Ванна (ген)

ВАННА
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	1S31
Идентификаторы
Псевдонимы	Тун , rd5, rdob, двойной транскрипционный фактор Tubby, фактор двухпартной транскрипции ванны
Внешние идентификаторы	Омим : 601197 ; MGI : 2651573 ; Гомологен : 31147 ; Бытие : ванна ; OMA : ванна - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	8,106,243 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	108,633,667 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	pars reticulata; ; Pars compacta; ; middle temporal gyrus; ; postcentral gyrus; ; entorhinal cortex; ; superior frontal gyrus; ; superior vestibular nucleus; ; pons; ; ventral tegmental area; ; pituitary gland;
	Top expressed in
	neural layer of retina; ; dorsomedial hypothalamic nucleus; ; arcuate nucleus; ; subiculum; ; ventromedial nucleus; ; anterior amygdaloid area; ; paraventricular nucleus of hypothalamus; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; habenula; ; lateral hypothalamus;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	phosphatidylinositol binding; protein-containing complex binding; G protein-coupled receptor binding; intraciliary transport particle A binding;
Cellular component	cytoplasm; extracellular region; cytosol; plasma membrane; cilium; membrane; nucleus;
Biological process	phagocytosis, recognition; receptor localization to non-motile cilium; response to hormone; positive regulation of phagocytosis; photoreceptor cell maintenance; hearing; retina development in camera-type eye; protein localization to photoreceptor outer segment; response to stimulus; phagocytosis; protein localization to cilium; regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway; intraciliary transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7275
	22141
	ENSG00000166402
	Ensmusg00000031028
	P50607
	P50586
	NM_003320 ; NM_177972
	NM_021885
	NP_003311 ; NP_813977
	NP_068685
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Гомолог белка Tubby - это белок , который у людей кодируется ванны геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Этот ген кодирует члена семейства двухпартных транскрипционных факторов Tubby. Кодированный белок может играть роль в ожирении и сенсониральной деградации. Кристаллическая структура была определена для аналогичного белка у мыши, и она функционирует как мембранный регулятор транскрипции, который транслоцируется в ядро в ответ на гидролиз фосфоинозитида. Два варианта транскрипта, кодирующие различные изоформы, были идентифицированы для этого гена. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что ванна (ген) взаимодействует с PLCG1 . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000166402 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG00000031028 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Kleyn PW, Fan W, Kovats SG, Lee JJ, Pulido JC, Wu Y, Berkemeier LR, Misumi DJ, Holmgren L, Charlat O, Woolf EA, Tayber O, Brody T, Shu P, Hawkins F, Kennedy B, Baldini l , Ebeling C, Alperin GD, Deeds J, Lakey ND, Culpepper J, Chen H, Glucksmann-Kuis MA, Carlson GA, Duyk GM, Moore KJ (Jun 1996). «Идентификация и характеристика гена мышиного ожирения Tubby: член нового семейства генов» . Клетка . 85 (2): 281–90. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 81104-6 . PMID 8612280 . S2CID 15670925 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: Tubbby Homolog (мышь)» .
^ Капеллер, R; Мориарти А; Штраус А; Стабдал H; Theriault k; Зиберт Э; Чикинг Т; Morgenstern JP; Tartaglia la; Лилли Дж (август 1999). «Тирозин фосфорилирование ванны и ее связь с доменными белками SRC гомологии 2, содержащимися в внутриклеточной передаче сигналов с помощью инсулина» . Дж. Биол. Химический 274 (35). Соединенные Штаты: 24980–6. doi : 10.1074/jbc.274.35.24980 . ISSN 0021-9258 . PMID 10455176 .

