СРРМ1

СРРМ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1MP1
Идентификаторы
Псевдонимы	SRRM1 , 160-KD, POP101, SRM160, повторяющаяся матрица серина и аргинина 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 605975 ; МГИ : 1858303 ; Гомологен : 136796 ; Генные карты : SRRM1 ; ОМА : SRRM1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	24,673,267 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	135,353,321 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	corpus epididymis; ; sural nerve; ; caput epididymis; ; right uterine tube; ; left ovary; ; buccal mucosa cell; ; right ovary; ; body of uterus; ; tail of epididymis; ; right hemisphere of cerebellum;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; genital tubercle; ; primitive streak; ; Paneth cell; ; abdominal wall; ; neural layer of retina; ; ciliary body; ; Ileal epithelium; ; zygote; ; cumulus cell;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; protein binding; RNA binding;
Cellular component	nuclear matrix; cytosol; catalytic step 2 spliceosome; spliceosomal complex; nucleus; nucleoplasm; nuclear speck;
Biological process	RNA splicing, via transesterification reactions; mRNA splicing, via spliceosome; termination of RNA polymerase II transcription; mRNA processing; mRNA 3'-end processing; mRNA export from nucleus; RNA splicing; RNA export from nucleus;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10250
	51796
	ENSG00000133226
	ENSMUSG00000028809
	Q8IYB3
	Q52KI8
	НМ_001303448 ; НМ_001303449 ; НМ_005839
showНМ_001130477 ; НМ_016799 ; НМ_001369067 ; НМ_001369068 ; НМ_001369069 ;
	NM_001369070; NM_001369071; NM_001369072; NM_001369073; NM_001369074
showНП_001290377 ; НП_001290378 ; НП_005830 ; НП_001353494 ; НП_001353495 ;
	NP_001353496; NP_001353497; NP_001353498; NP_001353499; NP_001353500; NP_001353501; NP_001353502; NP_001353504; NP_001353505; NP_001353506; NP_001353507; NP_001353510; NP_001353511; NP_001353513; NP_001353514; NP_001353515; NP_001353516; NP_001353517; NP_001353518; NP_001353519; NP_001353520; NP_001353521; NP_001353522; NP_001353523; NP_001353524; NP_001353525; NP_001353526; NP_001353527; NP_001353528; NP_001353529
showНП_001123949 ; НП_058079 ; НП_001355996 ; НП_001355997 ; НП_001355998 ;
	NP_001355999; NP_001356000; NP_001356001; NP_001356002; NP_001356003
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 1 матричного повторяющегося серина/аргинина — это белок , который у человека кодируется SRRM1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что SRRM1 взаимодействует с CDC5L . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000133226 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028809 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Бленкоу Б.Дж., Исснер Р., Никерсон Дж.А., Шарп П.А. (май 1998 г.). «Коактиватор сплайсинга пре-мРНК» . Генс Дев . 12 (7): 996–1009. дои : 10.1101/gad.12.7.996 . ПМК 316672 . ПМИД 9531537 .
^ «Ген Энтрез: повторяющаяся серин/аргининовая матрица SRRM1 1» .
^ Аджух П., Кастер Б., Панов К., Зомердейк Дж.К., Манн М., Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . ЭМБО Дж . 19 (23): 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .

Дальнейшее чтение

Ван ХИ, Линь В., Дайк Дж.А., Йекли Дж.М., Сонгян З., Кэнтли Л.С., Фу XD (1998). «SRPK2: дифференциально экспрессируемая специфичная для белка SR киназа, участвующая в обеспечении взаимодействия и локализации факторов сплайсинга пре-мРНК в клетках млекопитающих» . Дж. Клеточная Биол . 140 (4): 737–50. дои : 10.1083/jcb.140.4.737 . ПМК 2141757 . ПМИД 9472028 .
Уилсон К.Ф., Фортес П., Сингх США, Оно М., Маттадж И.В., Серионе Р.А. (1999). «Комплекс, связывающий ядерный кэп, является новой мишенью передачи сигнала, связанной с рецептором фактора роста» . Ж. Биол. Хим . 274 (7): 4166–73. дои : 10.1074/jbc.274.7.4166 . ПМИД 9933612 .
Элдридж А.Г., Ли Ю., Шарп П.А., Бленкоу Б.Дж. (1999). «Коактиватор сплайсинга SRm160/300 необходим для функции экзона-энхансера» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 96 (11): 6125–30. Бибкод : 1999PNAS...96.6125E . дои : 10.1073/pnas.96.11.6125 . ПМК 26846 . ПМИД 10339552 .
Бленкоу Б.Дж., Баурен Г., Элдридж А.Г., Исснер Р., Никерсон Дж.А., Розонина Е., Шарп П.А. (2000). «Субъединицы коактиватора сплайсинга SRm160/300» . РНК . 6 (1): 111–20. дои : 10.1017/S1355838200991982 . ПМЦ 1369899 . PMID 10668804 .
Ле Хир Х., Мур М.Дж., Макват Л.Е. (2000). «Сплайсинг пре-мРНК изменяет состав мРНП: доказательства стабильной ассоциации белков в соединениях экзон-экзон» . Генс Дев . 14 (9): 1098–108. дои : 10.1101/gad.14.9.1098 . ПМК 316578 . ПМИД 10809668 .
МакГарви Т., Розонина Е., Маккракен С., Ли К., Арнаут Р., Мьентжес Э., Никерсон Дж.А., Оури Д., Гринблатт Дж., Гросвельд Г., Бленкоу Б.Дж. (2000). «Белок, связанный с острым миелолейкозом, DEK, образует зависимое от сплайсинга взаимодействие с комплексами экзон-продукт» . Дж. Клеточная Биол . 150 (2): 309–20. дои : 10.1083/jcb.150.2.309 . ПМК 2180225 . ПМИД 10908574 .
Ле Хир Х., Изаурральде Э., Макват Л.Е., Мур М.Дж. (2000). «Сплайсосома откладывает множество белков на 20–24 нуклеотида выше экзон-экзонных соединений мРНК» . ЭМБО Дж . 19 (24): 6860–9. дои : 10.1093/emboj/19.24.6860 . ПМК 305905 . ПМИД 11118221 .
Ликке-Андерсен Дж., Шу, доктор медицинских наук, Стейц Дж. А. (2001). «Передача положения экзон-экзонных соединений с механизмом наблюдения за мРНК с помощью белка RNPS1». Наука . 293 (5536): 1836–9. Бибкод : 2001Sci...293.1836L . дои : 10.1126/science.1062786 . ПМИД 11546874 . S2CID 389385 .
Маккракен С., Ламбермон М., Бленкоу Б.Дж. (2002). «Коактиватор сплайсинга SRm160 способствует расщеплению 3'-конца транскрипта» . Мол. Клетка. Биол . 22 (1): 148–60. дои : 10.1128/MCB.22.1.148-160.2002 . ПМК 134228 . ПМИД 11739730 .
Шимчина Б.Р., Пинеда-Лучена А., Миллс Дж.Л., Шиперски Т., Эрроусмит CH (2002). «Отнесение резонансов 1H, 13C и 15N и вторичная структура домена PWI из SRm160 с использованием ЯМР пониженной размерности». Дж. Биомол. ЯМР . 22 (3): 299–300. дои : 10.1023/А:1014904502424 . ПМИД 11991360 . S2CID 13594831 .
Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р., Григорьев Н., Мур М.Дж. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа» . РНК . 8 (4): 426–39. дои : 10.1017/S1355838202021088 . ПМК 1370266 . ПМИД 11991638 .
Лежен Ф., Исигаки Ю., Ли Х., Макват Л.Е. (2002). «Комплекс соединения экзонов обнаруживается на мРНК, связанной с CBP80, но не связанной с eIF4E, в клетках млекопитающих: динамика ремоделирования мРНП» . ЭМБО Дж . 21 (13): 3536–45. дои : 10.1093/emboj/cdf345 . ПМК 126094 . ПМИД 12093754 .
Мейснер М, Лопато С, Готцманн Дж, Зауэрманн Г, Барта А (2003). «Протоонкопротеин TLS/FUS связан с ядерным матриксом и образует комплекс с белками факторов сплайсинга PTB, SRm160 и SR». Эксп. Сотовый Res . 283 (2): 184–95. дои : 10.1016/S0014-4827(02)00046-0 . ПМИД 12581738 .
Шимчина Б.Р., Боуман Дж., Маккракен С., Пинеда-Лусена А., Лу Ю., Кокс Б., Ламбермон М., Грейвли Б.Р., Эрроусмит CH, Бленкоу Б.Дж. (2003). «Структура и функция мотива PWI: новый домен, связывающий нуклеиновую кислоту, который облегчает процессинг пре-мРНК» . Генс Дев . 17 (4): 461–75. дои : 10.1101/gad.1060403 . ЧВК 196000 . ПМИД 12600940 .
Вагнер С., Чиосеа С., Никерсон Дж.А. (2003). «Пространственное нацеливание и домены связывания ядерного матрикса SRm160» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (6): 3269–74. Бибкод : 2003PNAS..100.3269W . дои : 10.1073/pnas.0438055100 . ПМК 152281 . ПМИД 12624182 .
Маккракен С., Лонгман Д., Джонстон И.Л., Касерес Дж.Ф., Бленкоу Б.Дж. (2003). «Эволюционно консервативная роль SRm160 в процессинге 3'-конца, которая функционирует независимо от образования комплекса экзонных соединений» . Ж. Биол. Хим . 278 (45): 44153–60. дои : 10.1074/jbc.M306856200 . ПМИД 12944400 .
Вагнер С., Чиосеа С., Ившина М., Никерсон Дж.А. (2004). «In vitro FRAP выявляет АТФ-зависимую ядерную мобилизацию белка SRm160 комплекса экзонов» . Дж. Клеточная Биол . 164 (6): 843–50. дои : 10.1083/jcb.200307002 . ПМК 2172284 . ПМИД 15024032 .
Брилл Л.М., Саломон А.Р., Фикарро С.Б., Мукерджи М., Стеттлер-Гилл М., Питерс ЕС (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т-клеток человека с использованием аффинной хроматографии с иммобилизованными металлами и тандемной масс-спектрометрии». Анальный. Хим . 76 (10): 2763–72. дои : 10.1021/ac035352d . ПМИД 15144186 .

Внешние ссылки

SRRM1 Расположение гена человека в браузере генома UCSC .
Подробности о гене человека SRRM1 в браузере генома UCSC .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000133226 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028809 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9531537-5] Бленкоу Б.Дж., Исснер Р., Никерсон Дж.А., Шарп П.А. (май 1998 г.). «Коактиватор сплайсинга пре-мРНК» . Генс Дев . 12 (7): 996–1009. дои : 10.1101/gad.12.7.996 . ПМК 316672 . ПМИД 9531537 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: повторяющаяся серин/аргининовая матрица SRRM1 1» .

[pmid11101529-7] Аджух П., Кастер Б., Панов К., Зомердейк Дж.К., Манн М., Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . ЭМБО Дж . 19 (23): 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]