Бета -защитник 1

Defb1
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	1E4S, 1IJU, 1IJV, 1KJ5, 2NLB, 2NLC, 2NLD, 2NLE, 2NLF, 2NLG, 2NLH, 2NLP, 2NLQ, 2NLS, 2PLZ
Идентификаторы
Псевдонимы	Defb1 , bd1, defb-1, defb101, hbd1, defensin beta 1
Внешние идентификаторы	Омим : 602056 ; MGI : 1096878 ; Гомологен : 88476 ; GeneCards : defb1 ; OMA : defb1 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 8 (human)
End	6,877,936 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	22,285,201 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	body of pancreas; ; salivary gland; ; skin of abdomen; ; minor salivary glands; ; human kidney; ; skin of leg; ; islet of Langerhans; ; mucosa of esophagus; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; right lobe of liver;
	Top expressed in
	conjunctival fornix; ; right kidney; ; human kidney; ; islet of Langerhans; ; lip; ; cornea; ; esophagus; ; skin of external ear; ; corneal stroma; ; ciliary body;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	CCR6 chemokine receptor binding; protein binding; identical protein binding;
Cellular component	Golgi lumen; extracellular region; extracellular exosome; sperm midpiece; extracellular space; extrinsic component of membrane; microvesicle; membrane;
Biological process	chemotaxis; G protein-coupled receptor signaling pathway; defense response; innate immune response in mucosa; acute inflammatory response; response to bacterium; immune response; response to testosterone; positive regulation of flagellated sperm motility involved in capacitation; defense response to bacterium; calcium-mediated signaling using intracellular calcium source; cAMP-mediated signaling; defense response to Gram-negative bacterium; antimicrobial humoral response; innate immune response; antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; defense response to Gram-positive bacterium;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1672
	13214
	ENSG00000164825 ; ENSG00000284881
	EMSMUSM000000444748
	P60022
	P56386
	NM_005218
	NM_007843
	NP_005209
	NP_031869
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Бета-дефенсин 1 -это белок , который у людей кодируется DEFB1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Дефенсины образуют семейство микробицидных и цитотоксических пептидов, изготовленных нейтрофилами . Члены семейства дефенсинов очень схожи в белковой последовательности. Этот ген кодирует дефенсин, бета 1, антимикробный пептид, вовлеченный в устойчивость эпителиальных поверхностей к микробной колонизации. Этот ген отображает в непосредственной близости от дефенсина члена семейства дефенсина, Альфа 1 , и участвует в патогенезе муковисцидоза . ^{[ 6 ]} Однонуклеотидные полиморфизмы в гене DEFB1 были связаны с концентрациями кинуренана в плазме у пациентов с большими депрессивными заболеваниями в исследовании ассоциации по всему геному . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ENSG00000284881 GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000164825, ENSG00000284881 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000044748 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Bensch KW, Raida M, Mägert HJ, Schulz-Knappe P, Forssmann WG (июль 1995 г.). «HBD-1: новый бета-дефенсин от человеческой плазмы» . Письма Febs . 368 (2): 331–5. doi : 10.1016/0014-5793 (95) 00687-5 . PMID 7628632 . S2CID 84766207 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: Defb1 Defensin, Beta 1" .
^ Liu D, Ray B, Neavin DR, Zhang J, Athreya AP, Biernacka JM, et al. (Январь 2018). «Бета-дефенсин 1, арилоггдыглеводородный рецептор и плазменный кинуренин при крупном депрессивном расстройстве: геномика, информированная на метаболомике» . Переводная психиатрия . 8 (1): 10. doi : 10.1038/s41398-017-0056-8 . PMC 5802574 . PMID 29317604 .

