CSTF1

CSTF1
Идентификаторы
Псевдонимы	CSTF1 , CstF-50, CstFp50, субъединица 1 фактора стимуляции расщепления
Внешние идентификаторы	Опустить : 600369 ; МГИ : 1914587 ; Гомологен : 1012 ; Генные карты : CSTF1 ; OMA : CSTF1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	56,406,362 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	172,224,368 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	testicle; ; secondary oocyte; ; Achilles tendon; ; gonad; ; islet of Langerhans; ; stromal cell of endometrium; ; ventricular zone; ; rectum; ; granulocyte; ; body of pancreas;
	Top expressed in
	spermatid; ; seminiferous tubule; ; spermatocyte; ; yolk sac; ; epiblast; ; ventricular zone; ; secondary oocyte; ; Ileal epithelium; ; tail of embryo; ; embryo;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; RNA binding;
Cellular component	nucleus; nucleoplasm; mRNA cleavage stimulating factor complex;
Biological process	mRNA splicing, via spliceosome; termination of RNA polymerase II transcription; mRNA processing; mRNA 3'-end processing;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1477
	67337
	ENSG00000101138
	ENSMUSG00000027498
	Q05048
	Q99LC2
	НМ_001033521 ; НМ_001033522 ; НМ_001324
	НМ_024199
	НП_001028693 ; НП_001028694 ; НП_001315
	НП_077161
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица фактора стимуляции расщепления 50 кДа представляет собой белок , который у человека кодируется CSTF1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Этот ген кодирует одну из трех субъединиц, которые объединяются, образуя фактор стимуляции расщепления (CSTF). CSTF участвует в полиаденилировании и расщеплении 3'-конца пре-мРНК . Подобно бета-субъединицам G-белка млекопитающих , этот белок содержит трансдуцин-подобные повторы . несколько вариантов транскрипта с разными 5'-UTR , но кодирующими один и тот же белок. Для этого гена обнаружено ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что CSTF1 взаимодействует с BARD1 . ^{[ 6 ]}^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000101138 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027498 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Такагаки Ю., Мэнли Дж.Л. (ноябрь 1992 г.). «Человеческий фактор полиаденилирования представляет собой гомолог бета-субъединицы G-белка» . Журнал биологической химии . 267 (33): 23471–4. дои : 10.1016/S0021-9258(18)35861-7 . ПМИД 1358884 .
^ Jump up to: ^а ^б Клейман Ф.Е., Мэнли Дж.Л. (март 2001 г.). «Взаимодействие BARD1-CstF-50 связывает образование 3'-конца мРНК с повреждением ДНК и подавлением опухоли» . Клетка . 104 (5): 743–53. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00270-7 . ПМИД 11257228 . S2CID 15022237 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: фактор стимуляции расщепления CSTF1, 3'-пре-РНК, субъединица 1, 50 кДа» .
^ Клейман Ф.Е., Мэнли Дж.Л. (сентябрь 1999 г.). «Функциональное взаимодействие BRCA1-ассоциированного BARD1 с фактором полиаденилирования CstF-50». Наука . 285 (5433): 1576–9. дои : 10.1126/science.285.5433.1576 . ПМИД 10477523 .

