Термококк
В этой статье есть несколько проблем. Пожалуйста, помогите улучшить его или обсудите эти проблемы на странице обсуждения . ( Узнайте, как и когда удалять эти шаблонные сообщения )
|
Термококк | |
---|---|
Научная классификация | |
Домен: | |
Королевство: | |
Тип: | |
Сорт: | |
Заказ: | |
Семья: | |
Род: | Термококк Зиллиг 1983 г. |
Типовой вид | |
Термококк сельдерей Зиллиг 1983 г. | |
Разновидность | |
Посмотреть текст |
В систематике . Thermococcus — род термофильных архей семейства Thermococcaceae [1]
Представители рода Thermococcus обычно представляют собой кокковидные виды неправильной формы, размером от 0,6 до 2,0 мкм в диаметре. [2] Некоторые виды Thermococcus неподвижны, а некоторые виды обладают подвижностью , используя жгутики в качестве основного способа передвижения. [ нужна ссылка ] Эти жгутики обычно существуют на определенном полюсе организма. [ нужна ссылка ] Это движение наблюдалось при комнатной или при высоких температурах, в зависимости от конкретного организма. [3] У некоторых видов эти микроорганизмы могут агрегировать и образовывать бело-серые бляшки. [4] Виды Thermococcus обычно процветают при температуре от 60 до 105 °C. [5] либо при наличии черных курильщиков (гидротермальные источники), либо при наличии пресноводных источников. [6] Виды этого рода являются строго анаэробами. [7] [8] и являются термофильными, [2] [7] Встречается на разных глубинах, например, в гидротермальных источниках на глубине 2500 м ниже поверхности океана. [9] но и в сантиметрах ниже поверхности воды в геотермальных источниках. [10] Эти организмы процветают при уровне pH 5,6-7,9. [11] Представители этого рода были обнаружены во многих гидротермальных жерловых системах мира, в том числе в Японском море, [12] у берегов Калифорнии. [13] Хлорид натрия обычно присутствует в этих местах в концентрации 1-3%. [8] но не является необходимым субстратом для этих организмов, [14] [15] как показало одно исследование, члены Thermococcus, живущие в системах пресной горячей воды в Новой Зеландии, [6] но для роста им требуется низкая концентрация ионов лития. [16] Члены Thermococcus описываются как гетеротрофные, хемотрофные, [2] [17] [18] и являются органотрофными сульфаногенами; использование источников элементарной серы и углерода, включая аминокислоты, углеводы и органические кислоты, такие как пируват. [17] [18] [19]
Филогения
[ редактировать ]на основе 16S рРНК ДП _08_2023 [20] [21] [22] | GTDB 08-RS214 по базе данных таксономии генома . [23] [24] [25] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
Неназначенные виды:
- Т. coalescens Kuwabara et al. 2005 г.
- Т. marinus Jolivet et al. 2004 г.
- Т. mexicalis Антуан 1996 г.
- « T. waimanguensis » Goetz & Morgan, 1999 г.
Метаболизм
[ редактировать ]Метаболически Thermococcus spp. развили другую форму гликолиза, чем у эукариот и прокариот. [26] [5] Одним из примеров метаболического пути этих организмов является метаболизм пептидов, [26] который происходит в три стадии: сначала гидролиз пептидов до аминокислот катализируется пептидазами, [5] затем превращение аминокислот в кетокислоты катализируется аминотрансферазами, [26] и, наконец, CO 2 высвобождается в результате окислительного декарбоксилирования или кетокислот четырьмя различными ферментами: [5] который производит производные кофермента А, которые используются в других важных метаболических путях. [5] Виды Thermococcus также содержат фермент рубиско (рибулозо-1,5-бисфосфаткарбоксилаза / оксигеназа), [27] который производится из ферментов, участвующих в метаболизме нуклеиновых кислот Thermococcus kodakarensis , [5] [26] [27] показывая, насколько действительно интегрированы эти метаболические системы для этих гипертермофильных микроорганизмов. [27] Некоторые питательные вещества ограничивают рост клеток Thermococcus . [27] Питательными веществами, которые больше всего влияют на рост клеток у видов термококков, являются источники углерода и азота. [27] Поскольку виды термококков не производят метаболически все необходимые аминокислоты, некоторые из них должны обеспечиваться средой, в которой эти организмы процветают. Некоторые из этих необходимых аминокислот — лейцин, изолейцин и валин (аминокислоты с разветвленной цепью). [27] Когда виды Thermococcus получают эти аминокислоты, они могут метаболизировать их и производить ацетил-КоА или сукцинил-КоА. [27] которые являются важными предшественниками, используемыми в других метаболических путях, необходимых для клеточного роста и дыхания. [27] Thermococcus onnurineus не имеет генов, отвечающих за биосинтез пуриновых нуклеотидов , и поэтому для удовлетворения своих потребностей в пуринах он полагается на источники окружающей среды. [28] Благодаря современным технологиям представители Thermococcus относительно легко выращиваются в лабораториях. [29] и поэтому считаются модельными организмами для изучения физиологических и молекулярных путей экстремофилов. [30] [31] Thermococcus kodakarensis является одним из примеров модельного вида Thermococcus , микроорганизма, весь геном которого был исследован и воспроизведен. [31] [32] [33]
