Рецептор внешней мембраны
| рецептор-зависимый TonB | |||
|---|---|---|---|
 Структура рецептора захвата гидроксамата железа. [ 1 ] | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | TonB_dep_Rec | ||
| Пфам | PF00593 | ||
| Пфам Клан | CL0193 | ||
| ИнтерПро | IPR000531 | ||
| PROSITE | PDOC00354 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 2fcp / СКОПе / СУПФАМ | ||
| TCDB | 1.Б.14 | ||
| Суперсемейство OPM | 33 | ||
| белок OPM | 1 кфг | ||
| CDD | cd01347 | ||
| |||
Рецепторы внешней мембраны , также известные как TonB-зависимые рецепторы , представляют собой семейство белков бета-баррелей, названных в честь их локализации во внешней мембране бактерий грамотрицательных . Комплексы TonB воспринимают сигналы снаружи бактериальных клеток и передают их в цитоплазму , что приводит к активации транскрипции мишеней генов- . TonB-зависимые рецепторы у грамотрицательных бактерий связаны с поглощением и транспортом крупных субстратов, таких как комплексы сидерофоров железа и витамина B12 . [ 2 ]
Взаимодействие TonB с другими белками
[ редактировать ]В Escherichia coli белок TonB взаимодействует с белками-рецепторами внешней мембраны, которые осуществляют высокоаффинное связывание и энергозависимое поглощение специфических субстратов в периплазматическое пространство. [ 3 ] Эти субстраты либо плохо транспортируются через неспецифические пориновые каналы, либо встречаются в очень низких концентрациях. В отсутствие TonB эти рецепторы связывают свои субстраты, но не осуществляют активного транспорта. TonB-зависимые регуляторные системы состоят из шести белковых компонентов. [ 4 ]
Белки, которые в настоящее время известны или предположительно взаимодействуют с TonB, включают BtuB, [ 5 ] CirA, FatA, FcuT, FecA, [ 6 ] ФуА, [ 7 ] ФхуЕ, ФепА , [ 8 ] FptA, HemR, IrgA, IutA, PfeA, PupA, LbpA и TbpA. Белок TonB также взаимодействует с некоторыми колицинами. Большинство этих белков содержат короткую консервативную область на N-конце. [ 9 ]
TonB-зависимый рецепторный домен
[ редактировать ]| TonB-зависимый рецепторный домен | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | Затыкать | ||
| Пфам | PF07715 | ||
| ИнтерПро | ИПР012910 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1фи1 / СКОПе / СУПФАМ | ||
| |||
TonB-зависимые рецепторы включают домен пробки , независимую сворачивающуюся субъединицу, которая действует как ворота канала, блокируя пору до тех пор, пока канал не свяжется с лигандом. В этот момент он претерпевает конформационные изменения, открывая канал. [ 10 ]
TonB как фаговый рецептор
[ редактировать ]TonB также действует как рецептор сальмонеллы бактериофага H8. Фактически, инфекция H8 зависит от TonB. [ 11 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Фергюсон А.Д., Велте В., Хофманн Э. и др. (июнь 2000 г.). «Консервативный структурный мотив распознавания липополисахаридов прокариотическими и эукариотическими белками» . Структура . 8 (6): 585–92. дои : 10.1016/S0969-2126(00)00143-X . ПМИД 10873859 .
- ^ Кебник, Ральф (2000). «Структура и функции белков внешней мембраны бактерий: вкратце о бочках». Микрообзор . 37 (2): 239–253.
- ^ Каднер Р.Дж., Чименто Д.П., Винер MC (2003). «Переносчик кобаламина BtuB внешней мембраны Escherichia coli: структурный анализ связывания кальция и субстрата и идентификация ортологичных транспортеров путем сохранения последовательности/структуры». Дж. Мол. Биол . 332 (5): 999–1014. дои : 10.1016/j.jmb.2003.07.005 . ПМИД 14499604 .
- ^ Кебник Р. (2005). «TonB-зависимая трансконвертная сигнализация: исключение или правило?». Тенденции Микробиол . 13 (8): 343–7. дои : 10.1016/j.tim.2005.06.005 . ПМИД 15993072 .
- ^ Каднер Р.Дж., Чименто Д.П., Винер М.К., Моханти А.К. (2003). «Субстрат-индуцированная трансмембранная передача сигналов в транспортере кобаламина BtuB». Нат. Структура. Биол . 10 (5): 394–401. дои : 10.1038/nsb914 . ПМИД 12652322 . S2CID 24883519 .
- ^ Дайзенхофер Дж., Смит Б.С., Эссер Л., Чакраборти Р., ван дер Хельм Д., Фергюсон А.Д. (2002). «Структурная основа пропускания транспортером внешней мембраны FecA». Наука . 295 (5560): 1715–1719. Бибкод : 2002Sci...295.1715F . дои : 10.1126/science.1067313 . ПМИД 11872840 . S2CID 86844549 .
- ^ Морас Д., Розенбуш Дж.П., Митшлер А., Рис Б., Лохер К.П., Кёбник Р., Мулинье Л. (1998). «Трансмембранная передача сигналов через лиганд-управляемый рецептор FhuA: кристаллические структуры свободного и связанного с феррихромом состояний обнаруживают аллостерические изменения» . Клетка . 95 (6): 771–778. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81700-6 . ПМИД 9865695 . S2CID 16899072 .
- ^ Дайзенхофер Дж., Ся Д., Бьюкенен С.К., Смит Б.С., Венкатрамани Л., Эссер Л., Палниткар М., Чакраборти Р., ван дер Хельм Д. (1999). «Кристаллическая структура активного переносчика внешней мембраны FepA из Escherichia coli». Нат. Структура. Биол . 6 (1): 56–63. дои : 10.1038/4931 . ПМИД 9886293 . S2CID 20231287 .
- ^ Клебба ЧП (2003). «Три парадокса поглощения трехвалентного энтеробактина» . Передний. Биосци . 8 (6): с1422–с1436. дои : 10.2741/1233 . ПМИД 12957833 .
- ^ Бьюкенен С.К., Эванс Р.В., Гирландо Р., Оке М., Сарра Р., Фарно С., Горриндж А.Р. (2004). «Домен пробки нейсериального TonB-зависимого транспортера сохраняет структурную целостность в отсутствие его трансмембранного бета-цилиндра» . ФЭБС Летт . 564 (3): 294–300. дои : 10.1016/S0014-5793(04)00196-6 . ПМИД 15111112 . S2CID 20056753 .
- ^ Рабш, В.; Ма, Л.; Уайли, Г.; Наджар, ФЗ; Казерер, В.; Шуерх, Д.В.; Клебба, Дж. Э.; Роу, бакалавр; Лаверде Гомес, JAL; Шаллми, М.; Ньютон, SMC; Клебба, ЧП (2007). «FepA- и TonB-зависимый бактериофаг H8: связывание рецептора и геномная последовательность» . Журнал бактериологии . 189 (15): 5658–5674. дои : 10.1128/JB.00437-07 . ЧВК 1951831 . ПМИД 17526714 .
 | Эта мембранных белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |