НОВИНКА1

НОВИНКА1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 1DT4, 2ANN, 2ANR
Идентификаторы
Псевдонимы	NOVA1 , Nova-1, альтернативный регулятор сплайсинга NOVA 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 602157 ; МГИ : 104297 ; Гомологен : 21296 ; Генные карты : NOVA1 ; ОМА : NOVA1 – ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 14 (human) Band 14q12 Start 26,443,093 bp End 26,597,754 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 12 (mouse) Band 12 B3|12 21.46 cM Start 46,694,517 bp End 46,818,929 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in cerebellum cerebellar hemisphere C1 segment hypothalamus paraflocculus of cerebellum Brodmann area 46 right hemisphere of cerebellum prefrontal cortex pons synovial joint Top expressed in lumbar subsegment of spinal cord dorsomedial hypothalamic nucleus lateral hypothalamus central gray substance of midbrain paraventricular nucleus of hypothalamus medial vestibular nucleus cerebellar cortex superior colliculus deep cerebellar nuclei inferior colliculus More reference expression data BioGPS More reference expression data
показывать Генная онтология Molecular function nucleic acid binding mRNA binding RNA binding protein binding Cellular component nucleolus intracellular membrane-bounded organelle nucleus Biological process mRNA splicing, via spliceosome RNA processing locomotory behavior RNA splicing regulation of RNA metabolic process chemical synaptic transmission negative regulation of cold-induced thermogenesis Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 4857 664883 Вместе ENSG00000139910 ENSMUSG00000021047 ЮниПрот P51513 Q9JKN6 RefSeq (мРНК) НМ_002515 НМ_006489 НМ_006491 показывать НМ_021361 НМ_001364634 НМ_001364635 НМ_001364636 НМ_001364637 NM_001364638 NM_001364639 RefSeq (белок) показывать НП_002506 НП_006480 НП_006482 НП_001353319 НП_001353320 NP_001353321 NP_001353322 NP_001353323 NP_001353324 NP_001353325 NP_001353326 NP_001353327 показывать НП_067336 НП_001351563 НП_001351564 НП_001351565 НП_001351566 NP_001351567 NP_001351568 Местоположение (UCSC) Чр 14: 26,44 – 26,6 Мб Чр 12: 46,69 – 46,82 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

РНК-связывающий белок Nova-1 — белок , который у человека кодируется NOVA1 геном .

Этот ген кодирует нейронспецифический РНК-связывающий белок, член семейства Nova антигенов паранеопластических заболеваний , который распознается и ингибируется паранеопластическими антителами. Эти антитела обнаруживаются в сыворотке пациентов с паранеопластической опсоклонус-атаксией, раком молочной железы и мелкоклеточным раком легкого. Альтернативно сплайсированные транскрипты, кодирующие различные изоформы . были описаны И у неандертальцев, и у денисовцев была одна версия, и почти у всех современных людей была другая, предполагающая положительный отбор. Вставка неандертальского варианта гена нейроонкологического вентрального антигена 1 (NOVA1) в кортикальные органоиды человека может способствовать замедлению развития и более высокой сложности поверхности в моделях мозга. но это может быть артефактом побочного эффекта CRISPR, поскольку это не могло быть воспроизведено в последующем исследовании.

Дальнейшее чтение

• Буканович Р.Дж., Познер Дж.Б., Дарнелл Р.Б. (1993). «Nova, паранеопластический антиген Ri, гомологичен РНК-связывающему белку и специфически экспрессируется в развивающейся двигательной системе». Нейрон . 11 (4): 657–72. дои : 10.1016/0896-6273(93)90077-5 . ПМИД   8398153 . S2CID   22554933 .
• Буканович Р.Дж., Дарнелл Р.Б. (1997). «Нейрональный РНК-связывающий белок Nova-1 распознает специфические РНК-мишени in vitro и in vivo» . Мол. Клетка. Биол . 17 (6): 3194–201. дои : 10.1128/MCB.17.6.3194 . ПМК   232172 . ПМИД   9154818 .
• Льюис Х.А., Чен Х., Эдо С. и др. (1999). «Кристаллические структуры РНК-связывающих доменов K-гомологии Nova-1 и Nova-2» . Структура . 7 (2): 191–203. дои : 10.1016/S0969-2126(99)80025-2 . ПМИД   10368286 .
• Дженсен К.Б., Дредж Б.К., Стефани Дж. и др. (2000). «Nova-1 регулирует специфичный для нейронов альтернативный сплайсинг и необходим для жизнеспособности нейронов» . Нейрон . 25 (2): 359–71. дои : 10.1016/S0896-6273(00)80900-9 . ПМИД   10719891 .
• Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верёвски-Алмейда С. и др. (2000). «Секвенирование транскриптома человека с помощью меток последовательности, экспрессируемых ORF» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (7): 3491–6. Бибкод : 2000PNAS...97.3491D . дои : 10.1073/pnas.97.7.3491 . ПМК   16267 . ПМИД   10737800 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Дредж Б.К., Дарнелл Р.Б. (2003). «Nova регулирует альтернативный сплайсинг гамма2 рецептора ГАМК (А) через дистальный нижестоящий энхансер сплайсинга, богатый UCAU» . Мол. Клетка. Биол . 23 (13): 4687–700. дои : 10.1128/MCB.23.13.4687-4700.2003 . ПМК   164843 . ПМИД   12808107 .
• Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С. и др. (2005). «Описание характеристик транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Нат. Биотехнология . 22 (6): 707–16. дои : 10.1038/nbt971 . ПМИД   15146197 . S2CID   27764390 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Уле Дж., Уле А., Спенсер Дж. и др. (2005). «Нова регулирует специфическое для мозга сращивание, формируя синапсы». Нат. Жене . 37 (8): 844–52. дои : 10.1038/ng1610 . ПМИД   16041372 . S2CID   8446567 .
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД   16713569 .