КМТ5А

КМТ5А
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1ZKK, 2BQZ, 3F9W, 3F9X, 3F9Y, 3F9Z, 4IJ8, 5HQ2
Идентификаторы
Псевдонимы	KMT5A , PR-Set7, SET07, SET8, SETD8, лизинметилтрансфераза 5А, PR/SET07
Внешние идентификаторы	Опустить : 607240 ; МГИ : 1915206 ; Гомологен : 41372 ; Генные карты : KMT5A ; ОМА : КМТ5А – ортологи
Номер ЕС	2.1.1.354
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	123,409,353 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	124,600,371 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sural nerve; ; ventricular zone; ; right coronary artery; ; thoracic aorta; ; ascending aorta; ; Descending thoracic aorta; ; Achilles tendon; ; right lobe of thyroid gland; ; body of pancreas; ; popliteal artery;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; genital tubercle; ; gastrula; ; granulocyte; ; muscle of thigh; ; pyloric antrum; ; zygote; ; lip; ; knee joint; ; ventricular zone;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein-lysine N-methyltransferase activity; methyltransferase activity; transcription corepressor activity; p53 binding; protein binding; transferase activity; lysine N-methyltransferase activity; histone-lysine N-methyltransferase activity; histone methyltransferase activity (H4-K20 specific);
Cellular component	nucleus; nucleoplasm; chromosome; cytosol;
Biological process	methylation; regulation of transcription, DNA-templated; peptidyl-lysine monomethylation; cell cycle; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; negative regulation of transcription, DNA-templated; cell division; transcription, DNA-templated; regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; histone lysine methylation; regulation of signal transduction by p53 class mediator; histone H4-K20 methylation; chromatin organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	387893
	67956
	ENSG00000183955
	ENSMUSG00000049327
	Q9NQR1
	Q2YDW7
showНМ_020382 ; НМ_001324504 ; НМ_001324505 ; НМ_001324506 ; НМ_001367386 ;
	NM_001367388; NM_001367389
	НМ_030241 ; НМ_001310723 ; НМ_001310725 ; НМ_001310727
showНП_001311433 ; НП_001311434 ; НП_001311435 ; НП_065115 ; НП_001354315 ;
	NP_001354317; NP_001354318
showНП_001297652 ; НП_001297654 ; НП_001297656 ; НП_084517 ; НП_001392317 ;
	NP_001392319
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

N-лизинметилтрансфераза КМТ5А — фермент , который у человека кодируется КМТ5А геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Фермент представляет собой гистон-метилтрансферазу , содержащую домен SET и специфичную к лизину . Фермент переносит одну метильную группу на гистона H4 остаток лизина в положении 20. S -аденозилметионин (SAM) является как кофактором , так и донором метильной группы. Остаток лизина превращается в N ⁶-остаток метиллизина .

Эту модификацию гистонов часто обозначают сокращенно H4K20me1:

H4 - тип гистона
К - символ лизина
20 - модифицированное положение остатка лизина
я - сокращение от метильной группы
1 - количество перенесенных метильных групп

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000183955 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000049327 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Кутюр Ж.Ф., Коллазо Э., Брунзель Дж.С., Тривел Р.С. (июнь 2005 г.). «Структурный и функциональный анализ SET8, метилтрансферазы гистона H4 Lys-20» . Гены и развитие . 19 (12): 1455–65. дои : 10.1101/gad.1318405 . ПМЦ 1151662 . ПМИД 15933070 .
^ Нисиока К., Райс Дж.С., Сарма К., Эрджюмент-Бромаж Х., Вернер Дж., Ван Ю., Чуйков С., Валенсуэла П., Темпст П., Стюард Р., Лис Дж.Т., Эллис К.Д., Рейнберг Д. (июнь 2002 г.). «PR-Set7 представляет собой специфичную для нуклеосом метилтрансферазу, которая модифицирует лизин 20 гистона H4 и связана с молчащим хроматином» . Молекулярная клетка . 9 (6): 1201–13. дои : 10.1016/S1097-2765(02)00548-8 . ПМИД 12086618 .
^ Фанг Дж., Фэн К.С., Кетел К.С., Ван Х., Цао Р., Ся Л., Эрджюмент-Бромаж Х., Темпст П., Саймон Дж.А., Чжан Ю. (июль 2002 г.). «Очистка и функциональная характеристика SET8, нуклеосомного гистона H4-лизин-20-специфической метилтрансферазы» . Современная биология . 12 (13): 1086–99. Бибкод : 2002CBio...12.1086F . дои : 10.1016/S0960-9822(02)00924-7 . ПМИД 12121615 . S2CID 15504308 .
^ «Ген Энтреза: лизинметилтрансфераза 5А KMT5A [Homo sapiens (человек)]» .