Экология
[ редактировать ]Виды термококков могут расти при температуре от 60 до 102 °C, оптимальная температура составляет 85 °C, что дает им большое экологическое преимущество, позволяющее им стать первыми организмами, колонизирующими новые гидротермальные среды. [5] [34] [35] Гипертермофилам необходимы экстремальные условия окружающей среды, включая температуру, pH и соль. Эти условия приводят к выработке стрессовых белков и молекулярных шаперонов, которые защищают ДНК, а также поддерживают клеточный механизм. Термококк также процветает в глюконеогенных условиях. Некоторые виды термококков производят CO 2 , H 2 и H 2 S в качестве продуктов метаболизма и дыхания. [31] Высвобождение этих молекул затем используется другими автотрофными видами, способствуя разнообразию гидротермальных микробных сообществ. [5] Этот тип культуры непрерывного обогащения играет решающую роль в экологии глубоководных гидротермальных источников. [36] предполагая, что термококки взаимодействуют с другими организмами посредством обмена метаболитов, что поддерживает рост автотрофов. [5] Thermococcus Виды , которые выделяют H 2 с помощью множества гидрогеназ (включая CO-зависимые гидрогеназы), рассматривались как потенциальные биокатализаторы реакций конверсии водяного газа. [37]
Транспортные механизмы
[ редактировать ]Виды Thermococcus от природы способны поглощать ДНК и включать донорскую ДНК в свои геномы посредством гомологичной рекомбинации. [38] Эти виды могут продуцировать мембранные везикулы (МВ), [38] образуются путем отпочкования от самых внешних клеточных мембран, [38] [39] которые могут захватывать и получать плазмиды от соседних видов архей для переноса ДНК либо себе, либо окружающим видам. [38] Эти МВ секретируются клетками в кластерах, образуя наносферы или нанотрубки. [39] сохранение целостности внутренних мембран. [38] Способность к переносу ДНК и интеграции донорской ДНК в геном реципиента путем гомологичной рекомбинации распространена у архей и, по-видимому, является адаптацией для восстановления повреждений ДНК в клетках-реципиентах (см. Подраздел архей «Перенос генов и генетический обмен»).
Виды Thermococcus производят многочисленные МВ, переносящие ДНК, метаболиты и даже токсины у некоторых видов; [39] более того, эти МВ защищают свое содержимое от термодеградации, перенося эти макромолекулы в защищенную среду. [38] [39] МВ также предотвращают инфекции, улавливая вирусные частицы. [39] Помимо транспортировки макромолекул виды Thermococcus используют МВ для общения друг с другом. [38] Кроме того, эти MV используются определенными видами ( Thermococcus coalescens ), чтобы указать, когда должна произойти агрегация. [38] поэтому эти типично одноклеточные микроорганизмы могут сливаться в одну массивную одиночную клетку. [38]
Сообщалось, что Thermococcus kodakarensis имеет четыре вирусоподобных интегрированных генных элемента, содержащих субтилизин-подобные предшественники сериновой протеазы. [40] выделено только два вируса : PAVE1 и TPV1. На сегодняшний день из Thermococcus spp. [40] Эти вирусы существуют у своих хозяев в состоянии носителя. [40]
Процесс репликации и элонгации ДНК широко изучен у T. kodakarensis . [40] Молекула ДНК представляет собой кольцевую структуру, состоящую примерно из 2 миллионов пар оснований в длину и имеющую более 2000 последовательностей, кодирующих белки. [40]
Технологии будущего
[ редактировать ]фермент из Thermococcus , ДНК-полимераза Tpa-S Было обнаружено, что , более эффективен в длинной и быстрой полимеразной цепной реакции (ПЦР), чем полимераза Taq . [41] Tk-SP , другой фермент T. kodakarensis , [41] [42] может разрушать аномальные прионные белки (PrPSc); [41] Прионы — это неправильно свернутые белки, которые могут вызывать смертельные заболевания у всех организмов. [41] Tk-SP демонстрирует широкую субстратную специфичность и экспоненциально разлагает прионы в лабораторных условиях. [41] Для сворачивания этого фермента не требуется кальций или какой-либо другой субстрат, поэтому в исследованиях на данный момент он демонстрирует большой потенциал. [41] Были скоординированы дополнительные исследования фермента фосфосеринфосфатазы (PSP) T. onnurineus , который является важным компонентом регуляции активности PSP. [42] Эта информация полезна для фармацевтических компаний, поскольку аномальная активность PSP приводит к значительному снижению уровня серина в нервной системе , вызывая неврологические заболевания и осложнения. [42]
Виды термококков . могут повысить эффективность добычи золота до 95% благодаря своим особым способностям к биовыщелачиванию . [43]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ См . веб-страницу NCBI , посвященную Thermococcus . Данные, извлеченные из «Ресурсы таксономии NCBI» . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 19 марта 2007 г.
