РИПП1

РИПП1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4ZC4, 5C0V
Идентификаторы
Псевдонимы	LARP1 , LARP, член семейства 1 доменов рибонуклеопротеина La, рибонуклеопротеин 1 La, регулятор трансляции, Lar1, Lhp1
Внешние идентификаторы	Опустить : 612059 ; МГИ : 1890165 ; Гомологен : 9089 ; GeneCards : LARP1 ; OMA : LARP1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	154,817,605 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	57,952,860 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	superior vestibular nucleus; ; pars reticulata; ; spinal ganglia; ; Pars compacta; ; middle temporal gyrus; ; lateral nuclear group of thalamus; ; trigeminal ganglion; ; pylorus; ; Brodmann area 23; ; renal medulla;
	Top expressed in
	primitive streak; ; crypt of lieberkuhn of small intestine; ; lacrimal gland; ; fetal liver hematopoietic progenitor cell; ; epiblast; ; tail of embryo; ; trigeminal ganglion; ; left lobe of liver; ; entorhinal cortex; ; somite;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	RNA cap binding; translation activator activity; translation initiation factor binding; protein binding; eukaryotic initiation factor 4E binding; mRNA 3'-UTR binding; mRNA 5'-UTR binding; RNA binding; cadherin binding; RNA 7-methylguanosine cap binding; ribosomal small subunit binding;
Cellular component	cytoplasm; TORC1 complex; membrane; polysome; cytoplasmic stress granule; polysomal ribosome;
Biological process	translational initiation; positive regulation of macroautophagy; positive regulation of viral genome replication; cell population proliferation; TOR signaling; protein biosynthesis; positive regulation of translation; negative regulation of translation; TORC1 signaling; mRNA stabilization; cellular response to rapamycin; response to amino acid starvation; regulation of translation; negative regulation of translational initiation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	23367
	73158
	ENSG00000155506
	ENSMUSG00000037331
	Q6PKG0
	Q6ZQ58
showНМ_015315 ; НМ_033551 ; НМ_001367713 ; НМ_001367714 ; НМ_001367715 ;
	NM_001367716; NM_001367717; NM_001367718; NM_001367719
	НМ_028451
showНП_056130 ; НП_001354642 ; НП_001354643 ; НП_001354644 ; НП_001354645 ;
	NP_001354646; NP_001354647; NP_001354648; NP_291029
	НП_082727
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

La-родственный белок 1 (LARP1) 150 кДа представляет собой белок массой , который у человека кодируется LARP1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} LARP1 является новой мишенью сигнального пути комплекса рапамицина 1 (mTORC1) млекопитающих, схемы, часто гиперактивируемой при раке, которая регулирует рост и пролиферацию клеток, главным образом, посредством регуляции синтеза белка. ^{[ 8 ]}

Функция

LARP1 является крупнейшим из семи членов семейства белков LARP (другие: LARP1B, LARP3 (также известный как настоящий La или SSB), LARP4A, LARP4B, LARP6 и LARP7). ^{[ 9 ]} Все белки LARP, включая LARP человека, содержат 2 консервативных участка. Первая консервативная область имеет гомологию с белками La (называемая мотивом La, см. SSB ), тогда как вторая консервативная область (называемая LA-мотивом) ограничена белками LARP. LARP1 и 1B также содержат консервативную «область DM15» на своем С-конце. ^{[ 10 ]} Эта область уникальна и, как было показано, необходима для связывания РНК. Мышиный Larp1 экспрессируется в ганглиях дорсальных корешков и спинном мозге , а также в развивающихся органах, характеризующихся эпителиально - мезенхимальными взаимодействиями. ^{[ 6 ]} Человеческий LARP1 присутствует на низких уровнях в нормальных, неэмбриональных клетках, но высоко экспрессируется при эпителиальном раке (например, раке яичников, колоректальном раке, предстательной железе, немелкоклеточном раке легких, гепатоцеллюлярном раке и раке шейки матки). ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}^{[ 14 ]} Некоторые исследования показали, что высокие уровни белка LARP1 коррелируют с худшим прогнозом у онкологических больных. ^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}

LARP1 связывается и регулирует трансляцию терминального олигопиримидинового мотива (TOP- мРНК ) и может напрямую взаимодействовать с 5'-кэпом мРНК. ^{[ 17 ]}^{[ 18 ]} Также было показано, что он взаимодействует с 3'-концом и кодирующими областями (CDS) других генов. ^{[ 17 ]} Белок LARP1 колокализуется со стрессовыми гранулами и Р-тельцами . ^{[ 19 ]} которые участвуют в хранении и деградации РНК. Было высказано предположение, что LARP1 функционирует в P-тельцах, уменьшая количество консервативных мРНК Ras - MAPK . Кластер гомологов LARP1 может контролировать экспрессию ключевых регуляторов развития. ^{[ 19 ]}

