PCDH1

PCDH1
Идентификаторы
Псевдонимы	PCDH1 , PC42, PCDH42, протокадгерин 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 603626 ; МГИ : 104692 ; Гомологен : 12613 ; GeneCards : PCDH1 ; OMA : PCDH1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	141,879,246 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	38,345,106 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	mucosa of pharynx; ; beta cell; ; mucosa of transverse colon; ; right lung; ; minor salivary glands; ; skin of arm; ; apex of heart; ; upper lobe of left lung; ; skin of leg; ; olfactory zone of nasal mucosa;
	Top expressed in
	dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; superior frontal gyrus; ; esophagus; ; lip; ; primary visual cortex; ; yolk sac; ; genital tubercle; ; tail of embryo; ; intestinal villus; ; epithelium of small intestine;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	calcium ion binding;
Cellular component	integral component of membrane; plasma membrane; integral component of plasma membrane; membrane; cell-cell junction; nucleus; nucleolus; cell junction; intracellular membrane-bounded organelle;
Biological process	cell-cell signaling; cell adhesion; nervous system development; homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5097
	75599
	ENSG00000156453
	ENSMUSG00000051375
	Q08174
	н/д
	НМ_001278613 ; НМ_001278615 ; НМ_002587 ; НМ_032420
	НМ_029357
	НП_001265542 ; НП_001265544 ; НП_002578 ; НП_115796
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Протокадгерин-1 — это белок , который у человека кодируется PCDH1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Этот ген принадлежит к протокадгеринов подсемейству суперсемейства кадгеринов . Кодируемый белок представляет собой мембранный белок, обнаруженный на межклеточных границах. Он участвует в адгезии нервных клеток , что указывает на его возможную роль в развитии нейронов. Белок включает внеклеточную область, содержащую 7 кадгериноподобных доменов, трансмембранную область и С-концевую цитоплазматическую область. Клетки, экспрессирующие белок, демонстрировали активность агрегации клеток. В этом гене происходит альтернативный сплайсинг . ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000156453 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000051375 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Сано К., Танихара Х., Хеймарк Р.Л., Обата С., Дэвидсон М., Сент-Джон Т., Такетани С., Сузуки С. (июль 1993 г.). «Протокадгерины: большое семейство родственных кадгеринам молекул в центральной нервной системе» . ЭМБО Дж . 12 (6): 2249–56. дои : 10.1002/j.1460-2075.1993.tb05878.x . ПМК 413453 . ПМИД 8508762 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: протокадгерин 1 PCDH1» .

Дальнейшее чтение

Яги Т., Такеичи М. (2000). «Гены суперсемейства кадгеринов: функции, геномная организация и неврологическое разнообразие» . Генс Дев . 14 (10): 1169–80. дои : 10.1101/gad.14.10.1169 . ПМИД 10817752 . S2CID 44844497 .
Ноллет Ф., Кулс П., ван Рой Ф. (2000). «Филогенетический анализ суперсемейства кадгеринов позволяет идентифицировать шесть основных подсемейств, помимо нескольких отдельных членов». Дж. Мол. Биол . 299 (3): 551–72. дои : 10.1006/jmbi.2000.3777 . ПМИД 10835267 .
Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геном Рез . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
Дель Мастро Р.Г., Ван Л., Симмонс А.Д. и др. (1997). «Библиотеки кДНК, специфичные для хромосом человека: новые инструменты для идентификации генов и аннотации генома» . Геном Рез . 5 (2): 185–94. дои : 10.1101/гр.5.2.185 . ПМИД 9132272 .
Ву Ц, Маниатис Т (2000). «Большие экзоны, кодирующие несколько эктодоменов, являются характерной особенностью генов протокадгеринов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (7): 3124–9. дои : 10.1073/pnas.060027397 . ПМК 16203 . ПМИД 10716726 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Колланд Ф., Жак Икс, Труплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека» . Геном Рез . 14 (7): 1324–32. дои : 10.1101/гр.2334104 . ПМК 442148 . ПМИД 15231748 .
Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А. и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши» . Мол. Клетка. Протеомика . 3 (11): 1093–101. дои : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . ПМИД 15345747 . S2CID 18659460 .
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Нат. Биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД 15592455 . S2CID 7200157 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевых слов in silico для селекции полноразмерных кДНК человека, кодирующих секреторные или мембранные белки из библиотек кДНК с олигокепками» . ДНК Рез . 12 (2): 117–26. дои : 10.1093/dnares/12.2.117 . ПМИД 16303743 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 5 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000156453 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000051375 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8508762-5] Сано К., Танихара Х., Хеймарк Р.Л., Обата С., Дэвидсон М., Сент-Джон Т., Такетани С., Сузуки С. (июль 1993 г.). «Протокадгерины: большое семейство родственных кадгеринам молекул в центральной нервной системе» . ЭМБО Дж . 12 (6): 2249–56. дои : 10.1002/j.1460-2075.1993.tb05878.x . ПМК 413453 . ПМИД 8508762 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: протокадгерин 1 PCDH1» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]