Дальнейшее чтение

Миззен К.А., Ян XJ, Кокубо Т., Браунелл Дж.Э., Баннистер А.Дж., Оуэн-Хьюз Т., Уоркман Дж., Ван Л., Бергер С.Л., Кузаридес Т., Накатани Ю., Эллис К.Д. (декабрь 1996 г.). «Субъединица TAF (II) 250 TFIID обладает активностью гистон-ацетилтрансферазы» . Клетка . 87 (7): 1261–70. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81821-8 . ПМИД 8980232 . S2CID 18409257 .
Райс Дж.К., Нисиока К., Сарма К., Стюард Р., Рейнберг Д., Эллис К.Д. (сентябрь 2002 г.). «Митотически-специфическое метилирование гистона H4 Lys 20 следует за усилением экспрессии PR-Set7 и его локализацией в митотических хромосомах» . Гены и развитие . 16 (17): 2225–30. дои : 10.1101/gad.1014902 . ПМК 186671 . ПМИД 12208845 .
Шлисио С., Гальперин Т., Видал М., Невинс-младший (ноябрь 2002 г.). «Взаимодействие YY1 с E2F, опосредованное RYBP, обеспечивает механизм специфичности функции E2F» . Журнал ЭМБО . 21 (21): 5775–86. дои : 10.1093/emboj/cdf577 . ПМК 131074 . ПМИД 12411495 .
Сяо Б., Цзин С., Уилсон-младший, Уокер П.А., Васишт Н., Келли Г., Хауэлл С., Тейлор И.А., Блэкберн ГМ, Гамблин С.Дж. (февраль 2003 г.). «Структура и каталитический механизм гистон-метилтрансферазы человека SET7/9» (PDF) . Природа . 421 (6923): 652–6. Бибкод : 2003Natur.421..652X . дои : 10.1038/nature01378 . ПМИД 12540855 . S2CID 4423407 .
Сяо Б., Цзин С., Келли Г., Уокер П.А., Маскетт Ф.В., Френкил Т.А., Мартин С.Р., Сарма К., Рейнберг Д., Гамблин С.Дж., Уилсон Дж.Р. (июнь 2005 г.). «Специфичность и механизм действия гистонов метилтрансферазы Pr-Set7» . Гены и развитие . 19 (12): 1444–54. дои : 10.1101/gad.1315905 . ПМЦ 1151661 . ПМИД 15933069 .
Инь Ю, Лю С., Цай С.Н., Чжоу Б, Нгай С.М., Чжу Г (август 2005 г.). «SET8 распознает последовательность RRHRK20VLRDN на N-конце гистона H4 и монометилирует лизин 20» . Журнал биологической химии . 280 (34): 30025–31. дои : 10.1074/jbc.M501691200 . ПМИД 15964846 .
Ши X, Качирская I, Ямагути Х, Вест ЛЭ, Вэнь Х, Ван ЭВ, Дутта С, Аппелла Э, Гозани О (август 2007 г.). «Модуляция функции р53 посредством SET8-опосредованного метилирования лизина 382» . Молекулярная клетка . 27 (4): 636–46. doi : 10.1016/j.molcel.2007.07.012 . ПМЦ 2693209 . ПМИД 17707234 .
Танака Х., Такебаяси С.И., Сакамото А., Игата Т., Накацу Ю., Сайто Н., Хино С., Накао М. (февраль 2017 г.). «Метилтрансфераза SETD8/PR-Set7 действует как барьер для предотвращения метаболического ремоделирования, связанного со старением» . Отчеты по ячейкам . 18 (9): 2148–2161. дои : 10.1016/j.celrep.2017.02.021 . ПМИД 28249161 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 12 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000183955 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000049327 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid15933070-5] Кутюр Ж.Ф., Коллазо Э., Брунзель Дж.С., Тривел Р.С. (июнь 2005 г.). «Структурный и функциональный анализ SET8, метилтрансферазы гистона H4 Lys-20» . Гены и развитие . 19 (12): 1455–65. дои : 10.1101/gad.1318405 . ПМЦ 1151662 . ПМИД 15933070 .

[pmid12086618-6] Нисиока К., Райс Дж.С., Сарма К., Эрджюмент-Бромаж Х., Вернер Дж., Ван Ю., Чуйков С., Валенсуэла П., Темпст П., Стюард Р., Лис Дж.Т., Эллис К.Д., Рейнберг Д. (июнь 2002 г.). «PR-Set7 представляет собой специфичную для нуклеосом метилтрансферазу, которая модифицирует лизин 20 гистона H4 и связана с молчащим хроматином» . Молекулярная клетка . 9 (6): 1201–13. дои : 10.1016/S1097-2765(02)00548-8 . ПМИД 12086618 .

[pmid12121615-7] Фанг Дж., Фэн К.С., Кетел К.С., Ван Х., Цао Р., Ся Л., Эрджюмент-Бромаж Х., Темпст П., Саймон Дж.А., Чжан Ю. (июль 2002 г.). «Очистка и функциональная характеристика SET8, нуклеосомного гистона H4-лизин-20-специфической метилтрансферазы» . Современная биология . 12 (13): 1086–99. Бибкод : 2002CBio...12.1086F . дои : 10.1016/S0960-9822(02)00924-7 . ПМИД 12121615 . S2CID 15504308 .

[entrez-8] «Ген Энтреза: лизинметилтрансфераза 5А KMT5A [Homo sapiens (человек)]» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]