WDR57

СНРНП40
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3JCR
Идентификаторы
Псевдонимы	SNRNP40 , 40K, HPRP8BP, PRP8BP, PRPF8BP, SPF38, WDR57, субъединица 40 малого ядерного рибонуклеопротеина U5.
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 607797 ; МГИ : 1913835 ; Гомологен : 3538 ; Генные карты : SNRNP40 ; OMA : SNRNP40 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	31,296,788 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	130,283,819 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ganglionic eminence; ; ventricular zone; ; mucosa of transverse colon; ; cerebellar hemisphere; ; C1 segment; ; anterior pituitary; ; right hemisphere of cerebellum; ; ectocervix; ; right ovary; ; tibial nerve;
	Top expressed in
	epiblast; ; ventricular zone; ; genital tubercle; ; tail of embryo; ; ganglionic eminence; ; embryo; ; embryo; ; neural tube; ; mesencephalon; ; bone marrow;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; RNA binding;
Cellular component	sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex; U5 snRNP; catalytic step 2 spliceosome; spliceosomal complex; precatalytic spliceosome; nucleus; nucleoplasm; cytosol; nuclear speck; U2-type catalytic step 2 spliceosome;
Biological process	RNA splicing, via transesterification reactions; mRNA splicing, via spliceosome; mRNA processing; RNA processing; RNA splicing;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9410
	66585
	ENSG00000060688
	ENSMUSG00000074088
	Q96DI7
	Q6PE01
	НМ_004814
	НМ_025645
	НП_004805
	НП_079921
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Домен 57 повтора WD (специфичный для U5 snRNP) , также известный как WDR57 , представляет собой ген , обнаруженный во многих организмах, включая, помимо прочего, Homo sapiens , Gallus Gallus , Pan troglodytes , Canus familiris , Bos taurus , Mus musculus и Rattus norvegicus. . ^{[ 5 ]}

Функция

Этот ген кодирует компонент частицы малого ядерного рибонуклеопротеина U5 (мяРНП). мяРНП U5 является частью сплайсосомы, мультибелкового комплекса, который катализирует удаление интронов из премессенджерных РНК. ^{[ 5 ]}

Взаимодействия

Было показано, что WDR57 взаимодействует с PRPF8. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} и ЕФТУД2 . ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000060688 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000074088 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: домен 57 повтора WDR57 WD (специфичный для U5 snRNP)» .
^ Jump up to: ^а ^б Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О., Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дювел. Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .
^ Jump up to: ^а ^б Аксель Т., Аренс К., Брамс Х., Тейгелькамп С., Люрманн Р. (ноябрь 1998 г.). «Человеческий белок U5-220kD (hPrp8) образует стабильный не содержащий РНК комплекс с несколькими U5-специфичными белками, включая РНК-унвиндазу, гомолог фактора элонгации рибосом EF-2 и новый белок WD-40» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (11): 6756–66. дои : 10.1128/mcb.18.11.6756 . ПМК 109259 . ПМИД 9774689 .

Дальнейшее чтение

Тернер И.А., Норман К.М., Черчер М.Дж., Ньюман А.Дж. (декабрь 2004 г.). «Роль мяРНП U5 в динамике и катализе сплайсосом». Труды Биохимического общества . 32 (Часть 6): 928–31. дои : 10.1042/BST0320928 . ПМИД 15506927 .
Нойбауэр Г., Кинг А., Раппсилбер Дж., Кальвио С., Уотсон М., Аджух П., Слиман Дж., Ламонд А., Манн М. (сентябрь 1998 г.). «Масс-спектрометрия и поиск в базе данных EST позволяют охарактеризовать мультибелковый сплайсосомный комплекс». Природная генетика . 20 (1): 46–50. дои : 10.1038/1700 . ПМИД 9731529 . S2CID 585778 .
Аксель Т., Аренс К., Брамс Х., Тейгелькамп С., Люрманн Р. (ноябрь 1998 г.). «Человеческий белок U5-220kD (hPrp8) образует стабильный не содержащий РНК комплекс с несколькими U5-специфичными белками, включая РНК-унвиндазу, гомолог фактора элонгации рибосом EF-2 и новый белок WD-40» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (11): 6756–66. дои : 10.1128/mcb.18.11.6756 . ПМК 109259 . ПМИД 9774689 .
Макаров Е.М., Макарова О.В., Аксель Т., Люрманн Р. (май 2000 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого фактора сплайсинга prp6p содержит несколько элементов TPR и стабильно связан с мяРНП U5 посредством белок-белковых взаимодействий». Журнал молекулярной биологии . 298 (4): 567–75. дои : 10.1006/jmbi.2000.3685 . ПМИД 10788320 .
Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р., Григорьев Н., Мур М.Дж. (апрель 2002 г.). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа» . РНК . 8 (4): 426–39. дои : 10.1017/S1355838202021088 . ПМК 1370266 . ПМИД 11991638 .
Иорданова А, Ироби Дж, Томас Ф.П., Ван Дейк П., Меершерт К., Дьюил М., Дирик И., Джейкобс А., Де Вриендт Э., Гергельчева В., Рао К.В., Турнев И., Гондим Ф.А., Д'Хуге М., Ван Гервен В., Каллартс П., Ван Ден Бош Л., Тиммерманс Дж.П., Робберехт В., Геттеманс Дж., Тевелейн Дж. М., Де Йонге П., Кременский И., Тиммерман В. (февраль 2006 г.). «Нарушение функции и аксональное распределение мутантной тирозил-тРНК-синтетазы при доминантной промежуточной невропатии Шарко-Мари-Тута» . Природная генетика . 38 (2): 197–202. дои : 10.1038/ng1727 . ПМИД 16429158 . S2CID 16668375 .
Лю С., Раухут Р., Ворнлохер Х.П., Люрманн Р. (июль 2006 г.). «Сеть белок-белковых взаимодействий внутри три-мяРНП человека U4/U6.U5» . РНК . 12 (7): 1418–30. дои : 10.1261/rna.55406 . ПМЦ 1484429 . ПМИД 16723661 .
Хига Л.А., Ву М., Йе Т., Кобаяши Р., Сунь Х., Чжан Х. (ноябрь 2006 г.). «Убиквитинлигаза CUL4-DDB1 взаимодействует с множеством белков-повторов WD40 и регулирует метилирование гистонов». Природная клеточная биология . 8 (11): 1277–83. дои : 10.1038/ncb1490 . hdl : 10397/34293 . ПМИД 17041588 . S2CID 22180568 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О., Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дювел. Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000060688 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000074088 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: домен 57 повтора WDR57 WD (специфичный для U5 snRNP)» .

[pmid17353931-6] Jump up to: ^а ^б Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О., Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дювел. Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

[pmid9774689-7] Jump up to: ^а ^б Аксель Т., Аренс К., Брамс Х., Тейгелькамп С., Люрманн Р. (ноябрь 1998 г.). «Человеческий белок U5-220kD (hPrp8) образует стабильный не содержащий РНК комплекс с несколькими U5-специфичными белками, включая РНК-унвиндазу, гомолог фактора элонгации рибосом EF-2 и новый белок WD-40» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (11): 6756–66. дои : 10.1128/mcb.18.11.6756 . ПМК 109259 . ПМИД 9774689 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]