Ю, Лодиш Х.Ф. (ноябрь 1999 г.). «Специфичность трансформации транскрипции, индуцированной фактором роста бета, гена ингибитора активатора плазминогена-1: взаимодействие промоторной ДНК, фактора транскрипции muE3 и белков Smad» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 96 (23): 13130–5. Бибкод : 1999PNAS...9613130H . дои : 10.1073/pnas.96.23.13130 . ПМК 23912 . ПМИД 10557285 .

Дальнейшее чтение

Бекманн Х, Кадеш Т (1991). «Лейциновая застежка-молния TFE3 определяет специфичность димеризации спираль-петля-спираль» . Генс Дев . 5 (6): 1057–66. дои : 10.1101/gad.5.6.1057 . ПМИД 2044953 .
Бекманн Х, Су ЛК, Кадеш Т (1990). «TFE3: белок спираль-петля-спираль, который активирует транскрипцию посредством мотива muE3, усиливающего иммуноглобулин» . Генс Дев . 4 (2): 167–79. дои : 10.1101/gad.4.2.167 . ПМИД 2338243 .
Чжао GQ, Чжао Q, Чжоу X, Маттеи М.Г., де Кромбрюгге Б (1993). «TFEC, основной белок спираль-петля-спираль, образует гетеродимеры с TFE3 и ингибирует TFE3-зависимую активацию транскрипции» . Мол. Клетка. Биол . 13 (8): 4505–12. дои : 10.1128/mcb.13.8.4505 . ПМК 360062 . ПМИД 8336698 .
Сидхар С.К., Кларк Дж., Гилл С., Хамуди Р., Крю А.Дж., Гвиллиам Р., Росс М., Линехан В.М., Бердсолл С., Шипли Дж., Купер К.С. (1997). «Транслокация t(X;1)(p11.2;q21.2) при папиллярной почечно-клеточной карциноме объединяет новый ген PRCC с геном транскрипционного фактора TFE3» . Хм. Мол. Жене . 5 (9): 1333–8. дои : 10.1093/hmg/5.9.1333 . ПМИД 8872474 .
Ветерман М.А., Уилбринк М., Гертс ван Кессель А. (1997). «Слияние гена транскрипционного фактора TFE3 с новым геном PRCC в t(X;1)(p11;q21)-положительных папиллярных почечно-клеточных карциномах» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (26): 15294–8. дои : 10.1073/pnas.93.26.15294 . ПМК 26398 . ПМИД 8986805 .
Кларк Дж., Лу Ю.Дж., Сидхар С.К., Паркер С., Гилл С., Смедли Д., Хамуди Р., Линехан В.М., Шипли Дж., Купер К.С. (1997). «Слияние генов факторов сплайсинга PSF и NonO (p54nrb) с геном TFE3 при папиллярной почечно-клеточной карциноме» . Онкоген . 15 (18): 2233–9. дои : 10.1038/sj.onc.1201394 . ПМИД 9393982 .
Хуа X, Лю X, Ансари ДО, Лодиш Х.Ф. (1998). «Синергическое сотрудничество TFE3 и белков smad в TGF-бета-индуцированной транскрипции гена ингибитора активатора плазминогена-1» . Генс Дев . 12 (19): 3084–95. дои : 10.1101/gad.12.19.3084 . ПМК 317197 . ПМИД 9765209 .
Стейнгримссон Э., Тессаролло Л., Рид С.В., Дженкинс Н.А., Коупленд Н.Г. (1999). «Фактор транскрипции bHLH-Zip Tfeb необходим для васкуляризации плаценты» . Разработка . 125 (23): 4607–16. дои : 10.1242/dev.125.23.4607 . ПМИД 9806910 .
Хуа Х, Миллер З.А., Ву Г, Ши Ю, Лодиш Х.Ф. (1999). «Специфичность трансформации транскрипции, индуцированной фактором роста бета, гена ингибитора активатора плазминогена-1: взаимодействие промоторной ДНК, фактора транскрипции muE3 и белков Smad» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 96 (23): 13130–5. Бибкод : 1999PNAS...9613130H . дои : 10.1073/pnas.96.23.13130 . ПМК 23912 . ПМИД 10557285 .
