Лабиринтуломицеты
| Лабиринтуломицеты | |
|---|---|
| |
| Клетка с сетью эктоплазматических нитей ( Aplanochytrium sp.) | |
Научная классификация 
| |
| Домен: | Эукариоты |
| Клэйд : | потогонные средства |
| Клэйд : | САР |
| Клэйд : | Страменопилес |
| Тип: | Бигира |
| Подтип: | Сагенист |
| Сорт: | Лабиринтуломицеты Аркс, 1970 г., Дик, 2001 г. |
| Заказы [ 1 ] | |
| Синонимы | |
| |
Лабиринтуломицеты ( ICBN ) или Labyrinthulea [ 2 ] ( ICZN ) — класс простейших , образующих сеть нитей или трубок, [ 3 ] которые служат дорожками для скольжения клеток и поглощения для них питательных веществ . Двумя основными группами являются лабиринтулиды (или сети слизи) и траустохитриды . Они в основном морские , обычно встречаются как паразиты на водорослях и морских травах или как разлагатели мертвого растительного материала. К ним относятся также некоторые паразиты морских беспозвоночных и миксотрофные виды, живущие в симбиотических отношениях с зоохлореллой . [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ]
Характеристики
[ редактировать ] |
Нити лабиринтуломицетов, хотя и находятся вне клеток, окружены мембраной . Они образуются и соединяются с цитоплазмой уникальной органеллой, называемой сагеногеном или ботросомой. Клетки безъядерные , обычно яйцевидной формы, движутся вперед и назад вдоль аморфной сети со скоростью от 5 до 150 мкм в минуту. У лабиринтулид клетки заключены внутри трубочек, а у траустохитрид - прикреплены к их бокам.
Эволюция
[ редактировать ]Эволюционное происхождение
[ редактировать ]Лабиринтуломицеты не грибы , а монофилетическая группа эукариот внутри Stramenopiles . Они принадлежат к типу Bigyra , который содержит другие гетеротрофные микроорганизмы, такие как бикозоециды . Учитывая, что пластиды Stramenopiles , возможно, являются результатом эндосимбиоза у их последнего общего предка , бикозоециды и лабиринтуломицеты могли произойти от миксотрофных водорослей общего предка , который вторично потерял свои пластиды. [ 3 ]
Некоторые особенности лабиринтуломицетов можно объяснить их происхождением от предковых пластид. Они производят полиненасыщенные жирные кислоты омега-3 с помощью десатуразы, обычно присутствующей в хлоропластах . Зооспоры лабиринтулид имеют глазное пятно, состоящее из связанных с мембраной гранул, напоминающее глазные пятна фотосинтезирующих страменопилей, которые либо находятся внутри пластиды, либо, как полагают, происходят из пластиды. [ 3 ]
Внутри Bigyra лабиринтуломицеты являются родственной группой Eogyrea Pseudophyllomitus , классу, включающему вид vesiculosus и экологическую кладу под названием MAST-4. Вместе они составляют подтип Sagenista . [ 7 ] [ 8 ]
| Страменопилес | |
Классификация
[ редактировать ]Labyrinthulomycetes или Labyrinthulea раньше составляли несуществующий тип грибов Labyrinthulomycota. [ 9 ] Первоначально их считали необычными слизевиками , хотя они не очень похожи на другие виды. Структура их зооспор и генетические исследования показывают, что они представляют собой примитивную группу гетероконтов , но их классификация и лечение остаются несколько нерешенными.
Этот класс обычно включал два порядка: Labyrinthulales и Thraustochytriales (ICBN) или Labyrinthulida и Thraustochytrida (ICZN), но недавно была предложена другая классификация. [ 6 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 1 ] [ 9 ]
- Отряд Labyrinthulales / Labyrinthulida EA Bessey 1950/Doffein
- Семейство Aplanochytriaceae / Aplanochytriidae Leander ex Cavalier-Smith 2012
- Aplanochytrium Bahnweg & Sparrow 1972 [= Labyrinthuloides Perkins 1973 ]
- Семейство Labyrinthulaceae / Labyrinthulidae Haeckel 1868/Cinekowksa.
- Лабиринтомикса Дюбоск 1921 г.
- Псевдоплазмодий Молиш 1925 г.
- Labyrinthula Cienkowski 1864 [= Labyrinthodictyon Valkanov 1969 ; Лабиринториза Шадефо, 1956 ]
- Клада семейного уровня "Stellarchytriaceae/Stellarchytriidae" - эта группа временно помещена в Labyrinthulida. [ 9 ] [ 1 ] но, согласно филогенетическому анализу, расходится раньше остальных лабиринтовых клад. [ 11 ]
- Стеллахитриум ФиоРито и Леандер 2016
- Семейство Aplanochytriaceae / Aplanochytriidae Leander ex Cavalier-Smith 2012
- Отряд Oblongichytriales / Oblongichytrida.
