XPG N термин

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Терминальный домен XPG N
Терминальный домен XPG N
	Кристаллическая структура мутанта лоскутной эндонуклеазы-1 r42e Pyrococcus horikoshii
Идентификаторы
Символ	XPG_N
Пфам	PF00752
Пфам Клан	CL0280
ИнтерПро	ИПР006085
PROSITE	PDOC00658
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2	1а77 / СКОПе / СУПФАМ
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

В молекулярной биологии белковый домен XPG в данном случае относится к N-концу XPG. Белок XPG можно корректировать с помощью ядерного белка XPGC массой 133 кДа . ^{[ 1 ]} XPGC представляет собой кислый белок , который обеспечивает нормальную устойчивость к ультрафиолетовому (УФ) свету. ^{[ 2 ]} Это магний -зависимая одноцепочечная ДНК эндонуклеаза ДНК, , которая делает структурно-специфические эндонуклеолитические разрезы в субстрате содержащем дуплексную область и одноцепочечные плечи. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} XPGC расщепляет одну цепь дуплекса на границе с одноцепочечной областью. ^{[ 3 ]}

Гомология

XPG принадлежит к семейству белков , которое включает:

RAD2 из Saccharomyces cerevisiae (пекарские дрожжи) и rad13 из Schizosaccharomyces pombe (делящиеся дрожжи), которые представляют собой одноцепочечные ДНК- эндонуклеазы ; ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}
мышиный и человеческий FEN-1, структурно-специфическая эндонуклеаза;
RAD2 от делящихся дрожжей и RAD27 от почкующихся дрожжей;
exo1 делящихся дрожжей , 5'- 3'- двухцепочечной ДНК экзонуклеаза , которая может действовать по пути, корректирующему несовпадающие пары оснований ;
дрожжи DHS1,
дрожжи DIN7.

Выравнивание последовательностей этого семейства белков показывает, что сходство в основном ограничивается двумя областями. Первый расположен на N-конце (N-область) и соответствует первым 95–105 аминокислотам . Вторая область является внутренней (I-область) и находится ближе к С-концу; он охватывает около 140 остатков и содержит высококонсервативное ядро из 27 аминокислот , которое включает консервативный пентапептид (EA-[DE]-A-[QS]). Возможно, консервативные кислотные остатки участвуют в каталитическом механизме эксцизионной репарации ДНК в XPG. Аминокислота, связывающая N- и I-области, не консервативна .

Пигментная ксеродерма

Пигментная ксеродерма (XP) ^{[ 1 ]} Это заболевание человека аутосомно-рецессивное , характеризующееся высокой частотой развития кожи рака , вызванного солнечным светом . людей кожи Клетки с этим заболеванием сверхчувствительны к ультрафиолетовому свету из-за дефектов на этапе разреза при эксцизионной репарации ДНК. В этом пути участвуют как минимум семь групп генетической комплементации: от XP-A до XP-G. XP-G является одним из наиболее редких и фенотипически гетерогенных типов XP, демонстрируя от незначительного до крайнего нарушения эксцизионной репарации ДНК. ^{[ 2 ]}^{[ 5 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Танака К., Вуд Р.Д. (февраль 1994 г.). «Пигментная ксеродерма и эксцизионная репарация нуклеотидов ДНК». Тенденции биохимии. Наука . 19 (2): 83–6. дои : 10.1016/0968-0004(94)90040-X . ПМИД 8160271 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с О'Донован А., Шерли Д., Кларксон С.Г., Вуд Р.Д. (июнь 1994 г.). «Выделение активного рекомбинантного белка XPG, эндонуклеазы репарации ДНК человека» . Ж. Биол. Хим . 269 (23): 15965–8. дои : 10.1016/S0021-9258(17)33956-X . PMID 8206890 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с О'Донован А., Дэвис А.А., Моггс Дж.Г., Вест СК, Вуд Р.Д. (сентябрь 1994 г.). «Эндонуклеаза XPG делает 3'-надрез при эксцизионной репарации нуклеотидов ДНК человека». Природа . 371 (6496): 432–5. Бибкод : 1994Natur.371..432O . дои : 10.1038/371432a0 . ПМИД 8090225 . S2CID 4328388 .
^ Хабракен И., Сунг П., Пракаш Л., Пракаш С. (ноябрь 1993 г.). «Ген эксцизионной репарации дрожжей RAD2 кодирует эндонуклеазу одноцепочечной ДНК». Природа . 366 (6453): 365–8. Бибкод : 1993Natur.366..365H . дои : 10.1038/366365a0 . ПМИД 8247134 . S2CID 4286568 .
^ Карр А.М., Шелдрик К.С., Мюррей Дж.М., аль-Харити Р., Уоттс Ф.З., Леманн А.Р. (март 1993 г.). «Эволюционная консервативность эксцизионной репарации у Schizosaccharomyces pombe: доказательства существования семейства последовательностей, связанных с геном RAD2 Saccharomyces cerevisiae» . Нуклеиновые кислоты Рез . 21 (6): 1345–9. дои : 10.1093/нар/21.6.1345 . ПМК 309318 . PMID 8464724 .

В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR006085.

[pmid8160271-1] Jump up to: ^а ^б Танака К., Вуд Р.Д. (февраль 1994 г.). «Пигментная ксеродерма и эксцизионная репарация нуклеотидов ДНК». Тенденции биохимии. Наука . 19 (2): 83–6. дои : 10.1016/0968-0004(94)90040-X . ПМИД 8160271 .

[pmid8206890-2] Jump up to: ^а ^б ^с О'Донован А., Шерли Д., Кларксон С.Г., Вуд Р.Д. (июнь 1994 г.). «Выделение активного рекомбинантного белка XPG, эндонуклеазы репарации ДНК человека» . Ж. Биол. Хим . 269 (23): 15965–8. дои : 10.1016/S0021-9258(17)33956-X . PMID 8206890 .

[pmid8090225-3] Jump up to: ^а ^б ^с О'Донован А., Дэвис А.А., Моггс Дж.Г., Вест СК, Вуд Р.Д. (сентябрь 1994 г.). «Эндонуклеаза XPG делает 3'-надрез при эксцизионной репарации нуклеотидов ДНК человека». Природа . 371 (6496): 432–5. Бибкод : 1994Natur.371..432O . дои : 10.1038/371432a0 . ПМИД 8090225 . S2CID 4328388 .

[pmid8247134-4] Хабракен И., Сунг П., Пракаш Л., Пракаш С. (ноябрь 1993 г.). «Ген эксцизионной репарации дрожжей RAD2 кодирует эндонуклеазу одноцепочечной ДНК». Природа . 366 (6453): 365–8. Бибкод : 1993Natur.366..365H . дои : 10.1038/366365a0 . ПМИД 8247134 . S2CID 4286568 .

[pmid8464724-5] Карр А.М., Шелдрик К.С., Мюррей Дж.М., аль-Харити Р., Уоттс Ф.З., Леманн А.Р. (март 1993 г.). «Эволюционная консервативность эксцизионной репарации у Schizosaccharomyces pombe: доказательства существования семейства последовательностей, связанных с геном RAD2 Saccharomyces cerevisiae» . Нуклеиновые кислоты Рез . 21 (6): 1345–9. дои : 10.1093/нар/21.6.1345 . ПМК 309318 . PMID 8464724 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]