С100А13

С100А13
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1YUR, 1YUS, 1YUT, 1YUU, 2EGD, 2H2K, 2K8M, 2KI4, 2KI6, 2KOT, 2L5X, 2LE9
Идентификаторы
Псевдонимы	S100A13 , S100 кальцийсвязывающий белок A13
Внешние идентификаторы	Опустить : 601989 ; МГИ : 109581 ; Гомологен : 7523 ; Генные карты : S100A13 ; ОМА : S100A13 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	153,631,360 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	90,431,888 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right lobe of thyroid gland; ; left lobe of thyroid gland; ; Achilles tendon; ; substantia nigra; ; putamen; ; C1 segment; ; amygdala; ; right uterine tube; ; nucleus accumbens; ; caudate nucleus;
	Top expressed in
	lactiferous gland; ; interventricular septum; ; cardiac muscle tissue of left ventricle; ; brown adipose tissue; ; ankle joint; ; subcutaneous adipose tissue; ; granulocyte; ; superior surface of tongue; ; right lung lobe; ; optic nerve;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	calcium ion binding; protein homodimerization activity; zinc ion binding; metal ion binding; protein binding; RAGE receptor binding; fibroblast growth factor binding; copper ion binding; lipid binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; perinuclear region of cytoplasm; nucleus; mast cell granule; extracellular space; nucleolus; plasma membrane; extracellular region;
Biological process	response to copper ion; response to electrical stimulus; positive regulation of cell population proliferation; regulation of cell shape; protein transport; positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; mast cell degranulation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6284
	20196
	ENSG00000189171
	ENSMUSG00000042312
	Q99584
	P97352
	НМ_001024210 ; НМ_001024211 ; НМ_001024212 ; НМ_001024213 ; НМ_005979
	НМ_009113
	НП_001019381 ; НП_001019382 ; НП_001019383 ; НП_001019384 ; НП_005970
	НП_033139
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Кальций-связывающий белок S100 A13 ( S100A13 ) — это белок , который у человека кодируется S100A13 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков S100, содержащим 2 кальцийсвязывающих мотива EF-hand. Белки S100 локализованы в цитоплазме и/или ядре широкого спектра клеток и участвуют в регуляции ряда клеточных процессов, таких как развитие и дифференцировка клеточного цикла. Гены S100 включают по меньшей мере 13 членов, которые расположены кластером на хромосоме 1q21. Этот белок широко экспрессируется в различных типах тканей с высоким уровнем экспрессии в щитовидной железе. В гладкомышечных клетках этот белок экспрессируется совместно с другими членами семейства в ядре и стрессовых волокнах, что указывает на разнообразные функции передачи сигнала. Для этого гена было обнаружено множество вариантов альтернативно сплайсированных транскриптов, кодирующих один и тот же белок. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что S100A13 взаимодействует с SYT1. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} и FGF1 . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Патология

Повышенная регуляция S100A13 обнаружена при кистозно-папиллярной карциноме щитовидной железы. ^{[ 9 ]} а связь экспрессии S100A13 и устойчивости к химиотерапии была показана в протеомном исследовании меланомы. ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000189171 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042312 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Вики Р., Маренхольц И., Мишке Д., Шефер Б.В., Хайцманн К.В. (декабрь 1996 г.). «Характеристика человеческого гена S100A12 (кальгранулин C, p6, CAAF1, CGRP), нового члена кластера генов S100 на хромосоме 1q21». Клеточный кальций . 20 (6): 459–64. дои : 10.1016/S0143-4160(96)90087-1 . ПМИД 8985590 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: S100A13 S100 кальцийсвязывающий белок A13» .
^ Jump up to: ^а ^б Мута Каррейра С, ЛаВалле ТМ, Тарантини Ф, Джексон А, Латроп Дж.Т., Хэмптон Б, Берджесс У.Х., Макиаг Т. (август 1998 г.). «S100A13 участвует в регуляции фактора роста фибробластов-1 и высвобождения синаптотагмина-1 p40 in vitro» . Журнал биологической химии . 273 (35): 22224–31. дои : 10.1074/jbc.273.35.22224 . hdl : 2158/26736 . ПМИД 9712836 .
^ Jump up to: ^а ^б Ландришина М., Багала С., Мандинова А., Солди Р., Микуччи И., Беллум С., Прудовский И., Мачиаг Т. (июль 2001 г.). «Медь индуцирует сборку мультибелкового агрегата, участвующего в высвобождении фактора роста фибробластов 1 в ответ на стресс» . Журнал биологической химии . 276 (27): 25549–57. дои : 10.1074/jbc.M102925200 . ПМИД 11432880 .
^ Динец А., Пернемальм М., Челлин Х., Святоха В., Софиадис А., Юлин К.С., Зедениус Дж., Ларссон С., Лехтиё Дж., Хёог А. (май 2015 г.). «Дифференциальные профили экспрессии белка в кистозной жидкости папиллярной карциномы щитовидной железы и доброкачественных поражений щитовидной железы» . ПЛОС ОДИН . 10 (5): e0126472. Бибкод : 2015PLoSO..1026472D . дои : 10.1371/journal.pone.0126472 . ПМЦ 4433121 . ПМИД 25978681 .
^ Азими А, Пернемальм М, Фроствик Столт М, Ханссон Дж, Лехтиё Дж, Эгихази Браге С, Герцман Йоханссон С (2014). «Протеомный анализ метастазов меланомы: связь между экспрессией S100A13 и устойчивостью к химиотерапии» . Британский журнал рака . 110 (10): 2489–2495. дои : 10.1038/bjc.2014.169 . ПМК 4021518 . ПМИД 24722184 .

