Н. Гаутам

Намасиваям Гаутам
Намасиваям Гаутам
Рожденный	Намасиваям Гаутам ; 9 июля 1955 г. (69 лет)
Национальность	Индийский
Альма-матер	Мадрасский христианский колледж , Мадрасский университет ; Махараджа Саяджирао, Университет Бароды ; Индийский институт науки ;
Известный	Исследования по кристаллографии ДНК и применению метода взаимно ортогональных латинских квадратов для предсказания структуры белка и молекулярного стыковки
	Научная карьера
Поля	Кристаллография ДНК ; Структура белка ; Прогнозирование структуры белка ; Биоинформатика ;
Учреждения	Мадрасский университет
Докторантура	Майсур А. Вишвамитра
Докторанты	П. Карт ;

Намасиваям Гаутам (род. 1955) — почетный профессор на пенсии Центра перспективных исследований в области кристаллографии и биофизики Мадрасского университета . ^[3] Он известен своими работами в области кристаллографии ДНК , предсказания структуры белков и молекулярного докинга . ^[4]

Образование

В 1975 году Гаутам получил степень бакалавра физики в Мадрасском христианском колледже Мадрасского университета . ^[5] Позже, в 1979 году, он получил степень магистра наук по физике в Университете Махараджи Саяджирао в Бароде . В 1983 году ему была присвоена степень доктора философии за исследования в области структурной биологии производных изопропилиденнуклеозидов Майсура А. под руководством Висвамитры . ^[6]

Карьера и исследования

Гаутам работал научным сотрудником в Индийском институте науки . После получения докторской степени в 1985 году он был назначен преподавателем в Мадрасском университете. В 1997 году ему было присвоено звание профессора. Он продолжал работать в Мадрасском университете до выхода на пенсию в 2016 году. ^{[ нужна ссылка ]}

Гаутам использовал кристаллографию ДНК для изучения влияния ионов металлов на переход правосторонней B-ДНК в левостороннюю Z-ДНК . ^[7] а также самосборка декамерных последовательностей ДНК в четырехстороннее соединение Холлидея. ^[8] В области структурной биоинформатики Гаутам разработал новый Ab initio вычислительный метод с использованием взаимно ортогональных латинских квадратов (MOLS) — метода, используемого в области планирования экспериментов — для эффективной выборки конформационного пространства полипептидов и белков с целью выявления глобального минимума. энергетические конформации. ^[9] Позже его лаборатория применила метод MOLS к проблеме молекулярного стыковки. ^[10]^[11] и выпустил пакет программного обеспечения с открытым исходным кодом под названием MOLS. ^[12]

Гаутам написал два учебника по биофизике . ^[13] и биоинформатика . ^[14] Ему принадлежат два патента на разработку вычислительных методов построения оптимальных моделей трехмерных молекулярных структур, в частности связанных с пептидами и белками . ^[15]^[16]

Исследования Гаутама финансировались Департаментом науки и технологий (DST) , Департаментом биотехнологии и Советом научных и промышленных исследований .

Награды и почести

Гаутам был избран членом Национальной академии наук Индии (FNASc) в 2007 году. ^[17] В 1990 году он был награжден стипендией BOYSCAST от DST, Индия. В 1983 году он получил золотую медаль Мартина Фостера за лучшую диссертацию на факультете физики и математики Индийского института науки . ^{[ нужна ссылка ]}

См. также

Список программного обеспечения для стыковки белков и лигандов

Ссылки

^ Запись докторской диссертации под руководством профессора Н. Гаутама.
^ «Информационное письмо – Общество выпускников физики Мадрасского христианского колледжа» . Проверено 19 мая 2020 г.
^ «Страница факультета» .
^ «Публикации на ResearchGate» . Исследовательские ворота . 8 мая 2020 г.
^ «Информационное письмо – Общество выпускников физики Мадрасского христианского колледжа» . Проверено 19 мая 2020 г.
^ Вишвамитра М.А., Гаутам Н. (1984). «Структуры производных изопропилиденнуклеозидов: влияние на гибкость кольца рибозы при внешних циклических ограничениях» . Журнал химических наук . 93 (3): 261–269. дои : 10.1007/BF02840518 . S2CID 82905540 .
^ Тиягараджан С., Раджан С.С., Гаутам Н. (2004). «Гексаммин кобальта индуцировал таутомерный сдвиг в Z-ДНК: структура d(CGCGCA)*d(TGCGCG) в двух кристаллических формах» . Исследования нуклеиновых кислот . 32 (19): 5945–53. дои : 10.1093/nar/gkh919 . ПМК 528804 . ПМИД 15534365 .
^ Венкадеш С., Мандал П.К., Гаутам Н. (апрель 2011 г.). «Последовательность d (CGGCGGCCGC) самособирается в двумерную ромбическую решетку ДНК». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 407 (3): 548–51. дои : 10.1016/j.bbrc.2011.03.056 . ПМИД 21419105 .
^ Венгадесан К., Гаутам Н. (май 2003 г.). «Расширенная выборка поверхности потенциальной энергии молекул с использованием взаимно ортогональных латинских квадратов: применение к пептидным структурам» . Биофизический журнал . 84 (5): 2897–906. Бибкод : 2003BpJ....84.2897V . дои : 10.1016/S0006-3495(03)70017-4 . ПМК 1302853 . ПМИД 12719222 .
^ Арун Прасад П., Гаутам Н. (ноябрь 2008 г.). «Новая стратегия стыковки пептидов с использованием метода среднего поля с взаимно ортогональными выборками в латинском квадрате». Журнал компьютерного молекулярного дизайна . 22 (11): 815–29. Бибкод : 2008JCAMD..22..815A . дои : 10.1007/s10822-008-9216-5 . ПМИД 18465087 . S2CID 189952889 .
^ Виджи С.Н., Прасад П.А., Гаутам Н. (декабрь 2009 г.). «Докирование белка и лиганда с использованием взаимно ортогональных латинских квадратов (MOLSDOCK)». Журнал химической информации и моделирования . 49 (12): 2687–94. дои : 10.1021/ci900332a . ПМИД 19968302 .
^ Сэм Пол Д., Гаутам Н. (сентябрь 2018 г.). «Стыковка белков с малыми молекулами с гибкостью рецепторов в iMOLSDOCK». Журнал компьютерного молекулярного дизайна . 32 (9): 889–900. arXiv : 2010.05475 . Бибкод : 2018JCAMD..32..889S . дои : 10.1007/s10822-018-0152-8 . ПМИД 30128925 . S2CID 52051606 .
^ Паттабхи V, Гаутам Н. (30 января 2009 г.). Биофизика (2-е изд.). Альфа Сайенс Интернешнл Лтд. 260. ИСБН 978-1842655177 .
^ Гаутам Н. (3 января 2006 г.). Биоинформатика: базы данных и алгоритмы . Альфа Сайенс Интернешнл Лтд. 260. ИСБН 1842653008 .
^ «Метод и система построения оптимальных моделей трехмерных молекулярных структур» . Ведомство США по патентам и товарным знакам .
^ «Метод построения оптимальных моделей трехмерных молекулярных структур» . ИП Австралия .
^ «Запись товарищей» . Индия: Национальная академия наук.