Дальнейшее чтение

Ikeda A, Nishina PM, Naggert JK (2002). «Белки, похожие на тубби, семейство с ролями в развитии и функционировании нейронов» . J. Cell Sci . 115 (Pt 1): 9–14. doi : 10.1242/jcs.115.1.9 . PMID 11801719 .
Джонс JM, Meisler MH, Seldin MF, et al. (1992). «Локализация инсулина-2 (ins-2) и мутанта ожирения (ванна) в различных областях мышиной хромосомы 7». Геномика . 14 (1): 197–9. doi : 10.1016/s0888-7543 (05) 80308-8 . HDL : 2027.42/29864 . PMID 1358794 .
North MA, Naggert JK, Yan Y, et al. (1997). «Молекулярная характеристика ванны, TULP1 и TULP2, членов нового семейства генов Tubby и их возможного отношения к заболеваниям глаз» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 94 (7): 3128–33. Bibcode : 1997pnas ... 94.3128n . doi : 10.1073/pnas.94.7.3128 . PMC 20333 . PMID 9096357 .
Kapeller R, Moriarty A, Strauss A, et al. (1999). «Тирозин фосфорилирование ванны и ее связь с доменными белками SRC гомологии 2, содержащимися в внутриклеточной передаче сигналов с помощью инсулина» . Дж. Биол. Химический 274 (35): 24980–6. doi : 10.1074/jbc.274.35.24980 . PMID 10455176 .
Boggon TJ, Shan WS, Santagata S, et al. (1999). «Смысл белков Tubby в качестве факторов транскрипции с помощью структурного функционального анализа». Наука . 286 (5447): 2119–25. doi : 10.1126/science.286.5447.2119 . PMID 10591637 . S2CID 33506220 .
Он W, Ikeda S, Bronson RT, et al. (2001). «Экспрессия, меченная GFP и иммуногистохимические исследования для определения субклеточной локализации членов семейства гена Tubby». Brain Res. Мол Brain Res . 81 (1–2): 109–17. doi : 10.1016/s0169-328x (00) 00164-9 . PMID 11000483 .
Santagata S, Boggon TJ, Baird CL, et al. (2001). «G-белковая передача сигналов через белки Tubby». Наука . 292 (5524): 2041–50. doi : 10.1126/science.1061233 . PMID 11375483 . S2CID 29856557 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Shiri-Sverdlov R, Custers A, Van Vliet-Ostaptchouk JV, et al. (2006). «Идентификация ванны как нового гена -кандидата, влияющего на массу тела у людей» . Диабет . 55 (2): 385–9. doi : 10.2337/диабет.55.02.06.db05-0997 . PMID 16443771 .
Giannaccini G, Giusti L, Santini F, et al. (2007). «Тубби белок в лимфоцитах человека от нормального веса и ожирений». Клин Биохимия . 40 (11): 806–9. doi : 10.1016/j.clinbiochem.2007.03.020 . PMID 17498679 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Uniprot : P50607 (гомолог белка для человека Tubby) в PDBE-KB .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Uniprot : P50586 (белок мыши ванн) в PDBE-KB .

Эта статья о гене о хромосоме человека 11 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000166402 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG00000031028 - ENSEMBL , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid8612280-5] Kleyn PW, Fan W, Kovats SG, Lee JJ, Pulido JC, Wu Y, Berkemeier LR, Misumi DJ, Holmgren L, Charlat O, Woolf EA, Tayber O, Brody T, Shu P, Hawkins F, Kennedy B, Baldini l , Ebeling C, Alperin GD, Deeds J, Lakey ND, Culpepper J, Chen H, Glucksmann-Kuis MA, Carlson GA, Duyk GM, Moore KJ (Jun 1996). «Идентификация и характеристика гена мышиного ожирения Tubby: член нового семейства генов» . Клетка . 85 (2): 281–90. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 81104-6 . PMID 8612280 . S2CID 15670925 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: Tubbby Homolog (мышь)» .

[pmid10455176-7] Капеллер, R; Мориарти А; Штраус А; Стабдал H; Theriault k; Зиберт Э; Чикинг Т; Morgenstern JP; Tartaglia la; Лилли Дж (август 1999). «Тирозин фосфорилирование ванны и ее связь с доменными белками SRC гомологии 2, содержащимися в внутриклеточной передаче сигналов с помощью инсулина» . Дж. Биол. Химический 274 (35). Соединенные Штаты: 24980–6. doi : 10.1074/jbc.274.35.24980 . ISSN 0021-9258 . PMID 10455176 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]