Actr1a

Actr1a
Идентификаторы
Псевдонимы	ACTR1A , ARP1, CTRN1, ARP1A, ARP1, связанный с актином белка 1 гомолог A, центротетин альфа, ARP1, связанный с актином, гомолог 1, белок, связанный с актином, белок 1A
Внешние идентификаторы	Омим : 605143 ; MGI : 1858964 ; Гомологен : 21173 ; Genecards : Actr1a ; OMA : ACTR1A - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 10 (human)
End	102,502,712 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 19 (mouse)
End	46,384,187 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	ganglionic eminence; ; gastrocnemius muscle; ; prefrontal cortex; ; right frontal lobe; ; stromal cell of endometrium; ; muscle layer of sigmoid colon; ; cingulate gyrus; ; anterior cingulate cortex; ; apex of heart; ; C1 segment;
	Top expressed in
	otic vesicle; ; saccule; ; spermatocyte; ; otic placode; ; spermatid; ; facial motor nucleus; ; lip; ; ganglionic eminence; ; external carotid artery; ; internal carotid artery;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	ATP binding; nucleotide binding; protein binding; cytoskeletal protein-membrane anchor activity;
Cellular component	cytosol; microtubule cytoskeleton; microtubule associated complex; cytoplasm; myelin sheath; centrosome; microtubule organizing center; cytoskeleton; extracellular exosome; dynactin complex; manchette; centriole; COPI-coated vesicle; cell cortex region; cell cortex;
Biological process	G2/M transition of mitotic cell cycle; antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; vesicle-mediated transport; spermatogenesis; ciliary basal body-plasma membrane docking; endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle; establishment of mitotic spindle orientation; nuclear migration along microtubule;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10121
	54130
	ENSG00000138107
	Ensmusg00000025228
	P61163
	P61164
	NM_005736
	NM_016860 ; NM_001365070
	NP_005727
	NP_058556 ; NP_001351999
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Альфа-центтрактин (дрожжи) или ARP1 -это белок , который у людей кодируется ACTR1A геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Этот ген кодирует 42,6 кДа субъединицы Dynactin , макромолекулярного комплекса, состоящего из 10-11 субъединиц, варьирующихся в размере от 22 до 150 кДа. Динактин связывается как с микротрубочками , так и с цитоплазматическим динеином . Он участвует в разнообразных клеточных функциях, включая транспорт ER-к-Гольги, центростремительное движение лизосом и эндосом, образование веретена, движение хромосом, ядерное положение и аксоногенез. Эта субъединица присутствует в 8-13 экземплярах на молекулу динактина и является наиболее распространенной молекулой в комплексе Dynactin. Это белок, связанный с актином, и примерно 60% идентичен на уровне аминокислот до обычного актина. ^{[ 6 ]} ARP1 образует 37-нм, подобную нити структуру и является ядром комплекса Dynactin . ^{[ 7 ]} Он существует только в комплексе Dynactin in vivo. Высоко очищенные, нативные ARP1 быстро полимеризуются при чрезвычайно низких концентрациях в короткие нити in vitro, которые были одинаковыми, но не идентичными, по длине с концентрациями в динактине. Со временем эти нити ARP1, по -видимому, отжигали, чтобы сформировать более длинные сборки, но никогда не достигли длины обычных актиновых филаментов. Что касается обычного актина, ARP1 может связывать и гидролизовать АТФ , а сборка ARP1 сопровождается нуклеотидным гидролизом. ^{[ 8 ]}

Сообщалось, что ARP1 взаимодействует с другими компонентами Dynactin, включая DCTN1 /P150 ^{Приклеен}, ^{[ 9 ]} DCTN4 /P62 ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} и actr10 /arp11. ^{[ 12 ]} ARP1 был показан в качестве домена для связывания динактина с мембранными везикулами (такими как Гольджи или поздняя эндосома ) посредством его ассоциации с β- спектрином . ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}

