SETD6

SETD6
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3QXY, 3RC0
Идентификаторы
Псевдонимы	SETD6 , домен SET, содержащий 6, домен SET, содержащий 6, протеинлизинметилтрансфераза
Внешние идентификаторы	Опустить : 616424 ; МГИ : 1913333 ; Гомологен : 38743 ; Генные карты : SETD6 ; OMA : SETD6 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 16 (human)
End	58,523,842 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	95,719,010 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; body of pancreas; ; right hemisphere of cerebellum; ; tendon of biceps brachii; ; right uterine tube; ; right lobe of thyroid gland; ; left lobe of thyroid gland; ; cerebellar vermis; ; pituitary gland; ; anterior pituitary;
	Top expressed in
	otic placode; ; ascending aorta; ; saccule; ; aortic valve; ; otic vesicle; ; external carotid artery; ; internal carotid artery; ; proximal tubule; ; zygote; ; yolk sac;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	methyltransferase activity; transferase activity; protein binding; NF-kappaB binding; protein-lysine N-methyltransferase activity;
Cellular component	nucleus; nucleoplasm; cytosol;
Biological process	stem cell population maintenance; histone lysine methylation; methylation; negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; peptidyl-lysine monomethylation; stem cell differentiation; regulation of inflammatory response;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	79918
	66083
	ENSG00000103037
	ENSMUSG00000031671
	Q8TBK2
	Q9CWY3
	НМ_001160305 ; НМ_024860
	НМ_001035123
	НП_001153777 ; НП_079136
	НП_001030295 ; НП_001355283
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Домен SET, содержащий 6, представляет собой белок человека, кодируемый геном SETD6 . ^{[ 5 ]}

SETD6 монометилирует субъединицу RelA ядерного фактора каппа B (NF-κB). Монометилирование RelA по лизину 310 (RelAK310me1) приводит к конститутивной репрессии генов-мишеней RelA путем рекрутирования PKMT G9a-подобного белка (GLP), который катализирует H3K9me2 и приводит к молчанию хроматина и репрессии генов. В ответ на стимуляцию TNFa и липополисахаридом фосфорилирование RelA по серину 311 (RelAS311ph) с помощью PKCzeta физически блокирует взаимодействие между GLP и RelAK310me1, что приводит к активации транскрипции. ^{[ 6 ]}

Метилирование PAK4 с помощью SETD6 способствует активации пути Wnt/β-катенин. SETD6 связывает и метилирует PAK4 как in vitro, так и в клетках на хроматине. Истощение SETD6 в различных клеточных линиях приводит к резкому снижению экспрессии генов-мишеней Wnt/β-катенина. ^{[ 7 ]}

SETD6 связывается с DJ1, но не метилирует его. В базальных условиях SETD6 и DJ1 связываются с хроматином, который ингибирует DJ1 и активирует транскрипционную активность Nrf2. В ответ на окислительный стресс уровни мРНК и белка SETD6 резко снижаются. ^{[ 8 ]}

SETD6 специфически связывает и метилирует PLK1 во время митоза на участках K209 и K413. Истощение SETD6, а также двойная замена остатков лизина (K209/413R) приводит к повышению каталитической активности PLK1, что приводит к ускорению различных стадий митоза, заканчивающихся ранним цитокинезом. ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000103037 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031671 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтреза: домен SET, содержащий 6» . Архивировано из оригинала 5 декабря 2010 г. Проверено 1 ноября 2017 г.
^ Леви Д., Куо Эй.Дж., Чанг Ю., Шефер Ю., Китсон С., Чунг П., Зеркало А., Зи Б.М., Лю С.Л., Тангсомбатвизит С., Теннен Р.И., Куо А.Ю., Танцзин С., Чунг Р., Чуа К.Ф., Утц П.Дж., Ши Х. , Принджа Р.К., Ли К., Гарсия Б.А., Бедфорд М.Т., Тараховский А., Ченг Икс, Гозани О (январь 2011 г.). «Метилирование лизина субъединицы RelA NF-κB с помощью SETD6 связывает активность гистон-метилтрансферазы GLP в хроматине с тонической репрессией передачи сигналов NF-κB» . Природная иммунология . 12 (1): 29–3 дои : 10.1038/н.1968 . ПМК 3074206 . ПМИД 21131967 .
^ Вершинин З., Фельдман М., Чен А., Леви Д. (март 2016 г.). «Метилирование PAK4 с помощью SETD6 способствует активации пути Wnt/β-катенин» . Журнал биологической химии . 291 (13): 6786–95. дои : 10.1074/jbc.M115.697292 . ПМЦ 4807267 . ПМИД 26841865 .
^ Чен А., Фельдман М., Вершинин З., Леви Д. (февраль 2016 г.). «SETD6 является негативным регулятором реакции на окислительный стресс». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Механизмы регуляции генов . 1859 (2): 420–7. дои : 10.1016/j.bbagrm.2016.01.003 . ПМИД 26780326 .
^ Фельдман М., Вершинин З., Голианд И., Элия Н., Леви Д. (январь 2019 г.). «Метилтрансфераза SETD6 регулирует прогрессию митоза посредством метилирования PLK1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 116 (4): 1235–1240. Бибкод : 2019PNAS..116.1235F . дои : 10.1073/pnas.1804407116 . ПМК 6347700 . ПМИД 30622182 .

Дальнейшее чтение

Вейл Л.Е., Шмидов Ю., Кублановский М., Моргенштерн Д., Фельдман М., Биттон Р., Леви Д. (октябрь 2018 г.). «Олигомеризация и аутометилирование человеческой лизинметилтрансферазы SETD6». Журнал молекулярной биологии . 430 (21): 4359–4368. дои : 10.1016/j.jmb.2018.08.028 . ПМИД 30189201 . S2CID 52167348 .
Кублановский М., Ахарони А., Леви Д. (июль 2018 г.). «Улучшенное распознавание ПКМТ-субстрата за счет взаимодействия неактивных центров». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 501 (4): 1029–1033. дои : 10.1016/j.bbrc.2018.05.103 . ПМИД 29778536 . S2CID 205956659 .
Фельдман М., Леви Д. (январь 2018 г.). «Пептидное ингибирование каталитической активности метилтрансферазы SETD6» . Онкотаргет . 9 (4): 4875–4885. дои : 10.18632/oncotarget.23591 . ПМК 5797019 . ПМИД 29435148 .
Мартин-Моралес Л., Фельдман М., Вершинин З., Гарре П., Кальдес Т., Леви Д. (ноябрь 2017 г.). рака «Доминантно-негативная мутация SETD6 при семейном типе колоректального » Молекулярная генетика человека . 26 (22): 4481–4493. дои : 10.1093/hmg/ddx336 . ПМИД 28973356 .
Чанг Ю, Леви Д., Хортон-младший, Пэн Дж., Чжан Х, Гозани О, Ченг Х (август 2011 г.). «Структурная основа SETD6-опосредованной регуляции сети NF-kB посредством передачи сигналов метиллизина» . Исследования нуклеиновых кислот . 39 (15): 6380–9. дои : 10.1093/nar/gkr256 . ПМК 3159447 . ПМИД 21515635 .
Леви Д., Лю С.Л., Ян З., Ньюман А.М., Ализаде А.А., Утц П.Дж., Гозани О (октябрь 2011 г.). «Протеомный подход к идентификации новых субстратов лизинметилтрансферазы» . Эпигенетика и хроматин . 4:19 . дои : 10.1186/1756-8935-4-19 . ПМК 3212905 . ПМИД 22024134 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 16 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000103037 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031671 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Энтреза: домен SET, содержащий 6» . Архивировано из оригинала 5 декабря 2010 г. Проверено 1 ноября 2017 г.

[6] Леви Д., Куо Эй.Дж., Чанг Ю., Шефер Ю., Китсон С., Чунг П., Зеркало А., Зи Б.М., Лю С.Л., Тангсомбатвизит С., Теннен Р.И., Куо А.Ю., Танцзин С., Чунг Р., Чуа К.Ф., Утц П.Дж., Ши Х. , Принджа Р.К., Ли К., Гарсия Б.А., Бедфорд М.Т., Тараховский А., Ченг Икс, Гозани О (январь 2011 г.). «Метилирование лизина субъединицы RelA NF-κB с помощью SETD6 связывает активность гистон-метилтрансферазы GLP в хроматине с тонической репрессией передачи сигналов NF-κB» . Природная иммунология . 12 (1): 29–3 дои : 10.1038/н.1968 . ПМК 3074206 . ПМИД 21131967 .

[7] Вершинин З., Фельдман М., Чен А., Леви Д. (март 2016 г.). «Метилирование PAK4 с помощью SETD6 способствует активации пути Wnt/β-катенин» . Журнал биологической химии . 291 (13): 6786–95. дои : 10.1074/jbc.M115.697292 . ПМЦ 4807267 . ПМИД 26841865 .

[8] Чен А., Фельдман М., Вершинин З., Леви Д. (февраль 2016 г.). «SETD6 является негативным регулятором реакции на окислительный стресс». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Механизмы регуляции генов . 1859 (2): 420–7. дои : 10.1016/j.bbagrm.2016.01.003 . ПМИД 26780326 .

[9] Фельдман М., Вершинин З., Голианд И., Элия Н., Леви Д. (январь 2019 г.). «Метилтрансфераза SETD6 регулирует прогрессию митоза посредством метилирования PLK1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 116 (4): 1235–1240. Бибкод : 2019PNAS..116.1235F . дои : 10.1073/pnas.1804407116 . ПМК 6347700 . ПМИД 30622182 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]