DDX17

DDX17
Идентификаторы
Псевдонимы	DDX17 , P72, RH70, геликаза DEAD-box 17
Внешние идентификаторы	Опустить : 608469 ; МГИ : 1914290 ; Гомологен : 101101 ; Генные карты : DDX17 ; OMA : DDX17 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 22 (human)
End	38,507,660 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	79,430,942 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	tibia; ; middle temporal gyrus; ; Brodmann area 23; ; endothelial cell; ; germinal epithelium; ; visceral pleura; ; parietal pleura; ; Epithelium of choroid plexus; ; right uterine tube; ; corpus callosum;
	Top expressed in
	medullary collecting duct; ; renal corpuscle; ; condyle; ; fossa; ; Rostral migratory stream; ; Gonadal ridge; ; vas deferens; ; ciliary body; ; iris; ; primitive streak;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	nucleotide binding; RNA helicase activity; protein binding; ATP binding; helicase activity; transcription coactivator activity; hydrolase activity; nucleic acid binding; ATP-dependent activity, acting on RNA; RNA binding;
Cellular component	membrane; nucleus; nuclear speck; cytosol; nucleoplasm; nucleolus; cytoplasm;
Biological process	RNA processing; RNA secondary structure unwinding; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; regulation of skeletal muscle cell differentiation; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; alternative mRNA splicing, via spliceosome; regulation of transcription by RNA polymerase II; miRNA metabolic process; intracellular estrogen receptor signaling pathway; androgen receptor signaling pathway; epithelial to mesenchymal transition; myoblast differentiation; immune system process; rRNA processing; mRNA processing; RNA splicing; gene silencing; defense response to virus;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10521
	67040
	ENSG00000100201
	ENSMUSG00000055065
	Q92841
	Q501J6
	НМ_030881 ; НМ_001098504 ; НМ_001098505 ; НМ_006386
	НМ_001040187 ; НМ_152806 ; НМ_199079 ; НМ_199080
	НП_001091974 ; НП_006377
	НП_001035277 ; НП_690019 ; НП_951061 ; НП_951062
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Вероятная АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX17 (p72) — фермент , который у человека кодируется DDX17 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Белки DEAD-бокса, характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), представляют собой предполагаемые РНК-хеликазы. Они участвуют в ряде клеточных процессов, включающих изменение вторичной структуры РНК, таких как инициация трансляции, ядерный и митохондриальный сплайсинг, а также сборка рибосом и сплайсосом . Судя по характеру их распространения, считается, что некоторые члены этого семейства участвуют в эмбриогенезе, сперматогенезе, а также росте и делении клеток. Этот ген кодирует белок DEAD-бокс, который представляет собой АТФазу, активируемую различными видами РНК, но не дцДНК. Этот белок и белок, кодируемый геном DDX5, более тесно связаны друг с другом, чем с любым другим членом семейства DEAD-боксов. Альтернативный сплайсинг этого гена генерирует 2 варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы, причем более длинный транскрипт, как сообщается, также инициирует трансляцию в стартовом сайте, отличном от AUG (CUG). ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что DDX17 взаимодействует с:

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000100201 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000055065 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ламм ГМ, Никол С.М., Фуллер-Пейс Ф.В., Ламонд А.И. (декабрь 1996 г.). «p72: человеческий ядерный белок DEAD box, тесно связанный с p68» . Нуклеиновые кислоты Рез . 24 (19): 3739–47. дои : 10.1093/нар/24.19.3739 . ПМК 146168 . ПМИД 8871553 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: DDX17 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) боксерский полипептид 17» .
^ Огилви В.К., Уилсон Б.Дж., Никол С.М., Моррис Н.А., Сондерс Л.Р., Барбер Г.Н., Фуллер-Пейс Ф.В. (2003). «Близкородственные DEAD-боксные РНК-хеликазы p68 и p72 существуют в клетках в виде гетеродимеров» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (5): 1470–80. дои : 10.1093/нар/gkg236 . ПМК 149829 . ПМИД 12595555 .
^ Уилсон Б.Дж., Жигер В. (ноябрь 2007 г.). «Идентификация новых партнеров по пути РНК-хеликаз p68 и p72 посредством метаанализа Oncomine» . БМК Геномика . 8 : 419. дои : 10.1186/1471-2164-8-419 . ПМК 3225811 . ПМИД 18005418 .
^ Уилсон Б.Дж., Бейтс Дж.Дж., Никол С.М., Грегори Дж.Д., Перкинс Н.Д., Фуллер-Пейс Ф.В. (август 2004 г.). «РНК-хеликазы DEAD-бокса p68 и p72 взаимодействуют с HDAC1 и подавляют транскрипцию промотор-специфичным образом» . БМК Мол. Биол . 5:11 . дои : 10.1186/1471-2199-5-11 . ПМК 514542 . ПМИД 15298701 .

