Цитохром b 5
| Цитохром b5 | |||
|---|---|---|---|
 Цитохром B5 (крыса) связан со своим кофактором . Гем показан черным, железо — оранжевым, а железосвязывающие остатки гистидина показаны в виде палочек. ( PDB : 1ICC ) | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | CYB5A | ||
| Альт. символы | CYB5 | ||
| ген NCBI | 1528 | ||
| HGNC | 2570 | ||
| МОЙ БОГ | 250790 | ||
| ПДБ | 1JEX | ||
| RefSeq | НМ_001914 | ||
| ЮниПрот | P00167 | ||
| Другие данные | |||
| Локус | 18 q23 | ||
| |||
| Цитохром b5 | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | Цит_B5 | ||
| Пфам | PF00173 | ||
| ИнтерПро | ИПР001199 | ||
| PROSITE | PDOC00170 | ||
| Мембраном | 211 | ||
| |||
Цитохромы b 5 представляют собой повсеместные электронтранспортные гемопротеины, обнаруженные у животных , растений , грибов и пурпурных фототрофных бактерий . Микросомальные митохондриальные и и варианты мембраносвязаны, а бактериальные и эритроциты другие ткани животных водорастворимы. Семейство цитохром b 5 -подобных белков включает (кроме самого цитохрома b 5 ) гемопротеиновые домены, ковалентно связанные с другими редокс-доменами флавоцитохрома цитохрома b 2 ( L -лактатдегидрогеназа; КФ 1.1.2.3 ), сульфитоксидазу ( КФ 1.8.3.1 ). , нитратредуктазы растений и грибов ( КФ 1.7.1.1 , КФ 1.7.1.2 , EC 1.7.1.3 ), а также слитые белки цитохром b 5 /ациллипиддесатураза растений и грибов.
Структура
[ редактировать ]трехмерные структуры ряда цитохрома b 5 и дрожжевого флавоцитохрома b 2 Известны . Складка принадлежит к классу α+β с двумя гидрофобными ядрами на каждой стороне β-листа. Более крупное гидрофобное ядро представляет собой гем-связывающий карман, закрытый с каждой стороны парой спиралей, соединенных витком. Меньшее гидрофобное ядро может иметь только структурную роль и образовано пространственно близкими N-концевыми и C-концевыми сегментами. Два остатка гистидина образуют пятый и шестой гемовые лиганды, а пропионатный край гемовой группы лежит у отверстия гемовой щели. Два изомера цитохрома b 5 , называемые формами A (основная) и B (минорная), отличаются поворотом гема на 180° вокруг оси, определяемой α- и γ-мезоуглеродами.
Цитохром b 5 в некоторых биохимических реакциях
[ редактировать ]EC 1.6.2.2 Цитохром- b 5- редуктаза
- НАДН + Н + + 2 феррицитохром b 5 → НАД + + 2 ферроцитохром b 5
EC 1.10.2.1 L - аскорбат-цитохром- b 5- редуктаза
- L -аскорбат + феррицитохром b 5 → монодегидроаскорбат + ферроцитохром b 5
EC 1.14.18.2 CMP -N -ацетилнейрамината монооксигеназа
- CMP- N -ацетилнейраминат + 2 ферроцитохром b 5 + O 2 + 2 H + → CMP- N -гликолоилнейраминат + 2 феррицитохром b 5 + H 2 O
EC 1.14.19.1 стеароил-КоА 9-десатураза
- стеароил-КоА + 2 ферроцитохром b 5 + O 2 + 2 H + → олеоил-КоА + 2 феррицитохром b 5 + H 2 O
EC 1.14.19.3 линолеоил-КоА 9-десатураза
- линолеоил-КоА + 2 ферроцитохром b 5 + O 2 + 2 H + → γ-линоленоил-КоА + 2 феррицитохром b 5 + H 2 O
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- Ледерер Ф (1994). «Цитохром b5-фолд: адаптируемый модуль». Биохимия . 76 (7): 674–92. дои : 10.1016/0300-9084(94)90144-9 . ПМИД 7893819 .
- Напье Дж.А., Майклсон Л.В., Саянова О. (февраль 2003 г.). «Роль десатураз слияния цитохрома b5 в синтезе полиненасыщенных жирных кислот». Простагландины, лейкотриены и незаменимые жирные кислоты . 68 (2): 135–43. дои : 10.1016/S0952-3278(02)00263-6 . ПМИД 12538077 .
- Ривера М., Бариллас-Мьюри С., Кристенсен К.А., Литтл Дж.В., Уэллс М.А., Уокер Ф.А. (декабрь 1992 г.). «Синтез генов, бактериальная экспрессия и 1H ЯМР-спектроскопические исследования цитохрома b5 внешней митохондриальной мембраны крысы». Биохимия . 31 (48): 12233–40. дои : 10.1021/bi00163a037 . ПМИД 1333795 .
- Шенкман Дж. Б., Янссон I (февраль 2003 г.). «Множество ролей цитохрома b5». Фармакология и терапия . 97 (2): 139–52. дои : 10.1016/S0163-7258(02)00327-3 . ПМИД 12559387 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- PDB : 1B5A – Структура раствора цитохрома b 5 крысы (форма А)
- PDB : 1B5B – Структура раствора цитохрома b 5 крысы (форма B)
- PDB : 1CXY - Рентгеновская структура цитохрома b 558 Ectothiorhodospira vacuolata.
- Онлайн-менделевское наследование у человека (OMIM): 250790 – Метгемоглобинемия вследствие дефицита цитохрома b 5