Взаимодействия

Было показано, что ACTR1A взаимодействует с SPTBN2 . ^{[ 14 ]}^{[ 17 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000138107 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000025228 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Lees-Miller JP, Helfman DM, Schroer TA (октябрь 1992). «Белок, связанный с актином позвоночных, является компонентом мультисубнитного комплекса, участвующего в подвижности везикул на основе микротрубочек». Природа . 359 (6392): 244–6. Bibcode : 1992natur.359..244L . doi : 10.1038/359244A0 . PMID 1528266 . S2CID 4239305 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: ACTR1A ARP1-актин, связанный с белком 1 гомолог A, центрин-альфа (дрожжи)» .
^ Schafer DA, Gill SR, Cooper JA, Heuser JE, Schroer TA (1994). «Ультраструктурный анализ комплекса Dynactin: белок, связанный с актином, является компонентом нити, напоминающего F-актин» . Журнал клеточной биологии . 126 (2): 403–412. doi : 10.1083/jcb.126.2.403 . PMC 2200042 . PMID 7518465 .
^ Bingham JB, Schroer TA (1999). «Саморегулируемая полимеризация белка, связанного с актином, ARP1» . Карт Биол . 9 (4): 223–6. doi : 10.1016/s0960-9822 (99) 80095-5 . PMID 10074429 . S2CID 208851 .
^ Waterman-Storer CM, Karki S, Holzbaur EL (1995). «Компонент Dynactin Complex комплекса Dynactin связывается как с микротрубочками, так и с актиновым белком центтрактином (ARP-1)» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 92 (5): 1634–8. Bibcode : 1995pnas ... 92.1634W . doi : 10.1073/pnas.92.5.1634 . PMC 42574 . PMID 7878030 .
^ Garces JA, Clark IB, Meyer DI, Vallee RB (1999). «Взаимодействие субъединицы P62 динактина с ARP1 и корковым актиновым цитоскелетом» . Карт Биол . 9 (24): 1497–500. doi : 10.1016/s0960-9822 (00) 80122-0 . PMID 10607597 . S2CID 10924633 .
^ Karki S, Tokito MK, Holzbaur EL (2000). «Субъединица Dynactin с высококонсервативным мотивом, богатым цистеином, взаимодействует непосредственно с ARP1» . Дж. Биол. Химический 275 (7): 4834–9. doi : 10.1074/jbc.275.7.4834 . PMID 10671518 .
^ Экли Д.М., Шроер Т.А. (2003). «Взаимодействие между эволюционно консервативным, связанным с актином белком, ARP11, актин и ARP1» . Мол Биол. Клетка . 14 (7): 2645–54. doi : 10.1091/mbc.e03-01-0049 . PMC 165665 . PMID 12857853 .
^ Holleran EA, Tokito MK, Karki S, Holzbaur EL (1996). «Центрактин (ARP1) ассоциируется со спектрином, выявляющим потенциальный механизм связывания динактина с внутриклеточными органеллами» . J. Cell Biol . 135 (6 Pt 2): 1815–29. doi : 10.1083/jcb.135.6.1815 . PMC 2133946 . PMID 8991093 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Holleran EA, Ligon LA, Tokito M, Stankewich MC, Morrow JS, Holzbaur EL (2001). «Спектрин бета III связывается с субъединицей ARP1 Dynactin» . Дж. Биол. Химический 276 (39): 36598–605. doi : 10.1074/jbc.m104838200 . PMID 11461920 .
^ Muresan V, Stankewich MC, Steffen W, Morrow JS, Holzbaur EL, Schnapp BJ (2001). «Динактин-зависимый транспорт везикул, управляемый динеином в отсутствие мембранных белков: роль спектрина и кислых фосфолипидов» . Мол Клетка . 7 (1): 173–83. doi : 10.1016/s1097-2765 (01) 00165-4 . PMID 11172722 .
^ Йоханссон М., Роча Н., Зварт В., Джордс И., Янссен Л., Куйджл С., Олкконен В.М., Нифджес Дж. (2007). «Активация эндосомальных двигателей динеина путем поэтапной сборки Rab7-Rilp-P150-Huled, ORP1L и рецепторного спектрина» . J. Cell Biol . 176 (4): 459–71. doi : 10.1083/jcb.200606077 . PMC 2063981 . PMID 17283181 .
^ Mao B, Wu W, Li Y, Hoppe D, Stannek P, Glinka A, Niehrs C (2001). «Связанный с LDL-рецептор белок 6 является рецептором для белков dickkopf». Природа . 411 (6835): 321–5. Bibcode : 2001natur.411..321m . doi : 10.1038/35077108 . PMID 11357136 . S2CID 4323027 .

