PCDH17

PCDH17
Идентификаторы
Псевдонимы	PCDH17 , PCDH68, PCH68, Protocadherin 17
Внешние идентификаторы	Омим : 611760 ; MGI : 2684924 ; Гомологен : 8700 ; GeneCards : PCDH17 ; OMA : PCDH17 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 13 (human)
End	57,729,311 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 14 (mouse)
End	84,776,442 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	endothelial cell; ; visceral pleura; ; sperm; ; Brodmann area 23; ; entorhinal cortex; ; lower lobe of lung; ; pars reticulata; ; superior vestibular nucleus; ; germinal epithelium; ; ventral tegmental area;
	Top expressed in
	lateral hypothalamus; ; ventromedial nucleus; ; dorsomedial hypothalamic nucleus; ; anterior amygdaloid area; ; mammillary body; ; lateral septal nucleus; ; paraventricular nucleus of hypothalamus; ; ventral tegmental area; ; arcuate nucleus; ; supraoptic nucleus;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	calcium ion binding; protein binding;
Cellular component	integral component of membrane; plasma membrane; membrane; integral component of plasma membrane; glutamatergic synapse; GABA-ergic synapse; integral component of postsynaptic membrane; integral component of presynaptic membrane;
Biological process	presynaptic active zone assembly; adult behavior; regulation of synaptic vesicle clustering; negative regulation of synaptic transmission; homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; cell adhesion; cell-cell signaling; synapse assembly; synaptic membrane adhesion;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	27253
	219228
	ENSG00000118946
	Ensmusg00000035566
	O14917
	n/a
	NM_001040429 ; NM_014459
	NM_001013753
	NP_001035519
	n/a
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Протокадгерин-17 -это белок , который у людей кодируется PCDH17 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Этот ген принадлежит к семейству генов протокадерина, подсемейству суперсемейства кадгерина. Кодированный белок содержит шесть внеклеточных кадгериновых доменов, трансмембранного домена и цитоплазматический хвост, отличающийся от таковых классических кадгеринов. Кодированный белок может играть роль в создании и функции специфических клеточных связей в мозге. ^{[ 6 ]} Обнаружено, что метилирование промотора PCDH17 тесно связано со раком мочевого пузыря злокачественной ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000118946 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG00000035566 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Nollet F, Kools P, Van Roy F (июль 2000). «Филогенетический анализ суперсемейства кадгерина позволяет идентифицировать шесть основных подсемейств, кроме нескольких одиночных членов». J Mol Biol . 299 (3): 551–72. doi : 10.1006/jmbi.2000.3777 . PMID 10835267 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: PCDH17 Protocadherin 17» .
^ Ван XB (апрель 2014 г.). «Промотало -промотор -промотор -промотор в опухолевой ткани у пациентов с переходным клеточным карциномой мочевого пузыря» . J Int Med Res . 42 (2): 292–9. doi : 10.1177/0300060513504364 . PMID 24567353 . S2CID 38799502 .

Дальнейшее чтение

Яги Т., Такечи М (2000). «Гены суперсемейства кадгерина: функции, геномная организация и неврологическое разнообразие» . Гены Дев . 14 (10): 1169–80. doi : 10.1101/gad.14.10.1169 . PMID 10817752 . S2CID 44844497 .
Suzuki St (2000). «Недавний прогресс в исследованиях протокадеринов». Эксплуат Ячейка . 261 (1): 13–8. doi : 10.1006/excr.2000.5039 . PMID 11082270 .
Wu Q, Maniatis T (2000). «Большие экзоны, кодирующие множественные эктодомены, являются характерной особенностью генов протокадерина» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 97 (7): 3124–9. Bibcode : 2000pnas ... 97.3124W . doi : 10.1073/pnas.060027397 . PMC 16203 . PMID 10716726 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК» . НАТ Генет . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 . S2CID 21903526 .
Dunham A, Matthews LH, Burton J, et al. (2004). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы человека 13» . Природа . 428 (6982): 522–8. Bibcode : 2004natur.428..522d . doi : 10.1038/nature02379 . PMC 2665288 . PMID 15057823 .
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, et al. (2004). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях» . Геном Res . 14 (9): 1711–8. doi : 10.1101/gr.2435604 . PMC 515316 . PMID 15342556 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов» . Геном Res . 16 (1): 55–65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .
Szafranski K, Schindler S, Taudien S, et al. (2007). «Нарушение правил сплайсинга: TG-динуклеотиды функционируют как альтернативные 3 'сайта сплайсинга в U2-зависимых интронах» . Биология генома . 8 (8): R154. doi : 10.1186/gb-2007-8-8-r154 . PMC 2374985 . PMID 17672918 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 13 представляет собой заглушку . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000118946 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG00000035566 - ENSEMBL , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid10835267-5] Nollet F, Kools P, Van Roy F (июль 2000). «Филогенетический анализ суперсемейства кадгерина позволяет идентифицировать шесть основных подсемейств, кроме нескольких одиночных членов». J Mol Biol . 299 (3): 551–72. doi : 10.1006/jmbi.2000.3777 . PMID 10835267 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: PCDH17 Protocadherin 17» .

[pmid_=_24567353-7] Ван XB (апрель 2014 г.). «Промотало -промотор -промотор -промотор в опухолевой ткани у пациентов с переходным клеточным карциномой мочевого пузыря» . J Int Med Res . 42 (2): 292–9. doi : 10.1177/0300060513504364 . PMID 24567353 . S2CID 38799502 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]