Дальнейшее чтение

Люкинг А, Шталь У, Шмидт У (1998). «Белковое семейство РНК-хеликаз». Крит. Преподобный Биохим. Мол. Биол . 33 (4): 259–96. дои : 10.1080/10409239891204233 . ПМИД 9747670 .
Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Дж.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (1996). «Метод «двойного адаптера» для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим . 236 (1): 107–13. дои : 10.1006/abio.1996.0138 . ПМИД 8619474 .
Ю В., Андерссон Б., Уорли К.С., Музный Д.М., Дин Ю., Лю В., Рикафренте Дж.Ю., Вентланд М.А., Леннон Дж., Гиббс Р.А. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геном Рез . 7 (4): 353–8. дои : 10.1101/гр.7.4.353 . ПМК 139146 . ПМИД 9110174 .
Данхэм И, Симидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж.Э., Брускевич Р., Беар Д.М., Клэмп М., Сминк Л.Дж., Эйнско Р., Алмейда Дж.П., Бэббидж А., Бэггули С., Бэйли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бизли О, Бёрд С.П., Блейки С., Бриджмен А.М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл WD, О'Брайен КП (1999). «Последовательность ДНК 22 хромосомы человека» . Природа . 402 (6761): 489–95. Бибкод : 1999Natur.402..489D . дои : 10.1038/990031 . ПМИД 10591208 .
Ульманн-Шиффлер Х., Рёсслер О.Г., Шталь Х. (2002). «МРНК белка p72 DEAD-бокса альтернативно транслируется в РНК-хеликазу массой 82 кДа» . Ж. Биол. Хим . 277 (2): 1066–75. дои : 10.1074/jbc.M107535200 . ПМИД 11675387 .
Хёниг А., Обёф Д., Паркер М.М., О'Мэлли Б.В., Бергет С.М. (2002). «Регуляция альтернативного сплайсинга с помощью АТФ-зависимой РНК-хеликазы DEAD-Box p72» . Мол. Клетка. Биол . 22 (16): 5698–707. дои : 10.1128/MCB.22.16.5698-5707.2002 . ПМК 133985 . ПМИД 12138182 .
Охта С., Сиоми Ю., Сугимото К., Обусе С., Цуримото Т. (2002). «Протеомный подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация комплекса CHL12/RFCs2-5 человека как нового PCNA-связывающего белка» . Ж. Биол. Хим . 277 (43): 40362–7. дои : 10.1074/jbc.M206194200 . ПМИД 12171929 .
Ли К.Г. (2002). «RH70, двунаправленная РНК-геликаза, очищается совместно с U1snRNP» . Ж. Биол. Хим . 277 (42): 39679–83. дои : 10.1074/jbc.C200337200 . ПМИД 12193588 .
Огилви В.К., Уилсон Б.Дж., Никол С.М., Моррис Н.А., Сондерс Л.Р., Барбер Г.Н., Фуллер-Пейс Ф.В. (2003). «Близкородственные DEAD-боксные РНК-хеликазы p68 и p72 существуют в клетках в виде гетеродимеров» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (5): 1470–80. дои : 10.1093/нар/gkg236 . ПМК 149829 . ПМИД 12595555 .
Фудзита Т., Кобаяши Ю., Вада О., Татейши Ю., Китада Л., Ямамото Ю., Такашима Х., Мураяма А., Яно Т., Баба Т., Като С., Кавабе Ю., Янагисава Дж. (2003). «Полная активация функции активации альфа-1 рецептора эстрогена вызывает пролиферацию клеток рака молочной железы» . Ж. Биол. Химия 278 (29): 26704–14. дои : 10.1074/jbc.M301031200 . ПМИД 12738788 .
Ли Дж., Хокинс И.С., Харви К.Д., Дженнингс Дж.Л., Линк Эй.Дж., Паттон Дж.Г. (2003). «Регуляция альтернативного сплайсинга с помощью SRrp86 и его взаимодействующих белков» . Мол. Клетка. Биол . 23 (21): 7437–47. дои : 10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003 . ПМК 207616 . ПМИД 14559993 .
Уилсон Б.Дж., Бейтс Дж.Дж., Никол С.М., Грегори Дж.Д., Перкинс Н.Д., Фуллер-Пейс Ф.В. (2005). «РНК-хеликазы DEAD-бокса p68 и p72 взаимодействуют с HDAC1 и подавляют транскрипцию промотор-специфичным образом» . БМК Мол. Биол . 5:11 . дои : 10.1186/1471-2199-5-11 . ПМК 514542 . ПМИД 15298701 .
Джин Дж., Смит Ф.Д., Старк С., Уэллс К.Д., Фосетт Дж.П., Кулкарни С., Металников П., О'Доннелл П., Тейлор П., Тейлор Л., Зугман А., Вуджетт Дж.Р., Лангеберг Л.К., Скотт Дж.Д., Поусон Т. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3-связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации» . Курс. Биол . 14 (16): 1436–50. Бибкод : 2004CBio...14.1436J . дои : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . ПМИД 15324660 . S2CID 2371325 .
Сузуки Ю, Ямашита Р, Широта М, Сакакибара Ю, Чиба Дж, Мидзусима-Сугано Дж, Накаи К, Сугано С (2004). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши показывает гомологичную блочную структуру в промоторных регионах» . Геном Рез . 14 (9): 1711–8. дои : 10.1101/гр.2435604 . ПМК 515316 . ПМИД 15342556 .
Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс К. А., Дэвис М. П., Гринхэм Дж. А., Коул К. Г., Говард М. Е., Агуадо Б., Малля М., Мокраб Ю., Хакл Э. Дж., Беар Д. М., Данэм I (2005). «Подход к клонированию ORFeome человека на основе аннотаций генома» . Геном Биол . 5 (10): Р84. дои : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . ПМК 545604 . ПМИД 15461802 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 22 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000100201 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000055065 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8871553-5] Ламм ГМ, Никол С.М., Фуллер-Пейс Ф.В., Ламонд А.И. (декабрь 1996 г.). «p72: человеческий ядерный белок DEAD box, тесно связанный с p68» . Нуклеиновые кислоты Рез . 24 (19): 3739–47. дои : 10.1093/нар/24.19.3739 . ПМК 146168 . ПМИД 8871553 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: DDX17 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) боксерский полипептид 17» .

