Циклин H.

CCNH
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	1JKW, 1KXU
Идентификаторы
Псевдонимы	CCNH , CAK, CYCH, P34, P37, Cyclin H
Внешние идентификаторы	Омим : 601953 ; MGI : 1913921 ; Гомологен : 946 ; GeneCards : CCNH ; OMA : CCNH - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	87,412,930 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 13 (mouse)
End	85,371,588 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	Achilles tendon; ; left testis; ; right testis; ; ventricular zone; ; epithelium of colon; ; ganglionic eminence; ; anterior pituitary; ; right lung; ; sperm; ; C1 segment;
	Top expressed in
	interventricular septum; ; fossa; ; condyle; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; vas deferens; ; primitive streak; ; facial motor nucleus; ; otic placode; ; efferent ductule; ; Paneth cell;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	ATP-dependent activity, acting on DNA; kinase activity; cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity; protein binding; RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity;
Cellular component	nucleoplasm; transcription factor TFIIH holo complex; transcription factor TFIIK complex; nucleus; cyclin-dependent protein kinase activating kinase holoenzyme complex; cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex;
Biological process	termination of RNA polymerase I transcription; regulation of transcription, DNA-templated; phosphorylation; transcription initiation from RNA polymerase I promoter; transcription elongation from RNA polymerase II promoter; 7-methylguanosine mRNA capping; transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; positive regulation of phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain; positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity; cell cycle; transcription-coupled nucleotide-excision repair; transcription initiation from RNA polymerase II promoter; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; protein phosphorylation; nucleotide-excision repair, preincision complex assembly; protein stabilization; regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity; regulation of transcription by RNA polymerase II; G1/S transition of mitotic cell cycle; G2/M transition of mitotic cell cycle; transcription elongation from RNA polymerase I promoter;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	902
	66671
	ENSG00000134480
	Ensmusg00000021548
	P51946
	Q61458
	NM_001199189 ; NM_001239 ; NM_001363539 ; NM_001364075 ; NM_001364076
	NM_023243 ; NM_001347587 ; NM_001347588
	NP_001186118 ; NP_001230 ; NP_001350468 ; NP_001351004 ; NP_001351005
	NP_001334516 ; NP_001334517 ; NP_075732
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Cyclin-H -это белок , который у людей кодируется CCNH геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит высококонсервативному семейству циклина , чьи члены характеризуются драматической периодичностью в численности белка в клеточном цикле. Циклины функционируют как регуляторы CDK -киназ. Различные циклины демонстрируют различные паттерны экспрессии и деградации, которые способствуют временной координации каждого митотического события. Этот циклин образует комплекс с киназой CDK7 и белком безымянного пальца MAT1. Комплекс киназы способен фосфорилировать киназы CDK2 и CDC2, таким образом, функционирует как CDK-активирующая киназа (CAK). Этот циклин и его партнер киназы являются компонентами TFIIH, а также белковые комплексы РНК -полимеразы II. Они участвуют в двух разных процессах регуляции транскрипции, что предполагает важную связь между базальным контролем транскрипции и механизмом клеточного цикла. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Циклин H было показано, что взаимодействует с p53 , ^{[ 7 ]} Циклин-зависимая киназа 7 ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} и mnat1 . ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000134480 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000021548 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Eki T, Okumura K, Abe M, Kagotani K, Taguchi H, Murakami Y, Pan ZQ, Hanaoka F (январь 1998). «Картирование генов человека, кодирующих циклин H (CCNH) и коэффициент сборки киназы, активирующего CDK (CAK) MAT1 (MNAT1), на полосы хромосом 5Q13.3-Q14 и 14Q23 соответственно». Геномика . 47 (1): 115–20. doi : 10.1006/geno.1997.5053 . PMID 9465303 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Энтрез ген: CCNH Cyclin H» .
^ Schneider E, Mentenarh M, Wagner P (ноябрь 1998 г.). «Регуляция активности Cak -киназы с помощью p53». Онкоген . 17 (21): 2733–41. doi : 10.1038/sj.onc.1202504 . PMID 9840937 . S2CID 6281777 .
^ Mäkelä TP, Tassan JP, Nigge EA, Frutiger S, Hughes GJ, Weinberg RA (сентябрь 1994). «Циклин, связанный с CDK-активирующим киназой MO15». Природа . 371 (6494): 254–7. Bibcode : 1994natur.371..254m . doi : 10.1038/371254A0 . PMID 8078587 . S2CID 4369898 .
^ Yee A, Nichols MA, Wu L, Hall FL, Kobayashi R, Xiong Y (декабрь 1995 г.). «Молекулярное клонирование CDK7-ассоциированного MAT1 человека, циклин-зависимого киназы, активирующего киназу (CAK) фактор сборки». РАНКА . 55 (24): 6058–62. PMID 8521393 .
^ Garber Me, Mayall TP, Suess EM, Meisenhelder J, Thompson NE, Jones Ka (сентябрь 2000). «Аутофосфорилирование CDK9 регулирует высокоаффинное связывание вируса иммунодефицита человека типа 1 TAT-P-TEFB с TAR РНК» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (18): 6958–69. doi : 10.1128/mcb.20.18.6958-6969.2000 . PMC 88771 . PMID 10958691 .
^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х, Тейлор П., Клили С., МакБрум-Сираджевский Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарзее М., Хо Й., Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Ducewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка белка человека с помощью масс-спектрометрии» . Биология молекулярных систем . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
^ Talukder AH, Mishra SK, Mandal M, Balasenthil S, Mehta S, Sahin AA, Barnes CJ, Kumar R (март 2003 г.). «MTA1 взаимодействует с MAT1, циклин-зависимым киназой, активирующим киназную киназную коэффициент негритянного пальца и регулирует функции трансактивации рецептора эстрогена» . Журнал биологической химии . 278 (13): 11676–85. doi : 10.1074/jbc.m209570200 . PMID 12527756 .