- Семейство Oblongichytriaceae / Oblongichytriidae Cavalier-Smith 2012
- Облонгихитриум Йокояма и Хонда 2007 г.
- Семейство Oblongichytriaceae / Oblongichytriidae Cavalier-Smith 2012
- Отряд Thraustochytriales / Thraustochytrida Sparrow 1973.
- Пирросор, июль 1901 г.
- Танатострея Франк и Арви, 1969 г.
- Семейство Althornidiaceae / Althorniidae Jones & Alderman 1972.
- Алторния Джонс и Олдерман, 1972 г.
- Семейство Thraustochytriacae / Thraustochytriidae Sparrow ex Cejp 1959
- Japanochytrium Kobayasi & Road 1953
- Моноризохитриум Дои и Хонда 2017
- Sicyoidochytrium Yokoy., Саллех и Хонда, 2007 г.
- Аурантиохитриум Йокой. и Хонда 2007 г.
- Улькения Гертн. 1977 год
- Париетихитриум Йокой., Саллех и Хонда, 2007 г.
- Botryochytrium Yokoy., Саллех и Хонда, 2007 г.
- Шизохитриум Голдст. и Бельский исправляют. Бут и Милл.
- Траустохитриум Воробей 1936 г.
- Хондаа Амато и Каньяк 2018
- Лабиринтулохитриум Хассетт и Грейдингер, 2018 г. [ 12 ]
- Отряд «Amphitremidales»/ Amphitremida Gomaa et al. 2013 год
- Семейство «Amphitremidiaceae»/ Amphitremidae Poch 1913.
- Парамфитрема Валканов 1970г.
- Арчерелла Леблих и Таппан, 1961 г.
- Амфитрема Арчер 1867 г.
- Семейство Diplophrydaceae / Diplophryidae Cavalier-Smith 2012.
- Диплофрис Баркер 1868 г.
- Семейство «Amphitremidiaceae»/ Amphitremidae Poch 1913.
- Орден "Амфифилы"/ Amphifilida Cavalier Smith 2012 г.
- Family Sorodiplophryidae Cavalier-Smith 2012
- Sorodiplophrys Olive & Dykstra 1975
- Фиброфрис Такахаши и др. 2016 год
- Семейство Amphifilidae Кавалер-Смит 2012 г.
- Род Amphifila Cavalier-Smith 2012.
- Family Sorodiplophryidae Cavalier-Smith 2012
Генетический код
[ редактировать ]Лабиринтуломицет Thraustochytrium aureum отличается альтернативным генетическим кодом митохондрий , использующих ТТА в качестве стоп-кодона вместо кодирования лейцина . [ 13 ] Этот код представлен таблицей трансляции NCBI 23, Thraustochytrium митохондриальный код . [ 14 ]
| Генетический код | Перевод стол |
Кодон ДНК | Кодон РНК | Перевод с этим кодом |
Стандартный код (Таблица перевода 1) | |||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Траустохитрий митохондриальный | 23 | ТТА | УАА | СТОП = Тер (*) | Лео (Л) | |||
Галерея
[ редактировать ]-
Апланохитриум сп. под световым микроскопом -
Апланохитриум сп. под СЭМ -
Аурантиохитриум сп. -
Тест амфитремы , раковинной амебы, недавно включенной в группу -
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с Адл С.М., Басс Д., Лейн CE, Лукеш Дж., Шох К.Л., Смирнов А., Агата С., Берни С., Браун М.В., Бурки Ф., Карденас П., Чепичка И., Чистякова Л., дель Кампо Дж., Данторн М., Эдвардсен Б., Эглит. Ю, Гийу Л., Хампл В., Хейсс А.А., Хоппенрат М., Джеймс Т.Ю., Карнковска А, Карпов С, Ким Э, Колиско М, Кудрявцев А, Лар DJG, Лара Е, Ле Галл Л, Линн Д.Х., Манн Д.Г., Массана Р., Митчелл И.Д., Морроу С., Парк Дж.С., Павловски Дж.В., Пауэлл М.Дж., Рихтер Д.Д. , Рюкерт С., Шедвик Л., Шимано С., Шпигель Ф.В., Торруэлла Г., Юсеф Н., Златогурский. В., Чжан Ц (2019). «Пересмотр классификации, номенклатуры и разнообразия эукариот» . Журнал эукариотической микробиологии . 66 (1): 4–119. дои : 10.1111/jeu.12691 . ПМК 6492006 . ПМИД 30257078 .
- ^ Кавальер-Смит, Т. (1997). «Сагениста и бигира, два типа гетеротрофных гетероконтных хромистов». Архив для защиты . 148 (3): 253–267. дои : 10.1016/S0003-9365(97)80006-1 .
