УХРФ1

УХРФ1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 2FAZ, 2L3R, 2LGG, 2LGK, 2LGL, 2PB7, 3ASK, 3ASL, 3BI7, 3CLZ, 3DB3, 3DB4, 3DWH, 3FL2, 3SHB, 3SOU, 3SOW, 3SOX, 3T6R, 3ZVY, 3ZVZ, 4GY5, 4QQD, 5C6D, 5IAY
Идентификаторы
Псевдонимы	UHRF1 , ICBP90, Np95, RNF106, hNP95, hhuNp95, TDRD22, убиквитиноподобный домен с PHD и безымянным пальцем 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 607990 ; МГИ : 1338889 ; Гомологен : 7866 ; GeneCards : UHRF1 ; OMA : UHRF1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 19 (human) Band 19p13.3 Start 4,903,080 bp End 4,962,154 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 17 (mouse) Band 17|17 D Start 56,610,321 bp End 56,630,486 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in oocyte secondary oocyte thymus ventricular zone ganglionic eminence buccal mucosa cell trabecular bone mucosa of ileum bone marrow stromal cell of endometrium Top expressed in secondary oocyte primary oocyte maxillary prominence tail of embryo zygote mandibular prominence abdominal wall dermis epiblast medullary collecting duct More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function DNA binding ubiquitin protein ligase activity hemi-methylated DNA-binding DNA-binding transcription factor activity methyl-CpG binding cis-regulatory region sequence-specific DNA binding metal ion binding ubiquitin-protein transferase activity methylated histone binding protein binding identical protein binding transferase activity zinc ion binding histone binding Cellular component euchromatin nuclear matrix replication fork heterochromatin nucleus Biological process histone monoubiquitination positive regulation of protein metabolic process regulation of transcription, DNA-templated maintenance of DNA methylation positive regulation of DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) activity negative regulation of transcription by RNA polymerase II transcription, DNA-templated regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly cellular response to DNA damage stimulus protein ubiquitination cell cycle cell population proliferation histone ubiquitination DNA repair positive regulation of transcription by RNA polymerase II protein autoubiquitination chromatin organization ubiquitin-dependent protein catabolic process regulation of epithelial cell proliferation Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 29128 18140 Вместе ENSG00000276043 ENSMUSG00000001228 ЮниПрот Q96T88 Q8VDF2 RefSeq (мРНК) НМ_001048201 НМ_001290050 НМ_001290051 НМ_001290052 НМ_013282 НМ_001111078 НМ_001111079 НМ_001111080 НМ_010931 RefSeq (белок) НП_001041666 НП_001276979 НП_001276980 НП_001276981 НП_037414 НП_001104548 НП_001104549 НП_001104550 НП_035061 Местоположение (UCSC) Чр 19: 4,9 – 4,96 Мб Чр 17: 56,61 – 56,63 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Убиквитин-подобный, содержащий домены PHD и RING-пальца 1 , также известный как UHRF1 , представляет собой белок , который у человека кодируется UHRF1 геном .

Функция

Этот ген кодирует члена подсемейства RING-finger типа убиквитинлигаз Е3 . Белок связывается с полуметилированной ДНК во время S-фазы и рекрутирует основной белок ДНК-метилтрансферазы, DNMT1 , для регуляции структуры хроматина и экспрессии генов. Пик его экспрессии приходится на позднюю фазу G1 и продолжается во время фаз G2 и M клеточного цикла . Он играет важную роль в переходе G1/S и участвует в контрольной точке p53 -зависимого повреждения ДНК. Для этого гена обнаружено множество вариантов транскрипта, кодирующих разные изоформы. Первоначально он был идентифицирован как прямой регулятор топоизомеразы 2а, но впоследствии это было опровергнуто. Uhrf1 был тщательно изучен in vivo с использованием рыбок данио.

Клиническое значение

UHRF1 недавно был идентифицирован как новый онкоген гепатоцеллюлярной карциномы, первичного типа рака печени.

