Диэтилпирокарбонат

Диэтилпирокарбонат
Имена
	Предпочтительное название ИЮПАК Диэтилдикарбонат
	Другие имена Диэтилпирокарбонат ; Диэтилоксидиформиат ; Этоксимуравьиный ангидрид ; Диэтиловый эфир пироугольной кислоты ; ДЭПК ;
Идентификаторы
Номер CAS	1609-47-8 ;
3D model ( JSmol )	Интерактивное изображение ;
КЭБ	ЧЕБИ:59051 ;
ХЭМБЛ	ХЕМБЛ55517 ;
ХимическийПаук	2943 ;
Информационная карта ECHA	100.015.039
Номер ЕС	216-542-8 ;
КЕГГ	C11592 ;
МеШ	Диэтилпирокарбонат
ПабХим CID	3051 ;
НЕКОТОРЫЙ	ЛМР3ЛЗГ146 ;
Панель управления CompTox ( EPA )	DTXSID2051764 ;
	показывать ИнЧИ
	показывать УЛЫБКИ
Характеристики
Химическая формула	С 6 Н 10 О 5
Молярная масса	162.141 g·mol −1
Появление	Прозрачная бесцветная жидкость
Плотность	1,101 г/мл при 25 °C ; 1,121 г/мл при 20 °C
Точка кипения	От 93 до 94 ° C (от 199 до 201 ° F; от 366 до 367 К) при 24 гПа
Опасности
	Безопасность и гигиена труда (OHS/OSH):
Основные опасности	Вредный
	СГС Маркировка :
Пиктограммы
Сигнальное слово	Предупреждение
Заявления об опасности	Х302 , Х315 , Х319 , Х332 , Х335
Меры предосторожности	P261 , P264 , P270 , P271 , P280 , P301+P312 , P302+P352 , P304+P312 , P304+P340 , P305+P351+P338 , P312 , P321 , P330 , P332+P313 , P337 +P313 , P362 , P403+ П233 , П405 , П501
точка возгорания	69 ° C (156 ° F; 342 К) в закрытом тигле
	Летальная доза или концентрация (LD, LC):
ЛД 50 ( средняя доза )	Перорально - крыса - 850 мг/кг.
Родственные соединения
Родственные соединения	Ди- трет -бутилдикарбонат ; Диметилдикарбонат
	Если не указано иное, данные приведены для материалов в стандартном состоянии (при 25 °C [77 °F], 100 кПа). проверить ( что такое ?) Ссылки на инфобоксы

Диэтилпирокарбонат ( DEPC ), также называемый диэтилдикарбонатом ( название IUPAC ), используется в лаборатории для инактивации РНКазы ферментов в воде и на лабораторной посуде. Это происходит за счет ковалентной модификации остатков гистидина (наиболее сильно), лизина , цистеина и тирозина . ^[1]^[2]

Вода, обработанная DEPC (и, следовательно, не содержащая РНКазы), используется при работе с РНК в лаборатории, чтобы снизить риск разрушения РНК РНКазами.

Воду обычно обрабатывают 0,1% об. ДЭПК в течение не менее 2 часов при температуре 37 °C, а затем автоклавируют (не менее 15 минут) для инактивации следов ДЭПК. Инактивация DEPC таким способом приводит к образованию CO ₂ и этанола . Более высокие концентрации DEPC способны деактивировать большее количество РНКазы, но оставшиеся следы или побочные продукты могут ингибировать дальнейшие биохимические реакции, такие как транскрипция in vitro. Кроме того, химическая модификация РНК, такая как карбоксиметилирование, возможна при наличии следов DEPC или его побочных продуктов, что приводит к нарушению восстановления интактной РНК даже после замены буфера (после осаждения).

ДЭПК нестабилен в воде и подвержен гидролизу до диоксида углерода и этанола, особенно в присутствии нуклеофила . По этой причине DEPC нельзя использовать с буферами Tris или HEPES . Напротив, его можно использовать с фосфатно-солевым буфером или MOPS . ^[3] Удобное правило заключается в том, что ферменты или химические вещества, которые имеют активные -O:, -N: или -S:, не могут быть обработаны DEPC, чтобы стать свободными от РНКазы, поскольку DEPC вступает в реакцию с этими видами. Кроме того, продукты деградации DEPC могут ингибировать транскрипцию in vitro.

DEPC- дериватизация гистидинов также используется для изучения важности гистидиловых остатков в ферментах. Модификация гистидина с помощью DEPC приводит к образованию карбэтоксилированных производных по азоту N-омега-2 имидазольного кольца . Модификацию гистидинов DEPC можно обратить вспять обработкой 0,5 М гидроксиламина при нейтральном pH.

DEPC также можно использовать для исследования структуры двухцепочечной ДНК. ^{[ нужна ссылка ]}

См. также

Декабрь

Ссылки

^ Чиргвин, Джон М; и др. (1979). «Выделение биологически активной рибонуклеиновой кислоты из источников, обогащенных рибонуклеазой». Биохимия . 18 (24): 5294–5299. дои : 10.1021/bi00591a005 . ПМИД 518835 .
^ Вольф, Барри; Лесно, Джудит А.; Райхманн, Манфред Э. (1970). «Механизм необратимой инактивации бычьей панкреатической рибонуклеазы диэтилпирокарбонатом. Общая реакция диэтилпирокарбоната с белками» . Европейский журнал биохимии . 13 (3): 519–25. дои : 10.1111/j.1432-1033.1970.tb00955.x . ПМИД 5444158 .
^ «Часто задаваемые вопросы о ДЭПК» . Сигма-Олдрич . Проверено 12 августа 2012 г.

Внешние ссылки

[1] Чиргвин, Джон М; и др. (1979). «Выделение биологически активной рибонуклеиновой кислоты из источников, обогащенных рибонуклеазой». Биохимия . 18 (24): 5294–5299. дои : 10.1021/bi00591a005 . ПМИД 518835 .

[2] Вольф, Барри; Лесно, Джудит А.; Райхманн, Манфред Э. (1970). «Механизм необратимой инактивации бычьей панкреатической рибонуклеазы диэтилпирокарбонатом. Общая реакция диэтилпирокарбоната с белками» . Европейский журнал биохимии . 13 (3): 519–25. дои : 10.1111/j.1432-1033.1970.tb00955.x . ПМИД 5444158 .

[sigma-3] «Часто задаваемые вопросы о ДЭПК» . Сигма-Олдрич . Проверено 12 августа 2012 г.

[1]

[2]

[3]