- ^ Перейти обратно: а б с Цуй, Клемент К.М.; Маршалл, Уит; Ёкояма, Ринка; Хонда, Дайске; Липпмайер, Дж. Кейси; Крэйвен, Келли Д; Петерсон, Пол Д.; Берби, Мэри Л. (январь 2009 г.). «Филогения лабиринтуломицетов и ее значение для эволюционной потери хлоропластов и приобретения эктоплазматического скольжения». Молекулярная филогенетика и эволюция . 50 (1): 129–40. дои : 10.1016/j.ympev.2008.09.027 . ПМИД 18977305 .
- ^ Шерер, Л.; Кнофлах, Д.; Визосо, Д.Б.; Ригер, Г.; Пейнтнер, У. (2007). «Траустохитриды как новые паразитические протисты морских свободноживущих плоских червей: Thraustochytrium caudivorum sp. nov. Паразитирует Macrostomum lignano» (PDF) . Морская биология . 152 (5): 1095. doi : 10.1007/s00227-007-0755-4 . S2CID 4836350 .
- ^ Пан, Цзинвэнь (2016). Метаанализ разнообразия лабиринтуломицетов (MSc). Университет Британской Колумбии. дои : 10.14288/1.0223199 .
- ^ Перейти обратно: а б Гомаа, Фатма; Митчелл, Эдвард А.Д.; Лара, Энрике (2013). «Amphitremida (poche, 1913) — новая крупная и повсеместно распространенная клада лабиринтуломицетов» . ПЛОС Один . 8 (1): e53046. Бибкод : 2013PLoSO...853046G . дои : 10.1371/journal.pone.0053046 . ПМЦ 3544814 . ПМИД 23341921 .
- ^ Кавальер-Смит, Томас (2017). «Королевство Chromista и его восемь типов: новый синтез, подчеркивающий нацеливание на перипластидные белки, эволюцию цитоскелета и перипластид, а также древние расхождения» . Протоплазма . 255 (1): 297–357. дои : 10.1007/s00709-017-1147-3 . ПМЦ 5756292 . ПМИД 28875267 .
- ^ Тхакур, Рабиндра; Ширатори, Такаши; Исида, Кен-итиро (2019). «Мультигенный филогенетический анализ, богатый таксонами, разрешает филогенетические отношения между страменопилами с глубоким разветвлением» . Протист . 170 (5): 125682. doi : 10.1016/j.protis.2019.125682 . ISSN 1434-4610 . PMID 31568885 . S2CID 202865459 .
- ^ Перейти обратно: а б с Беннетт, Руэл М.; Хонда, Д.; Бикс, Гордон В.; Тайнс, Марко (2017). «Глава 14. Лабиринтуломикота». В Арчибальде, Джон М.; Симпсон, Аластер ГБ; Сламовиц, Клаудио Х. (ред.). Справочник протистов . Спрингер. стр. 507–542. дои : 10.1007/978-3-319-28149-0_25 . ISBN 978-3-319-28147-6 .
- ^ Андерсон, О. Роджер; Кавальер-Смит, Томас (2012). «Ультраструктура Diplophrys parva, нового мелкого пресноводного вида, и пересмотренный анализ Labyrinthulea (Heterokonta)» . Акта Протозоология . 8 (1): 291–304. дои : 10.4467/16890027AP.12.023.0783 .
- ^ Перейти обратно: а б ФиоРито, Ребекка; Леандер, Селеста; Леандер, Брайан (2016). «Характеристика трех новых видов Labyrinthulomycota, выделенных из охряных морских звезд (Pisaster ochraceus)». Морская биология . 163 (8): 170. doi : 10.1007/s00227-016-2944-5 . S2CID 43399688 .
- ^ Хассетт, Брэндон Т.; Градингер, Рольф (2018). «Новые виды сапробных Labyrinthulea (= Labyrinthulomycota) и появление гена nov. для решения молекулярной полифилии внутри апланохитрид». Журнал эукариотической микробиологии . 65 (4): 475–483. дои : 10.1111/jeu.12494 . hdl : 10037/13570 . ISSN 1550-7408 . ПМИД 29265676 . S2CID 46820836 .
- ^ Уайдман, Джереми Г.; Монье, Адам; Родригес-Мартинес, Ракель; Леонард, Гай; Кук, Эмили; Пуарье, Камилла; Магуайр, Финли; Милнер, Дэвид С.; Ирвин, Николас А.Т.; Мур, Карен; Санторо, Элисон Э. (25 ноября 2019 г.). «Неожиданное разнообразие митохондриального генома, выявленное с помощью целенаправленной геномики одиночных клеток гетеротрофных жгутиковых простейших» . Природная микробиология . 5 (1): 154–165. дои : 10.1038/s41564-019-0605-4 . hdl : 10871/39819 . ISSN 2058-5276 . ПМИД 31768028 . S2CID 208279678 .
- ^ Эльжановский А., Остелл Дж., Лейпе Д., Суссов В. «Генетические коды» . Браузер таксономии . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США . Проверено 11 августа 2016 г.
- ^ Циенковский, Л. (1867). О строительстве и развитии лабиринтных тоннелей. Арка микро. Анат , 3:274, [1] .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