- ^ Jump up to: а б с Канганелла Ф., Джонс В.Дж., Гамбакорта А., Антраникян Г. (октябрь 1998 г.). «Thermococcus guaymasensis sp. nov. и Thermococcus agggregans sp. nov., две новые термофильные археи, выделенные из гидротермального жерла бассейна Гуаймас» . Международный журнал систематической бактериологии . 48 Ч. 4 (4): 1181–5. дои : 10.1099/00207713-48-4-1181 . ПМИД 9828419 .
- ^ Тагашира К., Фукуда В., Мацубара М., Канаи Т., Атоми Х., Иманака Т. (январь 2013 г.). «Генетические исследования вирусоподобных областей в геноме гипертермофильного архея Thermococcus kodakarensis». Экстремофилы . 17 (1): 153–60. дои : 10.1007/s00792-012-0504-6 . ПМИД 23224520 . S2CID 15924402 .
- ^ Тэ-Ян Юнг, Ю.-СК, Бён-Ха О и Ыйджон У (2012). «Идентификация нового сайта связывания лиганда в фосфосеринфосфатазе гипертермофильной археи Thermococcus onnurineus ». Периодические издания Wiley: 11.
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я Чжан Ю, Чжао З, Чен КТ, Тан К, Су Дж, Цзяо Н (2012). «Микробы, метаболизирующие серу, доминируют в микробных сообществах мелководных гидротермальных систем, расположенных в андезитах» . ПЛОС ОДИН . 7 (9): e44593. Бибкод : 2012PLoSO...744593Z . дои : 10.1371/journal.pone.0044593 . ПМЦ 3436782 . ПМИД 22970260 .
- ^ Jump up to: а б Антуан Э., Гезеннек Ж., Менье Ж.Р., Лезонёр Ф., Барбье Дж. (1995). «Выделение и характеристика чрезвычайно термофильных архебактерий, относящихся к роду Thermococcus, из глубоководного гидротермального бассейна Гуаймас». Современная микробиология . 31 (3): 7. дои : 10.1007/bf00293552 . S2CID 25215530 .
- ^ Jump up to: а б Аменабар М.Дж., Флорес П.А., Пугин Б., Бёмвальд Ф.А., Блейми Дж.М. (2013). «Археальное разнообразие гидротермальных систем острова Десепшн, Антарктида». Полярная биология . 36 (3): 373–380. дои : 10.1007/s00300-012-1267-3 . S2CID 11705986 .
- ^ Jump up to: а б Ким Б.К., Ли Ш., Ким С.И., Чон Х., Квон С.К., Ли Ч.Х. и др. (июль 2012 г.). «Последовательность генома олигогалинной гипертермофильной археи Thermococcus zilligii AN1, выделенной из наземного геотермального пресноводного источника» . Журнал бактериологии . 194 (14): 3765–6. дои : 10.1128/jb.00655-12 . ПМЦ 3393502 . ПМИД 22740682 .
- ^ Крупович М., Гоннет М., Хания ВБ, Фортер П., Эраузо Г. (2013). «Понимание динамики мобильных генетических элементов в гипертермофильной среде на основе пяти новых плазмид Thermococcus» . ПЛОС ОДИН . 8 (1): e49044. Бибкод : 2013PLoSO...849044K . дои : 10.1371/journal.pone.0049044 . ПМЦ 3543421 . ПМИД 23326305 .