Ветерман М.Дж., ван Гронинген Дж.Дж., Янсен А., ван Кессель А.Г. (2000). «Ядерная локализация и трансактивирующая способность белков TFE3 и PRCC (слияния), связанных с папиллярной почечно-клеточной карциномой» . Онкоген . 19 (1): 69–74. дои : 10.1038/sj.onc.1203255 . ПМИД 10644981 .
Хуа Х, Миллер З.А., Бенчабане Х., Врана Дж.Л., Лодиш Х.Ф. (2000). «Синергизм между факторами транскрипции TFE3 и Smad3 в трансформирующей транскрипции гена Smad7, индуцированной бета-фактором роста» . Ж. Биол. Хим . 275 (43): 33205–8. дои : 10.1074/jbc.C000568200 . ПМИД 10973944 .
Ладани М, Луи МЮ, Антонеску ЧР, Краузе-Бем А, Мейндл А, Аргани П, Хили Дж. Х., Уэда Т, Йошикава Х, Мелони-Эриг А, Соренсен П.Х., Мертенс Ф, Мандал Н, ван ден Берге Х, Скиот Р. , Дал Син П., Бридж Дж. (2001). «der(17)t(X;17)(p11;q25) альвеолярной саркомы мягких тканей человека объединяет ген фактора транскрипции TFE3 с ASPL, новым геном в 17q25» . Онкоген . 20 (1): 48–57. дои : 10.1038/sj.onc.1204074 . ПМИД 11244503 .
Ветерман М.А., ван Гронинген Дж.Дж., ден Хартог А., Гертс ван Кессель А. (2001). «Способность к трансформации слитых генов PRCCTFE3 и TFE3PRCC, связанных с папиллярной почечно-клеточной карциномой». Онкоген . 20 (12): 1414–24. дои : 10.1038/sj.onc.1204213 . ПМИД 11313885 . S2CID 2671248 .
Хейманн П., Эль Хусни Х., Огур Г., Ветерман М.А., Петти Э.М., Вассарт Г. (2001). «Слияние нового гена RCC17 с геном TFE3 в папиллярной почечно-клеточной карциноме, несущей t (X; 17) (p11.2; q25.3)». Рак Рез . 61 (10): 4130–5. ПМИД 11358836 .
Чунг MC, Ким Х.К., Кавамото С. (2001). «TFEC может функционировать как активатор транскрипции гена тяжелой цепи-А немышечного миозина II в трансфицированных клетках». Биохимия . 40 (30): 8887–97. дои : 10.1021/bi002847d . ПМИД 11467950 .
Динтильяк А., Бернюес Дж. (2002). «HMGB1 взаимодействует со многими явно неродственными белками, распознавая короткие аминокислотные последовательности» . Ж. Биол. Хим . 277 (9): 7021–8. дои : 10.1074/jbc.M108417200 . hdl : 10261/112516 . ПМИД 11748221 .
Кавата Ю, Сузуки Х, Хигаки Ю, Денисенко О, Шуллери Д, Абрасс С, Бомштик К (2002). «Элемент-зависимая активация bcn-1 гена цепи ламинина гамма-1 за счет совместного действия транскрипционного фактора E3 (TFE3) и белков Smad» . Ж. Биол. Хим . 277 (13): 11375–84. дои : 10.1074/jbc.M111284200 . ПМИД 11801598 .
Стейнгримссон Э., Тессаролло Л., Патак Б., Хоу Л., Арнхайтер Х., Коупленд Н.Г., Дженкинс Н.А. (2002). «Mitf и Tfe3, два члена семейства Mitf-Tfe транскрипционных факторов bHLH-Zip, играют важную, но функционально дублирующую роль в развитии остеокластов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (7): 4477–82. Бибкод : 2002PNAS...99.4477S . дои : 10.1073/pnas.072071099 . ПМЦ 123673 . ПМИД 11930005 .

