МГМЕ1

МГМЕ1
Идентификаторы
Псевдонимы	MGME1 , C20orf72, DDK1, MTDPS11, bA504H3.4, экзонуклеаза 1 поддержания митохондриального генома
Внешние идентификаторы	Опустить : 615076 ; МГИ : 1921778 ; Гомологен : 12573 ; Генные карты : MGME1 ; ОМА : MGME1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	17,991,122 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	144,123,147 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	skin of arm; ; myocardium of left ventricle; ; cardiac muscle tissue of right atrium; ; ventricular zone; ; human penis; ; amniotic fluid; ; skin of thigh; ; gingival epithelium; ; trabecular bone; ; deltoid muscle;
	Top expressed in
	interventricular septum; ; gastrula; ; epiblast; ; embryo; ; morula; ; right kidney; ; blastocyst; ; proximal tubule; ; yolk sac; ; muscle of thigh;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	nuclease activity; single-stranded DNA exodeoxyribonuclease activity; exonuclease activity; hydrolase activity;
Cellular component	mitochondrion;
Biological process	mitochondrial DNA replication; mitochondrial DNA repair; mitochondrial genome maintenance; DNA repair; nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis; cellular response to DNA damage stimulus;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	92667
	74528
	ENSG00000125871
	ENSMUSG00000027424
	Q9BQP7
	Q9CXC3
	НМ_001310338 ; НМ_001310339 ; НМ_052865 ; НМ_001363738
	НМ_001289630 ; НМ_001289631 ; НМ_028984 ; НМ_001355688
	НП_001297267 ; НП_001297268 ; НП_443097 ; НП_001350667
	НП_001276559 ; НП_001276560 ; НП_083260 ; НП_001342617
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Экзонуклеаза 1 поддержания митохондриального генома , сокращенно MGME1 , представляет собой фермент , который у человека кодируется геном MGME1 . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} 344 аминокислоты, длиной MGME1 представляет собой белок принадлежащий семейству нуклеаз PD-(D/E)XK. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Он локализуется в митохондриях , где важен для поддержания митохондриального генома. Мутации потери функции в MGME1 приводят к дефектам митохондриальной ДНК, включая истощение митохондриальной ДНК, дупликации, делеции и увеличение количества промежуточных продуктов репликации. ^{[ 6 ]}^{[ 5 ]}^{[ 7 ]} Также наблюдается скопление 7S ДНК, короткой одноцепочечной линейной цепи ДНК. Дефицит MGME1 у человека приводит к мультисистемному митохондриальному заболеванию . ^{[ 5 ]}

Функция

Активность MGME1 изучали с использованием очищенного белка в бесклеточных анализах in vitro . В совокупности эти исследования показывают, что MGME1 действует, удаляя одноцепочечные нуклеотидные лоскуты, которые возникают во время митохондриальной ДНК репликации и/или репарации . MGME1 имеет сильное предпочтение разрезанию одноцепочечной ДНК, обладает слабой активностью в отношении дуплексной ДНК и неактивен в отношении РНК . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Он действует как эндо-/экзонуклеаза, требуя для расщепления свободного 5’- или 3’-конца. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} MGME1 может разрезать подложки с 5-дюймовыми лоскутами, имитирующие промежуточные материалы для грунтовки/восстановления. ^{[ 5 ]}^{[ 8 ]} Более того, MGME1 удаляет одноцепочечные 5'-флопы в анализах репликации восстановленной митохондриальной ДНК, где это необходимо для обеспечения лигирования вновь синтезированной цепи. ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000125871 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000027424 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Корнблюм С., Николлс Т.Дж., Хаак Т.Б., Шелер С., Пеева В., Данхаузер К. и др. (февраль 2013 г.). «Мутации потери функции в MGME1 нарушают репликацию мтДНК и вызывают мультисистемное митохондриальное заболевание» . Природная генетика . 45 (2): 214–9. дои : 10.1038/ng.2501 . ПМЦ 3678843 . ПМИД 23313956 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Щесны Р.Ю., Гейнович М.С., Стешкевич К., Мушевска А., Боровский Л.С., Гинальский К., Дзембовский А. (март 2013 г.). «Идентификация новой митохондриальной эндо-/экзонуклеазы человека Ddk1/c20orf72, необходимой для поддержания правильного уровня 7S ДНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 41 (5): 3144–61. дои : 10.1093/nar/gkt029 . ПМЦ 3597694 . ПМИД 23358826 .
^ Николлс Т.Дж., Журка Г., Пеева В., Шелер С., Щесны Р.Дж., Цисевски Д. и др. (декабрь 2014 г.). «Линейные фрагменты мтДНК и необычные перестройки мтДНК, связанные с патологическим дефицитом экзонуклеазы MGME1» . Молекулярная генетика человека . 23 (23): 6147–62. дои : 10.1093/hmg/ddu336 . ПМЦ 4222359 . ПМИД 24986917 .
^ Jump up to: ^а ^б Улер Дж.П., Торн С., Николлс Т.Дж., Матич С., Миленкович Д., Густафссон К.М., Фалькенберг М. (июль 2016 г.). «MGME1 превращает лоскуты в лигируемые разрезы совместно с ДНК-полимеразой γ во время репликации мтДНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (12): 5861–71. дои : 10.1093/nar/gkw468 . ПМЦ 4937333 . ПМИД 27220468 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000125871 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000027424 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[:0-5] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Корнблюм С., Николлс Т.Дж., Хаак Т.Б., Шелер С., Пеева В., Данхаузер К. и др. (февраль 2013 г.). «Мутации потери функции в MGME1 нарушают репликацию мтДНК и вызывают мультисистемное митохондриальное заболевание» . Природная генетика . 45 (2): 214–9. дои : 10.1038/ng.2501 . ПМЦ 3678843 . ПМИД 23313956 .

[:1-6] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Щесны Р.Ю., Гейнович М.С., Стешкевич К., Мушевска А., Боровский Л.С., Гинальский К., Дзембовский А. (март 2013 г.). «Идентификация новой митохондриальной эндо-/экзонуклеазы человека Ddk1/c20orf72, необходимой для поддержания правильного уровня 7S ДНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 41 (5): 3144–61. дои : 10.1093/nar/gkt029 . ПМЦ 3597694 . ПМИД 23358826 .

[7] Николлс Т.Дж., Журка Г., Пеева В., Шелер С., Щесны Р.Дж., Цисевски Д. и др. (декабрь 2014 г.). «Линейные фрагменты мтДНК и необычные перестройки мтДНК, связанные с патологическим дефицитом экзонуклеазы MGME1» . Молекулярная генетика человека . 23 (23): 6147–62. дои : 10.1093/hmg/ddu336 . ПМЦ 4222359 . ПМИД 24986917 .

[:2-8] Jump up to: ^а ^б Улер Дж.П., Торн С., Николлс Т.Дж., Матич С., Миленкович Д., Густафссон К.М., Фалькенберг М. (июль 2016 г.). «MGME1 превращает лоскуты в лигируемые разрезы совместно с ДНК-полимеразой γ во время репликации мтДНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (12): 5861–71. дои : 10.1093/nar/gkw468 . ПМЦ 4937333 . ПМИД 27220468 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]