- ^ Хетцер А., Морган Х.В., Макдональд И.Р., Доуни С.Дж. (июль 2007 г.). «Микробная жизнь в бассейне с шампанским, геотермальном источнике в Вайотапу, Новая Зеландия». Экстремофилы . 11 (4): 605–14. дои : 10.1007/s00792-007-0073-2 . ПМИД 17426919 . S2CID 24239907 .
- ^ Тори К., Исино С., Киёнари С., Тахара С. , Исино Ю. (2013). «Новая одноцепочечная специфичная 3'-5' экзонуклеаза, обнаруженная у гипертермофильного архея Pyrococcus Furiosus» . ПЛОС ОДИН . 8 (3): e58497. Бибкод : 2013PLoSO...858497T . дои : 10.1371/journal.pone.0058497 . ПМЦ 3591345 . ПМИД 23505520 .
- ^ Цуй З, Ван Й, Фам Б.П., Пинг Ф., Пан Х., Чеонг Г.В. и др. (июль 2012 г.). «Высокий уровень экспрессии и характеристика термостабильной лизофосфолипазы из Thermococcus kodakarensis KOD1». Экстремофилы . 16 (4): 619–25. дои : 10.1007/s00792-012-0461-0 . ПМИД 22622648 . S2CID 17109990 .
- ^ Уэхара Р., Танака С., Такано К., Кога Ю., Канайя С. (ноябрь 2012 г.). «Требование вставочной последовательности IS1 для термической адаптации Pro-Tk-субтилизина от гипертермофильных архей». Экстремофилы . 16 (6): 841–51. дои : 10.1007/s00792-012-0479-3 . ПМИД 22996828 . S2CID 10924828 .
- ^ Чубонёва Л., Катано М., Канаи Т., Атоми Х., Рив Дж. Н., Сантанджело Т. Дж. (декабрь 2012 г.). «Для трансформации Thermococcus kodakarensis необходим архейный гистон» . Журнал бактериологии . 194 (24): 6864–74. дои : 10.1128/jb.01523-12 . ПМК 3510624 . ПМИД 23065975 .
- ^ Постек А., Лезонёр Ф., Пинье П., Оливье Б., Кереллу Дж., Годфрой А. (ноябрь 2007 г.). «Непрерывное обогащение культур: понимание прокариотического разнообразия и метаболических взаимодействий в глубоководных жерловых трубах» . Экстремофилы . 11 (6): 747–57. дои : 10.1007/s00792-007-0092-z . hdl : 20.500.11850/58941 . ПМИД 17576518 . S2CID 24258675 .
- ^ Эберли Дж.О., Эли Р.Л. (2008). «Термотолерантные гидрогеназы: биологическое разнообразие, свойства и биотехнологическое применение». Критические обзоры по микробиологии . 34 (3–4): 117–30. дои : 10.1080/10408410802240893 . ПМИД 18728989 . S2CID 86357193 .
- ^ Jump up to: а б Шут Г.Дж., Бойд Э.С., Питерс Дж.В., Адамс М.В. (март 2013 г.). «Модульные дыхательные комплексы, участвующие в метаболизме водорода и серы у гетеротрофных гипертермофильных архей, и их эволюционные последствия» . Обзоры микробиологии FEMS . 37 (2): 182–203. дои : 10.1111/j.1574-6976.2012.00346.x . ПМИД 22713092 .
- ^ Jump up to: а б Юсуке Токудзи, TS, Синсуке Фудзивара, Тадаюки Иманака и Харуюки Атоми (2013). «Генетическое исследование начального окисления аминокислот и катаболизма глутамата у гипертермофильной археи Thermococcus kodakarensis ». Журнал бактериологии : 10.
- ^ Атоми Х., Томита Х., Исибаши Т., Ёкодзи Ю., Иманака Т. (февраль 2013 г.). «Биосинтез КоА у архей». Труды Биохимического общества . 41 (1): 427–31. дои : 10.1042/bst20120311 . ПМИД 23356323 .
- ^ «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ "ar53_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ Jump up to: а б с д Одзава Ю., Сиддики М.А., Такахаси Ю., Урушияма А., Омори Д., Ямакура Ф. и др. (июль 2012 г.). «Индолэпируватферредоксиноксидоредуктаза: чувствительный к кислороду железосерный фермент гипертермофильной археи Thermococcus profundus». Журнал бионауки и биоинженерии . 114 (1): 23–7. дои : 10.1016/j.jbiosc.2012.02.014 . ПМИД 22608551 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час Давыдова И.А., Дункан К.Е., Перес-Ибарра Б.М., Суфлита Дж.М. (июль 2012 г.). «Участие термофильных архей в биокоррозии нефтепроводов». Экологическая микробиология . 14 (7): 1762–71. дои : 10.1111/j.1462-2920.2012.02721.x . ПМИД 22429327 .
