Jump to content

Полимерная основа

(Перенаправлено с Белковой магистрали )
ИЮПАК определение

Основная цепь или Backbone
Эта линейная цепь, к которой относятся все другие цепи, длинные или короткие, или обе,
можно рассматривать как подвеску.

Примечание . Если две или более цепей
в равной степени можно считать основной цепью, то есть
выбрано, что приводит к простейшему представлению
молекула. [1]

В науке о полимерах полимерная цепь или просто основная цепь является полимера основной цепью полимера. Полимеры часто классифицируют по элементам в основных цепях. Характер основной цепи, т.е. ее гибкость, определяет свойства полимера (например, температуру стеклования ). Например, в полисилоксанах (силиконе) основная цепь очень гибкая, что приводит к очень низкой температуре стеклования - -123 ° C (-189 ° F; 150 К). [2] Полимеры с жесткой основой склонны к кристаллизации (например, политиофены ) в тонких пленках и растворах . Кристаллизация, в свою очередь, влияет на оптические свойства полимеров, их оптическую запрещенную зону и электронные уровни. [3]

Органические полимеры

[ редактировать ]
Образование полистирола, полимера с органической основой.

Обычные синтетические полимеры имеют основные цепи, состоящие из углерода, т.е. CCCC... Примеры включают полиолефины , такие как полиэтилен ((CH 2 CH 2 ) n ) и множество замещенных производных ((CH 2 CH(R)) n ), таких как полистирол ( R = C 6 H 5 ), полипропилен (R = CH 3 ) и акрилаты (R = CO 2 R').

Другими основными классами органических полимеров являются полиэфиры и полиамиды . В их основной цепи помимо углеродных цепей имеются соответственно группы -C(O)-O- и -C(O)-NH-. Основными коммерческими продуктами являются полиэтилентерефталат («ПЭТ») ((C 6 H 4 CO 2 C 2 H 4 OC(O)) n ) и нейлон-6 ((NH(CH 2 ) 5 C(O)) n ).

Неорганические полимеры

[ редактировать ]
Полидиметилсилоксан классифицируется как « неорганический полимер », поскольку в его основной цепи отсутствует углерод.

Силоксаны являются ярким примером неорганического полимера, хотя они имеют большое количество органических заместителей. Их основная связь состоит из чередующихся атомов кремния и кислорода, т. е. Si-O-Si-O... Атомы кремния несут два заместителя, обычно метил , как в случае полидиметилсилоксана . Некоторые необычные, но показательные неорганические полимеры включают политиазил ((SN)x) с чередующимися атомами S и N и полифосфаты ((PO 3 ) н ).

Биополимеры

[ редактировать ]

Основными семействами биополимеров являются полисахариды (углеводы), пептиды и полинуклеотиды . Известно множество вариантов каждого. [4]

Белки и пептиды

[ редактировать ]

Белки характеризуются амидными связями (-N(H)-C(O)-), образующимися при конденсации аминокислот . Последовательность аминокислот в основной цепи полипептида известна как первичная структура белка. Как и почти все полимеры, белок сворачивается и скручивается, образуя вторичную структуру , которая становится жесткой за счет водородных связей между карбонильными атомами кислорода и амидными атомами водорода в основной цепи, т.е. C=O---HN. Дальнейшие взаимодействия между остатками отдельных аминокислот формируют третичную структуру белка . По этой причине первичная структура аминокислот в основной цепи полипептида представляет собой карту окончательной структуры белка и, следовательно, указывает на его биологическую функцию. [5] [4] Пространственные положения атомов основной цепи можно реконструировать по положениям альфа-углеродов с использованием вычислительных инструментов для реконструкции основной цепи. [6]

Упрощенный пример конденсации, показывающий альфа- и бета -классификацию. Глюкоза и фруктоза образуют сахарозу . Синтез гликогена в организме осуществляется ферментом гликогенсинтазой , который использует уходящую группу уридиндифосфата (УДФ).

Углеводы

[ редактировать ]

Углеводы возникают в результате конденсации моносахаридов , таких как глюкоза . Полимеры можно разделить на олигосахариды (до 10 остатков) и полисахариды (до примерно 50 000 остатков). Основная цепь характеризуется эфирной связью между отдельными моносахаридами. Эта связь называется гликозидной связью . [7] Эти основные цепи могут быть неразветвленными (содержащими одну линейную цепь) или разветвленными (содержащими несколько цепей). Гликозидные связи обозначаются как альфа или бета в зависимости от относительной стереохимии аномерного ) (или наиболее окисленного углерода. В проекции Фишера , если гликозидная связь находится на той же стороне или стороне, что и углерод 6 обычного биологического сахарида, углевод обозначается как бета , а если связь находится на противоположной стороне, он обозначается как альфа . В традиционной проекции « структуры стула », если связь находится в той же плоскости (экваториальной или осевой), что и углерод 6, она обозначается как бета , а в противоположной плоскости — как альфа . Примером этого является сахароза (столовый сахар), которая содержит альфа-связь с глюкозой и бета-связь с фруктозой . Как правило, углеводы, расщепляемые нашим организмом, являются альфа -связанными (пример: гликоген) , а те, которые выполняют структурную функцию, являются бета -связанными (пример: целлюлоза ). [4] [8]

