Хромодомен
| Хромодомен | |||
|---|---|---|---|
 Структура полисотового хромодомена. [ 1 ] | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Хромодомен | ||
| Пфам | PF00385 | ||
| ИнтерПро | ИПР000953 | ||
| УМНЫЙ | SM00298 | ||
| PROSITE | PS50013 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1pfb / SCOPe / СУПФАМ | ||
| CDD | cd00024 | ||
| |||
Хромодомен ( хроматина ) организации модификатор [ 2 ] ) представляет собой белка структурный домен , состоящий примерно из 40–50 аминокислотных остатков, обычно встречающийся в белках, связанных с ремоделированием хроматина и манипуляциями с ним . Домен высококонсервативен как среди растений, так и среди животных и представлен в большом количестве различных белков во многих геномах , например, в геноме мыши . , содержащие хромодомен, Некоторые гены имеют несколько альтернативных изоформ сплайсинга, в которых хромодомен полностью отсутствует. [ 3 ] У млекопитающих белки, содержащие хромодомены, ответственны за аспекты регуляции генов, связанные с ремоделированием хроматина и образованием областей гетерохроматина . [ 4 ] Белки, содержащие хромодомен, также связывают метилированные гистоны. [ 5 ] [ 6 ] и появляются в РНК-индуцированном комплексе подавления транскрипции . [ 7 ] В модификациях гистонов хромодомены очень консервативны. Они функционируют путем идентификации и связывания метилированных остатков лизина , которые существуют на поверхности белков хроматина, и тем самым регулируют транскрипцию генов. [ 8 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Мин Дж, Чжан Ю, Сюй РМ (август 2003 г.). «Структурная основа специфического связывания хромодомена Polycomb с гистоном H3, метилированным по Lys 27» . Генс Дев . 17 (15): 1823–8. дои : 10.1101/gad.269603 . ЧВК 196225 . ПМИД 12897052 .
- ^ Мессмер С., Франке А., Паро Р. (июль 1992 г.). «Анализ функциональной роли хромодомена Polycomb у Drosophila melanogaster» . Генс Дев . 6 (7): 1241–1254. дои : 10.1101/gad.6.7.1241 . ПМИД 1628830 .
- ^ Таджул-Арифин К., Тисдейл Р., Раваси Т., Хьюм Д.А., Мэттик Дж.С. (2003). «Идентификация и анализ белков, содержащих хромодомены, закодированных в транскриптоме мыши» . Геном Рез . 13 (6Б): 1416–1429. дои : 10.1101/гр.1015703 . ПМК 403676 . ПМИД 12819141 .
- ^ Джонс Д.О., Коуэлл И.Г., Сингх П.Б. (2000). «Хромодоменные белки млекопитающих: их роль в организации и экспрессии генома». Биоэссе . 22 (2): 124–37. CiteSeerX 10.1.1.575.6410 . doi : 10.1002/(SICI)1521-1878(200002)22:2<124::AID-BIES4>3.0.CO;2-E . ПМИД 10655032 .
- ^ Нильсен П.Р., Нитлиспах Д., Мотт Х.Р., Каллаган Дж., Баннистер А., Кузаридес Т., Мурзин А.Г., Мурзина Н.В., Лауэ Э.Д. (2002). «Структура хромодомена HP1, связанного с гистоном H3, метилированным по лизину 9». Природа . 416 (6876): 103–7. Бибкод : 2002Natur.416..103N . дои : 10.1038/nature722 . ПМИД 11882902 . S2CID 4423019 .
- ^ Джейкобс С.А., Хорасанизаде С. (2002). «Структура хромодомена HP1, связанного с лизин-9-метилированным хвостом гистона H3». Наука . 295 (5562): 2080–3. Бибкод : 2002Sci...295.2080J . дои : 10.1126/science.1069473 . ПМИД 11859155 . S2CID 38589662 .
- ^ Вердель А., Цзя С., Гербер С., Сугияма Т., Гиги С., Гревал С.И., Моазед Д. (2004). «РНКи-опосредованное нацеливание на гетерохроматин комплексом RITS» . Наука . 303 (5658): 672–6. Бибкод : 2004Sci...303..672V . дои : 10.1126/science.1093686 . ПМЦ 3244756 . ПМИД 14704433 .
- ^ Яп К.Л., Чжоу М.М. (март 2011 г.). «Структура и механизмы распознавания метилирования лизина хромодоменом при транскрипции генов» . Биохимия . 50 (12): 1966–80. дои : 10.1021/bi101885m . ПМК 3062707 . ПМИД 21288002 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |