PACSIN2

PACSIN2
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	3ABH, 3ACO, 3HAJ, 3Q0K
Идентификаторы
Псевдонимы	PACSIN2 , SDPII, протеинкиназа C и субстрат казеинкиназы в нейронах 2
Внешние идентификаторы	Омим : 604960 ; MGI : 1345153 ; Гомологен : 21414 ; GeneCards : Pacsin2 ; OMA : PACSIN2 - Ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 22 (human)
End	43,015,149 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	83,348,807 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	parotid gland; ; tibia; ; mucosa of sigmoid colon; ; visceral pleura; ; body of pancreas; ; cartilage tissue; ; endothelial cell; ; renal medulla; ; urethra; ; cardia;
	Top expressed in
	interventricular septum; ; epithelium of stomach; ; neural layer of retina; ; primary oocyte; ; secondary oocyte; ; vestibular membrane of cochlear duct; ; myocardium of ventricle; ; zygote; ; atrioventricular valve; ; tunica media of zone of aorta;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	transporter activity; cytoskeletal protein binding; phosphatidic acid binding; protein binding; identical protein binding; lipid binding; cadherin binding; phospholipid binding;
Cellular component	endosome; cell projection; membrane; intracellular membrane-bounded organelle; cell-cell junction; focal adhesion; ruffle membrane; recycling endosome membrane; early endosome; caveola; extracellular exosome; cytoplasmic vesicle membrane; cytoskeleton; cytoplasmic vesicle; extrinsic component of membrane; cytoplasm; cytosol; plasma membrane; nuclear speck; glutamatergic synapse;
Biological process	regulation of endocytosis; caveolin-mediated endocytosis; negative regulation of endocytosis; endocytosis; caveola assembly; plasma membrane tubulation; protein localization to endosome; cell projection morphogenesis; actin cytoskeleton organization; membrane organization; cytoskeleton organization; modulation of chemical synaptic transmission;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	11252
	23970
	ENSG00000100266
	Ensmusg00000016664
	Q9Unf0
	Q9WVE8
showNM_001184970 ; NM_001184971 ; NM_007229 ; NM_001349968 ; NM_001349969 ;
	NM_001349970; NM_001349971; NM_001349972; NM_001349973; NM_001349974
showNM_001159509 ; NM_001159510 ; NM_011862 ; NM_001358641 ; NM_001358642 ;
	NM_001358643; NM_001358644
showNP_001171899 ; NP_001171900 ; NP_009160 ; NP_001336897 ; NP_001336898 ;
	NP_001336899; NP_001336900; NP_001336901; NP_001336902; NP_001336903
showNP_001152981 ; NP_001152982 ; NP_035992 ; NP_001345570 ; NP_001345571 ;
	NP_001345572; NP_001345573
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Протеинкиназа С и субстрат казеинкиназы в нейронах белка 2 (PACSIN 2) представляет собой белок, который у людей кодируется PACSIN2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Pacsin 2 участвует в формировании кавеол . ^{[ 8 ]}

Вариант RS2413739 в PACSIN2 был связан с активностью фермента тиопурин-метилтрансфераза во время ремиссионной терапии у детей с острым лимфобластным лейкозом и с заболеваемостью тяжелых газоодежных нежелательных событий, основанных на консолидации ремиссии, в основном на основе лечения, в основном на основе лечения, в основном на основе лечения на основе лечения, в основном на основе лечения на основе лечения, в основном на основе лечения на основе лечения, в основном на основе лечения лечения, в основном на основе лечения лечения, в основном на основе лечения лечения, в основном на основе лечения лечения, в основном на основе лечения лечения детей с острыми лимфаскаальными. Антиметаболиты Меркаптопурин и метотрексат. ^{[ 9 ]}

Взаимодействия

Было показано, что PACSIN2 взаимодействует :