Дальнейшее чтение

Clark SW, Meyer Di (1992). «Центрактин - это гомолог актина, связанный с центросомой». Природа . 359 (6392): 246–50. Bibcode : 1992natur.359..246c . doi : 10.1038/359246A0 . PMID 1356230 . S2CID 4352549 .
Clark SW, Staub O, Clark IB, et al. (1995). «Бета-центтрактин: характеристика и распределение нового члена семейства центтрактин белков, связанных с актином» . Мол Биол. Клетка . 5 (12): 1301–10. doi : 10.1091/mbc.5.12.1301 . PMC 301159 . PMID 7696711 .
Faulkner NE, Vig B, Echeverri CJ, et al. (1998). «Локализация моторных белков и связанных комплексов с активными, но не неактивными, центромерами» . Гул Мол Генет . 7 (4): 671–7. doi : 10.1093/hmg/7.4.671 . PMID 9499420 .
Heimann K, Percival JM, Weinberger R, et al. (1999). «Специфические изоформы актин-связывающих белков на различных популяциях везикул, полученных из Голги» . Дж. Биол. Химический 274 (16): 10743–50. doi : 10.1074/jbc.274.16.10743 . PMID 10196146 .
Кларк И.Б., Мейер Ди (2000). «Сверхэкспрессия нормальной и мутантной arp1alpha (центрротин) по -разному влияет на организацию микротрубочек во время митоза и интерфазы». J. Cell Sci . 112 (20): 3507–18. doi : 10.1242/jcs.112.20.3507 . PMID 10504299 .
Saffery R, Irvine DV, Griffiths B, et al. (2000). «Центромеры человека и неоцентромеры показывают идентичные паттерны распределения> 20 функционально важных белков, связанных с кинетохором» . Гул Мол Генет . 9 (2): 175–85. doi : 10.1093/hmg/9.2.175 . PMID 10607828 .
Fouquet J, Kann M, Souès S, Melki R (2000). «ARP1 в организации Гольджи и привязанности мангет -микротрубочек к ядру во время сперматогенеза млекопитающих». J. Cell Sci . 113 (5): 877–86. doi : 10.1242/jcs.113.5.877 . PMID 10671377 .
Хартли Дж. Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием специфической для сайта рекомбинации in vitro» . Геном Res . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Carew JA, Jackson AA, Bauer KA (2004). «ARP1 взаимодействует с 5 'фланкирующей областью гена фактора VII коагуляции» . J. Thromb. Кровотечение . 1 (6): 1220–7. doi : 10.1046/j.1538-7836.2003.00227.x . PMID 12871323 . S2CID 13442414 .

Внешние ссылки

ACTR1A Местоположение человеческого гена в браузере генома UCSC .
ACTR1A Человеческие детали гена в браузере генома UCSC .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000138107 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000025228 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid1528266-5] Lees-Miller JP, Helfman DM, Schroer TA (октябрь 1992). «Белок, связанный с актином позвоночных, является компонентом мультисубнитного комплекса, участвующего в подвижности везикул на основе микротрубочек». Природа . 359 (6392): 244–6. Bibcode : 1992natur.359..244L . doi : 10.1038/359244A0 . PMID 1528266 . S2CID 4239305 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: ACTR1A ARP1-актин, связанный с белком 1 гомолог A, центрин-альфа (дрожжи)» .

[7] Schafer DA, Gill SR, Cooper JA, Heuser JE, Schroer TA (1994). «Ультраструктурный анализ комплекса Dynactin: белок, связанный с актином, является компонентом нити, напоминающего F-актин» . Журнал клеточной биологии . 126 (2): 403–412. doi : 10.1083/jcb.126.2.403 . PMC 2200042 . PMID 7518465 .

