Lims2

Lims2
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	3IXE
Идентификаторы
Псевдонимы	LIMS2 , PINCH-2, PINCH2, LGMD2W, LIM ЦИНК-КИНГОВЫ
Внешние идентификаторы	Омим : 607908 ; MGI : 2385067 ; Гомологен : 41214 ; GeneCards : Lims2 ; OMA : LIMS2 - Ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	127,681,786 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	32,091,672 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	apex of heart; ; muscle layer of sigmoid colon; ; body of uterus; ; right coronary artery; ; popliteal artery; ; tibial arteries; ; ascending aorta; ; Descending thoracic aorta; ; left coronary artery; ; right lung;
	Top expressed in
	tunica media of zone of aorta; ; interventricular septum; ; ascending aorta; ; right lung lobe; ; sciatic nerve; ; left lobe of liver; ; belly cord; ; spermatocyte; ; aortic valve; ; myocardium of ventricle;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	protein binding; metal ion binding;
Cellular component	cytosol; cell junction; plasma membrane; membrane; nucleus; focal adhesion; cytoplasm; cell-cell junction;
Biological process	positive regulation of integrin-mediated signaling pathway; negative regulation of neural precursor cell proliferation; cell-cell junction organization; negative regulation of apoptotic process; negative regulation of hepatocyte proliferation; cell junction assembly; negative regulation of epithelial cell proliferation; cell-cell adhesion; positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	55679
	225341
	ENSG00000072163
	EMSMUSM0000000024395
	Q7Z4I7
	Q91XD2
	NM_001136037 ; NM_001161403 ; NM_001161404 ; NM_001256542 ; NM_017980
	NM_144862 ; NM_001365015 ; NM_001379137 ; NM_001379138
	NP_001129509 ; NP_001154875 ; NP_001154876 ; NP_001243471 ; NP_060450
	NP_659111 ; NP_001351944 ; NP_001366066 ; NP_001366067
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Домен пальца Lim Zinc, содержащий 2, является белком , который у людей кодируется геном LIMS2 . ^{[ 5 ]}

Функция

Этот ген кодирует член небольшого семейства фокальных белков адгезии, которые взаимодействуют с ILK (интегрин-связанная киназа), белка, который влияет на взаимодействие белка белка с экстрацелларным матриксом. Кодированный белок имеет пять доменов LIM, каждый домен образует два цинковых пальца, которые позволяют взаимодействия, которые регулируют форму клеток и миграцию. Псевдоген этого гена расположен на хромосоме 4. Для этого гена были обнаружены множественные варианты транскрипта, кодирующие различные изоформы. [Предоставлено Refseq, ноябрь 2011].

Ссылки

^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000072163 - Ensembl , май 2017 г.
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000024395 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Ген Entrez: домен пальца Lim Zinc, содержащий 2» . Получено 2017-11-06 .

Дальнейшее чтение

Zhang Y, Chen K, Guo L, Wu C (2002). «Характеристика PINCH-2, нового фокального белка адгезии, который регулирует взаимодействие PINCH-1-ILK, распространение клеток и миграцию» . Дж. Биол. Химический 277 (41): 38328–38. doi : 10.1074/jbc.m205576200 . PMID 12167643 .
Ким С.К., Джанг Х.Р., Ким Дж. Х., Нох С.М., Сонг К.С., Ким М.Р., Ким Си, Йом Йи, Ким Н.С., Ю Х.С., Ким Ю.С. (2006). «Эпигенетическое молчание LIMS2 при раке желудка и его ингибирующее влияние на миграцию клеток». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 349 (3): 1032–40. doi : 10.1016/j.bbrc.2006.08.128 . PMID 16959213 .
Davila S, Foeling FE, Tan A, Bonnard C, Boland GJ, Snippe H, Hibberd ML, Seielstad M (2010). «Новые генетические ассоциации, обнаруженные в исследовании реакции хозяина в вакцину против гепатита В» . Гены иммуно . 11 (3): 232–8. doi : 10.1038/gene.2010.1 . PMID 20237496 .
Юань Ю., Донг Х.П., Нимон Д.А., Несленд Дж.М., Ву С., Дэвидсон Б. (2011). «Экспрессия PINCH-2 при раке с участием серобальных выпот с использованием количественной ПЦР» . Цитопатология . 22 (1): 22–9. doi : 10.1111/j.1365-2303.2010.00757.x . PMC 3225403 . PMID 20500520 .
Park CH, Rha SY, Ahn JB, Shin SJ, Kwon WS, Kim TS, AN S, Kim NK, Yang WI, Chung HC (2015). «PINCH-2 представляет собой функциональное изменение числа копий и подавляет миграцию раковых клеток толстой кишки паракринной активностью» . Инт. Дж. Рак . 136 (10): 2273–83. doi : 10.1002/ijc.29273 . PMID 25346044 . S2CID 2850271 .
Chardon JW, Smith AC, Woulfe J, Pena E, Rakhra K, Dennie C, Beaulieu C, Huang L, Schwartzentruber J, Hawkins C, Harms MB, Dojeiji S, Zhang M, Majewski J, Bulman De, Boycott KM, Dyment Da, Dament Dam (2015). «Мутации LIMS2 связаны с новой мышечной дистрофией, тяжелой кардиомиопатией и треугольными языками». Клин Генет . 88 (6): 558–64. doi : 10.1111/cge.12561 . PMID 25589244 . S2CID 23714774 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 2 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

Эта статья включает в себя текст из Национальной медицины Соединенных Штатов , которая находится в общественном достоянии .

[refGRCh38Ensembl-1] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000072163 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000024395 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[entrez-5] «Ген Entrez: домен пальца Lim Zinc, содержащий 2» . Получено 2017-11-06 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]