- ^ Браун А.М., Хупс С.Л., Уайт Р.Х., Сариски Калифорния (декабрь 2011 г.). «Биосинтез пуринов у архей: вариации на тему» . Биология Директ . 6:63 . дои : 10.1186/1745-6150-6-63 . ПМК 3261824 . ПМИД 22168471 .
- ^ Дюффо Г.Д., д'Хеннезель О.Б., Пик А.С., Рейзенбах А.Л., Келли Р.М. (март 1998 г.). «Выделение и характеристика Thermococcus barossii, sp. nov., гипертермофильного архея, выделенного из гидротермального жерлового фланца». Систематическая и прикладная микробиология . 21 (1): 40–9. дои : 10.1016/s0723-2020(98)80007-6 . ПМИД 9741109 .
- ^ Петрова Т., Безсуднова Е.Ю., Бойко К.М., Марданов А.В., Поляков К.М., Волков В.В. и др. (декабрь 2012 г.). «АТФ-зависимая ДНК-лигаза из Thermococcus sp. 1519 демонстрирует новое расположение OB-складчатого домена» . Акта Кристаллографика. Раздел F. Структурная биология и кристаллизационные связи . 68 (Часть 12): 1440–7. дои : 10.1107/s1744309112043394 . ПМК 3509962 . ПМИД 23192021 .
- ^ Jump up to: а б с Поправка JP (2009). «Краткий обзор микробной геохимии мелководной гидротермальной системы острова Вулкано (Италия)». Фрайбергский онлайн-геофизический сайт . 22 :7.
- ^ Хьюз Р.К., Коутс Л., Блейкли М.П., Томаничек С.Дж., Ланган П., Ковалевский А.Ю. и др. (декабрь 2012 г.). «Кристаллы неорганической пирофосфатазы из Thermococcus thioreducens для дифракции рентгеновских лучей и нейтронов» . Акта Кристаллографика. Раздел F. Структурная биология и кристаллизационные связи . 68 (Часть 12): 1482–7. дои : 10.1107/S1744309112032447 . ПМК 3509969 . ПМИД 23192028 .
- ^ Атоми Х., Рив Дж. (ноябрь 2019 г.). «Микробный профиль: Thermococcus kodakarensis : модель гипертермофильного архея» . Микробиология . 165 (11): 1166–1168. дои : 10.1099/mic.0.000839 . ПМЦ 7137780 . ПМИД 31436525 .
- ^ Ито Т. (2003). «Таксономия неметаногенных гипертермофильных и родственных им термофильных архей». Журнал бионауки и биоинженерии . 96 (3): 203–212. дои : 10.1263/jbb.96.203 . ПМИД 16233511 .
- ^ Куба Ю., Ишино С., Ямагами Т., Токухара М., Канаи Т., Фуджикане Р. и др. (ноябрь 2012 г.). «Сравнительный анализ двух ядерных антигенов пролиферирующих клеток гипертермофильного архея Thermococcus kodakarensis» . Гены в клетки . 17 (11): 923–37. дои : 10.1111/gtc.12007 . ПМИД 23078585 . S2CID 25416025 .
- ^ Хакон Дале, ФГ, Марит Мэдсен, Нильс-Каре Биркеланд (2008). «Анализ структуры микробного сообщества пластовой воды высокотемпературного нефтяного месторождения Северного моря». Антони ван Левенгук 93:13.
- ^ Ппён Х, Ким И, Чо СС, Со К.Дж., Юн К., Квон С.Т. (декабрь 2012 г.). «Улучшение производительности ПЦР с использованием мутантной ДНК-полимеразы Tpa-S гипертермофильной археи Thermococcus pacificus». Журнал биотехнологии . 164 (2): 363–70. doi : 10.1016/j.jbiotec.2013.01.022 . ПМИД 23395617 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я Марге Э, Годен М, Гольяр Э, Фурко I, ле Блонд дю Плуи С, Мацуи I, Фортер П (февраль 2013 г.). «Мембранные везикулы, наноподы и/или нанотрубки, продуцируемые гипертермофильными архей рода Thermococcus». Труды Биохимического общества . 41 (1): 436–42. дои : 10.1042/bst20120293 . ПМИД 23356325 .