[pmid10074429-8] Bingham JB, Schroer TA (1999). «Саморегулируемая полимеризация белка, связанного с актином, ARP1» . Карт Биол . 9 (4): 223–6. doi : 10.1016/s0960-9822 (99) 80095-5 . PMID 10074429 . S2CID 208851 .

[pmid7878030-9] Waterman-Storer CM, Karki S, Holzbaur EL (1995). «Компонент Dynactin Complex комплекса Dynactin связывается как с микротрубочками, так и с актиновым белком центтрактином (ARP-1)» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 92 (5): 1634–8. Bibcode : 1995pnas ... 92.1634W . doi : 10.1073/pnas.92.5.1634 . PMC 42574 . PMID 7878030 .

[pmid10607597-10] Garces JA, Clark IB, Meyer DI, Vallee RB (1999). «Взаимодействие субъединицы P62 динактина с ARP1 и корковым актиновым цитоскелетом» . Карт Биол . 9 (24): 1497–500. doi : 10.1016/s0960-9822 (00) 80122-0 . PMID 10607597 . S2CID 10924633 .

[pmid10671518-11] Karki S, Tokito MK, Holzbaur EL (2000). «Субъединица Dynactin с высококонсервативным мотивом, богатым цистеином, взаимодействует непосредственно с ARP1» . Дж. Биол. Химический 275 (7): 4834–9. doi : 10.1074/jbc.275.7.4834 . PMID 10671518 .

[pmid12857853-12] Экли Д.М., Шроер Т.А. (2003). «Взаимодействие между эволюционно консервативным, связанным с актином белком, ARP11, актин и ARP1» . Мол Биол. Клетка . 14 (7): 2645–54. doi : 10.1091/mbc.e03-01-0049 . PMC 165665 . PMID 12857853 .

[pmid8991093-13] Holleran EA, Tokito MK, Karki S, Holzbaur EL (1996). «Центрактин (ARP1) ассоциируется со спектрином, выявляющим потенциальный механизм связывания динактина с внутриклеточными органеллами» . J. Cell Biol . 135 (6 Pt 2): 1815–29. doi : 10.1083/jcb.135.6.1815 . PMC 2133946 . PMID 8991093 .

[pmid11461920-14] Jump up to: ^а ^{беременный} Holleran EA, Ligon LA, Tokito M, Stankewich MC, Morrow JS, Holzbaur EL (2001). «Спектрин бета III связывается с субъединицей ARP1 Dynactin» . Дж. Биол. Химический 276 (39): 36598–605. doi : 10.1074/jbc.m104838200 . PMID 11461920 .

[pmid11172722-15] Muresan V, Stankewich MC, Steffen W, Morrow JS, Holzbaur EL, Schnapp BJ (2001). «Динактин-зависимый транспорт везикул, управляемый динеином в отсутствие мембранных белков: роль спектрина и кислых фосфолипидов» . Мол Клетка . 7 (1): 173–83. doi : 10.1016/s1097-2765 (01) 00165-4 . PMID 11172722 .

[pmid17283181-16] Йоханссон М., Роча Н., Зварт В., Джордс И., Янссен Л., Куйджл С., Олкконен В.М., Нифджес Дж. (2007). «Активация эндосомальных двигателей динеина путем поэтапной сборки Rab7-Rilp-P150-Huled, ORP1L и рецепторного спектрина» . J. Cell Biol . 176 (4): 459–71. doi : 10.1083/jcb.200606077 . PMC 2063981 . PMID 17283181 .

[pmid11357136-17] Mao B, Wu W, Li Y, Hoppe D, Stannek P, Glinka A, Niehrs C (2001). «Связанный с LDL-рецептор белок 6 является рецептором для белков dickkopf». Природа . 411 (6835): 321–5. Bibcode : 2001natur.411..321m . doi : 10.1038/35077108 . PMID 11357136 . S2CID 4323027 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]