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000100266 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000016664 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Ritter B, Modregger J, Paulsson M, Plomann M (август 1999). «Pacsin 2, новый член семейства PACSIN белков цитоплазматических адаптеров» . Фебс Летт . 454 (3): 356–62. doi : 10.1016/s0014-5793 (99) 00830-3 . PMID 10431838 . S2CID 44788141 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Modregger J, Ritter B, Witter B, Paulsson M, Plomann M (январь 2001 г.). «Все три изоформы Pacsin связываются с эндоцитарными белками и ингибируют эндоцитоз». J Cell Sci . 113 (24): 4511–21. doi : 10.1242/jcs.113.24.4511 . PMID 11082044 .
^ «Ген Entrez: Pacsin2 протеинкиназа C и субстрат казеинкиназы в нейронах 2» .
^ Shvets, E; Людвиг, а; Николс, BJ (август 2014 г.). «Новости из пещер: обновите структуру и функцию кавеол». Современное мнение в клеточной биологии . 29 : 99–106. doi : 10.1016/j.ceb.2014.04.011 . PMID 24908346 .
^ Франка, Раффаэлла; Стокко, Габриэле; Фавретто, Диего; Юрисоны, Нагу; Дель Риццо, Ирен; Локателли, Франко; Вон, Люсиана; Бионди, Андреа; Коломбини, Антонелла; Фагиоли, Франка; Баризоне, Елена; Пелин, Марко; Martellossi, Stefano; Вентура, Алессандро; ДеКорти, Джулиана; Рабузин, Марко (2020). «PACSIN2 RS2413739 Влияние на тиопуриновую фармакокинетику: валидационные исследования у педиатрических пациентов». Фармакогеномический журнал . 20 (3): 415–425. Doi : 10.1038/s41397-019-0130-0 . HDL : 2318/1757668 . PMID 31792371 . S2CID 208539277 .
^ Гадими М.П., Санзенбахер Р., Тиде Б., Венцель Дж., Цзин К., Пломанн М., Боркхардт А., Кабелиц Д., Янссен О (май 2002). «Идентификация партнеров по взаимодействию цитозольной полипролиновой области лиганда CD95 (CD178)». Фебс Летт . 519 (1–3): 50–8. doi : 10.1016/s0014-5793 (02) 02709-6 . PMID 12023017 . S2CID 26765451 .
^ Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж., Книги Дж., Фротон С., Ламошас Е., Севик С., Бекс С., Сирорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х. , Смоляр А., Босак С., Процессов Р, поддержка- Stander L, Cusick ME, Hid of FP Roth, Vidal M (октябрь 2005 г.). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .

Дальнейшее чтение

Andersson B, Wendland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (1996). «Метод" двойного адаптера "для улучшения строительства библиотеки ружья». Анальный. Биохимия . 236 (1): 107–13. doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wendland MA, Lennon G, Gibbs RA (1997). «Крупномасштабное секвенирование кДНК конкатенации» . Геном Res . 7 (4): 353–8. doi : 10.1101/gr.7.4.353 . PMC 139146 . PMID 9110174 .
Dunham I, Shimizu N, Roe Ba, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscoun , Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (1999). «Последовательность ДНК хромосомы человека 22» . Природа . 402 (6761): 489–95. Bibcode : 1999natur.402..489d . doi : 10.1038/990031 . PMID 10591208 .
Sumoy L, Pluvinet R, Andreu N, Estivill X, Scarceller M (2001). «Pacsin 3-новый белок цитоплазматического адаптера домена SH3 из семейства генов генов Pacsin-синддапин-FAP52». Ген . 262 (1–2): 199–205. doi : 10.1016/s0378-1119 (00) 00531-x . PMID 11179684 .
Wiemann S, потому что B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder B, Behrer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder B, Köhreer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder B, Köhrer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder B, Köhrer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder A, Köhreer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder. , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (2001). «На пути к каталогу генов человека и белка: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геном Res . 11 (3): 422–35. Doi : 10.1101/gr.gr1547r . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Гадими М.П., Санзенбахер Р., Тиде Б., Венцель Дж., Цзин К., Пломанн М., Боркхардт А., Кабелиц Д., Янссен О (2002). «Идентификация партнеров по взаимодействию цитозольной полипролиновой области лиганда CD95 (CD178)». Фебс Летт . 519 (1–3): 50–8. doi : 10.1016/s0014-5793 (02) 02709-6 . PMID 12023017 . S2CID 26765451 .
Коллинз Дж., Райт К.Л., Эдвардс К.А., Дэвис М.П., Гринхэм Дж.А., Коул К.Г., Говард М.Е., Агуадо Б., Малли М., Мокраб Ю., Гекл Э.Дж., Беарн Д.М., Данхэм И. (2005). «Подход, основанный на аннотациях генома к клонированию человека Orfeome» . Геном биол . 5 (10): R84. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC 545604 . PMID 15461802 .
Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж., Книги Дж., Фротон С., Уэлш Е., Севик С., Бекс С., Сирорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х., Смоляр А., Босак С., Прочтенность Р, Поддержка- Stander L, Cusick ME, Hid DE, FP Roth, Vidal M (2005). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .
Кесселс М.М., Донг Дж., Лейбиг В., Вестерманн П., Чэлманн Б. (2006). «Комплексы синдапина II с динамином II способствуют формированию пузырьков в транс-Гольги» . J. Cell Sci . 119 (Pt 8): 1504–16. doi : 10.1242/jcs.02877 . PMID 16551695 .
Cuajungco MP, Grimm C, Oshima K, D'hoedt D, Nilius B, Mensenkamp AR, Bindels RJ, Plomann M, Heller S (2006). «Паксины связываются с катионным каналом TRPV4. Pacsin 3 модулирует субклеточную локализацию TRPV4» . Дж. Биол. Химический 281 (27): 18753–62. doi : 10.1074/jbc.m602452200 . HDL : 2066/51163 . PMID 16627472 .
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). «Глобальная динамика фосфорилирования в Global, in vivo и сайт в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 22 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000100266 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000016664 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid10431838-5] Ritter B, Modregger J, Paulsson M, Plomann M (август 1999). «Pacsin 2, новый член семейства PACSIN белков цитоплазматических адаптеров» . Фебс Летт . 454 (3): 356–62. doi : 10.1016/s0014-5793 (99) 00830-3 . PMID 10431838 . S2CID 44788141 .