Дальнейшее чтение

Жанг К.Т. (1998). «TAT, TAT-ассоциированная киназа и транскрипция». Журнал биомедицинской науки . 5 (1): 24–7. doi : 10.1007/bf02253352 . PMID 9570510 .
Янкулов К, Бентли Д. (Jun 1998). «Транскрипционное управление: кофакторы TAT и удлинение транскрипции» . Текущая биология . 8 (13): R447–9. Bibcode : 1998cbio .... 8.r447y . doi : 10.1016/s0960-9822 (98) 70289-1 . PMID 9651670 . S2CID 15480646 .
Shiekhattar R, Mermelstein F, Fisher RP, Drapkin R, Dynlacht B, Wessling HC, Morgan Do, Reinberg D (март 1995). «CDK-активирующий киназный комплекс является компонентом транскрипционного фактора человека TFIIH». Природа . 374 (6519): 283–7. Bibcode : 1995natur.374..283s . doi : 10.1038/374283A0 . PMID 7533895 . S2CID 4282418 .
Darbon JM, Devault A, Taviaux S, Fesquet D, Martinez AM, Galas S, Cavadore JC, Dorée M, Blanchard JM (ноябрь 1994). «Клонирование, экспрессия и субклеточная локализация человеческого гомолога P40MO15 каталитической субъединицы киназы, активирующей CDK». Онкоген . 9 (11): 3127–38. PMID 7936635 .
Feaver WJ, Svejstrup JQ, Henry NL, Kornberg Rd (декабрь 1994 г.). «Связь, активирующей CDK киназы и РНК-полимеразу II CTD-киназа TFIIH/TFIIK». Клетка . 79 (6): 1103–9. doi : 10.1016/0092-8674 (94) 90040-x . PMID 8001136 . S2CID 205021029 .
Фишер Р.П., Морган До (август 1994 г.). «Новый циклин ассоциируется с MO15/CDK7, чтобы сформировать CDK-активирующую киназу». Клетка . 78 (4): 713–24. doi : 10.1016/0092-8674 (94) 90535-5 . PMID 8069918 . S2CID 2996948 .
Mäkelä TP, Tassan JP, Nigge EA, Frutiger S, Hughes GJ, Weinberg RA (сентябрь 1994). «Циклин, связанный с CDK-активирующим киназой MO15». Природа . 371 (6494): 254–7. Bibcode : 1994natur.371..254m . doi : 10.1038/371254A0 . PMID 8078587 . S2CID 4369898 .
Perez JL, Shen X, Finkernagel S, Sciorra L, Jenkins NA, Gilbert DJ, Copeland NG, Wong TW (январь 1994). «Идентификация и хромосомное картирование рецепторной тирозинкиназы с предполагаемой последовательности связывания фосфолипидов в его эктодомене». Онкоген . 9 (1): 211–9. PMID 8302582 .
Tassan JP, Jaquenoud M, Fry AM, Frutiger S, Hughes GJ, Nigge EA (ноябрь 1995 г.). «In vitro сборка функционального комплекса CDK7-циклина H CDK7 требует MAT1, нового белка на 36 кДа» . Embo Journal . 14 (22): 5608–17. doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb00248.x . PMC 394676 . PMID 8521818 .
Adamczewski JP, Rossignol M, Tassan JP, Nigg Ea, Moncollin V, Egly JM (апрель 1996 г.). «MAT1, CDK7 и Cyclin H образуют киназный комплекс, который чувствителен к ультрафиолетовому свету при ассоциации с TFIIH» . Embo Journal . 15 (8): 1877–84. doi : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00538.x . PMC 450106 . PMID 8617234 .
Blau J, Xiao H, McCracken S, O'Hare P, Greenblatt J, Bentley D (май 1996 г.). «Три функциональных класса домена активации транскрипции» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (5): 2044–55. doi : 10.1128/mcb.16.5.2044 . PMC 231191 . PMID 8628270 .