Дальнейшее чтение

Адамс, доктор медицинских наук, Керлаваж А.Р., Флейшманн Р.Д., Фулднер Р.А., Балт С.Дж., Ли Н.Х., Киркнесс Э.Ф., Вайнсток К.Г., Гокейн Дж.Д., Уайт О (сентябрь 1995 г.). «Первоначальная оценка разнообразия и моделей экспрессии генов человека на основе 83 миллионов нуклеотидов последовательности кДНК» (PDF) . Природа . 377 (6547 Приложение): 3–174. ПМИД 7566098 .
Шефер Б.В., Вики Р., Энгелькамп Д., Маттей М.Г., Хайцманн К.В. (февраль 1995 г.). «Выделение клона YAC, охватывающего кластер из девяти генов S100 на хромосоме 1q21 человека: обоснование новой номенклатуры семейства кальций-связывающих белков S100». Геномика . 25 (3): 638–43. дои : 10.1016/0888-7543(95)80005-7 . ПМИД 7759097 .
Вики Р., Шефер Б.В., Эрне П., Хайцманн К.В. (октябрь 1996 г.). «Характеристика кДНК человека и мыши, кодирующих S100A13, нового члена семейства белков S100». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 227 (2): 594–9. дои : 10.1006/bbrc.1996.1551 . ПМИД 8878558 .
Мута Каррейра С, ЛаВалле ТМ, Тарантини Ф, Джексон А, Латроп Дж.Т., Хэмптон Б, Берджесс У.Х., Макиаг Т. (август 1998 г.). «S100A13 участвует в регуляции фактора роста фибробластов-1 и высвобождения синаптотагмина-1 p40 in vitro» . Журнал биологической химии . 273 (35): 22224–31. дои : 10.1074/jbc.273.35.22224 . hdl : 2158/26736 . ПМИД 9712836 .
Ридингер К., Шефер Б.В., Дюруссель И., Кокс Дж.А., Хайцманн К.В. (март 2000 г.). «S100A13. Биохимическая характеристика и субклеточная локализация в разных клеточных линиях» . Журнал биологической химии . 275 (12): 8686–94. дои : 10.1074/jbc.275.12.8686 . ПМИД 10722710 .
Ландришина М., Багала С., Мандинова А., Солди Р., Микуччи И., Беллум С., Прудовский И., Мачиаг Т. (июль 2001 г.). «Медь индуцирует сборку мультибелкового агрегата, участвующего в высвобождении фактора роста фибробластов 1 в ответ на стресс» . Журнал биологической химии . 276 (27): 25549–57. дои : 10.1074/jbc.M102925200 . ПМИД 11432880 .
Се Х.Л., Шефер Б.В., Кокс Дж.А., Хайцманн К.В. (август 2002 г.). «S100A13 и S100A6 демонстрируют разные пути транслокации в эндотелиальных клетках». Журнал клеточной науки . 115 (Часть 15): 3149–58. дои : 10.1242/jcs.115.15.3149 . ПМИД 12118070 .
Прудовский И., Багала С., Тарантини Ф., Мандинова А., Солди Р., Беллум С., Масиаг Т. (июль 2002 г.). «Внутриклеточная транслокация компонентов комплекса высвобождения фактора роста фибробластов 1 предшествует их сборке перед экспортом» . Журнал клеточной биологии . 158 (2): 201–8. дои : 10.1083/jcb.200203084 . ПМК 2173119 . ПМИД 12135982 .
Чан Вайоминг, Ся CL, Донг округ Колумбия, Хейцманн CW, Ю Д.Т. (апрель 2003 г.). «Дифференциальная экспрессия белков S100 в развивающемся гиппокампе и височной коре человека». Микроскопические исследования и техника . 60 (6): 600–13. дои : 10.1002/jemt.10302 . ПМИД 12645008 . S2CID 13596098 .
Мандинова А., Солди Р., Грациани И., Багала С., Беллум С., Ландрискина М., Тарантини Ф., Прудовский И., Мачиаг Т. (июль 2003 г.). «S100A13 опосредует медь-зависимое, вызванное стрессом высвобождение IL-1альфа как из клеток U937 человека, так и из клеток NIH 3T3 мыши» (PDF) . Журнал клеточной науки . 116 (Пт 13): 2687–96. дои : 10.1242/jcs.00471 . ПМИД 12746488 . S2CID 9241829 .
Се Х.Л., Шефер Б.В., Вейгл Б., Хайцманн К.В. (апрель 2004 г.). «Транлокация белка S100 в ответ на внеклеточный S100 опосредуется рецептором конечных продуктов гликирования в эндотелиальных клетках человека». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 316 (3): 949–59. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.02.135 . ПМИД 15033494 .
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К., Онг С.Е., Лион К.Э., Ламонд А.И., Манн М. (январь 2005 г.). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД 15635413 . S2CID 4344740 .
Айрабедян С., Кюркчиев С., Кехаев И. (март 2005 г.). «Эндоглин (cd105) и S100A13 как маркеры активного ангиогенеза при эндометриозе». Репродуктивная биология . 5 (1): 51–67. ПМИД 15821778 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
О JH, Ян Джо, Хан Й, Ким М.Р., Бён СС, Чон Й.Дж., Ким Дж.М., Сон КС, Но СМ, Ким С., Ю Х.С., Ким Й.С., Ким НС (декабрь 2005 г.). «Транскриптомный анализ рака желудка человека». Геном млекопитающих . 16 (12): 942–54. дои : 10.1007/s00335-005-0075-2 . ПМИД 16341674 . S2CID 69278 .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000189171 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042312 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8985590-5] Вики Р., Маренхольц И., Мишке Д., Шефер Б.В., Хайцманн К.В. (декабрь 1996 г.). «Характеристика человеческого гена S100A12 (кальгранулин C, p6, CAAF1, CGRP), нового члена кластера генов S100 на хромосоме 1q21». Клеточный кальций . 20 (6): 459–64. дои : 10.1016/S0143-4160(96)90087-1 . ПМИД 8985590 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: S100A13 S100 кальцийсвязывающий белок A13» .