Дальнейшее чтение

• Ку Д.Х., Чанг С.Д., Конецкий Дж., Канниццаро ​​Л.А., Богосян-Селл Л., Алдер Х., Басерга Р. (апрель 1991 г.). «Новая комплементарная ДНК, регулируемая ростом, с последовательностью предполагаемого транс-активирующего фактора». Рост и дифференцировка клеток . 2 (4): 179–86. ПМИД   1868030 .
• Хиллер Л.Д., Леннон Дж., Беккер М., Бональдо М.Ф., Кьяпелли Б., Чиссо С., Дитрих Н., Дюбук Т., Фавелло А., Гиш В., Хокинс М., Хультман М., Кукаба Т., Лейси М., Ле М., Ле Н., Мардис Э. , Мур Б, Моррис М, Парсонс Дж, Прейндж С, Рифкин Л, Ролфинг Т, Шелленберг К, Бенто Соареш М, Тан Ф, Тьерри-Мэг Дж, Треваскис Э, Андервуд К, Уолдман П, Уотерстон Р, Уилсон Р, Марра М (сентябрь 1996 г.). «Создание и анализ 280 000 меток экспрессируемых последовательностей человека» . Геномные исследования . 6 (9): 807–28. дои : 10.1101/гр.6.9.807 . ПМИД   8889549 .
• Хопфнер Р., Мусли М., Йелч Дж.М., Вулгарис А., Лутц Ю., Марин С., Беллок Дж.П., Удет П., Броннер С. (январь 2000 г.). «ICBP90, новый человеческий CCAAT-связывающий белок, участвующий в регуляции экспрессии топоизомеразы IIальфа». Исследования рака . 60 (1): 121–8. ПМИД   10646863 .
• Хопфнер Р., Мусли М., Гарнье Ж.М., Редон Р., дю Мануар С., Чаттон Б., Гизелинк Н., Уде П., Броннер С. (март 2001 г.). «Геномная структура и хромосомное картирование гена, кодирующего ICBP90, белок, участвующий в регуляции экспрессии гена топоизомеразы IIальфа». Джин . 266 (1–2): 15–23. дои : 10.1016/S0378-1119(01)00371-7 . ПМИД   11290415 .
• Мусли М., Хопфнер Р., Аббади А.К., Монте Д., Жанблан М., Уде П., Луи Б., Броннер С. (июль 2003 г.). «ICBP90 принадлежит к новому семейству белков, экспрессия которых в раковых клетках не регулируется» . Британский журнал рака . 89 (1): 120–7. дои : 10.1038/sj.bjc.6601068 . ПМК   2394215 . ПМИД   12838312 .
• Читтерио Э., Папайт Р., Никассио Ф., Векки М., Гомеро П., Мантовани Р., Ди Фиоре П.П., Бонапейс И.М. (март 2004 г.). «Np95 представляет собой гистон-связывающий белок, наделенный активностью убиквитинлигазы» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (6): 2526–35. дои : 10.1128/MCB.24.6.2526-2535.2004 . ПМЦ   355858 . ПМИД   14993289 .
• Арима Ю, Хирота Т, Броннер С, Мусли М, Фудзивара Т, Нива С, Исикава Х, Сая Х (февраль 2004 г.). «Понижающая регуляция ядерного белка ICBP90 с помощью p53/p21Cip1/WAF1-зависимых сигналов контрольной точки повреждения ДНК способствует остановке клеточного цикла при переходе G1/S» . Гены в клетки . 9 (2): 131–42. дои : 10.1111/j.1356-9597.2004.00710.x . ПМИД   15009091 . S2CID   23980129 .
• Аббади А.К., Броннер С., Троцир М.А., Хопфнер Р., Батами К., Мюллер К.Д., Жанблан М., Мусли М. (декабрь 2003 г.). «Экспрессия ICBP90 снижается в клетках Jurkat, индуцированных апоптозом». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 1010 (1): 300–3. Бибкод : 2003NYASA1010..300A . дои : 10.1196/анналы.1299.052 . ПМИД   15033738 . S2CID   32581931 .
• Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С., Лей С., Мурадж Дж., Фиск Г.Дж., Ли Ю, Сюй С., Фанг Р., Гуглер К., Рао М.С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л.В. (июнь 2004 г.). «Описание характеристик транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Природная биотехнология . 22 (6): 707–16. дои : 10.1038/nbt971 . ПМИД   15146197 . S2CID   27764390 .
• Тротсье М.А., Броннер С., Батами К., Матье Э., Аббади А.К., Жанблан М., Мюллер К.Д., Рошетт-Эгли С., Мусли М. (июнь 2004 г.). «Фосфорилирование ICBP90 протеинкиназой А усиливает экспрессию топоизомеразы IIальфа». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 319 (2): 590–5. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.05.028 . ПМИД   15178447 .
• Уноки М., Нишидате Т., Накамура Ю. (октябрь 2004 г.). «ICBP90, мишень E2F-1, рекрутирует HDAC1 и связывается с метил-CpG через свой домен SRA». Онкоген . 23 (46): 7601–10. дои : 10.1038/sj.onc.1208053 . ПМИД   15361834 . S2CID   21948278 .
• Аббади А.К., Броннер С., Батами К., Мюллер К.Д., Жанблан М., Матье Э., Кляйн Дж.П., Кандольфи Э., Мусли М. (август 2005 г.). «Путь TCR включает подавление гена ICBP90 через сайты связывания E2F». Биохимическая фармакология . 70 (4): 570–9. дои : 10.1016/j.bcp.2005.05.012 . ПМИД   15964557 .
• Жанблан М., Мусли М., Хопфнер Р., Батами К., Мартине Н., Аббади А.К., Зифферт Дж.К., Матье Э., Мюллер К.Д., Броннер С. (ноябрь 2005 г.). «Ген ретинобластомы и его продукт подвергаются воздействию ICBP90: ключевой механизм перехода G1/S во время клеточного цикла» . Онкоген . 24 (49): 7337–45. дои : 10.1038/sj.onc.1208878 . ПМИД   16007129 .
• Дженкинс Ю , Марковцов В , Ланг В , Шарма П , Пирсолл Д , Уорнер Дж , Фрэнси С , Хуанг Б , Хуанг Дж , Ям Г.К. , Вистан Дж.П. , Пали Э , Виалард Дж , Джаникот М , Лоуренс Дж.Б. , Паян Д.Г. , Хитоши Ю. (декабрь 2005 г.). «Критическая роль убиквитинлигазной активности UHRF1, ядерного белка RING-пальца, в росте опухолевых клеток» . Молекулярная биология клетки . 16 (12): 5621–9. doi : 10.1091/mbc.E05-03-0194 . ПМЦ   1289407 . ПМИД   16195352 .
• Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Ю, Ота Т, Нисикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секинэ М, Цуритани К, Вакагури Х, Исии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ириэ Р, Кушида Н, Ёнеяма Т , Оцука Р, Канда К, Ёкой Т, Кондо Х, Вагацума М, Муракава К, Исида С, Исибаши Т, Такахаси-Фудзи А, Танасе Т, Нагай К, Кикучи Х, Накаи К, Исогай Т, Сугано С (январь 2006 г.) : Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» 16 / . ( 55–65 doi « 10.1101 . PMC   1356129 . .   gr.4039406 1) :
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (октябрь 2006 г.). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Природная биотехнология . 24 (10): 1285–92. дои : 10.1038/nbt1240 . ПМИД   16964243 . S2CID   14294292 .
• Муто М., Фухимори А., Неной М., Дайно К., Мацуда Ю., Куроива А., Кубо Э., Канари Ю., Уцуно М., Цудзи Х., Укаи Х., Мита К., Такахаги М., Тацуми К. (ноябрь 2006 г.). «Выделение и характеристика нового гена радиочувствительности человека, NP95». Радиационные исследования . 166 (5): 723–33. Бибкод : 2006РадР..166..723М . дои : 10.1667/RR0459.1 . ПМИД   17067204 . S2CID   85418126 .