Нуклеиновые кислоты

[ редактировать ]
В результате конденсации аденина и гуанина образуется фосфодиэфирная связь , трифосфорилированная рибоза входящего нуклеотида атакуется 3'- гидроксилом полимера, высвобождая пирофосфат .

Дезоксирибонуклеиновая кислота (ДНК) и рибонуклеиновая кислота (РНК) являются основными примерами полинуклеотидов . Они возникают путем конденсации нуклеотидов. Их основные цепи образуются в результате конденсации гидроксильной группы рибозы с фосфатной группой другой рибозы. Эта связь называется фосфодиэфирной связью . Конденсация катализируется ферментами , называемыми полимеразами . ДНК и РНК могут иметь длину в миллионы нуклеотидов, что обеспечивает генетическое разнообразие жизни. Основания отходят от основной цепи пентозофосфатного полимера и связаны водородными связями попарно со своими комплементарными партнерами (A с T и G с C). Это создает двойную спираль с пентозофосфатными остовами с обеих сторон, образуя таким образом вторичную структуру . [9] [4] [10]

  1. ^ ИЮПАК , Сборник химической терминологии , 2-е изд. («Золотая книга») (1997). Исправленная онлайн-версия: (2006–) « Основная цепь (основная цепь) полимера ». два : 10.1351/goldbook.M03694
  2. ^ «Полимеры» . Архивировано из оригинала 2 октября 2015 г. Проверено 17 сентября 2015 г.
  3. ^ Брабец, CJ; Уиндер, К.; Шарбер, MC; Сарычифтчи, SN ; Хуммелен, Дж. К.; Свенссон, М.; Андерссон, MR (2001). «Влияние беспорядка на фотоиндуцированные возбуждения в фенилзамещенных политиофенах» (PDF) . Журнал химической физики . 115 (15): 7235. Бибкод : 2001JChPh.115.7235B . дои : 10.1063/1.1404984 .
  4. ^ Jump up to: а б с д Воэт, Дональд; Воэт, Джудит Г.; Пратт, Шарлотта В. (2016). Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (5-е изд.). Уайли. ISBN  978-1-118-91840-1 . V
  5. ^ Берг Дж. М., Тимочко Дж. Л., Страйер Л. (2002). «3.2 Первичная структура: аминокислоты связаны пептидными связями с образованием полипептидных цепей» . Биохимия (5-е изд.). У. Х. Фриман. ISBN  0-7167-3051-0 . НБК22364.
  6. ^ Бадачевска-Давид, Александра Е.; Колинский, Анджей; Кмичик, Себастьян (2020). «Вычислительная реконструкция атомистических белковых структур на основе крупнозернистых моделей» . Журнал вычислительной и структурной биотехнологии . 18 : 162–176. дои : 10.1016/j.csbj.2019.12.007 . ISSN   2001-0370 . ПМК   6961067 . ПМИД   31969975 .
  7. ^ Бускьяццо, Алехандро (2004). «Кристаллическая структура гликогенсинтазы: гомологичные ферменты катализируют синтез и деградацию гликогена» . Журнал ЭМБО . 23 (16): 3196–3205. дои : 10.1038/sj.emboj.7600324 . ПМК   514502 . ПМИД   15272305 .
  8. ^ Бертоцци Ч.Р., Рабука Д. (2009). «Структурная основа разнообразия гликанов» . В Варки А., Каммингс Р.Д., Эско Дж.Д. и др. (ред.). Основы гликобиологии (2-е изд.). Лабораторный пресс Колд-Спринг-Харбор. ISBN  9780879697709 . ПМИД   20301274 .
  9. ^ Альбертс Б., Джонсон А., Льюис Дж. и др. (2002). «Механизмы репликации ДНК» . Молекулярная биология клетки (4-е изд.). Гирляндная наука. ISBN  0-8153-3218-1 . НБК26850.
  10. ^ Лодиш Х., Берк А., Зипурски С.Л. и др. (2000). «4.1. Строение нуклеиновых кислот» . Молекулярно-клеточная биология (4-е изд.). У. Х. Фриман. ISBN  0-7167-3136-3 . НБК21514.

См. также

[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 0cf0b6dd5fa94966a4759f6204f71127__1717381620
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/0c/27/0cf0b6dd5fa94966a4759f6204f71127.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Polymer backbone - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)