- ^ Jump up to: а б с д и Годен М, Гольяр Э, Схоутен С, Уэль-Рено Л, Ленорман П, Марге Э, Фортер П (февраль 2013 г.). «Гипертермофильные археи производят мембранные везикулы, способные переносить ДНК». Отчеты по экологической микробиологии . 5 (1): 109–16. дои : 10.1111/j.1758-2229.2012.00348.x . ПМИД 23757139 .
- ^ Jump up to: а б с д и Ли З., Кельман Л.М., Кельман З. (февраль 2013 г.). «Репликация ДНК Thermococcus kodakarensis». Труды Биохимического общества . 41 (1): 332–8. дои : 10.1042/bst20120303 . ПМИД 23356307 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж Хирата А., Хори Ю., Кога Ю., Окада Дж., Сакудо А., Икута К. и др. (февраль 2013 г.). «Ферментативная активность гомолога субтилизина Tk-SP из Thermococcus kodakarensis в моющих средствах и его способность разрушать аномальный прионный белок» . БМК Биотехнология . 13:19 . дои : 10.1186/1472-6750-13-19 . ПМК 3599501 . ПМИД 23448268 .
- ^ Jump up to: а б с Трофимов А.А., Слуцкая Е.А., Поляков К.М., Дороватовский П.В., Гумеров В.М., Попов В.О. (ноябрь 2012 г.). «Влияние межмолекулярных контактов на структуру рекомбинантной пролидазы Thermococcus sibiricus» . Акта Кристаллографика. Раздел F. Структурная биология и кристаллизационные связи . 68 (Часть 11): 1275–8. дои : 10.1107/s174430911203761x . ПМЦ 3515363 . ПМИД 23143231 .
- ^ Нисар М.А., Рашид Н., Башир К., Гарднер К.Т., Шафик М.Х., Ахтар М. (июль 2013 г.). «TK1299, высокотермостабильная НАД(Ф)Н-оксидаза из Thermococcus kodakaraensis, проявляющая более высокую ферментативную активность с НАДФН». Журнал бионауки и биоинженерии . 116 (1): 39–44. дои : 10.1016/j.jbiosc.2013.01.020 . ПМИД 23453203 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Судебная комиссия Международного комитета по систематике прокариот (январь 2005 г.). «Номенклатурными типами порядков Acholeplasmatales, Halanaerobiales, Halobacteriales, Methanobacteriales, Methanococcales, Methanomirobiales, Planctomycetales, Prochromales, Sulfolobales, Thermococcales, Thermoproteales и Verrucomicrobiales являются роды Acholeplasma, Halanaerobium, Halobacterium, Methanobacterium, Methanococcus Metha, nomicrobium, Planctomyces, Прохлорон, Сульфобус , Thermococcus, Thermoproteus и Verrucomicrobium соответственно. Мнение 79" . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 55 (Часть 1): 517–518. дои : 10.1099/ijs.0.63548-0 . ПМИД 15653928 .
- Мора М., Беллак А., Угеле М., Хопф Дж., Вирт Р. (август 2014 г.). «Прибор, формирующий температурный градиент, вспомогательный блок к обычным световым микроскопам для изучения биологии гипертермофильных микроорганизмов» . Прикладная и экологическая микробиология . 80 (15): 4764–70. Бибкод : 2014ApEnM..80.4764M . дои : 10.1128/AEM.00984-14 . ПМК 4148812 . ПМИД 24858087 .
- Зиллиг В., Хольц И., Кленк Х.П., Трент Дж., Вундерл С., Янекович Д., Имзель Э., Хаас Б. (1987). «Pyrococcus woesei, sp. nov., ультратермофильная морская архебактерия, представляющая новый отряд Thermococcales». Сист. Прил. Микробиол . 9 (1–2): 62–70. дои : 10.1016/S0723-2020(87)80057-7 .
- Зиллиг В., Хольц Л., Янекович Д., Шафер В., Райтер В.Д. (1983). «Архебактерия Thermococcus celer представляет собой новый род термофильной ветви архебактерий». Сист. Прил. Микробиол . 4 (1): 88–94. дои : 10.1016/S0723-2020(83)80036-8 . ПМИД 23196302 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Джон Р. Стивенсон. «Микробная эволюция и систематика» . Общая микробиология II . Проверено 13 июля 2008 г.
- Thermococcus в Bac Dive - база метаданных по бактериальному разнообразию