ЛСМ5

ЛСМ5
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3JCR
Идентификаторы
Псевдонимы	LSM5 , YER146W, гомолог LSM5, малая ядерная РНК U6 и деградация мРНК, связанная с
Внешние идентификаторы	Опустить : 607285 ; МГИ : 1913623 ; Гомологен : 40833 ; Генные карты : LSM5 ; ОМА : LSM5 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	32,495,283 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	56,681,695 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; human penis; ; rectum; ; superior surface of tongue; ; mucosa of transverse colon; ; body of pancreas; ; jejunum; ; pylorus; ; bone marrow;
	Top expressed in
	embryo; ; embryo; ; epiblast; ; ventricular zone; ; morula; ; primary oocyte; ; yolk sac; ; thymus; ; neural tube; ; blastocyst;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; RNA binding;
Cellular component	U6 snRNP; cytosol; Lsm1-7-Pat1 complex; U4/U6 x U5 tri-snRNP complex; spliceosomal complex; nucleus; nucleoplasm; U2-type precatalytic spliceosome; Lsm2-8 complex;
Biological process	nuclear-transcribed mRNA catabolic process; mRNA splicing, via spliceosome; mRNA processing; exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA; RNA splicing; response to bacterium;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	23658
	66373
	ENSG00000106355
	ENSMUSG00000091625
	Q9Y4Y9
	P62322
	НМ_001130710 ; НМ_001139499 ; НМ_012322
	НМ_025520
	НП_001124182 ; НП_001132971 ; НП_036454
	НП_079796
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Sm-подобный белок LSm5, ассоциированный с мяРНК U6, представляет собой белок , который у человека кодируется LSM5 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Sm-подобные белки были идентифицированы у различных организмов на основании гомологии последовательностей с семейством белков Sm (см. SNRPD2; MIM 601061). Sm-подобные белки содержат мотив последовательности Sm , который состоит из двух областей, разделенных линкером переменной длины, который сворачивается в виде петли. Считается, что Sm-подобные белки образуют стабильный гетеромер, присутствующий в частицах три-мяРНП, которые важны для сплайсинга пре-мРНК . [поставлено OMIM] ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000106355 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000091625 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Сальгадо-Гарридо Дж., Брагадо-Нильссон Э., Кандельс-Льюис С., Серафин Б. (август 1999 г.). «Sm и Sm-подобные белки собираются в два родственных комплекса глубокого эволюционного происхождения» . ЭМБО Дж . 18 (12): 3451–62. дои : 10.1093/emboj/18.12.3451 . ПМЦ 1171424 . ПМИД 10369684 .
^ Ингельфингер Д., Арндт-Йовин DJ, Лурманн Р., Ахсель Т. (январь 2003 г.). «Белки LSm1-7 человека колокализуются с ферментами, разрушающими мРНК Dcp1/2 и Xrnl, в отдельных цитоплазматических фокусах» . РНК . 8 (12): 1489–501. дои : 10.1017/S1355838202021726 . ПМК 1370355 . ПМИД 12515382 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: гомолог LSM5 LSM5, связанная с малой ядерной РНК U6 (S. cerevisiae)» .

Дальнейшее чтение

Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Ленер Б., Сандерсон К.М. (2004). «Схема белкового взаимодействия для деградации мРНК человека» . Геном Рез . 14 (7): 1315–23. дои : 10.1101/гр.2122004 . ПМК 442147 . ПМИД 15231747 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Шерер С.В., Чунг Дж., Макдональд Дж.Р. и др. (2003). «Человеческая хромосома 7: последовательность ДНК и биология» . Наука . 300 (5620): 767–72. Бибкод : 2003Sci...300..767S . дои : 10.1126/science.1083423 . ПМК 2882961 . ПМИД 12690205 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Эйстатиой Т., Пиблс К.Л., Хэмел Дж.К. и др. (2002). «Аутоантитела к hLSm4 и гептамерному комплексу LSm в сыворотке против Sm» . Ревмирующий артрит . 46 (3): 726–34. дои : 10.1002/арт.10220 . ПМИД 11920408 .
Сузуки Х., Фукуниси Ю., Кагава И. и др. (2001). «Панель белок-белкового взаимодействия с использованием полноразмерных кДНК мыши» . Геном Рез . 11 (10): 1758–65. дои : 10.1101/гр.180101 . ПМК 311163 . ПМИД 11591653 .
Фризен В.Дж., Дрейфус Г. (2000). «Специфические последовательности Sm и Sm-подобных (Lsm) белков опосредуют их взаимодействие с генным продуктом спинальной мышечной атрофии (SMN)» . Ж. Биол. Хим . 275 (34): 26370–5. дои : 10.1074/jbc.M003299200 . ПМИД 10851237 .
Аксель Т., Брамс Х., Кастнер Б. и др. (1999). «Гетемер Sm-подобных белков человека, имеющий форму пончика, связывается с 3'-концом мяРНК U6, тем самым способствуя образованию дуплекса U4/U6 in vitro» . ЭМБО Дж . 18 (20): 5789–802. дои : 10.1093/emboj/18.20.5789 . ПМЦ 1171645 . ПМИД 10523320 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 7 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000106355 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000091625 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10369684-5] Сальгадо-Гарридо Дж., Брагадо-Нильссон Э., Кандельс-Льюис С., Серафин Б. (август 1999 г.). «Sm и Sm-подобные белки собираются в два родственных комплекса глубокого эволюционного происхождения» . ЭМБО Дж . 18 (12): 3451–62. дои : 10.1093/emboj/18.12.3451 . ПМЦ 1171424 . ПМИД 10369684 .

[pmid12515382-6] Ингельфингер Д., Арндт-Йовин DJ, Лурманн Р., Ахсель Т. (январь 2003 г.). «Белки LSm1-7 человека колокализуются с ферментами, разрушающими мРНК Dcp1/2 и Xrnl, в отдельных цитоплазматических фокусах» . РНК . 8 (12): 1489–501. дои : 10.1017/S1355838202021726 . ПМК 1370355 . ПМИД 12515382 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: гомолог LSM5 LSM5, связанная с малой ядерной РНК U6 (S. cerevisiae)» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]