Несколько исследований показали, что дефицит LARP1 избирательно влияет на рекрутирование мРНК TOP в полисомы. ^{[ нужна ссылка ]}. В некоторых раковых клетках дефицит LARP1 снижает пролиферацию и активирует апоптотическую гибель клеток. ^{[ 13 ]} Несмотря на то, что в клетках с молчанием LARP1 сообщается об уменьшении количества белков, кодируемых мРНК TOP, некоторые исследователи полагают, что это можно объяснить просто уменьшением количества транскриптов мРНК TOP в клетках с дефицитом LARP1. ^{[ нужна ссылка ]}.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000155506 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037331 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Миядзима Н., Танака А. и др. (октябрь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 5 (5): 277–86. дои : 10.1093/dnares/5.5.277 . ПМИД 9872452 .
^ Jump up to: ^а ^б Шове С., Морель-Зафран С., Миасод Р., Жюльен Н., Прадель Дж., Араньол Д. (июль 2000 г.). «dlarp, новый кандидат-мишень Hox у дрозофилы, чей ортолог у мышей экспрессируется в местах взаимодействия эпителия и мезенхимы» . Динамика развития . 218 (3): 401–13. doi : 10.1002/1097-0177(200007)218:3<401::AID-DVDY1009>3.0.CO;2-6 . ПМИД 10878606 .
^ «Ген Энтрез: семейство доменов рибонуклеопротеина LARP1 La, член 1» .
^ Черкезян Дж., Карньелло М., Ромео Ю., Хаттлин Э.Л., Лавуа Г., Гиги С.П. и др. (февраль 2014 г.). «Протеомный анализ кэп-зависимой трансляции идентифицирует LARP1 как ключевой регулятор трансляции мРНК 5'TOP» . Генс Дев . 28 (4): 357–71. дои : 10.1101/gad.231407.113 . ПМЦ 3937514 . ПМИД 24532714 .
^ Буске-Антонелли С., Дерагон Ж.М. (май 2009 г.). «Комплексный анализ суперсемейства белков La-motif» . РНК . 15 (5): 750–64. дои : 10.1261/rna.1478709 . ПМК 2673062 . ПМИД 19299548 .
^ Лар Р.М., Мак С.М., Эру А., Благден С.П., Буске-Антонелли С., Дерагон Ж.М. и др. (сентябрь 2015 г.). «Домен, специфичный для La-родственного белка 1, переназначает HEAT-подобные повторы для прямого связывания с последовательностью 5'TOP» . Исследования нуклеиновых кислот . 43 (16): 8077–88. дои : 10.1093/nar/gkv748 . ПМЦ 4652764 . ПМИД 26206669 .
^ Ставрака С., Благден С. (октябрь 2015 г.). «Белки, родственные La, семейство, связанное с раком» . Биомолекулы . 5 (4): 2701–22. дои : 10.3390/biom5042701 . ПМЦ 4693254 . ПМИД 26501340 .
^ Мура М., Хопкинс Т.Г., Майкл Т., Абд-Латип Н., Вейр Дж., Абоагье Э. и др. (сентябрь 2015 г.). «LARP1 посттранскрипционно регулирует mTOR и способствует прогрессированию рака» . Онкоген . 34 (39): 5025–36. дои : 10.1038/onc.2014.428 . ПМЦ 4430325 . ПМИД 25531318 .
^ Jump up to: ^а ^б Хопкинс Т.Г., Мура М., Аль-Ашталь Х.А., Лар Р.М., Абд-Латип Н., Суини К. и др. (февраль 2016 г.). «РНК-связывающий белок LARP1 является посттранскрипционным регулятором выживания и онкогенеза при раке яичников» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (3): 1227–46. дои : 10.1093/nar/gkv1515 . ПМЦ 4756840 . ПМИД 26717985 .
^ Се С., Хуан Л., Се С., Се Д., Чжан Г., Ван П. и др. (октябрь 2013 г.). «LARP1 прогнозирует прогноз для гепатоцеллюлярной карциномы на ранней стадии и с нормальным AFP» . Журнал трансляционной медицины . 11 : 272. дои : 10.1186/1479-5876-11-272 . ПМЦ 3814951 . ПМИД 24159927 .
^ Йе Л., Линь С.Т., Ми Ю.С., Лю Ю., Ма Ю., Сунь Х.М. и др. (ноябрь 2016 г.). «Сверхэкспрессия LARP1 предсказывает плохой прогноз колоректального рака и, как ожидается, станет потенциальной терапевтической мишенью» . Биология опухолей . 37 (11): 14585–14594. дои : 10.1007/s13277-016-5332-3 . ПМК 5126195 . ПМИД 27614686 .
^ Сюй З, Сюй Дж, Лу Х, Линь Б, Цай С, Го Дж и др. (декабрь 2017 г.). «LARP1 регулируется осью XIST/миР-374a и действует как онкоген при немелкоклеточной карциноме легкого» . Отчеты онкологии . 38 (6): 3659–3667. дои : 10.3892/или.2017.6040 . ПМИД 29039571 .
^ Jump up to: ^а ^б Хонг С., Фриберг М.А., Хан Т., Камат А., Яо Ю., Фукуда Т. и др. (июнь 2017 г.). «LARP1 действует как молекулярный переключатель для опосредованной mTORC1 трансляции важного класса мРНК» . электронная жизнь . 6 . дои : 10.7554/elife.25237 . ПМК 5484620 . ПМИД 28650797 .
^ Лар Р.М., Фонсека Б.Д., Чиотти Г.Е., Аль-Ашталь Х.А., Цзя Дж.Дж., Никлаус М.Р. и др. (апрель 2017 г.). «La-связанный белок 1 (LARP1) связывает кэп мРНК, блокируя сборку eIF4F на мРНК TOP» . электронная жизнь . 6 . дои : 10.7554/elife.24146 . ПМК 5419741 . ПМИД 28379136 .
^ Jump up to: ^а ^б Найкамп К., Ли М.Х., Кимбл Дж. (июль 2008 г.). «Белок, родственный La C. elegans, LARP-1, локализуется в Р-тельцах зародышевой линии и ослабляет передачу сигналов Ras-MAPK во время оогенеза» . РНК . 14 (7): 1378–89. дои : 10.1261/rna.1066008 . ПМК 2441978 . ПМИД 18515547 .