[1] Запись докторской диссертации под руководством профессора Н. Гаутама.

[2] «Информационное письмо – Общество выпускников физики Мадрасского христианского колледжа» . Проверено 19 мая 2020 г.

[3] «Страница факультета» .

[4] «Публикации на ResearchGate» . Исследовательские ворота . 8 мая 2020 г.

[5] «Информационное письмо – Общество выпускников физики Мадрасского христианского колледжа» . Проверено 19 мая 2020 г.

[6] Вишвамитра М.А., Гаутам Н. (1984). «Структуры производных изопропилиденнуклеозидов: влияние на гибкость кольца рибозы при внешних циклических ограничениях» . Журнал химических наук . 93 (3): 261–269. дои : 10.1007/BF02840518 . S2CID 82905540 .

[7] Тиягараджан С., Раджан С.С., Гаутам Н. (2004). «Гексаммин кобальта индуцировал таутомерный сдвиг в Z-ДНК: структура d(CGCGCA)*d(TGCGCG) в двух кристаллических формах» . Исследования нуклеиновых кислот . 32 (19): 5945–53. дои : 10.1093/nar/gkh919 . ПМК 528804 . ПМИД 15534365 .

[8] Венкадеш С., Мандал П.К., Гаутам Н. (апрель 2011 г.). «Последовательность d (CGGCGGCCGC) самособирается в двумерную ромбическую решетку ДНК». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 407 (3): 548–51. дои : 10.1016/j.bbrc.2011.03.056 . ПМИД 21419105 .

[9] Венгадесан К., Гаутам Н. (май 2003 г.). «Расширенная выборка поверхности потенциальной энергии молекул с использованием взаимно ортогональных латинских квадратов: применение к пептидным структурам» . Биофизический журнал . 84 (5): 2897–906. Бибкод : 2003BpJ....84.2897V . дои : 10.1016/S0006-3495(03)70017-4 . ПМК 1302853 . ПМИД 12719222 .

[10] Арун Прасад П., Гаутам Н. (ноябрь 2008 г.). «Новая стратегия стыковки пептидов с использованием метода среднего поля с взаимно ортогональными выборками в латинском квадрате». Журнал компьютерного молекулярного дизайна . 22 (11): 815–29. Бибкод : 2008JCAMD..22..815A . дои : 10.1007/s10822-008-9216-5 . ПМИД 18465087 . S2CID 189952889 .

[11] Виджи С.Н., Прасад П.А., Гаутам Н. (декабрь 2009 г.). «Докирование белка и лиганда с использованием взаимно ортогональных латинских квадратов (MOLSDOCK)». Журнал химической информации и моделирования . 49 (12): 2687–94. дои : 10.1021/ci900332a . ПМИД 19968302 .

[12] Сэм Пол Д., Гаутам Н. (сентябрь 2018 г.). «Стыковка белков с малыми молекулами с гибкостью рецепторов в iMOLSDOCK». Журнал компьютерного молекулярного дизайна . 32 (9): 889–900. arXiv : 2010.05475 . Бибкод : 2018JCAMD..32..889S . дои : 10.1007/s10822-018-0152-8 . ПМИД 30128925 . S2CID 52051606 .

[13] Паттабхи V, Гаутам Н. (30 января 2009 г.). Биофизика (2-е изд.). Альфа Сайенс Интернешнл Лтд. 260. ИСБН 978-1842655177 .

[14] Гаутам Н. (3 января 2006 г.). Биоинформатика: базы данных и алгоритмы . Альфа Сайенс Интернешнл Лтд. 260. ИСБН 1842653008 .

[15] «Метод и система построения оптимальных моделей трехмерных молекулярных структур» . Ведомство США по патентам и товарным знакам .

[16] «Метод построения оптимальных моделей трехмерных молекулярных структур» . ИП Австралия .

[17] «Запись товарищей» . Индия: Национальная академия наук.

[2]

[1]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]