Дальнейшее чтение

Ганц Т., Лерер Р.И. (май 1995). "Дефенсины". Фармакология и терапия . 66 (2): 191–205. doi : 10.1016/0163-7258 (94) 00076-f . PMID 7667395 .
Бональдо М.Ф., Леннон Г., Соарс М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов» . Исследование генома . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Goldman MJ, Anderson GM, Stolzenberg ED, Kari Up, Zasloff M, Wilson JM (февраль 1997 г.). «Бета-дефенсин-1 человека представляет собой чувствительный к соле антибиотик в легких, который инактивируется при муковисцидозе» . Клетка . 88 (4): 553–60. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 81895-4 . PMID 9038346 . S2CID 6614946 .
McCray PB, Bentley L (март 1997 г.). «Эпителия дыхательных путей человека экспрессируют бета-дефенсин». Американский журнал респираторных клеток и молекулярной биологии . 16 (3): 343–9. doi : 10.1165/ajrcmb.16.3.9070620 . PMID 9070620 .
Лю Л., Чжао С., Хенг Х.Х., Ганц Т (август 1997 г.). «Человеческий бета-дефенсин-1 и альфа-дефенсины кодируются соседними генами: два пептидных семейства с различной дисульфидной топологией имеют общее происхождение». Геномика . 43 (3): 316–20. doi : 10.1006/geno.1997.4801 . PMID 9268634 .
Valore EV, Park CH, Quayle AJ, Wiles KR, McCray PB, Ganz T (апрель 1998 г.). «Человеческий бета-дефенсин-1: антимикробный пептид урогенитальных тканей» . Журнал клинических исследований . 101 (8): 1633–42. doi : 10.1172/jci1861 . PMC 508744 . PMID 9541493 .
Schnapp D, Reid CJ, Harris A (сентябрь 1998 г.). «Локализация экспрессии человеческого бета-дефенсина-1 в поджелудочной железе и почках». Журнал патологии . 186 (1): 99–103. doi : 10.1002/(SICI) 1096-9896 (199809) 186: 1 <99 :: AID-PATH133> 3.0.co; 2-# . PMID 9875146 . S2CID 196604843 .
Хирацука Т., Наказато М., Ашитани Дж., Мацукура С. (февраль 1999 г.). «[Исследование человеческого бета-дефенсина-1 и бета-дефенсина-2 человека в обороне слизистой оболочки дыхательных путей]» . Кансеншогаку Засши. Журнал Японской ассоциации инфекционных заболеваний . 73 (2): 156–62. doi : 10.11150/kansenshogakuzasshi1970.73.156 . PMID 10213993 .
Gropp R, Frye M, Wagner to, Bargon J (апрель 1999 г.). «Эпителиальные дефенсины нарушают аденовирусную инфекцию: значение для аденовирусной генной терапии». Генная терапия человека . 10 (6): 957–64. doi : 10.1089/10430349950018355 . PMID 10223729 .
Мэтьюз М., Цзя Х.П., Гатмиллер Дж. М., Лош Г., Грэм С., Джонсон Г.К. и др. (Июнь 1999 г.). «Производство бета-дефенсиновых антимикробных пептидов слизистой оболочкой полости рта и слюнных желез» . Инфекция и иммунитет . 67 (6): 2740–5. doi : 10.1128/iai.67.6.2740-2745.1999 . PMC 96577 . PMID 10338476 .
Bøe R, Silvola J, Yang J, Moens U, McCray PB, Stenfors LE, Seljfelid R (сентябрь 1999 г.). «МРНК бета-дефенсин-1 человека транскрибируется в барабанной перепончической мембране и прилегающем эпителии слухового канала» . Инфекция и иммунитет . 67 (9): 4843–6. doi : 10.1128/iai.67.9.4843-4846.1999 . PMC 96817 . PMID 10456939 .
Yang D, Chertov O, Bykovskaia SN, Chen Q, Buffo MJ, Shogan J, et al. (Октябрь 1999). «Бета-дефенсины: связывание врожденного и адаптивного иммунитета с помощью дендритных и Т-клеток CCR6». Наука . 286 (5439): 525–8. doi : 10.1126/science.286.5439.525 . PMID 10521347 .
Tunzi CR, Harper PA, Bar-Oz B, Valore EV, Semple JL, Watson-Macdonell J, et al. (Июль 2000 г.). «Экспрессия бета-дефенсина в эпителии молочной железы человека» . Педиатрическое исследование . 48 (1): 30–5. doi : 10.1203/00006450-200007000-00008 . PMID 10879797 .
Sahasrabudhe KS, Kimball JR, Morton TH, Weinberg A, Dale Ba (сентябрь 2000 г.). «Экспрессия антимикробного пептида, бета-дефенсина 1 человека, в клетках протоков незначительных слюн и обнаружения в слюне». Журнал стоматологических исследований . 79 (9): 1669–74. doi : 10.1177/00220345000790090601 . PMID 11023262 . S2CID 2364914 .
Jia HP, Starner T, Ackermann M, Kirby P, Tack BF, McCray PB (январь 2001 г.). «Обильная экспрессия бета-дефенсина-1 человека в эпителии молочной железы и молочной железы». Журнал педиатрии . 138 (1): 109–12. doi : 10.1067/mpd.2001.109375 . PMID 11148522 .
Али Р.С., Фалконер А., Икрам М., Биссетт К.Е., Церио Р., Куинн А.Г. (июль 2001 г.). «Экспрессия пептидных антибиотиков человеческий бета-дефенсин-1 и бета-дефенсин-2 человека в нормальной коже человека» . Журнал следственной дерматологии . 117 (1): 106–11. doi : 10.1046/j.0022-202x.2001.01401.x . PMID 11442756 .
Carothers DG, Graham SM, Jia HP, Ackermann MR, Tack BF, McCray PB (2001). «Производство бета-дефенсиновых антимикробных пептидов с помощью слизистой оболочки верхнечелюстной пазухи». Американский журнал ринологии . 15 (3): 175–9. doi : 10.2500/105065801779954238 . PMID 11453504 . S2CID 31583849 .
Гувер Д.М., Чертов О., Любковский Дж. (Октябрь 2001 г.). «Структура человеческого бета-дефенсина-1: новое понимание структурных свойств бета-дефенсинов» . Журнал биологической химии . 276 (42): 39021–6. doi : 10.1074/jbc.m103830200 . PMID 11486002 .

Эта статья о гене на хромосоме человека 8 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ENSG00000284881 GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000164825, ENSG00000284881 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000044748 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid7628632-5] Bensch KW, Raida M, Mägert HJ, Schulz-Knappe P, Forssmann WG (июль 1995 г.). «HBD-1: новый бета-дефенсин от человеческой плазмы» . Письма Febs . 368 (2): 331–5. doi : 10.1016/0014-5793 (95) 00687-5 . PMID 7628632 . S2CID 84766207 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: Defb1 Defensin, Beta 1" .

[7] Liu D, Ray B, Neavin DR, Zhang J, Athreya AP, Biernacka JM, et al. (Январь 2018). «Бета-дефенсин 1, арилоггдыглеводородный рецептор и плазменный кинуренин при крупном депрессивном расстройстве: геномика, информированная на метаболомике» . Переводная психиатрия . 8 (1): 10. doi : 10.1038/s41398-017-0056-8 . PMC 5802574 . PMID 29317604 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]