Дальнейшее чтение

Хорке С., Ройманн К., Швейцер М., Уилл Х., Хайзе Т. (июнь 2004 г.). «Ядерный транспорт белка La зависит от вновь выявленного сигнала ядрышковой локализации и способности связывать РНК» . Журнал биологической химии . 279 (25): 26563–70. дои : 10.1074/jbc.M401017200 . ПМИД 15060081 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж.Е., Виллен Дж., Ли Дж. и др. (август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Джин Дж., Смит Ф.Д., Старк С., Уэллс К.Д., Фосетт Дж.П., Кулкарни С. и др. (август 2004 г.). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3-связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации» . Современная биология . 14 (16): 1436–50. Бибкод : 2004CBio...14.1436J . дои : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . ПМИД 15324660 . S2CID 2371325 .
Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (октябрь 2006 г.). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Природная биотехнология . 24 (10): 1285–92. дои : 10.1038/nbt1240 . ПМИД 16964243 . S2CID 14294292 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П. и др. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 5 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000155506 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037331 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9872452-5] Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Миядзима Н., Танака А. и др. (октябрь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 5 (5): 277–86. дои : 10.1093/dnares/5.5.277 . ПМИД 9872452 .

[pmid10878606-6] Jump up to: ^а ^б Шове С., Морель-Зафран С., Миасод Р., Жюльен Н., Прадель Дж., Араньол Д. (июль 2000 г.). «dlarp, новый кандидат-мишень Hox у дрозофилы, чей ортолог у мышей экспрессируется в местах взаимодействия эпителия и мезенхимы» . Динамика развития . 218 (3): 401–13. doi : 10.1002/1097-0177(200007)218:3<401::AID-DVDY1009>3.0.CO;2-6 . ПМИД 10878606 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: семейство доменов рибонуклеопротеина LARP1 La, член 1» .

[8] Черкезян Дж., Карньелло М., Ромео Ю., Хаттлин Э.Л., Лавуа Г., Гиги С.П. и др. (февраль 2014 г.). «Протеомный анализ кэп-зависимой трансляции идентифицирует LARP1 как ключевой регулятор трансляции мРНК 5'TOP» . Генс Дев . 28 (4): 357–71. дои : 10.1101/gad.231407.113 . ПМЦ 3937514 . ПМИД 24532714 .