[pmid9712836-7] Jump up to: ^а ^б Мута Каррейра С, ЛаВалле ТМ, Тарантини Ф, Джексон А, Латроп Дж.Т., Хэмптон Б, Берджесс У.Х., Макиаг Т. (август 1998 г.). «S100A13 участвует в регуляции фактора роста фибробластов-1 и высвобождения синаптотагмина-1 p40 in vitro» . Журнал биологической химии . 273 (35): 22224–31. дои : 10.1074/jbc.273.35.22224 . hdl : 2158/26736 . ПМИД 9712836 .

[pmid11432880-8] Jump up to: ^а ^б Ландришина М., Багала С., Мандинова А., Солди Р., Микуччи И., Беллум С., Прудовский И., Мачиаг Т. (июль 2001 г.). «Медь индуцирует сборку мультибелкового агрегата, участвующего в высвобождении фактора роста фибробластов 1 в ответ на стресс» . Журнал биологической химии . 276 (27): 25549–57. дои : 10.1074/jbc.M102925200 . ПМИД 11432880 .

[pmid25978681-9] Динец А., Пернемальм М., Челлин Х., Святоха В., Софиадис А., Юлин К.С., Зедениус Дж., Ларссон С., Лехтиё Дж., Хёог А. (май 2015 г.). «Дифференциальные профили экспрессии белка в кистозной жидкости папиллярной карциномы щитовидной железы и доброкачественных поражений щитовидной железы» . ПЛОС ОДИН . 10 (5): e0126472. Бибкод : 2015PLoSO..1026472D . дои : 10.1371/journal.pone.0126472 . ПМЦ 4433121 . ПМИД 25978681 .

[Azimi-10] Азими А, Пернемальм М, Фроствик Столт М, Ханссон Дж, Лехтиё Дж, Эгихази Браге С, Герцман Йоханссон С (2014). «Протеомный анализ метастазов меланомы: связь между экспрессией S100A13 и устойчивостью к химиотерапии» . Британский журнал рака . 110 (10): 2489–2495. дои : 10.1038/bjc.2014.169 . ПМК 4021518 . ПМИД 24722184 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]