Внешние ссылки

человека Расположение генома CSTF1 и CSTF1 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Такагаки Ю., Макдональд С.С., Шенк Т., Мэнли Дж.Л. (февраль 1992 г.). «Человеческий фактор полиаденилирования 64 кДа содержит РНК-связывающий домен рибонуклеопротеинового типа и необычные вспомогательные мотивы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (4): 1403–7. Бибкод : 1992PNAS...89.1403T . дои : 10.1073/pnas.89.4.1403 . ПМК 48459 . ПМИД 1741396 .
Мурти К.Г., Мэнли Дж.Л. (ноябрь 1995 г.). «Субъединица человеческого фактора специфичности расщепления-полиаденилирования массой 160 кДа координирует образование 3'-конца пре-мРНК» . Гены и развитие . 9 (21): 2672–83. дои : 10.1101/gad.9.21.2672 . ПМИД 7590244 .
Такагаки Ю., Мэнли Дж.Л. (декабрь 1994 г.). «Субъединица фактора полиаденилирования является человеческим гомологом супрессора раздвоенного белка дрозофилы». Природа . 372 (6505): 471–4. Бибкод : 1994Natur.372..471T . дои : 10.1038/372471a0 . ПМИД 7984242 . S2CID 4329672 .
Рюгсеггер У., Бейер К., Келлер В. (март 1996 г.). «Очистка и характеристика человеческого фактора расщепления Im, участвующего в процессинге 3'-конца предшественников информационной РНК» . Журнал биологической химии . 271 (11): 6107–13. дои : 10.1074/jbc.271.11.6107 . ПМИД 8626397 .
Клейман Ф.Е., Мэнли Дж.Л. (сентябрь 1999 г.). «Функциональное взаимодействие BRCA1-ассоциированного BARD1 с фактором полиаденилирования CstF-50». Наука . 285 (5433): 1576–9. дои : 10.1126/science.285.5433.1576 . ПМИД 10477523 .
Такагаки Ю., Мэнли Дж.Л. (март 2000 г.). «Сложные белковые взаимодействия в механизме полиаденилирования человека идентифицируют новый компонент» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (5): 1515–25. дои : 10.1128/MCB.20.5.1515-1525.2000 . ПМЦ 85326 . ПМИД 10669729 .
Фонг Н., Bentley DL (июль 2001 г.). «Кэпирование, сплайсинг и 3'-процессинг независимо стимулируются РНК-полимеразой II: разные функции для разных сегментов CTD» . Гены и развитие . 15 (14): 1783–95. дои : 10.1101/gad.889101 . ПМК 312735 . ПМИД 11459828 .
Андерсен Дж.С., Лион CE, Фокс А.Х., Люнг А.К., Лам Ю.В., Стин Х., Манн М., Ламонд А.И. (январь 2002 г.). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Современная биология . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 . S2CID 14132033 .
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Дж., Чжан Х., Чжа К.М., Полакевич Р.Д., Комб М.Дж. (январь 2005 г.). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Природная биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД 15592455 . S2CID 7200157 .
Цузуки М., Ву В., Нисикава Х., Хаями Р., Ояке Д., Ябуки Ю., Фукуда М., Охта Т. (февраль 2006 г.). «Усеченный вариант сплайсинга человеческого BARD1, в котором отсутствует КОЛЬЦЕВОЙ палец и анкириновые повторы». Письма о раке . 233 (1): 108–16. дои : 10.1016/j.canlet.2005.03.012 . ПМИД 15878232 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 20 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000101138 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027498 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1358884-5] Такагаки Ю., Мэнли Дж.Л. (ноябрь 1992 г.). «Человеческий фактор полиаденилирования представляет собой гомолог бета-субъединицы G-белка» . Журнал биологической химии . 267 (33): 23471–4. дои : 10.1016/S0021-9258(18)35861-7 . ПМИД 1358884 .

[pmid11257228-6] Jump up to: ^а ^б Клейман Ф.Е., Мэнли Дж.Л. (март 2001 г.). «Взаимодействие BARD1-CstF-50 связывает образование 3'-конца мРНК с повреждением ДНК и подавлением опухоли» . Клетка . 104 (5): 743–53. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00270-7 . ПМИД 11257228 . S2CID 15022237 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: фактор стимуляции расщепления CSTF1, 3'-пре-РНК, субъединица 1, 50 кДа» .

[pmid10477523-8] Клейман Ф.Е., Мэнли Дж.Л. (сентябрь 1999 г.). «Функциональное взаимодействие BRCA1-ассоциированного BARD1 с фактором полиаденилирования CstF-50». Наука . 285 (5433): 1576–9. дои : 10.1126/science.285.5433.1576 . ПМИД 10477523 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]