[9] Буске-Антонелли С., Дерагон Ж.М. (май 2009 г.). «Комплексный анализ суперсемейства белков La-motif» . РНК . 15 (5): 750–64. дои : 10.1261/rna.1478709 . ПМК 2673062 . ПМИД 19299548 .

[10] Лар Р.М., Мак С.М., Эру А., Благден С.П., Буске-Антонелли С., Дерагон Ж.М. и др. (сентябрь 2015 г.). «Домен, специфичный для La-родственного белка 1, переназначает HEAT-подобные повторы для прямого связывания с последовательностью 5'TOP» . Исследования нуклеиновых кислот . 43 (16): 8077–88. дои : 10.1093/nar/gkv748 . ПМЦ 4652764 . ПМИД 26206669 .

[11] Ставрака С., Благден С. (октябрь 2015 г.). «Белки, родственные La, семейство, связанное с раком» . Биомолекулы . 5 (4): 2701–22. дои : 10.3390/biom5042701 . ПМЦ 4693254 . ПМИД 26501340 .

[12] Мура М., Хопкинс Т.Г., Майкл Т., Абд-Латип Н., Вейр Дж., Абоагье Э. и др. (сентябрь 2015 г.). «LARP1 посттранскрипционно регулирует mTOR и способствует прогрессированию рака» . Онкоген . 34 (39): 5025–36. дои : 10.1038/onc.2014.428 . ПМЦ 4430325 . ПМИД 25531318 .

[Hopkins_2016-13] Jump up to: ^а ^б Хопкинс Т.Г., Мура М., Аль-Ашталь Х.А., Лар Р.М., Абд-Латип Н., Суини К. и др. (февраль 2016 г.). «РНК-связывающий белок LARP1 является посттранскрипционным регулятором выживания и онкогенеза при раке яичников» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (3): 1227–46. дои : 10.1093/nar/gkv1515 . ПМЦ 4756840 . ПМИД 26717985 .

[14] Се С., Хуан Л., Се С., Се Д., Чжан Г., Ван П. и др. (октябрь 2013 г.). «LARP1 прогнозирует прогноз для гепатоцеллюлярной карциномы на ранней стадии и с нормальным AFP» . Журнал трансляционной медицины . 11 : 272. дои : 10.1186/1479-5876-11-272 . ПМЦ 3814951 . ПМИД 24159927 .

[15] Йе Л., Линь С.Т., Ми Ю.С., Лю Ю., Ма Ю., Сунь Х.М. и др. (ноябрь 2016 г.). «Сверхэкспрессия LARP1 предсказывает плохой прогноз колоректального рака и, как ожидается, станет потенциальной терапевтической мишенью» . Биология опухолей . 37 (11): 14585–14594. дои : 10.1007/s13277-016-5332-3 . ПМК 5126195 . ПМИД 27614686 .

[16] Сюй З, Сюй Дж, Лу Х, Линь Б, Цай С, Го Дж и др. (декабрь 2017 г.). «LARP1 регулируется осью XIST/миР-374a и действует как онкоген при немелкоклеточной карциноме легкого» . Отчеты онкологии . 38 (6): 3659–3667. дои : 10.3892/или.2017.6040 . ПМИД 29039571 .

[Hong_2017-17] Jump up to: ^а ^б Хонг С., Фриберг М.А., Хан Т., Камат А., Яо Ю., Фукуда Т. и др. (июнь 2017 г.). «LARP1 действует как молекулярный переключатель для опосредованной mTORC1 трансляции важного класса мРНК» . электронная жизнь . 6 . дои : 10.7554/elife.25237 . ПМК 5484620 . ПМИД 28650797 .

[Lahr_Fonseca_Ciotti_Al-Ashtal_p.-18] Лар Р.М., Фонсека Б.Д., Чиотти Г.Е., Аль-Ашталь Х.А., Цзя Дж.Дж., Никлаус М.Р. и др. (апрель 2017 г.). «La-связанный белок 1 (LARP1) связывает кэп мРНК, блокируя сборку eIF4F на мРНК TOP» . электронная жизнь . 6 . дои : 10.7554/elife.24146 . ПМК 5419741 . ПМИД 28379136 .

[Nykamp_2008-19] Jump up to: ^а ^б Найкамп К., Ли М.Х., Кимбл Дж. (июль 2008 г.). «Белок, родственный La C. elegans, LARP-1, локализуется в Р-тельцах зародышевой линии и ослабляет передачу сигналов Ras-MAPK во время оогенеза» . РНК . 14 (7): 1378–89. дои : 10.1261/rna.1066008 . ПМК 2441978 . ПМИД 18515547 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]