[pmid11082044-6] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Modregger J, Ritter B, Witter B, Paulsson M, Plomann M (январь 2001 г.). «Все три изоформы Pacsin связываются с эндоцитарными белками и ингибируют эндоцитоз». J Cell Sci . 113 (24): 4511–21. doi : 10.1242/jcs.113.24.4511 . PMID 11082044 .

[entrez-7] «Ген Entrez: Pacsin2 протеинкиназа C и субстрат казеинкиназы в нейронах 2» .

[8] Shvets, E; Людвиг, а; Николс, BJ (август 2014 г.). «Новости из пещер: обновите структуру и функцию кавеол». Современное мнение в клеточной биологии . 29 : 99–106. doi : 10.1016/j.ceb.2014.04.011 . PMID 24908346 .

[9] Франка, Раффаэлла; Стокко, Габриэле; Фавретто, Диего; Юрисоны, Нагу; Дель Риццо, Ирен; Локателли, Франко; Вон, Люсиана; Бионди, Андреа; Коломбини, Антонелла; Фагиоли, Франка; Баризоне, Елена; Пелин, Марко; Martellossi, Stefano; Вентура, Алессандро; ДеКорти, Джулиана; Рабузин, Марко (2020). «PACSIN2 RS2413739 Влияние на тиопуриновую фармакокинетику: валидационные исследования у педиатрических пациентов». Фармакогеномический журнал . 20 (3): 415–425. Doi : 10.1038/s41397-019-0130-0 . HDL : 2318/1757668 . PMID 31792371 . S2CID 208539277 .

[pmid12023017-10] Гадими М.П., Санзенбахер Р., Тиде Б., Венцель Дж., Цзин К., Пломанн М., Боркхардт А., Кабелиц Д., Янссен О (май 2002). «Идентификация партнеров по взаимодействию цитозольной полипролиновой области лиганда CD95 (CD178)». Фебс Летт . 519 (1–3): 50–8. doi : 10.1016/s0014-5793 (02) 02709-6 . PMID 12023017 . S2CID 26765451 .

[pmid16189514-11] Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж., Книги Дж., Фротон С., Ламошас Е., Севик С., Бекс С., Сирорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х. , Смоляр А., Босак С., Процессов Р, поддержка- Stander L, Cusick ME, Hid of FP Roth, Vidal M (октябрь 2005 г.). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]