[pmid12595555-7] Огилви В.К., Уилсон Б.Дж., Никол С.М., Моррис Н.А., Сондерс Л.Р., Барбер Г.Н., Фуллер-Пейс Ф.В. (2003). «Близкородственные DEAD-боксные РНК-хеликазы p68 и p72 существуют в клетках в виде гетеродимеров» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (5): 1470–80. дои : 10.1093/нар/gkg236 . ПМК 149829 . ПМИД 12595555 .

[pmid18005418-8] Уилсон Б.Дж., Жигер В. (ноябрь 2007 г.). «Идентификация новых партнеров по пути РНК-хеликаз p68 и p72 посредством метаанализа Oncomine» . БМК Геномика . 8 : 419. дои : 10.1186/1471-2164-8-419 . ПМК 3225811 . ПМИД 18005418 .

[pmid15298701-9] Уилсон Б.Дж., Бейтс Дж.Дж., Никол С.М., Грегори Дж.Д., Перкинс Н.Д., Фуллер-Пейс Ф.В. (август 2004 г.). «РНК-хеликазы DEAD-бокса p68 и p72 взаимодействуют с HDAC1 и подавляют транскрипцию промотор-специфичным образом» . БМК Мол. Биол . 5:11 . дои : 10.1186/1471-2199-5-11 . ПМК 514542 . ПМИД 15298701 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]