Reardon JT, GE H, Gibbs E, Sancar A, Hurwitz J, Pan ZQ (Jun 1996). «Выделение и характеристика двух транскрипционных факторов человека IIH (TFIIH), связанных с комплексами: ERCC2/CAK и TFIIH» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (13): 6482–7. Bibcode : 1996pnas ... 93.6482R . doi : 10.1073/pnas.93.13.6482 . PMC 39049 . PMID 8692841 .
Drapkin R, Le Roy G, Cho H, Akoulitchev S, Reinberg D (Jun 1996). «Человеческая циклин-зависимая киназа киназа существует в трех различных комплексах» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (13): 6488–93. Bibcode : 1996pnas ... 93.6488d . doi : 10.1073/pnas.93.13.6488 . PMC 39050 . PMID 8692842 .
Ким К.К., Чемберлин Х.М., Морган До, Ким Ш.Х. (октябрь 1996). «Трехмерная структура человеческого циклина H, положительного регулятора CDK-активирующей киназы». Природа структурная биология . 3 (10): 849–55. doi : 10.1038/nsb1096-849 . PMID 8836101 . S2CID 8880795 .
Чжоу Q, Sharp PA (октябрь 1996 г.). «TAT-SF1: кофактор для стимуляции удлинения транскрипции с помощью ВИЧ-1 ТАТ». Наука . 274 (5287): 605–10. Bibcode : 1996sci ... 274..605Z . doi : 10.1126/science.274.5287.605 . PMID 8849451 . S2CID 13266489 .
Parada CA, Roeder RG (ноябрь 1996 г.). «Улучшенная процессивность РНК-полимеразы II, вызванной TAT-индуцированным фосфорилированием его карбокси-концевого домена». Природа . 384 (6607): 375–8. Bibcode : 1996natur.384..375p . doi : 10.1038/384375A0 . PMID 8934526 . S2CID 4278432 .
García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (март 1997 г.). «Ассоциация ТАТ с очищенными комплексами транскрипции ВИЧ-1 и ВИЧ-2 транскрипции» . Журнал биологической химии . 272 (11): 6951–8. doi : 10.1074/jbc.272.11.6951 . PMID 9054383 .
Потерсман А., Андерсен Г., Бусо Д., Россиньол М., Эгли Дж. М., Тьерри Дж.С. (март 1997 г.). «Экспрессия в Escherichia coli: очистка и характеристика циклина H, субъединица общей транскрипции человека/фактора репарации ДНК Tfiih». Экспрессия и очистка белка . 9 (2): 153–8. doi : 10.1006/prep.1996.0693 . PMID 9056480 .
Marinoni JC, Roy R, Vermeulen W, Miniou P, Lutz Y, Weeda G, Seroz T, Gomez DM, Hoeijmakers JH, Egly JM (Mar 1997). «Клонирование и характеристика p52, пятой субъединицы ядра транскрипции/ДНК репарации Tfiih» . Embo Journal . 16 (5): 1093–102. doi : 10.1093/emboj/16.5.1093 . PMC 1169708 . PMID 9118947 .
Андерсен Г., Буссо Д., Потерсман А., Хванг Дж.Р., Вюрц Дж.М., Рипп Р., Тьерри Дж.С., Эгли Дж. М., Морас Д. (март 1997 г.). «Структура циклина H: общий режим активации киназы и специфических особенностей» . Embo Journal . 16 (5): 958–67. doi : 10.1093/emboj/16.5.958 . PMC 1169696 . PMID 9118957 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000134480 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000021548 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9465303-5] Eki T, Okumura K, Abe M, Kagotani K, Taguchi H, Murakami Y, Pan ZQ, Hanaoka F (январь 1998). «Картирование генов человека, кодирующих циклин H (CCNH) и коэффициент сборки киназы, активирующего CDK (CAK) MAT1 (MNAT1), на полосы хромосом 5Q13.3-Q14 и 14Q23 соответственно». Геномика . 47 (1): 115–20. doi : 10.1006/geno.1997.5053 . PMID 9465303 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} «Энтрез ген: CCNH Cyclin H» .

