DEFA6

DEFA6
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1ZMQ, 3QTE
Идентификаторы
Псевдонимы	DEFA6 , DEF6, HD-6, дефенсин альфа 6
Внешние идентификаторы	Опустить : 600471 ; МГИ : 3711900 ; Гомологен : 130499 ; Генные карты : DEFA6 ; OMA : DEFA6 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 8 (human)
End	6,926,076 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	21,556,012 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	duodenum; ; rectum; ; mucosa of transverse colon; ; appendix; ; lymph node; ; body of pancreas; ; skin of abdomen; ; bone marrow; ; right lung; ; gastric mucosa;
	Top expressed in
	ileum; ; jejunum; ; duodenum; ; embryo; ; colon; ; pancreas; ; thymus; ; esophagus; ; liver; ; stomach;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; protein homodimerization activity;
Cellular component	Golgi lumen; extracellular region; extracellular space;
Biological process	defense response; defense response to bacterium; defense response to fungus; antimicrobial humoral response; antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; killing of cells of other organism; innate immune response in mucosa; antibacterial humoral response; defense response to Gram-negative bacterium; defense response to Gram-positive bacterium; membrane disruption in other organism; cellular response to lipopolysaccharide;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1671
	100041688
	ENSG00000164822 ; ENSG00000285136
	ENSMUSG00000061845
	Q01524
	E9QLQ1
	НМ_001926
	НМ_001177481
	НП_001917
	НП_001170952
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Дефенсин альфа-6 (DEFA6), также известный как альфа-дефенсин человека 6 ( HD6 ), представляет собой человеческий белок , кодируемый DEFA6 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} DEFA6 экспрессируется в клетках Панета подвздошной кишки . ^{[ 7 ]}

Функция

Альфа -дефенсины представляют собой семейство микробицидных и цитотоксических пептидов, которые защищают хозяина от бактерий и вирусов . HD6 обладает плохой антибактериальной активностью. ^{[ 8 ]} Однако HD6 обеспечивает защиту от инвазии кишечными бактериальными патогенами путем самосборки с образованием фибрилл и наносетей , которые окружают и опутывают бактерии. ^{[ 9 ]}

Несколько альфа- дефенсина генов , включая DEFA6 , сосредоточены на хромосоме 8. ^{[ 5 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000285136 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000164822, ENSG00000285136 — Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061845 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: дефенсин DEFA6, альфа 6, специфичный для клеток Панета ( Homo sapiens )» .
^ Джонс Д.Е., Бевинс К.Л. (январь 1993 г.). «МРНК дефензина-6 в клетках Панета человека: значение антимикробных пептидов в защите кишечника человека» . Письма ФЭБС . 315 (2): 187–92. дои : 10.1016/0014-5793(93)81160-2 . ПМИД 8417977 . S2CID 45099115 .
^ Чжао С., Ван И, Лерер Р.И. (ноябрь 1996 г.). «Широко распространенная экспрессия бета-дефенсина hBD-1 в секреторных железах и эпителиальных клетках человека» . Письма ФЭБС . 396 (2–3): 319–22. дои : 10.1016/0014-5793(96)01123-4 . ПМИД 8915011 . S2CID 22367037 .
^ Эриксен Б., Ву З, Лу В., Лерер Р.И. (январь 2005 г.). «Антибактериальная активность и специфичность шести {альфа}-дефенсинов человека» . Антимикробные средства и химиотерапия . 49 (1): 269–75. doi : 10.1128/AAC.49.1.269-275.2005 . ПМЦ 538877 . ПМИД 15616305 .
^ Чу Х., Пасгиер М., Юнг Г., Нуччио С.П., Кастильо П.А., де Йонг М.Ф. и др. (июль 2012 г.). «Человеческий α-дефенсин 6 способствует врожденному иммунитету слизистой оболочки посредством самоорганизующихся пептидных наносетей» . Наука . 337 (6093): 477–81. Бибкод : 2012Sci...337..477C . дои : 10.1126/science.1218831 . ПМК 4332406 . ПМИД 22722251 .

Дальнейшее чтение

Шик А., Ву З, Такер К., Ян Д., Лу В., Лубковски Дж. (декабрь 2006 г.). «Кристаллические структуры альфа-дефенсинов человека HNP4, HD5 и HD6» . Белковая наука . 15 (12): 2749–60. дои : 10.1110/ps.062336606 . ПМЦ 2242434 . ПМИД 17088326 .
Ву З, Эриксен Б, Такер К, Лубковски Дж, Лу В (сентябрь 2004 г.). «Синтез и характеристика альфа-дефенсинов человека 4-6». Журнал исследований пептидов . 64 (3): 118–25. дои : 10.1111/j.1399-3011.2004.00179.x . ПМИД 15317502 .
Маллоу Э.Б., Харрис А., Зальцман Н., Рассел Дж.П., ДеБерардинис Р.Дж., Ручелли Э., Бевинс К.Л. (февраль 1996 г.). «Кишечные дефенсины человека. Структура генов и экспрессия в процессе развития» . Журнал биологической химии . 271 (8): 4038–45. дои : 10.1074/jbc.271.8.4038 . ПМИД 8626737 .
Бевинс К.Л., Джонс Д.Э., Дутра А., Шаффзин Дж., Мюнке М. (январь 1996 г.). «Гены кишечного дефенсина человека: положение на хромосомной карте и модель возможных эволюционных взаимоотношений». Геномика . 31 (1): 95–106. дои : 10.1006/geno.1996.0014 . ПМИД 8808285 .
Эйзенхауэр П.Б., Харвиг С.С., Лерер Р.И. (сентябрь 1992 г.). «Криптдины: антимикробные дефензины тонкого кишечника мышей» . Инфекция и иммунитет . 60 (9): 3556–65. дои : 10.1128/IAI.60.9.3556-3565.1992 . ПМК 257361 . ПМИД 1500163 .
Хаттнер К.М., Селстед М.Э., Уэллетт А.Дж. (февраль 1994 г.). «Структура и разнообразие семейства генов мышиного криптдина». Геномика . 19 (3): 448–53. дои : 10.1006/geno.1994.1093 . ПМИД 8188287 .

Внешние ссылки

PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для человеческого дефенсина-6.

Эта статья о гене человека й хромосомы незавершена 8 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000285136 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000164822, ENSG00000285136 — Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061845 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: дефенсин DEFA6, альфа 6, специфичный для клеток Панета ( Homo sapiens )» .

[pmid8417977-6] Джонс Д.Е., Бевинс К.Л. (январь 1993 г.). «МРНК дефензина-6 в клетках Панета человека: значение антимикробных пептидов в защите кишечника человека» . Письма ФЭБС . 315 (2): 187–92. дои : 10.1016/0014-5793(93)81160-2 . ПМИД 8417977 . S2CID 45099115 .

[pmid8915011-7] Чжао С., Ван И, Лерер Р.И. (ноябрь 1996 г.). «Широко распространенная экспрессия бета-дефенсина hBD-1 в секреторных железах и эпителиальных клетках человека» . Письма ФЭБС . 396 (2–3): 319–22. дои : 10.1016/0014-5793(96)01123-4 . ПМИД 8915011 . S2CID 22367037 .

[pmid15616305-8] Эриксен Б., Ву З, Лу В., Лерер Р.И. (январь 2005 г.). «Антибактериальная активность и специфичность шести {альфа}-дефенсинов человека» . Антимикробные средства и химиотерапия . 49 (1): 269–75. doi : 10.1128/AAC.49.1.269-275.2005 . ПМЦ 538877 . ПМИД 15616305 .

[pmid22722251-9] Чу Х., Пасгиер М., Юнг Г., Нуччио С.П., Кастильо П.А., де Йонг М.Ф. и др. (июль 2012 г.). «Человеческий α-дефенсин 6 способствует врожденному иммунитету слизистой оболочки посредством самоорганизующихся пептидных наносетей» . Наука . 337 (6093): 477–81. Бибкод : 2012Sci...337..477C . дои : 10.1126/science.1218831 . ПМК 4332406 . ПМИД 22722251 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]