Эта статья о гене человека Х-хромосомы и/или связанном с белке незавершена . ним Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000068323 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000134 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1672758-5] Пак Дж.М., Стюарт К.С., Хентхорн П.С. (май 1991 г.). «Высокочастотный RFLP в локусе TFE3 человека на Х-хромосоме» . Нуклеиновые кислоты Рез . 19 (3): 684. doi : 10.1093/nar/19.3.684-a . ПМЦ 333678 . ПМИД 1672758 .

[pmid1685140-6] Хентхорн П.С., Стюарт К.С., Кадеш Т., Пак Дж.М. (февраль 1992 г.). «Ген, кодирующий человеческий TFE3, фактор транскрипции, который связывает энхансер тяжелой цепи иммуноглобулина, сопоставляется с Xp11.22». Геномика . 11 (2): 374–8. дои : 10.1016/0888-7543(91)90145-5 . ПМИД 1685140 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: связывание транскрипционного фактора TFE3 с энхансером 3 IGHM» .

[pmid12748276-8] Джангранде П.Х., Холлстром Т.К., Туньяплин С., Каламе К., Невинс-младший (июнь 2003 г.). «Идентификация фактора E-box TFE3 как функционального партнера фактора транскрипции E2F3» . Мол. Клетка. Биол . 23 (11): 3707–20. дои : 10.1128/mcb.23.11.3707-3720.2003 . ПМК 155231 . ПМИД 12748276 .

[pmid11930005-9] Стейнгримссон Э., Тессаролло Л., Патак Б., Хоу Л., Арнхайтер Х., Коупленд Н.Г., Дженкинс Н.А. (апрель 2002 г.). «Mitf и Tfe3, два члена семейства Mitf-Tfe транскрипционных факторов bHLH-Zip, играют важную, но функционально дублирующую роль в развитии остеокластов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (7): 4477–82. Бибкод : 2002PNAS...99.4477S . дои : 10.1073/pnas.072071099 . ПМЦ 123673 . ПМИД 11930005 .

[pmid11818452-10] Мански К.К., Сульцбахер С., Пурдом Г., Нельсен Л., Хьюм Д.А., Рели М., Островски М.С. (февраль 2002 г.). «Фактор транскрипции микрофтальмии и родственные ему факторы «спираль-петля-спираль-молния» TFE-3 и TFE-C взаимодействуют, чтобы активировать промотор тартрат-резистентной кислой фосфатазы» . Дж. Леукок. Биол . 71 (2): 304–10. дои : 10.1189/jlb.71.2.304 . ПМИД 11818452 . S2CID 22801820 .

[pmid12551947-11] Гринберг А.В., Керппола Т. (март 2003 г.). «И Max, и TFE3 взаимодействуют с белками Smad, связывая промотор ингибитора активатора плазминогена-1, но они оказывают противоположные эффекты на транскрипционную активность» . Ж. Биол. Хим . 278 (13): 11227–36. дои : 10.1074/jbc.M211734200 . ПМИД 12551947 .

[pmid10557285-12] Хуа X, Миллер З.А., Ву Г, Ши Ю, Лодиш Х.Ф. (ноябрь 1999 г.). «Специфичность трансформации транскрипции, индуцированной фактором роста бета, гена ингибитора активатора плазминогена-1: взаимодействие промоторной ДНК, фактора транскрипции muE3 и белков Smad» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 96 (23): 13130–5. Бибкод : 1999PNAS...9613130H . дои : 10.1073/pnas.96.23.13130 . ПМК 23912 . ПМИД 10557285 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]