[pmid9840937-7] Schneider E, Mentenarh M, Wagner P (ноябрь 1998 г.). «Регуляция активности Cak -киназы с помощью p53». Онкоген . 17 (21): 2733–41. doi : 10.1038/sj.onc.1202504 . PMID 9840937 . S2CID 6281777 .

[pmid8078587-8] Mäkelä TP, Tassan JP, Nigge EA, Frutiger S, Hughes GJ, Weinberg RA (сентябрь 1994). «Циклин, связанный с CDK-активирующим киназой MO15». Природа . 371 (6494): 254–7. Bibcode : 1994natur.371..254m . doi : 10.1038/371254A0 . PMID 8078587 . S2CID 4369898 .

[pmid8521393-9] Yee A, Nichols MA, Wu L, Hall FL, Kobayashi R, Xiong Y (декабрь 1995 г.). «Молекулярное клонирование CDK7-ассоциированного MAT1 человека, циклин-зависимого киназы, активирующего киназу (CAK) фактор сборки». РАНКА . 55 (24): 6058–62. PMID 8521393 .

[pmid10958691-10] Garber Me, Mayall TP, Suess EM, Meisenhelder J, Thompson NE, Jones Ka (сентябрь 2000). «Аутофосфорилирование CDK9 регулирует высокоаффинное связывание вируса иммунодефицита человека типа 1 TAT-P-TEFB с TAR РНК» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (18): 6958–69. doi : 10.1128/mcb.20.18.6958-6969.2000 . PMC 88771 . PMID 10958691 .

[pmid17353931-11] Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х, Тейлор П., Клили С., МакБрум-Сираджевский Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарзее М., Хо Й., Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Ducewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка белка человека с помощью масс-спектрометрии» . Биология молекулярных систем . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .

[pmid12527756-12] Talukder AH, Mishra SK, Mandal M, Balasenthil S, Mehta S, Sahin AA, Barnes CJ, Kumar R (март 2003 г.). «MTA1 взаимодействует с MAT1, циклин-зависимым киназой, активирующим киназную киназную коэффициент негритянного пальца и регулирует функции трансактивации рецептора эстрогена» . Журнал биологической химии . 278 (13): 11676–85. doi : 10.1074/jbc.m209570200 . PMID 12527756 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]